合成微生物群落(Syncom)生物传感器是一种有前途的技术,用于检测和响应环境线索和靶分子。Syncom生物传感器使用工程的微生物来创建一个更复杂和多样化的传感系统,从而使它们能够以增强的灵敏度和准确性对刺激做出反应。在这里,我们给出了Syncom生物传感器的定义,超越了他们的建筑工作,并讨论了当前的生物传感技术。我们还强调了开发和优化Syncom生物传感器以及在农业和食品经营中的潜在应用,生物治疗发展,家庭感应,城市和环境监测以及One Health Foundation的挑战和未来。我们认为,Syncom生物传感器可以实时和遥控的方式使用,以感知不断动态的环境的混乱。
Motu Profiler或Short Motus是一种软件工具,可以从分类学组成,代谢活性成员的丰富性以及菌株群体的多样性方面对微生物群落的生产。为此,它维护了单拷贝系统发育标记基因序列的数据库,该数据库被用作参考,简短读取的元基因组和元文字读数被映射为识别和定量微生物分类群。在这里,我们描述了两个基本协议中最常见的MOTU剖面用例。其他支持协议提供有关其安装和深入指南的信息,以调整其设置,以增加或降低检测和量化分类单元的严格度,以及用于自定义输出文件格式。提供了解释分析结果的指南,以及有关独特功能,方法学细节和工具的开发历史的其他信息。©2021作者。Wiley Perigonicals LLC发布的当前协议。
结果:两种物种之间的土壤特性和根部特征存在显着差异,其中有土壤水含量(SWC)和根际和散装土壤中的土壤有机碳(SOC)(p <0.05)。虽然根部渗出液的代谢物分类相似,但它们的成分变化,而萜类化合物是主要的差分代谢物。土壤微生物结构和多样性也表现出显着差异,网络中具有不同的关键物种,并且主要与氮和碳周期有关的差异功能过程。在根渗出物介导的根性状,土壤微生物和土壤特性之间观察到了强相关性。 HA网络中发现的主要代谢产物包括糖和脂肪酸,而HP依赖于二级代谢产物,类固醇和萜类化合物。在根渗出物介导的根性状,土壤微生物和土壤特性之间观察到了强相关性。HA网络中发现的主要代谢产物包括糖和脂肪酸,而HP依赖于二级代谢产物,类固醇和萜类化合物。
能源生产沙漠中晴朗的天空和高水平的太阳能是发电的理想选择。摩洛哥的NOOR太阳能电厂是世界上最大的浓缩太阳能(CSP)开采大型石油和天然气储量。例如,沙特阿拉伯拥有第二大石油储备,卡塔尔拥有第三大已验证的天然气储量。两个国家都位于阿拉伯沙漠中。可以转移定居水供应,以使城市在沙漠中生长。例如,埃及的Sharm El Sheikh以其水上运动和水肺潜水而闻名。但是,由于该地区缺乏淡水,两家政府拥有的淡化公司正在运营,需要大量的能量使用。该地区依靠旅游业,因此需要游泳池和酒店的水。该市计划在2045年根据联合国栖息地计划获得无污染的计划。旅游业许多沙漠国家现在正在利用景观来产生游客的收入。活动包括骆驼游乐设施,沙丘越野车和砂板。尽管位于沙漠中,但阿拉伯联合酋长国的迪拜市仍有许多景点。其中包括一个水族馆,一个室内滑雪坡和一个水上乐园。
摘要:极端的气象事件和人为影响的影响决定了微生物群落组成的重要变化。要知道这些变化的程度,有必要深入研究地球因子,以被视为基线。这项研究的目的是评估地形特征和土壤地球化学对三个被认为是地中海环境的地形分子生物标志物的静脉细菌属的空间分布的影响。鉴于静脉细菌在生态系统中发挥的重要作用,我们进行了rubrobacter,gaiella和Microlunatus属的空间分布模型,并在基于机器学习(ML)框架的框架中研究了真菌/细菌的比例。可变重要性提供了对地貌空间分布的控制因素的洞察力。预测的肌细菌属的空间分布通常遵循地形约束,主要是高度。rubrobacter与斜率方面和锂有关。 Microlunatus与地形湿度指数(TWI)和归一化差异指数(NDWI)以及真菌/细菌比例有关。 Gaiella与流道和金属有关。我们的结果提供了有关地中海地区肌细菌适应的新信息,并显示了使用ML框架进行OTUS分布的空间预测的潜力。
