这项研究分析了在尼日利亚尼日尔三角洲地区的康复中心中生物素设计作为一种可持续治愈技术的潜力。从该地区丰富的生物多样性和文化过去汲取了生物设计概念,作为一种提高康复患者的身心健康的技术。通过将自然组件和模式集成到构造的环境中,康复机构可以提供有利于治愈和恢复的治疗场所。在康复机构的背景下,采用生物素设计概念可以为患者提供一些好处,包括减轻压力,增强的情绪和更快的康复。本文提出了在尼日尔三角洲的康复中心应用生物素设计的策略,并研究了这种方法的社会环境益处。
对于每个DiDail omni-c文库,将染色质与甲醛固定在原子核中,然后提取。用DNase I消化了固定的染色质,将染色质末端修复并连接到生物素化桥适配器,然后将含有末端的衔接子接近粘合。接近连接后,将交联后逆转并纯化了DNA。纯化的DNA以去除未结扎片段内部的生物素。使用NEBNEXT Ultra酶和Illumina兼容适配器生成测序文库。在每个文库富集之前,使用链霉亲和素珠分离含生物素的片段。库是在Illumina Hiseqx平台上测序的,以产生约30倍的序列覆盖率。然后Hirise使用MQ> 50读脚手架的读数(有关数字,请参见上面的“读取对”)。
包括天然产物,肽和合成小型化合物在内的各种分子通过与靶向生物大分子的特定相互作用表现出其生物学活性。蛋白质在内,包括酶,受体和离子通道代表这些靶标的主要群体。鉴定与生物活性配体相互作用的未知蛋白靶标在化学生物学和药物发育领域已经是必不可少的。但是,这种研究方法是耗时且费力的。靶标识别包括一系列过程:(1)使用具有生物活性配体作为诱饵的靶标的靶; (2)钩靶的富集; (3)通过Edman退化或质谱法(MS)对目标进行序列分析。1对于第一步,照片 - 亲和力标记允许在光辐射时将诱饵共价为相应的目标,因为可能适用于低亲和力配体靶向对。1a,b,2然后将钩状靶标与生物素链接蛋白珠相互纯化的生物素化接头分子使用生物素 - 链霉亲蛋白相互作用链接。1,3
对DNA的损害是其与活性氧(ROS)相互作用的结果,尤其是羟基自由基。羟基自由基是由芬顿反应由超氧化物阴离子和过氧化氢产生的,在DNA中产生多种修饰。羟基自由基对脱氧核糖部分的氧化攻击将导致从DNA中释放自由碱,从而产生各种糖修改和简单的可浸泡位点(AP位点)的链断裂。实际上,AP位点是ROS产生的DNA损伤的主要类型之一。醛反应性探针(ARP; N'-氨基甲基甲基苯基羟基羟苯二酰D-生物素)与存在于APETES的开环形式上的醛组有特定的反应(图1)。该反应使检测导致醛组形成的DNA修饰是可能的。用过量的ARP试剂处理后,DNA上的所有AP位点均标有生物素残基。这些生物素标记的AP位点可以使用Avidin-Biotin测定法进行定量,然后用过氧化物酶或碱性磷酸酶结合与Avidin的比色检测。DNA损伤定量套件包含所有必要的解决方案,用于检测每1 x 10
摘要:用生物大分子(例如蛋白质,聚糖或具有良好控制方向和密度的核酸)装饰的表面形成至关重要的重要性对于在体外模型的设计中,例如合成细胞膜和互动分析。为此,配体分子通常用锚固术功能化,该锚特定与具有高密度结合位点的表面结合,从而控制了分子的呈现。在这里,我们提出了一种方法,可以通过在孵育溶液中调整靶分子的相对浓度和自由锚固剂的相对浓度来鲁棒和定量控制一种或几种类型的锚固分子的表面密度。我们提供了一种理论背景,该背景将孵育浓度与感兴趣分子的最终表面密度联系起来,并提出了有效的指南,以优化对表面密度定量控制的孵化条件。专注于生物素锚,这是一种相互作用研究的常用锚,作为一个显着的例子,我们在实验上证明了表面密度在多种密度和靶分子大小上的控制。相反,我们可以通过量化样品溶液中的残留游离生物素反应剂的量来表明该方法如何适应质量控制质量的质量纯度,例如生物素化的糖胺聚糖。■简介
微生物对生物素的生物合成研究 (主审员) 论文研究委员会 绪方光一教授 镰田久明教授 岩井和夫教授
蚊子依靠其微生物群进行B维生素合成。我们以前发现,埃及埃及第三类幼虫清除了其微生物群的发育受损,尤其是由于缺乏叶酸(维生素B9)。在这项研究中,我们发现饮食中的饮食补充饮食的补充含有七种B族维生素并不能改善蚊子的发育成功,而是对由此产生的成年人的性别比例产生了显着影响,并富集了雌性蚊子在Bivimin and bivimin治疗的幼虫中出现的雌性蚊子。对男性和雌性幼虫的转录组分析在维生素治疗后鉴定出某些性别调节的基因。在用单个B族维生素治疗无菌幼虫时,我们检测到与生物素(维生素B7)暴露有关的特定毒性作用。然后,我们提供了无菌幼虫的生物素剂量,并表明雄性对生物素毒性的浓度比女性敏感。gnotobiotic幼虫暴露于受控的低细菌数量或以较慢的生长为特征的细菌显示出雄性富含雄性的成年人口,这表明雄性比女性所需的细菌衍生的养分少于雌性。这些发现表明,在幼虫发育过程中,蚊子具有性别特异性营养要求和毒性阈值,这会影响成年人的性别比。