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第56届中西部学生生物医学研究论坛
背景，意义和假设：沙眼衣原体（CTR）是一种强制性细胞内病原体，是细菌性传播感染（STI）的主要原因。尽管通常无症状，但感染可能会发展为上等生殖道，并可能导致严重的生殖健康后遗症，例如骨盆炎性疾病，异位妊娠，甚至不育（如果未经治疗）。全国有160万例案件，直接终身费用超过6.9亿美元，CTR被认为是主要的公共卫生负担。一些人自发清除感染，这些感染归因于宿主的适应性免疫。然而，研究还表明，感染可能会持续存在，并重新感染表明长期保护性免疫充其量是部分部分。尽管对CTR感染的适应性免疫反应已充分表征，但主动感染如何影响宿主的先天免疫力，尤其是在CTR-上皮界面上仍未开发。此外，通常会忽略存在未感染的旁观者细胞的宫颈上皮感染期间宿主反应的表征，而不是使用完全感染的上皮单层感染模型，其中在单个时间点感染后在单个时间点收集样品。这进一步强调了在感染过程中调查跨多个时间点的宿主反应的需求，这可能对CTR存活和扩散有影响。宫颈上皮位于CTR -HOST相互作用的中心，因为它是感染的主要部位。可溶性因子在内，包括干扰素（IFN）在感染微环境中产生丰富的。上皮相关的IFN（例如IFNβ和IFNλ）以自分泌和旁分泌方式通过JAK-STAT途径驱动IFN刺激的基因（ISGS）的表达。由于大多数ISG是推定的抗菌剂，因此累积上皮反应通常是抗菌剂，有助于病原体限制。因此，感染上皮细胞中的细胞因子信号传导通常是颠覆病原体的目标。我们最近表明，CTR可以抑制完全感染的上皮单层的上皮IFN反应。这与该领域所谓的CTR上皮宿主免疫生物学相反，通常被视为促炎性。为了调和观察到的减毒上皮IFN与当前炎症性CTR上皮相互作用的概念，我们假设旁观者细胞对于塑造细胞因子环境至关重要，并且在塑造上皮IFN反应的失调可能对CTRENSINCAINS产生导致的影响。
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背景，意义和假设：结直肠癌（CRC）是美国与癌症相关死亡的第二大原因。（Siegel Rl。等，CA Cancer J Clin。，2024年）约43％的CRC病例涉及KRAS突变，该突变激活RAS/MAPK途径，并且与野生型KRAS相比，它与预后明显较差。（McCall，J。L.等，分子和细胞生物学，2016年）。通过RAF/MEK/ERK支架蛋白的信号传导，KSR1在CRC肿瘤的起始，化学耐药性和上皮 - 间质转变（EMT）中至关重要。对EMT相关转录本翻译的事先分析表明，上皮基质相互作用1（EPSTI1）在CRC细胞中优先以KSR1依赖性方式翻译，并且EPSTI1是必不可少的，并且足以且足以促进N-钙粘蛋白转换，在促进肿瘤细胞迁移和入侵中起关键作用。KSR1驱动TIC形成的机制促进了TICS向DTP的过渡并调节对下游效应子（例如EPSTI1）的转录后控制，尚不清楚。对RAS突变的CRC细胞中KSR1调节的RNA剪接和下游效应子的全面理解可能揭示出治疗性剥削的新脆弱性。我们假设KSR1通过调节RNA结合蛋白来控制RNA剪接，这是驱动CRC中EMT必不可少的机制。KSR1的丧失有望引发RNA轮廓的广泛变化，阐明了先前未识别的调节剂以及替代剪接的途径，燃料结直肠癌发病机理。
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实验设计：每周注射胸腔炎的关节炎（n = 5/组）5周，包括：1）25μg/ml未修饰的波形蛋白（VIM），2）25μg/ml的VIM-MAA，或3）相等的盐水（附加盐水）。小鼠在第六周被牺牲。使用抗MAA，抗CIT和抗VIM抗体，切除肺组织，用毛状组（用于总胶原沉积）或免疫组织化学（IHC）或免疫组织化学（IHC）嵌入，切片和染色。 解离的肺组织通过流式细胞仪进行了分析，以表征免疫细胞浸润。 使用半定量评分评估小鼠进行关节炎的发育，该评分结合了爪子肿胀和发红。 使用Tukey的多重比较测试的单向方差分析进行统计分析。肺组织，用毛状组（用于总胶原沉积）或免疫组织化学（IHC）或免疫组织化学（IHC）嵌入，切片和染色。解离的肺组织通过流式细胞仪进行了分析，以表征免疫细胞浸润。小鼠进行关节炎的发育，该评分结合了爪子肿胀和发红。使用Tukey的多重比较测试的单向方差分析进行统计分析。
