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World File Search System物种组成
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抽象是一种有效的方法，用于快速分析物种关系，物种组成，以及与性状数据库（社区生物多样性的功能元素）结合使用，是DNA metabarcoding。传统的评估物种丰富度和丰度的方法受到分类识别的限制，可能会损害或破坏栖息地，并可能依靠使得难以找到小型或难以捉摸的物种的技术，从而对整个社区进行了估计。通过使用高通量测序（HTS）技术，该技术可以对与环境和社区样本收集的DNA条形码相关的数据进行顺序和提取数据。一种称为Metabarcoding的不断发展的技术利用了大量的DNA条形码序列和改进的DNA测序技术的吞吐量。脊椎动物饮食的分析是DNA元法编码最早的应用之一，该技术对于理解植物 - 授粉关系仍然有效。DNA研究的范围受到环境DNA降解的限制，尤其是在温暖的热带地区，经常仅存在很少的遗传物质残余物。DNA metabarcoding是一种仍在开发中的新技术。随着技术的发展和协议变得更加标准化，可以预期该方法将持续一段时间。元法编码预计将成为监测生态学和全球保护研究的关键工具，因为它得到了改进和更频繁的使用。关键字DNA元法编码，生物多样性，条形码，EDNA，METABARCODING，HTS
人类肠道真菌群的组成、发育模式和病理关联
目的：人类肠道真菌群由多种真菌物种组成，尽管与细菌种群相比数量相对较少，但其在健康和疾病中发挥着至关重要的作用。本综述概述了真菌群的组成、发育模式和各种病理条件下的菌群失调。此外，还讨论了肠道微生物群内真菌群落的复杂相互作用。当前内容：肠道真菌群的发展遵循与细菌微生物群相似的模式，出生方式、饮食和年龄是关键决定因素。与细菌趋势相反，真菌群多样性在儿童和老年时期增加。最近的研究表明，不同种族群体的真菌群组成存在差异。真菌群失调与自身免疫、胃肠道和心血管疾病有关。某些真菌，尤其是白色念珠菌，在病理状态下相对更丰富。真菌代谢活动，特别是次级代谢产物的产生，可显著影响疾病进展。肠道微生物群中的细菌-真菌相互作用很复杂，受饮食和抗生素使用等环境因素的调节。此外，肠道真菌群调节治疗效果。肠道真菌通过生物转化增强天然产物化合物的生物活性，包括其抗癌和抗炎作用。这表明肠道真菌群具有优化天然产物治疗效果的潜力。结论：本综述强调了肠道真菌群作为诊断生物标志物和治疗靶点的相关性。未来的研究应侧重于阐明真菌群变化与疾病状态之间的因果关系，并进一步探索肠道生态系统中的细菌-真菌相互作用。
柬埔寨自然历史杂志
在全球范围内，淡水生物多样性面临着越来越多的威胁（Dudgeon等，2006）和下湄公河下游盆地（LMB）的养生社区，这表明了这一趋势。气候变化，水力发电发展和人口越来越多的是盆地的主要压力源（Lauri等，2012; Pokhrel等，2018; Yoshida等，2020），涵盖了大约571,000 km 2，遍及Cambodia，Cambodia，Thailand，Laos和Vietnam。在柬埔寨，湄公河进入该国与老挝的边界，并流向向南480公里的流动，到达与越南的边界。在向南流动时，它是由大型支流提供的，包括Sekong，Sesan和Sre Pok（3s）河流，这些河流排出南部老挝，越南中部和柬埔寨东北部。此外，柬埔寨西亚最大的湖泊（The Tonle Sap）。作为一个热带流域，湖泊经常性潮湿季节和相关的湿地流动，该湖泊支持了一个超过1000多种鱼类的富有成效和多样化的社区（Hortle，2009a; Rainboth et al。，2012）。由于物种适应季节性可用的，高生产力的栖息地（Poulsen et al。，2002），因此物种适应了盆地的季节性脉冲驱动丰度。该生态系统每年的收获超过200万吨，由数百种物种组成，为超过7000万人提供了粮食安全（Hortle，2009b； Fao，2020）。这意味着监测鱼类社区至关重要，既是生物多样性损失的预警系统，又是评估保护措施的影响。然而，柬埔寨在大型热带河流系统中的生物视为监测所常见的挑战，包括
