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World File Search System环肽
细菌膜脂蛋白肽酶的环状肽抑制剂的计算设计
摘要：对抗多药革兰氏阴性细菌的新抗生素仍然存在至关重要的需求，这是一种继续影响死亡率的主要全球威胁。脂蛋白信号肽酶II是革兰氏阴性细菌的脂蛋白生物合成途径中必不可少的酶，使其成为发现抗菌药物发现的有吸引力的靶标。尽管已经鉴定出了LSPA的天然抑制剂，例如环状双肽球霉素，稳定性和生产困难限制了它们在临床环境中的使用。我们利用计算设计生成球霉素的稳定的新循环肽类似物。只需要合成和测试12种肽，以产生有效的抑制剂，避免准备大型图书馆和筛选运动。在针对Eskape-E病原体的微稀释测定中，最有效的类似物比球霉素表现出比球霉素相比或更好的抗菌活性。这项工作将计算设计作为对抗抗生素耐药性的一般策略。
Siminar_selmi的Lazardine -MRM
2013年，Selmi博士从Modena和Reggio Emilia大学获得了分子和再生医学博士学位，重点是表征癌细胞系中TIS11蛋白家族在转录后调控的致癌mRNA。 2014年，Selmi博士移居英国剑桥大学，加入Michaela Frye的实验室，并在RNA修改的（重新）新兴领域工作。 在那里，Selmi博士的团队制作了全转录组的单核苷酸分辨率，依赖NSUN6依赖性5-甲基环肽（M5C），并研究了M5C和腺苷脱氨酸对转录倍率失误和密码元对人胚胎干细胞中人类胚胎干细胞中的影响（Selmi，Hussain Nar Nar 202222222222222222222222222222222222222222222222222122221222222222222EMTRICT和CODON deamination; 2019年，Selmi博士加入了Horizon Discovery在英国剑桥的创新团队，参与开发模块化CRISPR基础编辑器进行精确基因组编辑（Collantes JC，The CRISPR Journal 2021）。 2021年初，Selmi博士加入了Consiglio Nazionale Delle Ricerche（CNR）的生物医学技术研究所。 在Selmi实验室中，研究重点介绍了两个主要领域：RNA修饰的研究及其对mRNA翻译的影响以及CRISPR基础编辑者的技术发展。 实验室结合了先进的基因组编辑和测序技术，以探索癌症和干细胞细胞模型中的新调节机制。2013年，Selmi博士从Modena和Reggio Emilia大学获得了分子和再生医学博士学位，重点是表征癌细胞系中TIS11蛋白家族在转录后调控的致癌mRNA。2014年，Selmi博士移居英国剑桥大学，加入Michaela Frye的实验室，并在RNA修改的（重新）新兴领域工作。 在那里，Selmi博士的团队制作了全转录组的单核苷酸分辨率，依赖NSUN6依赖性5-甲基环肽（M5C），并研究了M5C和腺苷脱氨酸对转录倍率失误和密码元对人胚胎干细胞中人类胚胎干细胞中的影响（Selmi，Hussain Nar Nar 202222222222222222222222222222222222222222222222222122221222222222222EMTRICT和CODON deamination; 2019年，Selmi博士加入了Horizon Discovery在英国剑桥的创新团队，参与开发模块化CRISPR基础编辑器进行精确基因组编辑（Collantes JC，The CRISPR Journal 2021）。 