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World File Search System猿类
猿类：系统发育和进化分析
描述 用于读取、写入、绘制和操作系统发育树的函数，在系统发育框架中分析比较数据，祖先特征分析，多样化和宏观进化分析，计算 DNA 序列的距离，读取和写入核苷酸序列以及从 BioConductor 导入，以及多种工具，例如 Mantel 检验、广义天际线图、系统发育数据的图形探索（alex、trex、kronoviz）、使用平均路径长度和惩罚可能性估计绝对进化率和时钟树，使用非同时期序列确定树的年代，将 DNA 转化为 AA 序列，以及评估序列比对。系统发育估计可以用 NJ、BIONJ、ME、MVR、SDM 和三角法以及几种处理不完整距离矩阵的方法（NJ*、BIONJ*、MVR* 和相应的三角法）来完成。一些函数调用外部应用程序（PhyML、Clustal、T-Coffee、Muscle），其结果返回到 R 中。
猿类制作生物多样性：蜘蛛，到处都是蜘蛛！
例如，我们可能会采样两个区域并找到：区域2区域2两个区域有四个物种和物种W 2 25 100动物总计，但分布物种x 90 25是非常不同的物种y 3 25种z 5 25区域2区域2区域均匀分布总数100个物种，而面积1。
Francisco Esteves 的公开资料 - Science-IUL
3 Gaspar, Maria Augusta Duarte Gaspar, Esteves, Francisco Gomes 和 Arriaga, Patricia Paula Lourenço (2014)。关于原型面部表情与面部行为的变化：通过测量人类和猿类的面部动作，我们对情绪的“可见性”有了什么了解。在 M. Pina 和 N. Gontier (Eds.) 的《灵长类动物社会交流的进化：一种多学科方法》中。 （第 101-126 页）。纽约：Springer International Publishing。 - Web of Science® 引用次数：13 - Google Scholar 引用次数：31
人类对大猿进化中脑衰老的脆弱性的独特性
衰老与大脑的进行性灰质损失有关。在黑猩猩中还发现了这种在人类寿命中的空间特异性，形态变化，这些伟大的猿类物种之间的比较为人脑衰老提供了独特的进化观点。在这里，我们提出了一个数据驱动的比较框架，以探索灰质萎缩与年龄的关系与黑猩猩和人类系统发育中最近的大脑扩张之间的关系。在人类中，我们显示出脑衰老与皮质膨胀之间的正相关关系，而在黑猩猩中没有发现这种关系。在强大的衰老作用和大型皮质扩张之间，这种人类特异性的关联尤其存在于腹侧前额叶皮层的高阶认知区域中，并支持人类培养基进化的“终点”假设。
GAHP治疗指南2024-编辑更新
用于治疗大猿中心血管疾病的治疗考虑因素，该文件旨在在考虑大猿中常见心血管疾病的治疗方案时作为指南。本文档中包含的信息基于人类和兽医心脏病学指南以及Great Ape Heart Project（GAHP）临床顾问委员会的综合临床经验，自2010年成立以来。信息不是基于这些物种中药物的药代动力学或药效学数据。由于缺乏有关这些疾病治疗的可用文献以及这些物种中药物的药代动力学和药物动力学行为，强烈建议您考虑在大猿类中考虑心血管疾病治疗方案的兽医临床医生在大APE中考虑与GAHP Cardiac和SPS-CardIAC和SSP特定物种兽医咨询人士的咨询，以咨询任何地方咨询者和任何地方咨询人员和任何专家的专家。由于我们的知识基础与大猿类心血管疾病的诊断和管理有关，因此潜在的治疗选择可能会改变。以超声心动图，心电图，血压评估和晚期成像（在某些情况下）确定的基于潜在的心血管疾病（在某些情况下）确定。给药指南，包括有关药物类别的背景信息。值得注意的是，心脏诊断通常不是特异性的，因为许多疾病病因，包括原发性/遗传性心脏病，都可能导致某种表型。非心态）病因。例如，扩张的心肌病（DCM）可能是主要疾病，但它也可能是病因包括传染病，有毒损伤，饮食/营养异常，持续性心律失常和梗塞。此外，心律不齐和高血压通常具有全身性（即因此，基于彻底的系统评估，可能需要其他非心脏药物。在动物和人类之间，甚至在驯养物种之间的心血管疾病的管理中，存在一些明显的差异。如果相关，这些差异将简要解决。最后，一些药物类（例如：β受体阻滞剂，ACE-I/ARB）是根据滴定时间表对其进行了加工的。这些药物的目标通常不是减轻临床体征，而是提供长期治疗益处（即减慢疾病进展）。因此，我们建议按照提供的上滴定时间表遵循滴定后推荐的治疗剂量，无论在开始剂量时的感知改善如何。
人类特异性遗传学：探索人类进化的分子和细胞基础的新工具
我们的祖先获得了形态、认知和代谢方面的改变，使人类能够在不同的栖息地定居、开发非凡的技术并重塑生物圈。了解这些变化的遗传、发育和分子基础将有助于我们了解人类是如何进化成人类的。由于存在大量低效应大小的遗传变化、在细胞类型层面上对发育过程中表型差异的描述有限以及缺乏实验模型，将人类特有的遗传变化与物种差异联系起来一直具有挑战性。单细胞测序、遗传操作和干细胞培养的新兴方法现在支持在具有人类或猿类遗传背景的特定细胞类型中进行描述性和功能性研究。在本综述中，我们描述了现代和古代人类、类人猿和其他灵长类动物的基因组测序如何揭示人类特有的遗传变化，以及新的分子和细胞方法（包括细胞图谱和类器官）如何能够探索人类特定特征背后的候选致病因素。
