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World File Search System生态型
有益的微生物和水胁迫影响质检查Quercus ilex幼苗对phytophthora cinnamomi rands
摘要：影响Holm Oak的根腐是伊比利亚半岛高生态和经济损失的原因，强调了发展疾病控制方法的相关性。这项工作的目的是评估由有益的生物（Trichoderma Complex，T-Complex）组成的生物处理的作用，对在两个对比的Holm Oak Ecotyp中感染的Holm Oak幼苗感染了phytophthora cinnamomi，一种被认为是高度易于耐受的霍尔姆oak oak Ecotyp，一种被认为是耐受性的（hu）和另一种被认为是耐受性的。为此，在温室中进行了完整的多因素测试，并监测幼苗以进行生存分析以及形态和生理属性评估。死亡率始于易感性（HU），而不是在耐受性（GR）生态型中，并且由于植物的生态型，生存率显示出不同的趋势。耐受性生态型显示出高生存率和对利用微生物治疗的更好反应。glm表明，治疗之间差异的主要原因是生态型，其次是T-复合和灌溉，并且发现生态型和肉桂疟原虫之间存在弱相互作用。光合作用（a）与蒸腾（TR）之间的线性关系显示，在DR型条件下，在DR型条件下，感染和接种植物的A/TR速率增加。受益的微生物治疗对耐受性生态型的影响更大。对Q的遗传多样性的理解和水应力对生物处理对根腐病的有效性的影响提供了有用的信息，以开发环保疾病控制方法来解决Holm Oak的下降。
用于稳定钠和锂离子电池的介孔分层氧化铁/RGO复合材料的合成
一所化学与化学工程学院，武汉纺织大学，江克萨斯阳光大道1号，武汉430200，中国B河北纤维纤维和生态型纤维及生态型和生态实验室，武汉大学，武汉大学，乌汉尼大学1号，韦恩·阿维（Wuhan Aveny），韦恩（Jiangxia Dong Chuan Road No. 800, Shanghai 200240, China d School of Materials Science and Engineering, Nanyang Technological University, 639798 Singapore e Singapore-HUJ Alliance for Research and Enterprise, NEW-CREATE Phase II, Campus for Research Excellence and Technological Enterprise (CREATE), 138602 Singapore f Energy Research Institute@NTU, ERI@N, Interdisciplinary Graduate School, Nanyang Technological大学，639798新加坡一所化学与化学工程学院，武汉纺织大学，江克萨斯阳光大道1号，武汉430200，中国B河北纤维纤维和生态型纤维及生态型和生态实验室，武汉大学，武汉大学，乌汉尼大学1号，韦恩·阿维（Wuhan Aveny），韦恩（Jiangxia Dong Chuan Road No.800, Shanghai 200240, China d School of Materials Science and Engineering, Nanyang Technological University, 639798 Singapore e Singapore-HUJ Alliance for Research and Enterprise, NEW-CREATE Phase II, Campus for Research Excellence and Technological Enterprise (CREATE), 138602 Singapore f Energy Research Institute@NTU, ERI@N, Interdisciplinary Graduate School, Nanyang Technological大学，639798新加坡