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Background, Significance, Hypothesis: C. trachomatis (Ctr) is an obligate intracellular pathogen that employs several strategies to evade host immune responses while replicating within permissive cell types, such as epithelial cells.在保护性膜结合的液泡中被划分为隔离层被称为包含，被称为包含，以隔离衣原体病原体相关的分子模式（PAMP），并修饰其脂多糖（LPS）（LPS）通过各种病原体识别受体（PRR）来防止检测。病原体识别的新范式暗示了病原体诱导的误差（感染不忠），负责激活PRR。例如，释放细胞内病原体相关的分子模式（PAMP），例如核酸，环状二核苷酸，肽聚糖（PG）成分等。只有在细菌膜完整性因生化过程失调而损害时才会发生。我们提出转录失调可能是一种感染的形式，当表达不当时，某些蛋白质能够触发病原体识别。宿主 - 病原关系的一个有趣的方面是，在铁饥饿或氨基酸限制中遭受压力，这两个实体都会从两个实体中产生反应以改变权力平衡。在铁饥饿的情况下，同时影响宿主和病原体的铁饥饿，通过诱导代谢误差来削弱后者，并通过增强对这些病原体错误的认识来增强前者。
第56届中西部学生生物医学研究论坛
鉴定沙利度胺，多纳拉替胺和莫利度胺作为脑（CRBN）粘合剂刺激了促蛋白水解靶向嵌合体（Protacs）的发展。带有CRBN结合部分的PROTAC是与CRBN形成三元复合物的异功能分子，它募集了CUL4-DDB1泛素连接酶蛋白蛋白复合物和感兴趣的蛋白质（POI），并靶向其降解。尽管进行了许多持续的努力，但基于结构的Protac设计仍然难以捉摸。当前的方法依赖于Protac库的合成并以所选测定格式筛选库来识别可行的命中，这可能是耗时的和资源密集的，强调了对更有效的筛选方法的需求。为了应对这一挑战，我们假设使用HCT116野生型（WT）POI敲除（POI - / - ）和CRBN敲除（CRBN - / - ）细胞的基于生存力的表型筛选系统将能够快速识别POI和CRBN依赖性方式以POI和CRBN依赖性方式显示活性。在这项研究中，我们选择了MAP3K1（一种致癌信号激活剂），作为我们的POI并使用各种接头将ATP竞争力的MAP3K1抑制剂与Thalidomide共轭，以生成库。使用上述WT，MAP3K1 - / - 和CRBN - / - 单元线对库进行3天的生存能力屏幕。屏幕将50-008识别为有选择性抑制WT细胞的生存能力而不是MAP3K1 - / - 或CRBN - / - 细胞的命中。50-008在结直肠癌细胞系和类器官模型中进行了化学验证，从而产生了影响CRBN结合，MAP3K1结合或接头的单个变化。随访研究表明，50-008抑制了癌细胞的增殖，诱导凋亡，并以CRBN和MAP3K1依赖性方式抑制了S期细胞周期停滞。此外，在约900个癌细胞系中，在50-008的混合物（PRISM）筛选中同时进行了相对抑制，鉴定出267个敏感的癌细胞系（IC 50 <0.1 µM），包括腔内B乳腺癌细胞系T47D和131个抗性癌细胞系（IC 50> 10 µM）。在T47D细胞中的机理研究表明，50-008降解MAP3K1并调节关键下游效应子（例如ERK和IKKβ）的激活。总而言之，我们的表型筛选系统，我们确定并验证了50-008是一种有效的MAP3K1靶向Protac，具有多种癌症模型的选择性活性。这种方法建立了一种快速可靠的管道，用于识别功能性protac，同时验证其细胞特异性和作用机理。我们的发现不仅为未来的Protac开发提供了验证的筛选平台，而且还为靶向MAP3K1依赖性癌症提供了治疗潜力。
肌腱病和肌病 - 生物医学