2021 财年计划协议年度报告和审查
10。更改USAG YPG可能会考虑改善任何规定的实施。该计划协议将于2024年到期，YPG打算开始在2022财年开始制定新协议文件。在开始新文档之前，将向咨询各方发送信件，告知他们过程的开始。每个附件h和先前对项目进行了豁免的项目清单。检查了先前接受过调查的项目，以确定当前猿类内没有任何历史性特性。说“没有地面干扰”的项目是没有豁免是不合适的，不进行地面干扰的情况，并且不会修改建筑物，但是需要进行环境考虑的记录，以提示文化资源管理响应。这些项目包括将连接盒放在铺装停车场和清除地面垃圾的活动。由于特定项目区域中存在的历史弹药的类型和数量，根据计划协议的附件C豁免了一个项目。该区域在附件C地图下涵盖，并确定该地区不允许在该地区允许爆炸物安全经理进行考古调查人员。
HOMINIDS中肠道微生物组的功能性宿主特异性适应
对人类肠道微生物组组成和功能的变化的精细知识比较了我们最亲密的亲戚对于理解其发育发展的进化过程至关重要。为了推断不同时间尺度的人类肠道微生物组的分类学和功能变化，我们对来自包括多样化的人群在内的200多个类似人群的粪便微生物组进行了高分辨率的基于合理的分析，以及野生生活的黑猩猩，bonobobos，bonobobos和gorillas。我们发现在非人类猿类和宿主特异性肠道微生物群的模式中耗尽了与人类相关的分类群，这表明沿宿主的进化差异，广泛地收购了新型微生物进化枝。相比之下，我们揭示了与高人类发展指数相关的人群多样性丧失多样性的多种证据，包括进化保守的进化枝。类似地，发现微生物和宿主之间的共晶发育模式在人类中被破坏。与识别与系统发育相关的单个微生物分类群和功能适应性，这些发现提供了对特定候选者的见解。我们发现，重复水平基因转移和基因丧失，以及对瞬态微恐惧条件的适应似乎在人类肠道微生物组的进化中起了作用。
随着哺乳动物的大脑尺寸和皮质折叠而进化
摘要 在哺乳动物进化的过程中，大脑尺寸和皮质折叠反复增加和减少。识别与这些性状共同进化的遗传元素，其序列或功能特性可为进化和发育机制提供独特信息。TRNP1 是这种比较方法的一个很好的候选者，因为它控制着小鼠和雪貂神经祖细胞的增殖。在这里，我们研究了 TRNP1 的调控序列和编码序列对 30 多种哺乳动物大脑尺寸和皮质折叠的贡献。我们发现 TRNP1 蛋白质进化的速度 ( ω ) 与大脑尺寸显著相关，与皮质折叠的相关性略低，与身体尺寸的相关性小得多。这种大脑相关性比 95% 以上的随机对照蛋白更强。这种共同进化可能影响 TRNP1 活性，因为我们发现来自大脑较大和皮质折叠较多物种的 TRNP1 会诱导神经干细胞的更高增殖率。此外，我们在大规模并行报告基因测定中比较了 TRNP1 的假定顺式调控元件 (CRE) 的活性，并确定了一种可能与旧世界猴和猿类的皮质折叠共同进化的 CRE。我们的分析表明，增加 TRNP1 活性的编码和调控变化被积极地选择为脑容量和皮质折叠增加的原因或结果。它们还提供了一个示例，说明系统发育方法如何为生物机制提供信息，尤其是当与多个物种的分子表型相结合时。
皮质脊髓对人类行走的控制 - Charles Capaday
人类行走有四个主要步态特征：（1）人类用两条腿直立行走，（2）与地面接触时腿几乎完全伸展，（3）脚后跟先着地（跖行步态），以及（4）在后期摆动阶段，身体的重心（COG）位于支撑面之外。相比之下，双足步行机器人的重心，如 Mark Tilden 的 Robosapien 和本田更复杂的 Asimo，则始终位于支撑面之内。由于人类步态的直腿特性，在脚后跟接触时伸肌和屈肌的激活是混合的，并且各个腿部伸肌的活动并不同步。踝关节伸肌活动延迟，发生在脚后跟接触之后，此时大多数其他腿部伸肌的活动已经停止（Capaday，2002）。在其他哺乳动物中，例如猫，当脚第一次接触地面时，腿部伸肌的活动是同相的（趾行步态）。亚历山大（Alexander，1992）认为，人类直腿行走的特点是将腿像支柱一样使用，从而最大限度地减少了肌肉活动。鸟类用两条腿走路，但采取蹲姿。企鹅比其他鸟类走路更直立，但它们仍然采取蹲姿，并且像其他鸟类一样，用脚尖走路。因此，除了一些猴子和猿类偶尔采用类似的步态外，直立、双足、跖行步态模式是人类独有的，其神经控制需要根据其自身条件来理解（Capaday，2002）。在这里，我以批判的方式回顾了关于运动皮层（MCx）在人类行走过程中的作用的研究，以及与 MCx 控制相关的某些脊髓反射机制方面。提出 MCx 在行走等看似自动的任务中发挥作用似乎令人惊讶，但这样做是有充分理由的。MCx 不仅发出自愿运动指令，而且还介导对上肢肌肉伸展的反射样反应（Matthews 等人，1990 年；Capaday 等人，1991 年）和接触放置等综合反应（Amassian 等人，1979 年）。从皮质脊髓束 (CST) 损伤导致的运动缺陷来看，其重要性随着系统发育顺序的增加而增加（Passingham