XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System珊瑚
与长期水族馆设施中的热带八放珊瑚相关的四种新型 Endozioicomonas 菌株的基因组序列
我们报告了从葡萄牙里斯本海洋馆 19 立方米热带展览水族馆中保存的两个 Litophy ton sp. 标本中分离出的四种 Endozoicomonas 菌株的基因组。如前所述 (2) 回收宿主衍生的微生物细胞悬浮液。将一克珊瑚组织在 9 mL 无菌 Ca 2+ - 和 Mg 2+ - 人工海水中均质化 (2)。将匀浆连续稀释，分别接种在 1:2 稀释的海洋琼脂和 1:10 稀释的 R2A 培养基上，并在 21°C 下孵育 4 周。使用 Wizard 基因组 DNA 纯化试剂盒 (Promega, USA) 从 1:2 海洋肉汤中新鲜生长的培养物中提取单个菌落的基因组 DNA。使用通用引物 (F27 和 R1492) 从基因组 DNA 中扩增 16S rRNA 基因，通过 Sanger 测序来确认纯度。使用 SILVA 比对、分类和树服务 (v1.2.12) 和数据库 (v138.1) 进行分类分配。使用 PacBio 测序技术 (5)，相同的基因组 DNA 样本在 DOE 联合基因组研究所 (JGI) 进行基因组测序。对于每个样本，将基因组 DNA 剪切至 6-10 kb，使用 SMRTbell Express Template Prep Kit 3.0 进行处理，并用 SMRTbell 清理珠 (PacBio) 进行纯化。使用条形码扩增寡核苷酸 (IDT) 和 SMRTbell gDNA 样本扩增试剂盒 (PacBio) 富集纯化产物。构建了 10 kb PacBio SMRTbell 文库，并使用 HiFi 化学在 PacBio Revio 系统上进行测序。使用 BBTools v.38.86 ( http://bbtools.jgi.doe.gov ) 根据 JGI 标准操作规范 (SOP) 协议 1061 对原始读段进行质量过滤。使用 Flye v2.8.3 (6) 组装过滤后的 >5 kb 读段。生物体和项目元数据存放在 Genomes OnLine 数据库中 (7)。使用 NCBI 原核基因组注释流程 (PGAP v.6.7) (8) 和 DOE-JGI 微生物基因组注释流程 (MGAP v.4) (9) 对重叠群进行注释，并与集成微生物基因组和微生物组系统 v7 (IMG/M) 相结合进行比较分析 (10)。使用 CheckM 评估基因组完整性和污染
与长期水族馆设施中的热带八放珊瑚相关的四种新型 Endozioicomonas 菌株的基因组序列
我们报告了从葡萄牙里斯本海洋馆 19 立方米热带展览水族馆中保存的两个 Litophy ton sp. 标本中分离出的四种 Endozoicomonas 菌株的基因组。如前所述 (2) 回收宿主衍生的微生物细胞悬浮液。将一克珊瑚组织在 9 mL 无菌 Ca 2+ - 和 Mg 2+ - 人工海水中均质化 (2)。将匀浆连续稀释，分别接种在 1:2 稀释的海洋琼脂和 1:10 稀释的 R2A 培养基上，并在 21°C 下孵育 4 周。使用 Wizard 基因组 DNA 纯化试剂盒 (Promega, USA) 从 1:2 海洋肉汤中新鲜生长的培养物中提取单个菌落的基因组 DNA。使用通用引物 (F27 和 R1492) 从基因组 DNA 中扩增 16S rRNA 基因，通过 Sanger 测序来确认纯度。使用 SILVA 比对、分类和树服务 (v1.2.12) 和数据库 (v138.1) 进行分类分配。使用 PacBio 测序技术 (5)，相同的基因组 DNA 样本在 DOE 联合基因组研究所 (JGI) 进行基因组测序。对于每个样本，将基因组 DNA 剪切至 6-10 kb，使用 SMRTbell Express Template Prep Kit 3.0 进行处理，并用 SMRTbell 清理珠 (PacBio) 进行纯化。使用条形码扩增寡核苷酸 (IDT) 和 SMRTbell gDNA 样本扩增试剂盒 (PacBio) 富集纯化产物。