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通过注意力预测蛋白质序列的酶促功能
结果：我们表明，我们的Enzbert Transformer模型通过蛋白质语言模型的专业化而受过训练，可预测酶佣金（EC）数量，仅基于序列而优于单功能酶类预测的最先进的工具。在EC40基准上的第二级预测EC数量的预测中，精度从84％提高到95％。为了评估第四级的预测质量，这是最详细的EC数字，我们构建了两个新的基于时间的基准测试，以与最先进的方法ECPRED和DEEPEC进行比较：Macro-F1分别从41％提高到54％，从20％提高到20％。最后，我们还表明，使用一个简单的注意力图与EC预测任务上的其他经典性方法相当，或者比其他经典性方法更好。更具体地，注意图鉴定出的重要残基倾向于对应于已知的催化位点。量化，我们报告的最高F-GEAIN评分为96.05％，而经典的可解释性方法最多达到91.44％。
根据分类隶属关系估算共识蛋白质组和代谢功能
摘要目的：元编码和元基因组测序使高度多样化的环境社区的表征能够表征。估计这些社区执行的代谢功能的挑战导致了几种最新方法的发展，其中大多数方法是根据特定基因标记量身定制的。但是，测序技术进步所产生的方法的增加，驱动了能够处理异质微生物社区数据的方法。预测通常取决于其内部分析管道，并受到基础数据库的影响，这些数据库将标记基因与特定功能注释联系起来。这限制了用户通过追踪内部数据和流程来评估预测质量的能力。最后，用户受这些方法提供的特定注释的约束（例如ec数），限制了他们根据中间结果进行进一步专业分析的能力。方法：ESMECATA预测分类学官员的共识蛋白质组及其相关功能。Esmecata的关键特征是其解释性和功能。为了支持异质测序数据的灵活整合，Esmecata利用了通过分析不同测序数据集的分析获得的分类学官方。为了深入了解每种分类学的知识并解释预测功能的相关性，Esmecata确定了在UNIPROT数据库中有记录的蛋白质组织能够辅助代表的给定官能中的分类学等级。根据阈值，将Uniprot蛋白质组的蛋白聚类并过滤，以创建共识蛋白质组。这些共有的蛋白质组会自动用功能信息（例如，EC数字，GO术语）注释，但它们也被设计为用于进一步的自定义注释工作流。功能注释在功能表中报道，该功能表可以充满分类的丰度，以产生全面的功能性文件。结果：ESMECATA预测已使用多个数据集验证，并将其与最新方法进行了比较。此外，它被应用于甲烷剂反应器的新型元编码数据集，表征了微生物群落和沼气在不同的时间点和进气条件上的产生。我们的结果证明了沼气之间的联系
产生的蛋白质激活天然杀伤细胞
在这项研究中，研究人员专注于IL-18。他们发现肿瘤细胞可以通过caspase-3裂解产生新型的IL-18形式，该裂解与传统的成熟IL-18途径无关。与成熟的IL-18不同，这种短形式不会退出细胞，而是进入细胞核，在该细胞核中促进了STAT1和ISG15分泌的磷酸化，从而增强了NK细胞抗肿瘤功能。
新型机制 - 蛋白质 - 乳房 - 乳房 - 癌症 -
乳腺癌仍然是全球主要的公共卫生问题，需要新颖的治疗策略，以增强结果并最大程度地减少不良反应。从公共卫生的角度来看，这篇评论突出了乳腺癌治疗中蛋白质递送的创新途径的潜力，以改变治疗方法。我们研究了复杂的蛋白质递送方法，例如配体定向靶向，基于纳米颗粒的载体和生物工程蛋白，并通过对最近文献的有方法综述来评估它们在最大程度地提高药物特异性和降低毒性方面的功效。根据我们的研究，这些创新的递送方法可大大提高治疗蛋白在乳腺癌细胞上的分布，从而提高了治疗疗效，同时降低了全身暴露和副作用。具体而言，已经证明生物屏障可以通过靶向递送系统来实现，这也针对肿瘤微环境。这允许在肿瘤部位局部释放治疗药物。这些发展具有重大影响，包括可能选择更个性化和微创乳腺癌治疗的可能性。这些创新的分娩方法可以通过减少常规化学疗法的不良影响来改善患者的生活质量和遵守治疗计划，这将改善整体治疗结果。期待，对蛋白质输送系统进行更多的研究和开发至关重要。未来的指示应该集中精力研究组合药物，精炼用于实际使用的输送系统以及进行广泛的临床试验以评估功效和安全性。这项研究强调了公共卫生在促进这些创新并增强癌症护理方面的作用，强调了将新型蛋白质递送系统纳入乳腺癌治疗方案的重要性。
空气污染，白质微观结构和脑量
a ISGlobal, Barcelona, Spain b Universitat Pompeu Fabra (UPF), Barcelona, Spain c CIBER Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Spain d Department of Child and Adolescent Psychiatry/Psychology, Erasmus MC, Erasmus University Medical Centre, Rotterdam, the Netherlands e Institute for Risk Assessment Sciences, Utrecht University, the Netherlands f Department of Radiology and