2021年初，Selmi博士加入了Consiglio Nazionale Delle Ricerche（CNR）的生物医学技术研究所。 在Selmi实验室中，研究重点介绍了两个主要领域：RNA修饰的研究及其对mRNA翻译的影响以及CRISPR基础编辑者的技术发展。 实验室结合了先进的基因组编辑和测序技术，以探索癌症和干细胞细胞模型中的新调节机制。2014年，Selmi博士移居英国剑桥大学，加入Michaela Frye的实验室，并在RNA修改的（重新）新兴领域工作。在那里，Selmi博士的团队制作了全转录组的单核苷酸分辨率，依赖NSUN6依赖性5-甲基环肽（M5C），并研究了M5C和腺苷脱氨酸对转录倍率失误和密码元对人胚胎干细胞中人类胚胎干细胞中的影响（Selmi，Hussain Nar Nar 202222222222222222222222222222222222222222222222222122221222222222222EMTRICT和CODON deamination;2019年，Selmi博士加入了Horizon Discovery在英国剑桥的创新团队，参与开发模块化CRISPR基础编辑器进行精确基因组编辑（Collantes JC，The CRISPR Journal 2021）。2021年初，Selmi博士加入了Consiglio Nazionale Delle Ricerche（CNR）的生物医学技术研究所。在Selmi实验室中，研究重点介绍了两个主要领域：RNA修饰的研究及其对mRNA翻译的影响以及CRISPR基础编辑者的技术发展。实验室结合了先进的基因组编辑和测序技术，以探索癌症和干细胞细胞模型中的新调节机制。
针对免疫肿瘤的针对CD137激动剂
摘要：CD137（4-1BB）是免疫细胞上的共刺激受体，而Nectin-4是一种细胞粘附分子，在多种肿瘤类型中过表达。使用一系列聚（乙二醇）（PEG）的接头，靶向CD137的合成双环肽与靶向Nectin-4的自行车结合。所得的双特异性分子是有效的CD137激动剂，它们需要表达蜜蜂-4的肿瘤细胞和表达CD137的免疫细胞以进行活性。通过探索化学构型，结合亲和力和药代动力学对CD137激动剂和抗肿瘤活性的影响，采用了多管齐下的方法来优化这些自行车肿瘤的免疫细胞激动剂。这项工作导致了BT7480的发现，在合成小鼠模型中引起了强大的CD137激动剂和最大抗肿瘤活性。使用具有高肿瘤渗透的低分子量，短作用分子的CD137激动剂的方法是诊所中尚未开发的路径，新兴数据表明，持续的靶标参与，生物学的特征，可能会导致亚疗法免疫反应。■简介
药物免疫毒性潜力的非临床评价
I. 引言 本指南旨在协助申办方对药品的免疫毒性潜力进行非临床评价。在本指南中，免疫毒性定义为非预期的免疫抑制或刺激（包括超敏反应），包括旨在作为免疫调节剂的药物的夸大药理学作用而产生的不良反应。2 本指南适用于药品，包括小分子药物和寡核苷酸，以及某些生物制品，如生物技术衍生的治疗性蛋白质（本文称为生物制药）。在本指南中，药品一词将用作涵盖所有这些产品类型的通用术语。细胞和基因疗法、佐剂疫苗和血液制品不属于本指南的讨论范围。一般而言，FDA 的指南文件并未规定具有法律强制执行力的责任。相反，指南描述了机构当前对某个主题的想法，除非引用了特定的监管或法定要求，否则应仅将其视为建议。机构指南中的“应该”一词的使用意味着建议或推荐某事，但不是要求。 II. 背景 免疫系统是一个复杂且受到严格监管的系统，涉及多个生物成分（例如，循环肽、蛋白质和细胞、组织驻留细胞以及
应用傅立叶变换红外光谱（...