构建了 10 kb PacBio SMRTbell 文库，并使用 HiFi 化学在 PacBio Revio 系统上进行测序。使用 BBTools v.38.86 ( http://bbtools.jgi.doe.gov ) 根据 JGI 标准操作规范 (SOP) 协议 1061 对原始读段进行质量过滤。使用 Flye v2.8.3 (6) 组装过滤后的 >5 kb 读段。生物体和项目元数据存放在 Genomes OnLine 数据库中 (7)。使用 NCBI 原核基因组注释流程 (PGAP v.6.7) (8) 和 DOE-JGI 微生物基因组注释流程 (MGAP v.4) (9) 对重叠群进行注释，并与集成微生物基因组和微生物组系统 v7 (IMG/M) 相结合进行比较分析 (10)。使用 CheckM 评估基因组完整性和污染
鹿角珊瑚组织内内生菌的差异聚集模式
预印本（未经同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可不得重复使用。此版本的版权所有者于 2024 年 12 月 20 日发布。；https://doi.org/10.1101/2024.12.17.629048 doi：bioRxiv 预印本
第四次全球珊瑚白化事件
环境森林和气候变化部 (MoEF&CC) 下属的国家可持续沿海管理中心 (NCSCM) 正在开展珊瑚礁原位观测网络 (CReON) 计划，该计划侧重于长期珊瑚礁健康监测、钙化率和海洋酸化，基于在印度海岸沿线各个珊瑚礁地点部署数据浮标和自动气象站，包括安达曼和尼科巴群岛和拉克沙群岛。NCSCM 按照 2011 年和 2019 年的沿海管制区通知 (CRZ) 绘制了印度 1439 平方公里的珊瑚礁地图。最近，NCSCM 向环境森林和气候变化部提交了一份提案，要求绘制拉克沙群岛的珊瑚生物多样性地图，以确定国家沿海任务下拉克沙群岛珊瑚礁的当前范围和状况（健康状况）。
庞帕诺比奇市上诉人诉珊瑚岩......
原告是开发商，他们声称市政府违反了第 760.26 条，因为他们的经济适用房联排别墅项目基于其资金来源（经济适用房融资）而受到歧视。通过第三次修改后的投诉，开发商根据该法案第 760.35(4) 条寻求对市政府的补救措施，包括宣告性救济、禁令性救济、损害赔偿以及律师费和费用。请参阅佛罗里达州法令（2021 年）第 760.35(4) 条。市政府提出驳回申诉，称主权豁免保护市政府免受开发商的索赔。审判法院驳回了动议，没有给出任何解释。
海葵：珊瑚共生研究的模型系统
热带珊瑚礁是世界上最多样化和最具生产力的生态系统之一，支持着一系列生态系统产品和服务，为数百万人的福祉做出贡献。然而，由于当地和全球的人为影响，全球珊瑚礁覆盖率正在下降（ Wilkinson，1999 ）。特别是，全球气候变化导致的大规模白化事件的频率和严重程度预计在未来会进一步增加，并威胁到珊瑚礁的长期生存（ Hughes 等人，2017 ）。这种海洋生态系统的营养和结构基础依赖于石珊瑚和它们相关的微生物共生体（光合甲藻、细菌、古菌等）之间的互利关系，形成一种称为珊瑚全生物的元生物（ Ste ́ venne 等人，2021 ）。尽管人们对珊瑚全生物功能的分子基础有了越来越多的了解，但我们的知识仍然存在重大空白。如果我们要充分了解珊瑚宿主与其微生物共生体之间建立和维持相互作用的潜在基本过程，以及珊瑚是否或如何适应环境干扰并生存下来，就必须揭示珊瑚宿主与其微生物共生体之间相互作用的建立和维持的潜在基本过程。模型生物的使用有着成功的记录，并在分子、细胞和发育生物学方面取得了重大进展（ Jacobovitz 等人，2023 年）。模型生物 Aiptasia，即 Exaiptasia diaphana，是一种小型海葵，遍布亚热带和热带海洋水域，细胞内寄生着共生的甲藻（科：Symbiodiniaceae）（ LaJeunesse 等人，2018 年）。与珊瑚不同，海葵没有碳酸钙骨架，可以在实验室条件下轻松操作和培养，并且可以在兼性共生状态下生存，这允许在非共生对照动物上进行实验（Matthews 等人，2016 年）。自 2008 年正式提出将其作为研究刺胞动物共生的模型系统以来（Weis 等人，2008 年）。越来越多的实验室采用海葵来探索以下研究问题：发育和
