1天然产品化学和生物技术实验室,科学技术学院,LaRénounionof LaréUnion,15 AvenueRenéCassin,CS 92003大道,CS 92003,CEDEX 09,97744法国SAINT-DENIS,法国2号,法国2瑞士3日内瓦大学药学学院,CMU-RUE MICHEL-SERVET 1,CH-1211 Geneva,瑞士4 4自然物质化学研究所(ICSN),CNRS UPR 2301,UNIVER 2301,UNIGERITURITUAL 2301,UNIGERITUE PARIS PARIS-PARIS-SACACLAY,1,AV。 de la terrasse,Cedex,91198法国Gif-Sur-Yvette,5药物认知实验室,药学系,中心互联网互联网,li feherche Surche surche sur s sur s sur s s s s s s s s s sur s sur s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s sur leimédicament(cirm),李氏大学,夸蒂尔·H·皮塔尔(Quartier h),pitalier h pital pital hippocrate,hippocrate,hippocrate 15,bat,bat。 b36,校园du sart-tilman,B-4000 Liege,比利时 *通信:mireille.fouillaud@univ-reunion.fr1天然产品化学和生物技术实验室,科学技术学院,LaRénounionof LaréUnion,15 AvenueRenéCassin,CS 92003大道,CS 92003,CEDEX 09,97744法国SAINT-DENIS,法国2号,法国2瑞士3日内瓦大学药学学院,CMU-RUE MICHEL-SERVET 1,CH-1211 Geneva,瑞士4 4自然物质化学研究所(ICSN),CNRS UPR 2301,UNIVER 2301,UNIGERITURITUAL 2301,UNIGERITUE PARIS PARIS-PARIS-SACACLAY,1,AV。de la terrasse,Cedex,91198法国Gif-Sur-Yvette,5药物认知实验室,药学系,中心互联网互联网,li feherche Surche surche sur s sur s sur s s s s s s s s s sur s sur s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s s sur leimédicament(cirm),李氏大学,夸蒂尔·H·皮塔尔(Quartier h),pitalier h pital pital hippocrate,hippocrate,hippocrate 15,bat,bat。b36,校园du sart-tilman,B-4000 Liege,比利时 *通信:mireille.fouillaud@univ-reunion.fr
1IhuMéeE E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E,Jean Moulin,13005 Marseille,法国2 AIX Marseille Univ,Ird,ird,ap-hm,ssa,vitrome,13005 Marseille,Marseille,Marseille,Marseille,France 3 France of France of Biotechnologies li es Animal Roprodiness of Scipiences of Sci of sci of sci v of sci v of sci v of sci v of sci ia 4 Rédier, Vitrome, IRD, 13005 Marseille, France 5 Public Establishment Hospitalier de Tamanrasset, Tamanrasset 11008, Algeria 6 Inspection, agricultural services, Tamanrasset 11008, Algeria 7 Aix Marseille Univ, IRD, AP-HM, MEPHI, 13005 Marseille, France 8 Ecole Sup Ecletere des sciences de liration and industries食物,阿尔及利亚16000,阿尔及利亚 *通信:philippe.parola@univ-amu.fr;这样的。: +33-(0)-4-13-73-24-01;传真: +33-(0)-4-13-73-24-02
Information Campus 155,30170 Venezia Messster,意大利。电子邮件:Fabi。 ciceco - ccepeda@uji。 Ciceco Box 116,GR-54124 框1000,fi-0 。 框17,Wagening,6700 AA,电子邮件:Fabi。ciceco - ccepeda@uji。 CicecoBox 116,GR-54124框1000,fi-0。框17,Wagening,6700 AA,
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证(未经同行评审证明)获得的是作者/资助者,他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可,以永久显示预印本。它是此预印本版本的版权持有人,该版本发布于2025年2月7日。 https://doi.org/10.1101/2025.02.07.637021 doi:Biorxiv Preprint
*与先前的50毫升保湿剂罐相比,质量平衡方法与认证的价值链***根据ISO 14040:2006和14044:2006标准和第三方验证的LCA
