图2。DNMT3A募集后的基因表达动力学与数字记忆不一致。使用特定于特定于染色体的染色体整合的169个报告基因基因的示意图。哺乳动物170构成启动子(EF1A)驱动荧光蛋白EBFP2的表达。上游结合位点可实现靶向171的表观遗传效应子,该效应子与DNA结合蛋白RTETR融合在一起,PHLF或DCAS9。报告基因是由染色质绝缘子与其他基因分离出来的172。b实验概述,描述了瞬时转染到具有报告基因的173个细胞,基于转染水平的荧光激活的细胞分选,以及时间顺序的流量细胞仪174测量。根据面板中所示的175个实验时间表。显示的是四种不同水平的转染水平的报告基因176(EBFP2)的流量细胞仪测量值的分布。DNMT3A-DCAS9靶向启动子上游的5个目标位点,177用作炒GRNA目标序列作为对照(图se.2 a,b,表S3)。显示的数据来自来自3个独立重复的代表性178重复。d使用DNMT3A-179的流量细胞仪的单细胞基因表达测量值对应于面板C中所示的细胞(30天)。父母是指带有180个报告基因的未转染细胞。数据来自3个独立重复的代表性重复。平均值。e MedIP-QPCR和ChIP-QPCR 181分析DNMT3A-DCAS9和细胞分类后14天分析高水平的转染。分析了启动子区域182。显示的数据来自三个独立的重复。报道的是折叠变化及其平均值,使用183标准∆ ∆ c t方法相对于活性状态。错误条为S.D.DNMT3A-DCAS9的靶向位置为184至5个目标位点(GRNA)。使用炒GRNA目标序列(GRNA NT)作为对照。185 *p≤0.05,**p≤0.01,***p≤0.001,未配对的两尾t检验。根据面板中所示的实验时间线,krab抑制的基因表达动力学(PHLF-KRAB)186。所示是从四种不同水平的转染水平的187个报告基因基因(EBFP2)的流量细胞仪测量值的分布。每天测量一个独立的重复。显示的数据188来自3个独立重复。g重新激活细胞的百分比(400-10 5基因表达A.U.F.)对应于F. h Medip-QPCR面板中显示的189个细胞种群和CHIP-QPCR分析后6天对PHLF-KRAB和Cell 190排序进行了高水平的转染。分析是启动子区域的。数据来自三个独立的重复。191显示的是折叠变化,其平均值由标准∆ΔCT方法确定相对于活性状态。错误192条是S.D.平均值。p≤0.05,**p≤0.01,***p≤0.001,未配对的两尾t检验。参见SI图参见Si无花果。202i简化染色质修饰193当krab = 0,dnmt3a = 0,tet1 = 0时获得的电路图,而H3K9me3并未介导从头催化194 DNA甲基化的催化。SM.1 C. J顶图:(CPGME,H3K4ME3)对的剂量响应曲线。底部图:(DNMT3A,CPGME)对的剂量-195响应曲线。SM.1 D和SM.3。 k k的基因表达的概率分布196的系统,该系统由Si Tape Sm.1和Sm.3中列出的反应表示。 参见Si无花果。 SM.1 B和SM.2。 l概率197在t = 28天后的基因表达分布,如面板I所述获得。 在小组j和l中,将198 DNMT3A动力学建模为脉冲,随着时间的流逝会呈指数减小。 在我们的模型中,α'是通过抑制组蛋白修饰的DNA甲基化建立的归一化速率199,DNA甲基化擦除率200速率与激活组蛋白的擦除速率和激活的组蛋白修改速率之间的µ'是每个基准级别(ε')的级别(均为基础率(均))(招募)(招募)(招募)。修改。 参见SI图 SM.1 E和SM.3。SM.1 D和SM.3。k k的基因表达的概率分布196的系统,该系统由Si Tape Sm.1和Sm.3中列出的反应表示。参见Si无花果。SM.1 B和SM.2。 l概率197在t = 28天后的基因表达分布,如面板I所述获得。SM.1 B和SM.2。l概率197在t = 28天后的基因表达分布,如面板I所述获得。在小组j和l中,将198 DNMT3A动力学建模为脉冲,随着时间的流逝会呈指数减小。在我们的模型中,α'是通过抑制组蛋白修饰的DNA甲基化建立的归一化速率199,DNA甲基化擦除率200速率与激活组蛋白的擦除速率和激活的组蛋白修改速率之间的µ'是每个基准级别(ε')的级别(均为基础率(均))(招募)(招募)(招募)。修改。参见SI图SM.1 E和SM.3。SM.1 E和SM.3。
概率效应。................................................................................................................................................ 88 Figure 8.2: (a) Arrangement of physical qubits for the surface code.数据量子位显示为空心圆,测量值作为实心圆圈。分别在十字架末端的绿色和黄色表示Z和X稳定器的测量值。在边界上,稳定器的测量仅包括三个数据量量,由截断的十字表示。(b)Z稳定器测量的电路图。身份以补偿(C)X稳定器测量中的Hadamards。对于所有稳定器,同时执行每个步骤。沿阵列的所有Z和X稳定器的一轮此类电路对应于一个综合征测量框,如图7.1所示。在美国物理社会的[FMMC12]版权所有(2012年)的许可后重印数字。”........................................................................... 91 Figure 8.3: Performance below threshold for the surface code for distances 3,5,7,9,11,15,25,35,45 and 55.对于距离3,5和7,二次,立方和四分位拟合曲线显示为虚线。