有毒的蓝细菌花的动力学 - 地平线IRD
摘要在巴西东北部半干旱地区的富营养化饮用水储层中分析了浮游植物的物种组成和季节性的继承。研究基于在1年（1997年至1998年）的两次或每月抽样，在1个代表站进行了2个采样深度（底部附近0.5和5 m）。limnological参数（温度，pH，pH，氧气，电导率，光，溶解的无机营养素），以确定影响浮游植物组成的可能因素。我们确定了30个分类单元，这些分类单元在数值上由叶绿素科主导。然而，在丰度和生物量方面，蓝细菌以cylindros- permopsis raciborskii（Wolsz。Seaveayya et subba Raju。该物种可以代表生物量接近浮游植物总生物量的96-100％，其值在1998年4月至11月之间达到70 mg 1-I（新重量）。在调查中，盘齿状梭菌的细丝盘绕（平均97％），平均比例为终端杂细胞的12.3％。物种毒性是根据生物症分析确定的，并且在开花过程中揭示了神经毒素的存在。到1998年3月，氯酸菌浓度在表面水平上达到135 pg 1-l，诱导了舒适区深度的急剧下降。在高温，高pH值，低N/P比以及没有有效的捕食者的情况下观察到了有利的环境条件。尽管没有外部养分供应，但营养环境似乎在蓝细菌的开花中起作用。然而，1998年与1997年的厄尔尼诺后果有关的年度雨水不足和缺乏水分的续约似乎是负责养育性贫血状况和氰基分体盛开的主要因素。因此，全球气候变化会影响大陆水域中的浮游植物种群动态，如海洋生态系统中经常证明的那样。
phytophthora Deaback对伊斯兰岛的关键荒地物种（asphodelaceae）（澳大利亚草丛）和东方植物的植物组成的影响，维多利亚州
上下文。植物病原体植物肉瘤肉瘤会导致易感植被的严重下降，包括植物物种的丧失，植被结构和动物群丰度。草丛（Xanthorrhoea spp。）是基石物种，为脊椎动物和无脊椎动物提供最佳栖息地，并且非常容易受到病原体的影响。尽管在特定地点评估了Otway范围的影响，但在整个景观方面，关于Xanthorrhoea australis（澳大利亚格拉斯特里）的损失程度的知识较少。目标。因此，目的是评估三个希思林地地点的影响，并确定X. Australis和易感物种损失的损失的幅度。方法。植物组成，物种覆盖物或丰度以及X. Australis的基础面积在治疗中记录在四方（未感染，感染，侵入后的植被）中。分析包括平流（底漆V7），显着效应（Anosim），物种对相似性/差异性的贡献（Simper）。物种丰富度和易感物种覆盖物，以检测现场，治疗和相互作用的影响。关键结果。未感染植被的物种组成与感染和侵入后的植被截然不同，未感染的地区易感物种更丰富。感染后的植被的易感物种百分比最低。X. Australis在未感染的植被中的平均百分比覆盖率（43％）比在感染区（4.3％）高10倍，在侵入后植被中极低（0.9％）。结论。易感物种的密度下降和灭绝，X. Australis的损失导致了重大的结构植被变化。含义。这些结果对希思林地社区和依赖动物群具有严重影响。限制P. cinnamomi和保护草丛的传播对于他们的安全至关重要。
奇异变形杆菌泛基因组景观中未表征和谱系特异性的附属基因