染色体规模的基因组组装，粗糙的littorina saxatilis
潮间带腹足动物Littorina saxatilis是研究物种形成和局部适应的模型系统。反复出现的不同生态型表现出不同水平的遗传差异使得萨克萨蒂利乳杆菌特别适合研究相同谱系中形成连续性的不同阶段。一个主要发现是存在与生态型差异相关的几种大染色体反转，并且该物种提供了一种系统来研究反演在这种差异中的作用的系统。萨克萨蒂利乳杆菌的基因组为1.35 GB，由17个染色体组成。该物种的第一个参考基因组是使用Illumina数据组装的，高度碎片（N50的44 kb），非常不完整，Metazoan数据集的BUSCO完整性为80.1％。一个全同胞家族的连锁图将587 MBP的基因组的放置放在17个连锁基团中，与单倍体数量相对应，但该参考基因组的分散性质限制了对divergent选择和在生态型形成过程中的相互作用的理解。在这里，我们提出了一个新生成的参考基因组，该基因组高度连续，n50为67 Mb，占总组装长度的90.4％，占17个超级折叠术。它也高度完成了BUSCO的完整性，占后生数据集的94.1％。此新参考将允许研究与生态型形成有关的基因组区域，并更好地表征反转及其在物种物种中的作用。
Cogent 2000
Cui J等。 （2023）从头开始的全长转录组分析，对澳大利亚刑事类的两种生态型（Swamp Reed和Dune Reed）提供了对沙丘芦苇的转录组复杂性及其对沙漠环境的长期适应性的新见解。 BMC基因组学，24（1），180。Cui J等。（2023）从头开始的全长转录组分析，对澳大利亚刑事类的两种生态型（Swamp Reed和Dune Reed）提供了对沙丘芦苇的转录组复杂性及其对沙漠环境的长期适应性的新见解。BMC基因组学，24（1），180。
十二个假定的染色体倒位耦合对蜗牛生态型之间的基因流动形成了强大的障碍
染色体重排可导致生殖障碍的耦合，但它们是否以及如何促成物种形成的完成仍不清楚。 Littorina 属的海洋蜗牛反复在分离多个倒位排列的种群之间形成杂交区，为研究它们的屏障效应提供了机会。在这里，我们分析了适应瑞典岛屿不同海浪暴露条件的两种生态型 Littorina fabalis（“大”和“矮”）之间的杂交区中的 2 条相邻横断面。应用全基因组测序，我们发现 17 条染色体中的 9 条有 12 个推定的倒位。其中 9 个推定的倒位在两个生态型之间达到近乎差异固定，并且都处于强烈的连锁不平衡状态。这些倒位覆盖了 20% 的基因组，并携带 93% 的不同单核苷酸多态性 (SNP)。两个横断面的双峰杂交区表明，两种生态型的 Littorina fabalis 在接触后仍保持其遗传和表型完整性。双峰性反映了倒位趋势之间的强耦合和屏障效应在整个基因组中的扩展。人口统计学推断表明，耦合发生在异地时期，并在二次接触后维持了 1,000 代以上。总体而言，这项研究表明，多个染色体倒位的耦合导致了强烈的生殖隔离。值得注意的是，2 个假定的倒位与与近亲物种（Littorina saxatilis）的生态型差异相关的倒置基因组区域重叠，这表明具有相似结构变体的相同区域反复促进了不同物种的生态型进化。
留栖和迁徙三刺鱼（Gasterosteus aculeatus）的发育
三刺鱼 (Gasterosteus aculeatus) 是一种硬骨鱼，是进化生态学的模型生物，可用于实验室实验和自然实验。它因形态、行为和遗传学的巨大种内变异而受到特别重视。Swarup (1958) 的经典著作描述了单个淡水种群胚胎在实验室中的发育，但此次实验是在比许多刺鱼在野外会遇到的温度更高的温度下进行的，并且没有研究种群之间的变异。这里我们描述了两种来自苏格兰北尤伊斯特岛的同域咸水生态型刺鱼胚胎的发育情况，它们在 14˚C 的温度下长大，这大约是北尤伊斯特岛湖泊在繁殖季节的温度。这两种生态型分别是 (a) 一种大型的迁徙型，成年鱼全身覆盖着骨质盔甲；(b) 一种体型较小、盔甲较浅的型，常年居住在咸水泻湖中。通过在受精后每 24 小时监测一次胚胎，观察并拍摄了重要的发育特征，为北尤伊斯特岛生态型在此温度下的发育提供参考。孵化成功率超过 85%，定居和迁徙棘鱼之间没有差异，但迁徙卵的孵化时间明显早于定居生态型。我们的工作提供了一个框架，现在可用于比较可能在不同环境条件下生长的棘鱼种群，以帮助了解正常发育特征的广度并描述异常发育。
