评论前列腺癌(PCA)通常从雄激素依赖性状态转变为雄激素剥夺疗法(ADT)后,更具侵略性的形式称为耐custatration-Castration-Castration-Castration canstration Cancer(CRPC)。ADT,包括手术或医疗cast割,最初通过抑制Andro Gen受体(AR)信号传导来减轻肿瘤负担,这是Pros Tate癌症生长的关键驱动力[1,2]。但是,由于恢复或绕过AR信号的几种机制,CRPC最终会发展。这些机制包括AR基因扩增,AR突变,con活性AR剪接变体的表达和肿瘤内雄激素合成[1-3]。该过渡的基础机制涉及遗传,表观遗传和激素变化,这些变化促进了细胞塑性。关键的遗传改变包括肿瘤抑制基因(例如RB1,TP53和PTEN)的丧失,以及表观遗传调节剂(例如EZH2)的变化,这有助于从前列腺腺癌cinoma转变为NEPC [4,5]。此外,诸如ASCL1和SOX2之类的转录因子在驱动神经内分泌分化和主要表型中起着至关重要的作用[6,7]。NEPC的发展通常遵循广泛的雄激素受体途径抑制剂,抗雄激素耐药性和雄激素受体表达的丧失。尽管循环雄激素的cas含量水平,但这些适应性允许持续的AR活性,驱动肿瘤pro的疗程[1,2]。CRPC肿瘤的一个子集可以独立于AR信号传导并采用神经内分泌特征,从而导致神经内分泌前列腺癌(NEPC)。NEPC的出现与对常规疗法的抵抗力和预后不良有关。NEPC的特征是AR表达的丧失和神经内分泌标记物的增益,例如铬烷蛋白A和突触素蛋白[4]。这种过渡通常是由遗传和表观遗传学变化驱动的,包括肿瘤SUP压力器(如TP53和RB1)的丧失,谱系的激活
胞质DNA通过环状GMP-AMP(CGAMP)合酶(CGA)检测后促进炎症反应。已经表明,CGAS下调是由肿瘤细胞制定的免疫逃生策略。在这里,我们使用了胶质母细胞瘤细胞,这些细胞显示出无法检测到的CGA水平来解决替代DNA检测途径是否可以促进促炎信号传导。我们表明,DNA-PK DNA修复复合物(i)驱动与CGAS独立的IRF 3介导的I型Intyferon响应以及(ii)(II),其催化活性是CGAS依赖性CGAMP产生和最佳下游信号所必需的。我们进一步表明,DNA-PK与CGA之间的合作有利于趋化因子的表达,这些趋化因子在胶质母细胞瘤模型中促进肿瘤微环境中巨噬细胞募集的表达,这一过程会损害早期肿瘤的发生,但与Glioblas-Toma患者的结果相关。因此,我们的研究支持CGAS依赖性signaling在肿瘤发生过程中获得,并且应协同分析CGA和DNA-PK活性,以预测旨在提高肿瘤免疫原性的策略的影响。
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BRAF激酶融合是基因组结构变异的一种形式,是驱动器阴性黑色素瘤中的复发事件。虽然BRAF融合可重复保存激酶结构域,但具有5'基因伴侣和特定BRAF断裂点的遗传变异性。我们研究了BRAF激酶融合的遗传多样性如何影响二聚体信号传导和ERK激活。我们与5'基因伙伴(包括AGK,ZKSCAN1,ARMC10,PPFIBP2和TRIM24)的BRAF融合过过表达,并发现依赖融合的信号传导和抑制剂敏感性。尽管有下一代RAF抑制剂的发展,但多种pan-Raf抑制剂仍存在矛盾的ERK磷酸化,在某些BRAF融合中,使用TrameTinib和Ly3009120改善了垂直RAF/MEK抑制的某些BRAF融合。共同观察到了一些融合依赖性作用,但肿瘤的生长抑制和垂直途径抑制的矛盾激活的分辨率。
摘要:Grossberg的自适应共振理论的两个通用功能原理解密了所有生物学习和自适应智能的脑法规。低水平表示,这些规则整合了上下文配置的高级长期痕迹。这些普遍的编码原理导致在所有生物物种(从Aplysiae到灵长类动物)中建立了持久的脑签名。根据原始代码和大脑上下文调制的一些相关的经验发现,在本概念论文中重新审视了它们,突出了Grossberg的开拓性洞察力的潜力和开发理论解决方案的潜力,用于发育和认知机器人的智能解决方案。
