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蜗牛生物掌lara的DNA甲基化，对表型可塑性产生的作用和影响
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活性 DNA 去甲基化位于杆状病毒的上游...
多能视网膜祖细胞的视网膜细胞命运决定受染色质结构和基因表达的动态变化控制。DNA 胞嘧啶甲基化 (5mC) 受到积极调控，以正确控制基因表达和染色质结构。许多基因在视网膜发育过程中表现出活性 DNA 去甲基化；这个过程需要将 5mC 氧化为 5-羟甲基胞嘧啶 (5hmC)，并由十-十一易位甲基胞嘧啶双加氧酶 (TET) 酶控制。使用一系列等位基因条件性 TET 酶突变体，我们确定 DNA 去甲基化是 NRL 和 NR2E3 表达上游所必需的，以建立视杆细胞命运。使用组织学、行为学、转录组学和碱基对分辨率 DNA 甲基化分析，我们确定抑制活性 DNA 去甲基化会导致整体变化
甲基试剂盒.pdf
调整甲基C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3 assocComp . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ... 。 。 。 。 。 。 。 。 13 数据模拟。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 14 diffMethPerChr 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 16 摘录。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 ..................................................................................................................................................................................17 filterByCoverage ..................................................................................................................................................................................................................19 getAssembly ..................................................................................................................................................................................................................................................19 getContext ..................................................................................................................................................................................................19 getContext ..................................................................................................................................................................................19 ..................................................................................................................................................................................................................................................................................22 获取Correlation ..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................23 获取CoverageStats ..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................24 获取Data ..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................24 获取Data .................. ... . . . 28 getMethylDiff . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ... . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ... . ... 。。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 47
DMRcate：甲基化阵列和测序空间分析方法
DMRcate 包 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 DMRcate-内部 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 DMResults-类 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 extractRanges . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 15
神经孢子中全基因组DNA甲基化的比较分析
抽象DNA甲基化是一种表观遗传标记，在真核生物的遗传调节中起重要作用。在解剖调节DNA甲基化的分子途径方面已取得了重大进展。然而，关于进化时间的DNA甲基化变化知之甚少。在这里，我们介绍了丝状蛋白酶神经孢子物种中DNA甲基化和可转座元素（TE）含量变化的研究。，我们以单基碱分辨率生成了全基因组DNA甲基化数据，以及基因组TE含量和基因表达数据，分别代表了五种密切相关的神经孢子物质的10个个体。我们发现甲基化水平较低（范围从1.3％到2.5％），并且以物种特异性的方式在基因组中有所不同。此外，我们发现，超过400 bp的TE是通过DNA甲基化靶向的，在所有基因组中，高甲基化与低GC相关，证实了这组真菌中DNA甲基化与重复诱导点（RIP）突变之间的保守联系。TE含量和DNA甲基化模式均显示出系统发育信号，而Te载荷最高的物种（N. crassa）也表现出每TE的最高甲基化水平。我们的结果表明，DNA甲基化是一种可进化的性状，表明神经孢子的基因组是由TES和宿主防御之间的进化武器塑造的。
5mC 选择性脱氨酶的发现及其在碱基分辨率甲基化位点超灵敏直接测序中的应用
摘要 挖掘噬菌体中的新酶活性对于开发新的生物技术工具仍然很重要。在本研究中，我们使用 MetaGPA（一种将宏基因组数据中的基因型与表型联系起来的方法）来识别脱氧胞苷脱氨酶，这是一种与宏病毒组中的胞嘧啶修饰高度相关的蛋白质家族。出乎意料的是，这些脱氨酶的一个子集在单核苷酸和单链 DNA 底物中都表现出对 5-甲基胞嘧啶 (5mC) 的偏好，而不是胞嘧啶 (C)。在甲基化组测序工作流程中，这些酶优先脱氨 5mC，这使得甲基化胞嘧啶能够直接转化，同时完全消除任何未修饰胞嘧啶的背景脱氨。这种直接转换允许以单碱基分辨率精确识别甲基化位点，具有无与伦比的灵敏度，为基因组和甲基化组的同时测序提供了广泛的应用。
抑制甲基腺苷磷酸化酶可保护免受实验性急性肾损伤
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2025年2月17日。 https://doi.org/10.1101/2025.02.12.12.637574 doi：Biorxiv Preprint
甲基苯丙胺的自我给药会引起大鼠内侧前额叶皮层的神经元功能障碍，在性别特异性和戒断时间依赖的人体中
甲基苯丙胺（甲基苯丙胺）是全球使用的最广泛使用的非法药物之一，发挥了有效的心理刺激作用，可增强其高度上瘾的性质。慢性甲基苯丙胺的使用与严重的认知障碍有关，尤其是在执行功能，决策和工作记忆中，即使在停止使用甲基甲基苯丙胺后也持续了很长时间。这些认知统计与内侧前额叶皮层（MPFC）中谷氨酸能锥体神经元功能障碍有关，该神经元调节成瘾和认知。人类和动物研究都强调了甲基苯丙胺诱导的MPFC功能障碍，这有助于强迫行为和复发。新兴的证据还强调了甲基甲基苯丙胺障碍（MUD）的性别差异显着差异。先前的研究表明，男性和女性的甲基诱导的行为和神经元功能障碍是不同的，但是细胞和分子机制尚未完全了解。使用行为和电生理方法（全细胞弥补），这项研究确定了自我管理的METH（METH-SA）的MPFC中神经元功能障碍的某些性别差异，然后是短（2-5 d）或长期（≥30d）的短（2-5 d）或退出。我们发现，男性和雌性大鼠都以相似的模式自我施用甲基苯丙胺。然而，性别之间的MPFC神经元中产生的不良，多动症和钙失调不同。这种特异性神经元功能障碍分别与短期或长期戒断有关。通过理解不同的性别行为/神经元差异后，我们的新颖发现表明了性别作为生物学变量在甲基化和复发中的作用，并揭示了药物使用环境对MPFC神经元功能障碍的影响，在戒断过程中，在戒断过程中提供了洞察力治疗，从而提供了性别 - 适用策略。
光致发光和三链螺旋物的金属甲基分子体系结构的光发光和非线性光学特性
K。Waszkowska，Y。Cheret，A。Zawadzka，A。Korcala，J。Strzelecki等人。光致发光和基于三链螺旋物的金属金属螺旋体 - 苏普朗分子体系结构的光致发光和非线性光学特性。染料和颜料，2021，186，pp.109036-。10.1016/j.dyepig.2020.109036。hal-03492998
化妆品中使用的三甲基苯甲酰二苯基氧化物的安全评估
To: Expert Panel for Cosmetic Ingredient Safety Members and Liaisons From: Priya Cherian, M.S., Senior Scientific Analyst/Writer, CIR Date: February 14, 2025 Subject: Safety Assessment of Trimethylbenzoyl Diphenylphosphine Oxide as Used in Cosmetics Enclosed is the Draft Report on the Safety Assessment of Trimethylbenzoyl Diphenylphosphine Oxide如化妆品所用。（在PDF文档中，它被识别为Report_trimethylbenzoyldiphophosphinyoxine_032025）。科学文献综述（SLR）由CIR于2024年11月21日发布。自发出SLR以来，收到了一项使用研究，评估了使用含有三甲基苯甲酰二苯基磷脂氧化物的产品（基础，颜色和含有0.25、3.65和1.5％的顶部外套）的产品的刺激潜力。这些数据已添加到该报告中，并且可以在数据包中以Data1_trimethylbenzoyldiphenyl磷脂氧化物_032025的形式找到。此数据包中的其他项目包括：