致癌突变会使转录程序失调,导致突变细胞依赖某些分子调节剂或信号通路。癌细胞所依赖的调节剂或通路因细胞类型和受突变影响的细胞状态动态而异 (1)。一些可以诱导基于特定细胞身份的形态学和临床表型的血液学改变的最佳例子是剪接因子 SF3B1 (SF3B1 MT) 中的热点突变。SF3B1 MT 是骨髓增生异常综合征 (MDS) 中高度复发的起始事件,出现在最原始的造血干细胞 (HSC;参考文献 2) 中。尽管在不同的造血细胞类型中发现 (3),SF3B1 MT 优先使红系祖细胞失调,并且是 MDS 亚型的标志,该亚型的特征是骨髓 (BM) 中环状铁粒幼细胞 (RS) 的积累,即 MDS-RS (4-7)。多项研究已经剖析了 SF3B1 MT 调节 MDS-RS 中 RNA 剪接的分子机制。SF3B1 MT 诱导的与血红素生物合成和线粒体铁转运有关的基因异常剪接导致红系细胞中铁的异常沉积,从而导致
引言与连接上游 5′ 剪接位点 (ss) 和下游 3′ ss 的经典剪接不同,反向剪接将下游 5′ 反向剪接位点 (bss) 与上游 3′ bss 连接,产生共价闭合的环状 RNA (circRNA) [1-7]。尽管反向剪接的加工方式不利,但它由与经典剪接相同的剪接体机制催化 [8-10],表明它们之间存在直接竞争 [11]。此外,反向剪接也受顺式元件和反式因子的严格调控 [10,12-16],导致 circRNA 在所检测的广泛细胞系、组织和物种中呈现时空表达 [17-25]。越来越多的证据表明,circRNA 表达失调与人类疾病有关,如癌症 [ 26 – 29 ]、系统性红斑狼疮 [ 30 ] 和神经元变性 [ 31 , 32 ],表明它们在生理和病理条件下都发挥着潜在作用 [ 1 , 2 , 5 ]。从机制上讲,大多数 circRNA 位于细胞质中,有些被发现充当 miRNA 或蛋白质的诱饵 [ 12 , 15 , 19 , 22 , 30 , 32 , 33 ]。尽管如此,大多数 circRNA 的生物学意义仍未被充分探索,部分原因是其功能研究方法有限,例如 DNA 水平上的 circRNA 敲除 (KO)。例如,CRISPR/Cas9 基因组编辑去除了
diya Zhu 1 carmanah D.Hunter 1 samuel R.Baird 1│BradleyR. Davis 2│Allyson Bos 2│Stephen J.灰色2.3│Stephen A. Westcott 1
•根据Forester ET所描述的方法,使用FB在96孔微量滴定板中使用FB进行了杀死测定。al。3带有修改。接种物由90 µL 10°CFU/mL细菌悬浮液组成。将板在37°C下在5%CO 2的加湿环境中以200 rpm的速度孵育4小时,以使细菌达到生长的对数阶段。在初始生长阶段后,将10 µL的10倍药物稀释液(4×和16倍模料肉汤微稀释液以及在头孢曲松易感性断裂点≤0.25µg/mL(0.5 µg/ml)上方的1.25 µg/ml(0.5 µg/ml)上方,在适当的情况下为每个所需的效果均添加了每卷。另外,将10 µL的FB添加到用作阳性对照的井中。在时间-4小时(接种时间),0小时(添加药物的时间),2小时,4小时,6小时和24小时,使用限制稀释方法来监测细菌的生长。在每个时间点,使用16个连续稀释度确定CFU/ML,并通过移液从每个条件/稀释度中混合63 µL,通过移液稀释。第一次稀释中的生长代表23 cfu/ml(7.3×3.17),并且每个连续稀释的生长代表7.3×3.17(n)CFU/ml(n平均稀释度)。在时间杀死测定之前对28小时的细菌生长进行了验证,以确保在整个实验期间可以保持适当的生长。
基因组编辑工具,如锌指核酸酶、转录激活因子样效应核酸酶、CRISPR-Cas 系统和 CRISPR-Cas 衍生物(胞嘧啶和腺苷碱基编辑器),已广泛应用于基因组操作,并显示出它们的治疗潜力。除了基因组编辑技术之外,RNA 碱基编辑技术也得到了开发 1 。由于 RNA 编辑是可逆的、可调控的,并且不会导致基因组的永久性改变,因此它在治疗应用中可能具有一定的优势。对于腺苷的 RNA 编辑,作用于 RNA 的腺苷脱氨酶 (ADAR) 家族的成员,如 ADAR1(异构体 p110 和 p150)和 ADAR2(参考文献 2、3),已被设计用于将腺苷 (A) 精确转化为肌苷 (I) 1 。 ADAR1/2 的催化底物是双链 RNA,ADAR1/2 的脱氨酶结构域负责 A 到 I 的 RNA 编辑 4、5。肌苷被识别为鸟苷 (G),并在随后的细胞翻译过程中与胞苷 (C) 配对 3。