摘要 过去几十年来,靶向治疗在临床中的应用包括但不限于抑制多种促肿瘤信号的酪氨酸激酶抑制剂 (TKI)。TKI 可分为 (i) 直接靶向癌细胞的药物、(ii) 使血管生成正常化或 (iii) 影响血液谱系细胞的药物。然而,基于此定义对 TKI 进行明确区分受到以下事实的限制:许多旨在抑制癌细胞的 TKI 也会对正在发现的免疫细胞产生影响。此外,最初设计用于靶向血液癌症的 TKI 对同一血液谱系的健康细胞表现出生物活性。TKI 已被描述为改善免疫识别和癌症免疫监视,为将 TKI 与免疫疗法相结合提供了科学基础。事实上,TKI 与免疫疗法的结合在临床前模型和临床试验中显示出协同作用,一些使血管生成正常化的 TKI 与免疫检查点阻断抗体的组合已被 FDA 批准用于癌症治疗。然而,需要改进对适当药物组合的识别以及最佳剂量和时间安排,以便在癌症治疗方面取得切实进展。本试验观察总结了将 TKI 与各种免疫治疗策略相结合治疗癌症患者的活跃临床试验。
动机:抑制剂 - 激酶结合亲和力的准确预测对于药物发现和医疗应用至关重要,尤其是在治疗诸如癌症之类的疾病中。现有的预测抑制剂 - 激酶亲和力的方法仍然面临挑战,包括数据表达不足,功能提取有限和性能低。尽管通过人工智能(AI)方法(尤其是深度学习技术)取得了进展,但许多当前的方法未能捕获激酶与抑制剂之间的复杂相互作用。因此,有必要开发更先进的方法来解决抑制剂 - 激酶结合预测中的现有问题。结果:这项研究提出了Kinhibhib,这是抑制剂 - 激酶结合亲和力预测指标的新型框架。kinhibit会整合自我监督的预训练的预训练的分子编码器和蛋白质语言模型(ESM-S),以有效提取特征。kinhibit还采用特征融合方法来优化抑制剂和激酶特征的融合。实验结果证明了这种方法的优越性,在三种MAPK信号途径激酶的抑制剂预测任务中,精度达到了92.6%的精度:RAF蛋白激酶(RAF),有丝分裂原激活的蛋白激活蛋白激酶激酶激酶(MEK)和细胞外信号调节激酶(ERK)。此外,该框架在包含200多个激酶的数据集上达到了令人印象深刻的精度。这项研究为药物筛查和生物科学提供了有希望的有效的工具。
动机:抑制剂 - 激酶结合亲和力的准确预测对于药物发现和医疗应用至关重要,尤其是在治疗诸如癌症之类的疾病中。现有的预测抑制剂 - 激酶亲和力的方法仍然面临挑战,包括数据表达不足,功能提取有限和性能低。尽管通过人工智能(AI)方法(尤其是深度学习技术)取得了进展,但许多当前的方法未能捕获激酶与抑制剂之间的复杂相互作用。因此,有必要开发更先进的方法来解决抑制剂 - 激酶结合预测中的现有问题。结果:这项研究提出了Kinhibhib,这是抑制剂 - 激酶结合亲和力预测指标的新型框架。kinhibit会整合自我监督的预训练的预训练的分子编码器和蛋白质语言模型(ESM-S),以有效提取特征。kinhibit还采用特征融合方法来优化抑制剂和激酶特征的融合。实验结果证明了这种方法的优越性,在三种MAPK信号途径激酶的抑制剂预测任务中,精度达到了92.6%的精度:RAF蛋白激酶(RAF),有丝分裂原激活的蛋白激活蛋白激酶激酶激酶(MEK)和细胞外信号调节激酶(ERK)。此外,该框架在包含200多个激酶的数据集上达到了令人印象深刻的精度。这项研究为药物筛查和生物科学提供了有希望的有效的工具。
过去 30 年的大量研究已证实,依赖细胞周期蛋白的激酶 (CDK) 在发育过程中的许多分子和细胞过程中发挥着多种多样的重要功能。影响 CDK 或其激活细胞周期蛋白亚基的突变与多种罕见的人类发育障碍有关,这并不令人意外。本文回顾了这些最新发现,特别关注了已发现的突变及其已证实或假设的功能后果,这些后果可以解释人类的病理表型。本综述重点介绍了与人类疾病相关的新的、重要的 CDK 或细胞周期蛋白功能,并讨论了小鼠模型在揭示其中一些功能方面的不足之处。它解释了如何将人类遗传学与蛋白质组规模的相互作用数据库结合使用,以构建围绕 CDK 和细胞周期蛋白的调控网络。最后,它提倡使用这些网络来分析致病的 CDK 或细胞周期蛋白变体,以便了解蛋白质功能和致病机制。
摘要:酪氨酸激酶抑制剂 (TKI) 在癌症治疗方法的革命性发展中发挥了决定性作用,为提高生活质量提供了非侵入性、可耐受的治疗方法。尽管如此,TKI 治疗的反应程度和持续时间取决于癌症分子特征、产生耐药性的能力、种系变异引起的药代动力学改变以及膜转运蛋白和代谢酶水平上不必要的药物相互作用。大量获批的 TKI 是有机阳离子转运蛋白 (OCT) 的抑制剂。少数也是它们的底物。这些转运蛋白具有多特异性,在正常上皮细胞中高度表达,特别是在肠道、肝脏和肾脏中,因此可以说是 TKI 与其他 OCT 底物相互作用的相关位点。此外,OCT 通常在癌细胞中受到抑制,可能导致癌细胞对 TKI 产生耐药性。本文回顾了体外和体内报道的 OCT 与已批准和正在开发的 TKI 的相互作用,并批判性地讨论了其潜在的临床影响。