摘要 奇异变形杆菌是一种革兰氏阴性细菌，以其独特的群集运动能力和尿素酶活性而闻名。之前对四种菌株的蛋白质组学报告假设，与其他革兰氏阴性细菌不同，奇异变形杆菌可能不会表现出基因含量的显著种内变异。然而，目前还没有对来自各种来源的大量奇异变形杆菌基因组进行全面分析以支持或反驳这一假设。我们对 2,060 个变形杆菌基因组进行了比较基因组分析。我们对从美国三家大型学术医疗中心的临床标本中回收的 893 个分离株的基因组进行了测序，结合了来自 NCBI Assembly 的 1,006 个基因组和从公共域中的 Illumina 读取中组装的 161 个基因组。我们使用平均核苷酸同一性 (ANI) 来划分物种和亚种，使用核心基因组系统发育分析来识别高度相关的 P. mirabilis 基因组簇，并使用全基因组注释来识别模型 P. mirabilis 菌株 HI4320 中不存在的感兴趣基因。在我们的队列中，Proteus 由 10 个已命名的物种和 5 个未表征的基因组物种组成。P. mirabilis 可细分为三个亚种；亚种 1 占所有基因组的 96.7% (1,822/1,883)。P. mirabilis 全基因组包括 HI4320 之外的 15,399 个基因，其中 34.3% (5,282/15,399) 没有推定的指定功能。亚种 1 由几个高度相关的克隆群组成。编码假定面向细胞外的蛋白质的噬菌体和基因簇与克隆群相关。在泛基因组中可以识别出模型菌株 P. mirabilis HI4320 中不存在但与已知毒力相关操纵子具有同源性的未知基因。
DNA Primase大亚基是双子病毒的必不可少的植物基因
双子座科的家族由500多个可以感染众多双核和单子植物的圆形单链（SS）DNA病毒物种组成。双子病毒利用宿主的DNA复制机制，在植物细胞的核中复制其基因组。将其DNA转化为双链DNA，随后复制，这些病毒依赖于宿主DNA聚合酶。但是，此过程的第一步的启动，即传入的圆形ssDNA转化为dsDNA分子，已经难以捉摸近30年。In this study, sequencing of melon ( Cucumis melo ) accession K18 carrying the Tomato leaf curl New Delhi virus (ToLCNDV) recessive resistance quantitative trait locus (QTL) in chromosome 11, and analyses of DNA sequence data from 100 melon genomes, showed a conservation of a shared mutation in the DNA Primase Large subunit ( PRiL ) of all accessions that对TolCNDV的挑战表现出抵抗力。沉默（天然）烟熏本尼亚人pril以及随后对三种不同的双子病毒的挑战表明，所有三种病毒的滴度都严重减少，完全强调了pril在双子病毒复制中的重要作用。呈现了一个模型，以解释Pril在GESINIVIRAL DNA复制启动中的作用，即 作为原始酶的调节亚基，在DNA复制开始时类似于DNA Primase - 在所有生物体中介导的DNA复制起始。呈现了一个模型，以解释Pril在GESINIVIRAL DNA复制启动中的作用，即作为原始酶的调节亚基，在DNA复制开始时类似于DNA Primase - 在所有生物体中介导的DNA复制起始。
孟加拉人民共和国政府