Nuclear Medicine, Erasmus University Medical Centre, Rotterdam, the Netherlands g Department of Statistics and Operational Research, Universitat de Val ` encia, Spain h Epidemiology and Environmental Health Joint Research Unit, FISABIO-Universitat Jaume I-Universitat de Val ` encia, Val ` encia, Spain i The Generation R Study Group, Erasmus University Medical Centre,荷兰J鹿特丹社会与行为科学系，哈佛T.H.Chan公共卫生学院，美国波士顿Chan公共卫生学院，美国波士顿
COVID-19 新的血液生物标志物可以预测认知健康的老年人是否会发展阿尔茨海默氏病 研究强调了孕妇鸟类流感疫苗的关键需求 可含胶囊可以将药物直接泵入胃肠道的壁 分子“邮政编码”将杀手T细胞吸引到脑肿瘤 使用计算机和AI使医学工作更聪明 乌干达看到埃博拉疫苗试验的“最快推出”：WHO 研究人员确定了未来心力衰竭疗法的潜在药物目标 使用Elon Musk的大脑芯片是什么感觉？它如何工作？ 转移性癌症：靶向燃料治疗的蛋白质 - 改进的大脑解码器对失语症患者的交流有望 疱疹病毒可能会驱动阿尔茨海默氏病的病理，研究表明 受脑启发的神经网络揭示了对关系学习的生物学基础的见解 全球研究将数百万糖尿病和心脏病病例与含糖饮料联系起来 调查显示，许多美国人不知道怀孕患心脏病的长期风险 自毁疫苗可增强对猴子结核病的保护 研究发现停止了儿童脑肿瘤，然后才形成 DNA甲基化介导了儿童逆境与抑郁症之间的联系，研究表明
从两年的Proseco研究中发现，这一发现很重要，因为血液癌患者损害了免疫系统，无论是由于癌症还是癌症治疗。这使他们比其他人更容易受到COVID-19的影响，并就他们对疫苗接种的反应如何提出了疑问。该研究的最新发现发表在《柳叶刀》杂志上。
天然蛋白质组织的接近性分析揭示了自闭症和相关神经发育条件的小鼠模型中的表型修饰符
自闭症谱系障碍的主要驱动因素之一是数百个基因内的风险等位基因，它们可能在共享但未知的蛋白质复合物中相互作用。在这里，我们开发了一种可扩展的基因组编辑介导的方法来靶向小鼠大脑内的14个高强烈的自闭症风险基因，用于基于接近性的内源性蛋白质组学，从而实现了高特异性空间蛋白质组织的识别。产生的天然接近蛋白质组富含自闭症个体大脑失调的人类基因，并揭示了来自高强调风险基因与低调的蛋白质之间的接近性相互作用，这些蛋白质与较低信号的蛋白质之间可能提供新的途径，从而可以为遗传风险确定优先确定遗传风险。重要的是，数据集丰富了可能构成条件的共享旋转功能和遗传相互作用。我们通过两个自闭症模型中的空间蛋白质组学和基于CRISPR的表达调节来测试这一概念，证明了调节其失调机制的功能相互作用。一起，这些结果揭示了与自闭症相关的体内蛋白质组网络，从而为理解和操纵其病因的细胞驱动器提供了新的侵害。
激酶抑制剂下拉分析（KIP）用于临床蛋白质组学
©作者2024。Open Access本文是根据Creative Commons Attribution 4.0 International许可获得许可的，该许可允许以任何媒介或格式使用，共享，适应，分发和复制，只要您对原始作者和来源提供适当的信誉，请提供与创意共享许可证的链接，并指出是否进行了更改。本文中的图像或其他第三方材料包含在文章的创意共享许可中，除非在信用额度中另有说明。如果本文的创意共享许可中未包含材料，并且您的预期用途不受法定法规的允许或超过允许的用途，则您需要直接从版权所有者那里获得许可。要查看此许可证的副本，请访问http：//创建ivecommons。org/licen ses/by/4。0/。Creative Commons公共领域奉献豁免（http：//创建ivecommons。Org/publi cdoma in/Zero/1。0/1。0/）适用于本文中提供的数据，除非在数据信用额度中另有说明。
KMT5B神经发育中的单倍症的机制。 Sheppard，S.E。；科比，L。 Wickramasekara，R.N。； Vaccaro，C。；罗伯逊 分子医学时代的肉瘤治疗 Zhiqiang人脑sha的白质连接组的遗传结构； Schijven，d。; S.E. Fisher； Francks，C。2023，文章 /字母T < / div> 眼睛追踪技术支持视觉筛选... 在外太空的军备竞赛？ 预言与广泛的CRISPR – CAS ... 使用来自婴儿宇宙的中性氢的21 cm信号与低频空间干涉仪凝视到黑暗（年龄） 睾丸癌幸存者的心血管疾病 脾脏在训练有素的免疫力模型中的作用有限：对中性粒细胞增生的影响。 Uijen，R.F。; Bulut，O。;琼·乔奇（M.I.） de; doming 社会游戏行为以特定于区域的方式Bijlsma，Ate塑造前额叶抑制的发展； Vanderschuren，L。； Wierenga，Corette J. 地图集文档 神经肿瘤学进步