抽象的傅立叶变换红外光谱（FTIR）是一种具有傅立叶变换的红外光谱，用于检测和分析光谱结果。此方法用于定性和定量分析波数范围14000 cm -1 –10 cm -1的有机和无机分子。基于这些波数，红外区域分为三个区域，即近红外，中红外和远红外。该方法中使用的工具是FTIR分光光度计，其工作原理基于能量与材料之间的相互作用。这种方法是快速，无损，简单的样品制备，易用性，使用少量溶剂，因此与其他HPLC和光谱方法相比，它在环保方面友好。但是，此方法中的采样空间相对较小，因此可以阻止红外线。使用的研究方法是来自2005 - 2023年期间出版年的20条研究文章的系统文献综述（SLR）。基于对阿莫西林，五氧环肽，环丙沙星，双氯氟乙烯酸钠，头孢曲松钠，ibuprofen，valsartan和cefadroxil化合物在药物中可以使用这种方法进行分析和有机化的构造的结果。根据印尼药典IV版，分析的所有化合物浓度符合内容要求，该版本不少于90％，不超过110％。
重症肌无力治疗进展
最新发现根据对照数据，对于计划在全身麻醉下进行手术的稳定性重症肌无力患者，无需术前静脉注射免疫球蛋白 (IVIg) 来预防重症肌无力危象。如果在新发重症肌无力患者中及早使用利妥昔单抗，即使没有免疫疗法，35% 的患者在 2 年内也能获得更快、更持久的缓解。本文讨论了决定利妥昔单抗反应性 AChR 阳性患者后续输注时机的生物标志物。大多数用利妥昔单抗治疗的 MuSK 阳性重症肌无力患者都获得了持续的长期缓解，并且 IgG4 抗 MuSK 抗体持续减少。扩展 REGAIN 研究中的 Eculizumb 显示出持续的长期药物缓解和减少的急性加重。三种新型生物药物在 II 期对照重症肌无力试验中显示出有希望的结果：Zilucoplan，一种抑制补体 C5 的皮下大环肽； Efgartigimod 是一种与新生儿 FcRn 受体结合的 IgG1 衍生 Fc 片段；Rozanolixizumab 是一种高亲和力抗 FcRn 单克隆抗体。最后，讨论了 COVID19 大流行期间持续进行的重症肌无力免疫疗法的安全性。
AAMA介导的基因组宽基因的表观遗传控制...
收到2022年12月4日； 2023年8月3日接受；出版于2023年8月17日作者隶属关系：1分子环境微生物学实验室，韩国首尔韩国环境科学与生态工程系，韩国共和国。*信件：Woojun Park，WPARK@韩国。AC。KR关键词：抗生素耐药性；生物膜； DNA甲基化；外排泵；表观遗传学；甲基转移酶。缩写：AR，抗生素耐药性； Azi，阿奇霉素； CCCP，羰基氰化物3-氯苯基氢气； Col，Colistin； Ery，红霉素； Etbr，溴化乙锭； Gen，庆大霉素； IPD，脉间持续时间； Kan，Kanamycin； 6mA，n -6-甲基丹宁； 4MC，n -4-甲基环肽； 5MC，5-甲基胞嘧啶； MEM，MeropeNem； MIC，最小抑制浓度； MTase，甲基转移酶；小睡，核苷相关蛋白；也不，诺福路吗？ OMV，外膜外囊泡； PMB，多粘蛋白B; rif，利福平； RM，限制修改； SEM，扫描电子显微镜； SMRT-SEQ，单分子实时测序； TF，转录因子； TMP，甲氧苄啶。†这些作者对此工作数据声明也同样贡献：本文或通过补充数据文件中提供了所有支持数据，代码和协议。本文的在线版本可以使用三个补充数据和六个补充表。001093©2023作者
BT5528，一种针对 EphA2 的自行车毒素结合物 (BTC)