为了实现靶向 RNA 编辑,ADAR 蛋白(或其脱氨酶结构域 ADAR DD)已与多种 RNA 靶向模块融合,例如 λ N 肽 6 – 8、SNAP 标签 9 – 13 和 Cas13 蛋白 14。此外,可以利用带有 R/G 基序的工程向导 RNA 与异位表达的 ADAR1 或 ADAR2 蛋白偶联来实现靶向 RNA 编辑 15 – 18。然而,外源编辑酶的异位表达与几个问题有关,包括基因组和/或 RNA 转录物的大量全局脱靶编辑 19 – 23 、免疫原性 24 – 27 、致癌性 28 – 30 和递送障碍 24 。 Stafforst 团队和我们自己报告的两种 RNA 编辑技术 RESTORE 31 和 LEAPER 32 利用内源性 ADAR 对 RNA 进行可编程编辑,而无需引入
环状 RNA (circRNA) 是一大类非编码 RNA。尽管已鉴定出数千种环状转录本,但其中大多数的生物学意义仍未得到探索,部分原因是缺乏生成功能丧失动物模型的有效方法。在本研究中,我们重点研究了 circTulp4,这是一种源自 Tulp4 基因的丰富 circRNA,在大脑和突触区室中富集。通过创建 circTulp4 缺陷小鼠模型,我们在其中突变了负责生成 circTulp4 的剪接接受体位点,但不影响线性 mRNA 或蛋白质水平,我们能够进行全面的表型分析。我们的结果表明,circTulp4 在调节神经元和大脑生理学、调节兴奋性神经传递的强度和对厌恶刺激的敏感性方面至关重要。该研究提供的证据表明,circRNA能够调节神经元中的生物学相关功能,并在表型的多个层面上产生调节作用,为circRNA在神经过程中的调控作用建立了原理证明。
(未经同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可不得重复使用。此预印本的版权所有者此版本于 2024 年 10 月 29 日发布。;https://doi.org/10.1101/2024.10.26.620313 doi:bioRxiv preprint
序号 内容 学习时间 1. 环状体系的构象分析:环己烷及其衍生物(单、二和三取代)、稠合(十氢化萘)和桥连双环体系,动态立体化学,构象刚性和移动性,构象与反应性的定量相关性,构象对环状酮还原的影响,羰基的亲核加成(Cram、Karabatsos、Felkin-Ahn 模型,Cieplak 效应),环己烷底物上的亲核取代,环己烷环氧物的形成和开环,环己基卤化物、乙酸酯和相关化合物的消除反应,2-氨基环己醇的脱氨,非环状和环状分子的消除与取代竞争以及邻基参与反应。
非水系钠电池是下一代电化学储能装置的理想候选者。然而,尽管其在室温下性能表现良好,但它们在低温(如 < 0 °C)下的操作会受到电解质电阻增加和固体电解质界面 (SEI) 不稳定性增加的不利影响。在此,为了解决这些问题,我们提出了特定的电解质配方,其中包括线性和环状醚基溶剂以及三氟甲磺酸钠盐,它们在低至 -150 °C 的温度下仍具有热稳定性,并能够在低温下形成稳定的 SEI。在 Na||Na 纽扣电池配置中测试时,低温电解质可实现低至 -80 °C 的长期循环。通过原位物理化学(例如 X 射线光电子能谱、低温透射电子显微镜和原子力显微镜)电极测量和密度泛函理论计算,我们研究了高效低温电化学性能的机制。我们还报告了在 -20°C 和 -60°C 之间对完整的 Na||Na 3 V 2 (PO 4 ) 3 纽扣电池的组装和测试。在 -40°C 下测试的电池显示初始放电容量为 68 mAh g -1,在 22 mA g -1 下经过 100 次循环后容量保持率约为 94%。
摘要:可逆的氧化物细胞(RSOC)以燃料和化学物质的形式在电能和化学能之间具有有效的环状转化,从而为长期和高容量能量存储提供了途径。在研究中,氢,甲烷和氨的不同燃料中,作为碳中性能量载体引起了极大的关注。在这里,我们比较了基于这三种燃料的能源效率和RSOC的能量需求。在燃料电池运营方式(能源产生)中,甲烷和氨都考虑了两种不同的途径。路线1和2分别涉及内部改革(对于甲烷)或破裂(对于氨)和外部改革或破裂。使用氢作为燃料的使用提供了最高的往返效率(62.1%),其次是甲烷,然后是甲烷,乘以1号公路(43.4%),氨(41.1%)(41.1%),乘以2(40.4%)的甲烷,以及以1(39.2%)为单位的氨(40.4%)。内部氨开裂的较低效率与外部对应物相反,可以归因于最先进的燃料电极材料的催化活性和稳定性,这是该技术规模的主要障碍。初步的成本估算表明,以SOEC模式产生的氢,甲烷和氨的价格分别为〜1.91、3.63和0.48 $/kg。在SOFC模式下,使用氢,内部改良的甲烷和内部破裂的氨的发电成本分别为〜52.34、46.30和47.11 $/MWH。