结果和讨论:结果表明,物种的差异导致了两种森林之间土壤特性的差异,尤其是在云南氏假霉菌的土壤pH值显着增加。森林和Armandii Franch的土壤pH值显着减少。森林。氮添加均未显着影响任何任一元尼南氏菌的微生物多样性。或P. Armandii Franch。土壤;但是,森林类型的差异对细菌多样性产生了重大影响。氮的添加显着影响了两种森林中特定微生物群落的相对丰度,尤其是改变了云尼南氏菌的真菌群落结构,而在两种森林类型的细菌群落结构中均未观察到任何显着变化。此外,氮的添加增加了云尼那尼氏菌的细菌群落的网络复杂性。森林,同时降低了Armandii Franch的网络复杂性。森林。结构方程建模表明,氮添加通过修饰氮的可用性来调节两种森林类型的土壤细菌和真菌多样性。
fi g u r e 5在草食动物粪便中不同模式的真菌群落的功能表征。(a)在营养模式下相对丰度(> 1%)。(b)公会模式下预测的功能分布的组成; (c)在公会模式下对应于功能组的家庭层面上特定主要的真菌分类单元的相对丰度(第一级标题是真菌物种及其所在的类别;次级标题是与真菌相对应的官能团)。不同的字母表示在p <.05级别(n = 6)的显着差异;表S14列出了真菌公会模式下的比较统计结果;表S15列出了确切的p值。
机载微生物群落虽然经常因生物量低而挑战研究,但在公共卫生和病原体传播中起着至关重要的作用。通过shot弹枪宏基因组学,这项研究利用面罩和飞机舱滤清器的非侵入性空气采样来研究具有频繁人类相互作用的环境中的微生物多样性,包括医院和飞机。开发了全面的抽样和分析工作流程,并结合了环境和富集方案,以增强微生物DNA恢复和多样性分析。尽管存在生物量的局限性,但允许成功鉴定407种的优化提取方法,其中包括cutibacterium痤疮,表皮葡萄球菌,hankookensis和Radiotolerans甲基杆菌。富集加工导致更大的元基因组组装基因组(MAG)恢复和较高的抗菌耐药基因(ARG)鉴定。这些发现突出了高占用公共场所中ARG的存在,这表明监测的重要性以及在这种环境中减轻空气传播风险的潜力。这项研究证明了将环境和富集采样相结合以捕获狭窄空间中综合微生物和ARG概况的实用性,从而为在公共卫生环境中增强病原体监测提供了框架。
在连续种植多年后,农作物通常会受到生长抑制作用,这严重影响了其产量。在农业生产中,土壤熏蒸可以有效地减轻植物的生物压力。然而,对土壤熏蒸变化和植物反应的微生物群之间的关系,以及它们的存在是否对植物做出了有益的贡献,尚不清楚。我们通过影响微生物来探索土壤熏蒸的机理,从而促进植物生长。结果表明,dazomet的治疗显着缓解了烟草的生长迟缓,而这种差异在烟草的繁荣时期最为明显,当时植物高度和叶子面积分别增加了3.33次和3.24次。此外,地上组织的生长优势与根部优势显着相关(p <0.05)。同时,我们发现dazomet处理显着增加了与根相关的大量微生物基团,例如g_pedobacter,g_microbacterium和g_brevundimonas。结构方程建模的结果表明,与所应用的dazomet量正相关的微生物群落,并且与根部正相关(p <0.05)是有助于烟草生长优势的重要因素。总体而言,这项研究的发现对于增强我们通过熏蒸的土壤修复的理解具有重要意义,并且可能对dazomet熏蒸的实际应用具有很大的影响。
F. Vautrin,P。Piveteau,M。Cannavacciuolo,P。Barre,C。Chauvin等。土壤微生物群落对消化施用的短期反应取决于消化和土壤类型的特征。应用土壤生态学,2024,193,pp.Art。105105。10.1016/j.apsoil.2023.105105。hal- 04266661