差异和基因流历史记录在长期延伸的海马
染色体反演可以通过在进化谱系之间建立和维持不同的等位基因组合来在差异和生殖隔离中发挥重要作用。另外，他们可以采取平衡多态性的形式，这些形式在人群中隔离，直到一个排列变得固定为止。关于反演多态性如何出现，长期保持它们的维持方式以及最终是否以及它们如何贡献物种的许多问题。长长的海马（海马guttulatus）在遗传上细分为地理谱系和海洋泻湖生态型，具有共享的结构变化谱系和生态型差异。在这里，我们旨在表征结构变体并重建其历史并怀疑在生态型形成中的作用。，我们通过分析来自大西洋，地中海和黑海种群的112个整体基因组序列，生成了近乎染色体水平的基因组组装，并描述了多样性和差异的基因组宽模式。还通过分析链接的读取测序数据，我们发现了两个染色体反转的证据，这些染色体倒数长度是多个巨蛋，并显示了整个物种范围内谱系和生态型之间的对比等位基因频率模式。我们揭示了这些反转代表古老的种内多态性，一种可能是通过不同的选择来维持的，而另一种则由伪过度污染。缺乏特定的单倍型组合和两种复制反转之间的假定功能相互作用，进一步支持了两个反转之间的选择性耦合。最后，我们检测到两个反转的倒数等位基因之间的差异差异，可能会影响其动力学和对差异和物种形成的贡献。
遗传性特征的 - 选择 - ethiopian- ...
摘要：改善埃塞俄比亚的当地鸡肉生产将是实现“零饥饿”，粮食安全和可持续性的优先事项。鸡提供了可以满足人类需求的蛋白质的极好来源。埃塞俄比亚的土著鸡没有选择并改善，因此它们的生产力和生殖性能较低。本研究旨在使用16个SSR标记研究三种埃塞俄比亚本地鸡肉生态型的遗传多样性和种群结构，并将Koekoek品种用作比较。总共检测到97个等位基因，平均值为6.062个等位基因。多态信息内容范围从（0.54）MCW0183到（0.85）LEI0166，平均值为每个位点0.67。在所有研究的人群中，平均观察到的杂合性和预期的杂合性分别为0.026和0.60。Shannon信息索引从（i = 0.83）MCW 0098到（i = 1.57）LEI0166不等。Amova表明，个体内部的遗传差异差异3％，人群中的82％，品种之间的差异为15％。根据UPGMA的说法，Horro和Tilili人群被分组，而Jarso人口则是不同的，而Koekoek的品种则如预期的那样与众不同。研究的人群在人群中显示出较高的遗传多样性，而JARSO生态型显示出最高的遗传多样性和许多独特的等位基因。这一发现中使用的SSR标记是多态性的，可用于确定埃塞俄比亚本地鸡肉生态型的遗传变异。获得的信息将用于遗传保护和国家育种计划工作。
固定后时间的影响
摘要我们分析了迄今为止收集的结核分枝杆菌复合物（MTBC）的最多样化基因组数据集的泛基因组和基因含量调节。MTBC的封闭泛基因组的特征是辅助和特异性基因组的降低，与其克隆性质兼容。然而，随着MTBC基因组的系统发育距离的增加，共享基因家族大大少得多。这种效应仅在种间比较中观察到，而不是SPE内部的CIE，这表明物种特异性的生态特征与基因含量的变化有关。基因丢失是由于基因组缺失和伪源性元素引起的，可驱动基因含量的变异。MTBC物种和谱系之间的这种基因侵蚀也有所不同，即使在结核分枝杆菌中，L2的基因损失比L4更大。我们还表明，系统发育近端并不总是与MTBC中基因含量相关性的良好替代性，因为MyCobacte Rium Africanum L6的基因曲目偏离了其预期的系统发育生物的保守主义。以伪元注释代表的毒力因子的基因破坏大多不是保守的，是MTBC生态型的预测因素。每个MTBC生态型都具有自己的附件基因组，可能受宿主和地理等不同选择压力的影响。重要的是研究基因丧失如何赋予MTBC菌株的新适应性特征。检测到的异质基因损失在阐明负责MTBC中观察到的各种表型的遗传因素方面构成了重大挑战。通过详细介绍特定的基因损失，我们的研究是研究MTBC表型及其免疫逃避策略的研究人员的资源。