肌腱病和肌病是影响大量个体的普遍肌肉骨骼疾病。理解肌腱病和肌病的新发展强调了对各种生物标志物，microRNA，LNCRNA和细胞反应的认可，这些反应涉及其发展。高级技术现在可以对组织血管，回声和弹性进行定量评估，从而提供详细而精确的数据，从而增强我们对各种疾病过程的理解。此外，即将进行的治疗方法包括干细胞，外泌体，生物材料和纳米材料。这个特刊“肌腱病和肌病”突出了肌腱病和肌病的发病机理，诊断和治疗的进展。我们邀请全世界的专家提交有关此主题的最新研究。原始文章和评论都是同样受到欢迎的贡献。
在2003 - 2004年发表的非常引用的生物医学论文的出处和资金
此预印本版的版权持有人于2025年3月5日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.03.02.25323201 doi：medrxiv preprint
可访问，可再现和协作生物医学分析的星系平台：2018 Update
星系（主页：https：//galaxyproject.org，主要公共服务器：https：//usegalaxy.org）是一个基于Web的科学分析平台，该平台由全球科学家的数十种科学家使用，全世界的科学家都在全球范围内进行了大型生物媒体数据集，例如在基因组学中分析的大型生物学数据集中，并且是基因组学，protolomics和potsoic of potsololomics and Impecol＆Metsoil of Impecol of Metsoil of Metimol of nevem of nevimol of。始于2005年，Galaxy继续专注于数据驱动的生物医学科学的三个主要挑战：所有研究人员都可以访问分析的分析，对分析的分析是完全可重现的，并且可以简单地进行分析，以便可以重复使用并扩展它们。在过去的两年中，Galaxy团队和Galaxy周围的开源社区已为Galaxy的核心框架，用户互间，工具和培训材料做出了实质性的证明。框架和用户界面改进现在使Galaxy可以用于分析数以万计的数据集，并且现在可以从Galaxy工具设置中获得> 5500个工具。Galaxy Community努力创建众多针对常见类型的基因组分析类型的高质量教程。Galaxy De-Veloper和用户社区继续增长，并且是Galaxy的开发不可或缺的一部分。星系公共服务器的数量，开发人员为
生物医学
生物医学（ISSN 2227-9059）是一个开放访问期刊，该期刊致力于针对人类健康和疾病研究的各个方面，新的治疗靶标，治疗策略的发现和表征以及对自然驱动的生物医学，药物，药物和生物药物的研究。Topics include pathogenesis mechanisms of diseases, translational medical research, biomaterial in biomedical research, natural bioactive molecules, biologics, vaccines, gene therapies, cell-based therapies, targeted specific antibodies, recombinant therapeutic proteins, nanobiotechnology driven products, targeted therapy, bioimaging, biosensors, biomarkers, and生物仿制药。该期刊开放供基础科学和临床前研究级别进行的研究发表。我们邀请您考虑将您的工作提交生物医学，无论是原始研究，审查文章还是开发当前关键主题的特殊问题。
博士后研究奖学金（PDF）位于IIT海得拉巴生物医学工程系的再生医学和干细胞（RMS）实验室。
邀请了IIT Hyderabad（IIT）与Osmania Medical College and Hospital合作的生物医学工程系ICMR赞助研究项目的研究科学家III职位的兴趣和积极的科学家。由于该项目是跨学科的，在该项目的任何一个或多个部分中都具有丰富的经验，例如主要的干细胞隔离，胰岛器官，转录组学和人类免疫学经验。申请人被申请具有良好的高端出版物记录，具有超过1年的phD后经验。