孙德尔本斯是世界上最大的连续红树林，位于孟加拉国西南角的恒河河口。森林面积为 6017 平方公里，其中约 31% 的面积由各种运河和河流组成的复杂网络组成，宽度和深度差异很大。孙德尔本斯红树林为各种哺乳动物、爬行动物、两栖动物、鱼类和鸟类提供了独特的栖息地。与世界上许多其他红树林相比，孙德尔本斯的物种组成和丰富度代表了各种经济、社会和环境价值。这片森林在国家和世界范围内都非常重要，因为它提供了如此多的生态功能和自然资源。它于 1992 年被指定为拉姆萨尔湿地，并于 1997 年被列为联合国教科文组织世界遗产。目前，林业部门没有关于从孙德尔本斯开采资源的受益者的数字化信息（数据库）；并向受益人颁发在孙德尔本斯开采资源的书面许可。许可证发放的手动过程需要使用在线平台以数字方式完成。为了实现可持续的长期管理，需要实施一个基于网络的自动化系统来维护数据库，为开采孙德尔本斯自然资源的受益人颁发许可证和数字身份证[非木材林产品，如鱼、螃蟹、蜂蜜和蜂蜡、Golpata、太阳草（Imperata Sp.）、Hogla（Typha Sp.）等]。这个实时在线平台对于评估对孙德尔本斯的不同影响和基于可靠数据预测这个独特生态系统的未来非常重要。本职权范围（ToR）描述了咨询公司为准备开采孙德尔本斯自然资源的受益人的数据库和身份证以及许可证系统自动化而要执行的主要活动。
西太平洋棘冠海星的形态学和分子分析
棘冠海星 (COTS) 以在种群爆发期间吞食石珊瑚而破坏珊瑚礁而闻名。先前的研究表明，棘冠海星由四个物种组成，统称为 A. planci 物种复合体。尽管有可用的在线数据库序列，但太平洋 COTS 群（称为 Acanthaster solaris 或 Acanthaster cf. solaris）缺乏全面的形态描述和博物馆凭证标本。因此，本研究旨在使用形态特征和部分 CO1 线粒体基因对位于内格罗斯岛南部的两个地点的 COTS 标本进行表征。获得了大小、颜色、硬度、叉状棘、足尖棘和无足尖棘以及手臂的形态学和形态测量数据。收集了管足进行 DNA 条形码编码。使用 Kimura 2 参数替换模型确定了内格罗斯岛南部和 A. planci 物种复合体的参考序列之间的遗传分化。来自 SNI 的标本具有灰蓝色的无口体色，整个中央圆盘上分布着黑红色的斑点。体色变为灰白色，当动物暴露在空气中时，斑点会变得更红。它们全身有六种刺和微小的叉尾。从内格罗斯岛南部收集的所有 COTS 个体都与该物种复合体的太平洋群融合，标记为 Acanthaster cf. solaris 。内格罗斯岛南部序列和太平洋进化枝之间的种内遗传分歧分别为 0.192 和 0.38%。我们的结果证实了 A. cf. solaris 在菲律宾的存在，并提供了来自印度洋-太平洋地区的物种更全面的形态学描述。该物种的凭证标本存放在西利曼大学罗道夫·B·冈萨雷斯自然历史博物馆。
使用森林景观模型进行可再生能源与生物多样性关系情景分析
引入可再生能源 (RE) 对于建设可持续社会至关重要。然而，可再生能源可能导致能源生产和生物多样性保护之间的冲突。本研究进行了情景分析，以评估日本东北部别间屋史河流域能源与生物多样性之间关系的潜在冲突。由于农民人口减少，牧场废弃率不断上升，这是该地区的一个巨大不确定性来源。选择了两种替代可再生能源来利用这些废弃的牧场，每种都采用独特的方法来满足区域能源计划规定的目标，从而在景观尺度上产生不同的生态后果。模拟了 31 种可再生能源引入方案，包括一系列牧场废弃扩张速度和太阳能光伏 (PV) 电厂安装与生物质能使用的比例。使用两种 IPCC 代表性浓度路径 (RCP) 情景（2.6 和 8.5）将它们叠加，从而产生了 62 种情景，这些情景根据可再生能源供需平衡和生态影响被概括为三组。使用 LANDIS-II 模型模拟了 2016 年至 2100 年的这些情景。结果表明，牧场废弃率和两种可再生能源的比例都对树种多样性和猛禽栖息地适宜性的变化有很大影响。转变为树木生物质能生产的废弃牧场转向以先锋物种为主的森林。过渡森林的植物物种组成因气候情景而异。RCP 8.5 情景中到 2100 年的较高温度阻止了白桦的建立，并改变了树种多样性和毛叶木的栖息地适宜性。生物质能利用产生的能量少于需求，但增加了三个生态指标。太阳能光伏系统提供的能源超过了区域需求，但两个地区的树木多样性和栖息地适宜性指数