Bicycles® 是一种新型治疗剂：通过化学支架约束的双环肽，具有结构稳定性，因此具有与抗体相当的高亲和力和选择性。Bicycles 体积小（1.5-3 kDa），可快速渗透和渗出组织。Bicycles 是完全合成的，可通过简单结合形成双环毒素结合物，从而实现细胞毒性有效载荷的靶向递送。Ephrin 受体 A2 (EphA2) 是 Ephrin 受体家族细胞间连接蛋白的成员，在多种实体瘤中高度过表达，与预后不良有关。尽管该靶点具有价值，但针对 EphA2 (MEDI-547) 的抗体药物结合物的临床开发在出现严重不良事件（包括出血和肝毒性）后停止（Annunziata 等人，2013 年）。使用专有噬菌体展示肽技术鉴定了 EphA2 的自行车结合物，该技术由高度多样化的自行车噬菌体库组成，与可裂解的连接体和毒素结合形成自行车毒素结合物 (BTC)。BTC 体积小，与其他靶向细胞毒性方法（如抗体-药物结合物）相比具有显著优势，因为它具有快速渗出、更好的肿瘤渗透性和肾脏消除性。我们根据体内功效、耐受性和类药物特性，从 75 多个 BTC 中选出了候选 BTC BT5528。
BT5528 是一种针对 EphA2 的自行车毒素结合物 (BTC)，在动物模型中具有强大的抗肿瘤活性，且不会引起出血或凝血异常
Bicycles® 是新型治疗剂：通过化学支架约束的双环肽具有结构稳定性，因此具有与抗体相当的高亲和力和选择性。Bicycles 体积小（1.5-3 kDa），可以快速渗透和渗出组织。Bicycles 是完全合成的，可以通过简单结合形成双环毒素结合物，从而实现细胞毒性有效载荷的靶向递送。Ephrin 受体 A2 (EphA2) 是 Ephrin 受体家族细胞间连接蛋白的成员，在多种实体瘤中高度过表达，与患者预后不良有关。这一特性使 EphA2 成为抗体疗法（包括抗体药物结合物 (ADC)）的一个有吸引力的药物靶点。一种这样的 ADC，MEDI-547，在临床前模型（Jackson 等人，2008 年）中表现出良好的疗效，并已进入临床试验阶段。如 Annuziata 等人 (2013) 所述，临床试验提前终止，因为在接受起始剂量的 6 名患者中 5 名发生了治疗相关的出血和凝血事件（出血相关，n=3；鼻出血，n=2）。在人类中观察到的出血和凝血事件与大鼠和猴子中出现的事件有一些相似之处。在这三个物种中，都报告了活化部分凝血活酶时间 (APTT) 增加和纤维蛋白 D-二聚体增加，同时肝功能参数（ALT、AST、ALP、血清白蛋白）发生变化。对猴子的毒理学研究发现弥漫性血管内凝血 (DIC) 是 DLT。在人类中观察到的事件被认为与临床前发现一致，尤其是 DIC 的观察结果。
2024-2025 研讨会摘要 - 化学
Thanh Do，分析化学 驯服离子赛道上的构象异质性 大约 85% 的人类蛋白质组无法通过传统的小分子进行治疗。潜在的药物必须足够大且足够灵活，才能与大的凹槽状结合位点结合，或结合在两种蛋白质的界面上。环孢菌素是一类 N-甲基化的大环肽，它挑战了基于结构药物设计的传统观点。尽管环孢菌素 A (CycA) 自 1983 年以来彻底改变了器官移植领域，但针对不同靶点设计类似药物的尝试均未成功，这表明在 N-甲基化的作用和构象异质性在环孢菌素化学中的功能方面存在知识差距。环孢菌素由于 N-甲基化而具有灵活性，每次顺式/反式酰胺异构化都会改变分子的构象和物理化学性质。 CycA 可以与多个靶标（目前已知两个）结合，结合状态不同，这表明结合状态取决于靶标。先前的研究表明，结合状态（与已知靶标）在溶液中以次要构象异构体的形式存在。这表明环孢菌素可能通过反向诱导契合模型与其靶标结合，其中配体改变其构象以适应结合位点。因此，环孢菌素可以结合的靶标数量可能与其可以采用的可能构象异构体数量成正比。因此，为了充分了解环孢菌素的生化特性，我的实验室致力于准确探测 CycA 和 CycA 类似物的主要和次要构象异构体，使用多种技术，包括实验（X 射线/中子晶体学、离子迁移质谱、2D-NMR、离子光谱）和计算方法。我们发现了一个由二价离子调节的复杂构象网络和动力学。