它们仅近似于低物理错误率p [FDJ13]的实际曲线。经Macmillan Publishers Ltd的许可转载:科学报告(A. G. Fowler,S。J。Devitt和C. Jones,Sci。Rep。,3(1),2013年。 ),版权(2013年)。 “经[M. H. Amin。的许可重印数字 物理。Rep。,3(1),2013年。),版权(2013年)。“经[M. H. Amin。物理。..................... 93 Figure 8.4: Another two threshold plots indicating the threshold at the crossing of the different lines............... 97 Figure 9.1: Sketch of total time until the ground state is found with desired probability as a function of the problem size.虚线显示了每轮运行时间TF的几个固定值的性能。蓝线显示了最佳结果,如果为每个问题大小分别优化了运行时间TF,则达到了最佳结果。用固定的TF测量(例如,由于退火设备的局限性)时,测得的曲线(红色)的斜率可能表示错误的行为:对于小N,斜率低于最佳(可能在没有的地方伪造速度),对于大N,对于大n,斜率高于最佳(可能掩盖了可能存在的加速速度)。修订版A,92(5):052323,2015。]版权所有(2015年),美国物理社会。”................................................................................ 108 Figure 11.1: Number of qubits in GHZ state that have been realized experimentally.Mario Krenn博士批准了该数字的用法,并取自[KRE22]。........................................................................................ 123 Figure 15.1: Three-dimensional space-time lattice of syndrome measurement outcomes.一个水平层对应于一轮综合征测量,其中符号表示结果。红线显示了发生测量结果的改变。错误链导致进一步分开的符号变化对[FMMC12]。数据QUBIT的一个误差(X或Z)导致空间维度的一对符号变化,而中间的数据QUBIT位于中间,测量值的单个误差会导致一个在时间维度上的误差,并且在两个更改之间发生错误的误差(M)。“在美国物理社会的[FMMC12]版权所有(2012年)的允许下转载数字。”................................................................. 168 Figure 15.2: Implementation of logical qubits: (a) Double Z-cut qubit, (b) double X-cut qubit.逻辑运算符XL(ZL)由沿蓝色(红色)线的物理Qubit上的X(Z)操作组成[FMMC12]。在美国物理社会的[FMMC12]版权所有(2012年)的允许下转载数字。............ 169 Figure 15.3: Schematic protocol for creating and initializing a double X-cut qubit in a logical Z eigenstate.mz表示z的测量值,| g⟩表示基态以基态数据量的初始化[FMMC12]。“经。在美国物理社会的[FMMC12]版权所有(2012年)的允许下转载数字。.............................................................................................................. 170 Figure 15.4: (a) Circuit diagram for a logical CNOT operation between two double Z-cut qubits, mediated by a double X-cut qubit.在此过程中,测量目标量子位,并以|+⟩初始化了新的双z切割量子标式,以取代目标值。在初始化或测量量子线时,对应于同一量子的两个孔的两条线。(b)描述执行三个CNOT步骤的孔的编织的描述:每个双Z(x) - cut量子值以一对黑色(蓝色)线表示,其中沿x轴显示孔的孔的移动。(c)简化编织的表示形式,仅作为栅极的中间工具显示双X-Cut值。实际上,双Z切量盘根本不需要移动,并且可以在测得的旧目标的位置初始化新的目标量子定位。(d) - (f)在两个双X切位数之间间接cnot的等效表示。[FMMC12]在美国物理社会的[FMMC12]版权所有(2012年)的许可下重印了数字。............................................................................................. 171 Figure 15.5: Implementation of S (top) and T (bottom) gate on the input state |分别具有魔术状态| y⟩和| a⟩。在最新版本中,也可以在没有最终的Hadamard门的情况下执行S门,并在经典控制中携带副产品运算符[GF17]。t门还需要一个条件的门来纠正其非确定性。决定是否执行其他S