UOG科学家发现软珊瑚中气候变化弹性的基因
软珊瑚珊瑚礁生态系统的作用越来越受海洋温度，海洋酸性和污染的威胁。高温破坏了珊瑚与它们的共生藻类伴侣之间的关系，导致珊瑚漂白，而较低的pH却削弱了珊瑚骨骼，从而危害了它们的生存。石质珊瑚构成了珊瑚礁的结构基础，但软珊瑚（称为八焦）对于生态平衡至关重要，有助于生物多样性，栖息地供应，营养循环和礁石的韧性。
世界珊瑚礁的地位：2025
•网络的300多名成员贡献了数据。•从1978年到2019年跨越的全球数据集•来自全球73个礁石国家的12,000多个地点的近200万个观察结果。•从2008年至2019年全球珊瑚礁中的活珊瑚珊瑚实时珊瑚的全球减少14％
国家珊瑚礁弹性战略2025至2040
珊瑚礁是最多样化，最有价值的生态系统之一，支持800多种硬珊瑚91种，超过1,200种软珊瑚种，6,000种鱼类和数百种其他类型的海洋92生物（Knowlton等人，2010; Burke等。2011; Brandl等。2018）。在所有海洋93生命中，近25％的生命取决于珊瑚礁在生命周期中的某个时刻（Spalding等人2001）。健康，多样化的94个珊瑚礁需要支持生态系统服务，例如渔业，旅游，沿海保护和95种文化联系（Barlow等人2018）。例如，仅在旅游业和商业捕鱼行业中，美国珊瑚礁估计贡献了10.44亿美元，总经济价值为31亿美元97（Brander and van Beukeering 2013）。从珊瑚礁中获得新的和未来的药物98的潜力，珊瑚礁结构是重要的自然基础设施，为99个脆弱的海岸线提供了缓冲，并从波浪，风暴和洪水中减轻能量（Brucknor 2002; Ferrario et 100 al。2014）。101
国际珊瑚礁倡议（ICRI）
Theme 1 - Preparing for the Future: Promoting Resilient Coral Reefs Theme 2 - Coral Reef Science and Oceanography: Advancing and Utilizing the Latest Science and Technology Theme 3 - Local Threat Reduction: Integrating Response Planning Frameworks Theme 4 - Diversity and Inclusion: Expanding the Coral Reef Community Answer: Theme 1: Preparing for the Future: Promoting Resilient Coral Reefs Mote Marine Laboratory's Coral Reef Research & Restoration initiatives support numerous跨多个学科工作的科学家扭转了数十年的生态系统衰落，为世界各地的珊瑚礁带来了新的生命和新希望。MOTE努力的指导原则包括纳入促进人口和社区层面的韧性的机制。通常，珊瑚礁恢复工作集中在人口上。MOTE科学家正在积极评估多物种的常见园林恢复方法，这些方法利用了由规范性遗传管理计划引导的多种物种的弹性种群，以确保遗传，人口，社区和元社区水平的丰富性和均匀性。此外，Mote综合了非库物种，其生态功能（例如放牧者）直接和/或间接促进了珊瑚的生长，生存和募集。在人口水平上，我们研究并促进了对诸如传染病，高水温和海洋酸化过程等主要威胁具有抵抗力的珊瑚基因型的融合。最后，Mote是这些抗性基因在恢复育雏库中广泛分布，在区域珊瑚和生产设施中代表，并在Mote的国际珊瑚基因库中存档，但也被用作下一代的父母，以融入珊瑚中的潜在可遗传的弹性特征。我们在Mote的水产养殖研究公园创建了有史以来第一个加勒比国王螃蟹孵化场，该园区将允许生产这种本地的草食动物，该生物将与珊瑚季节一起存放在退化的礁石上。放养后，这些放牧者大大减少了藻类的覆盖，导致底栖群落促进了更丰富，更丰富的鱼类群落，增加了珊瑚灭绝剂的生存，并为自然的珊瑚募集提供了合适的栖息地。