与没有这种病变的那些相比,缺血性中风后的预后(3),并且它们经历了更大程度的认知障碍(4)。WML可能是由脑小血管疾病引起的,脑白质血液流量减少(5)。目前,WML的原因通常归因于慢性小血管疾病。一些研究发现,脑灌注减少可能会导致双侧缺血和缺氧,从而导致微循环疾病并恶化神经变性(6)。次要皮质损伤会发生,因为白质纤维之间的连接受损(7)。然而,除了包括年龄和高血压在内的危险因素外,视网膜微血管异常的严重程度与lacunar梗死的发生和发展有关(8)和WMLS(9)(如多项研究中)。减少了视网膜微动菌和微化的数量,以及视网膜内层内层厚度的减小,与认知能力受损,灰色和白色质量较低以及损害的白质网络结构显着相关(10)。
简介:自由放养的白尾鹿(Odocoileus virginianus)是位于密歇根州东北部(美国)的牛结核病(BTB)的自我维持的水库,(美国)不断使该地区的牛业陷入困境。自由娱乐鹿的收获,诱饵禁令和农场的缓解措施减少了但没有消除鹿的BTB,也没有消除向牛的传播。鹿的明显患病率很低(1-2%),但恒定,疫苗接种可能是帮助解决该问题和值得研究的附加工具。结核分枝杆菌Calmette-guérin(BCG)疫苗是一种广泛使用的人类疫苗用于结核病,在家庭牲畜和野生动植物中也接受了很好的研究。它是主要的疫苗候选者,口服输送是将其交付给自由放养鹿的逻辑手段,尽管以前从未尝试过。
由于它们通常形状和结构难以辨别,因此无法通过形态学检查对化石微生物类群进行精确识别 (Xie & Kershaw, 2012 )。此外,即使是对化石记录中得到很好体现的类群,如有孔虫门,由于存在由裸露的未化石物种组成的演化支,因此仅基于化石数据也无法正确解释它们随时间的演化模式 (Pawlowski et al., 2003 )。因此,与古老的动植物群 (McElwain & Punyasena, 2007 ; Raup & Sepkoski, 1982 ; Signor, 1994 ) 不同,可分类的古生物标本的稀有性只能揭示过去真实的微生物多样性的一小部分,并且难以研究不同地质时代的微生物演化、多样化和功能意义。
摘要。海洋氮 (N 2 ) 固定是一种具有全球意义的生物地球化学过程,由一群特殊的原核生物 (固氮菌) 进行,但我们对其生态学的理解在不断发展。尽管海洋 N 2 固定通常归因于蓝藻固氮菌,但间接证据表明非蓝藻固氮菌 (NCD) 也可能很重要。一种广泛用于了解固氮菌多样性和生物地理学的方法是对 nifH 基因的一部分进行聚合酶链式反应 (PCR) 扩增,该基因编码 N 2 固定酶复合物固氮酶的结构成分。存在一系列生物信息学工具来处理 nifH 扩增子数据;然而,缺乏标准化实践阻碍了交叉研究比较。这导致错失了更彻底评估固氮菌多样性和生物地理学以及它们对海洋氮循环的潜在贡献的机会。为了解决这些知识空白,我们设计了一个生物信息学工作流程,以标准化高通量测序 (HTS) 产生的 nifH 扩增子数据集的处理。使用专门的 DADA2 流程高效一致地处理多个数据集,以识别扩增子序列变体 (ASV)。然后,一系列可定制的后流程阶段检测并丢弃虚假的 nifH 序列,并使用多个参考数据库和分类方法注释后续质量过滤的 nifH ASV。这个新开发的工作流程用于重新处理几乎所有来自海洋研究的公开可用的 nifH 扩增子 HTS 数据集,并生成一个全面的 nifH ASV 数据库,其中包含从 21 项研究中汇总的 9383 个 ASV,这些研究代表了全球海洋中的固氮菌种群。对于每个样本,数据库都包含从 Simons 合作海洋图集项目 (CMAP) 获得的物理和化学元数据。在这里,我们展示了该数据库在揭示主要固氮菌群的全球生物地理模式方面的实用性,并强调了海面温度的影响。工作流程和 nifH ASV 数据库为研究 nifH 扩增子 HTS 捕获的海洋 N 2 固定和固氮菌多样性提供了一个强大的框架。可以轻松添加针对研究不足的海洋区域的未来数据集,用户可以根据其特定重点调整所包含的参数和研究。工作流程和数据库分别在 GitHub(https://github.com/jdmagasin/nifH-ASV-workflow,最后访问时间:2025 年 1 月 21 日;Morando 等人,2024c)和 Figshare(https://doi.org/10.6084/m9.gshare.23795943.v2;Morando 等人,2024b)上可用。
Tommaso Nicolini,Shekhar Shinde,Reem El-Actar,Gerardo Salinas,Damien Thuau,Mamatimin Abbas,Matthieu Raoux,Jochen Lang,Eric Clout,Eric Clout,Alexander Kuhn,Alexander Kuhn,Alexander Kuhn* T. Nicolini博士,G。Salinas博士,G。Salinas,PROFIV。Bordeaux,CNRS,Bordeaux INP,ISM,UMR 5255,33607 PESSAC,法国电子邮件:kuhn@enscbp.fr S. S. S. S. Shinde,E。Cloutet Uni博士。 Bordeaux,CNRS,Bordeaux INP,LCPO,UMR 5629,33615 Pessac,法国R. El-Actar,D。Thuau博士,M。AbbasUniv博士。 波尔多,CNRS,Bordeux INP,CBMN,UMR 5248,33600 PESSAC,法国,Bordeaux,CNRS,Bordeaux INP,ISM,UMR 5255,33607 PESSAC,法国电子邮件:kuhn@enscbp.fr S. S. S. S. Shinde,E。Cloutet Uni博士。Bordeaux,CNRS,Bordeaux INP,LCPO,UMR 5629,33615 Pessac,法国R. El-Actar,D。Thuau博士,M。AbbasUniv博士。 波尔多,CNRS,Bordeux INP,CBMN,UMR 5248,33600 PESSAC,法国,Bordeaux,CNRS,Bordeaux INP,LCPO,UMR 5629,33615 Pessac,法国R. El-Actar,D。Thuau博士,M。AbbasUniv博士。波尔多,CNRS,Bordeux INP,CBMN,UMR 5248,33600 PESSAC,法国,波尔多,CNRS,Bordeux INP,CBMN,UMR 5248,33600 PESSAC,法国,