KMT5B的机制和人类神经发育的机制。 Sheppard，S.E。 ; Brying，L。; Wickramascaker，R.N。 ;疫苗接种，c。罗伯茨，b。简，J。; Hulen，J。；沃森（C.J.） ; Faunds，V。; duffourd，y。 Lee，P。;西蒙，M.C。 ; Cruz，X。 N。Patilla；弗洛雷斯·梅德（Flores-Mend）； Akizu，n。;微笑，J。；来自R. Silva的Pellemino；仪式。;月，米；玫瑰，a。; Barcelo-Serts，i。 Choa，Z.X。 ; Lim，C.Y。 ;杜布格，c。日记，H。； Demurger，f。; Mulhern，M。；阿克曼，c。 Lippa，n。;安德鲁斯（M。）； Baldridge，D。君士坦丁，J。；毛发，A。Van； Snoeck-streef，i。 Chow，P。; Hing，A。; J.M. Graham Jr ; au，m。; Faivre，L。; Shen，W。;毛。 J。Palubos； Viscope，d。; Gahl，W。； tifft，c。; Mamamara，E。； Hauser，n。; Miller，R。； Maffeo，J。； Afenjar，A。; Doummar，d。; Keren，b。 Arn，P。; Macklin-Mania，S。；消息，i。 Callewaert，b。对，a。; Zweier，c。; Brewer，C。； Saggar，A。; Smeland，M.F。 ;库马尔，阿吉斯； Elmslie，F。; Deshpand，c。很好，m。 Cogne，b。 Ierland，Y。Van；威尔克（M。）； Slegtenst，M。Van；海岸Chhen，J.Y。 ;干燥，d。码头，d。 Wormanmann，S.B。 ; Kamstean，E.J。 ; Coch，J。； Haynes，d。;污染，L。； Tither，H。; Ranguin，K。； Pitch-Man，A.S。；韦伯，葬礼的佩雷斯，a。 Sanchez del Pozo，J。； J.M. Rosals ; Jose，P。;标准，K。；劳赫（Rauch） Mei，D。；玛丽，f。; Guerrini，r。 Lesin，J。； Tran Mau-Them，f。;菲利普，c。 Dauriat，b。雷蒙德（L. Raymond）； Moutton，S。； Quiet-Gonzal，A.M。；火灾，T.Y。 ;朋友，c。格罗托（Grotto）肾脏，f。; Drive，T.G。 ;伊斯兰教。 Sidlik，J.A。 ;亨德森（L.B.）KMT5B的机制和人类神经发育的机制。Sheppard，S.E。 ; Brying，L。; Wickramascaker，R.N。 ;疫苗接种，c。罗伯茨，b。简，J。; Hulen，J。；沃森（C.J.） ; Faunds，V。; duffourd，y。 Lee，P。;西蒙，M.C。 ; Cruz，X。 N。Patilla；弗洛雷斯·梅德（Flores-Mend）； Akizu，n。;微笑，J。；来自R. Silva的Pellemino；仪式。;月，米；玫瑰，a。; Barcelo-Serts，i。 Choa，Z.X。 ; Lim，C.Y。 ;杜布格，c。日记，H。； Demurger，f。; Mulhern，M。；阿克曼，c。 Lippa，n。;安德鲁斯（M。）； Baldridge，D。君士坦丁，J。；毛发，A。Van； Snoeck-streef，i。 Chow，P。; Hing，A。; J.M. Graham Jr ; au，m。; Faivre，L。; Shen，W。;毛。 J。Palubos； Viscope，d。; Gahl，W。； tifft，c。; Mamamara，E。； Hauser，n。; Miller，R。； Maffeo，J。； Afenjar，A。; Doummar，d。; Keren，b。 Arn，P。; Macklin-Mania，S。；消息，i。 Callewaert，b。对，a。; Zweier，c。; Brewer，C。； Saggar，A。; Smeland，M.F。 ;库马尔，阿吉斯； Elmslie，F。; Deshpand，c。很好，m。 Cogne，b。 Ierland，Y。Van；威尔克（M。）； Slegtenst，M。Van；海岸Chhen，J.Y。 ;干燥，d。码头，d。 Wormanmann，S.B。 ; Kamstean，E.J。 ; Coch，J。； Haynes，d。;污染，L。； Tither，H。; Ranguin，K。； Pitch-Man，A.S。；韦伯，葬礼的佩雷斯，a。 Sanchez del Pozo，J。； J.M. Rosals ; Jose，P。;标准，K。；劳赫（Rauch） Mei，D。；玛丽，f。; Guerrini，r。 Lesin，J。； Tran Mau-Them，f。;菲利普，c。 Dauriat，b。雷蒙德（L. Raymond）； Moutton，S。； Quiet-Gonzal，A.M。；火灾，T.Y。 ;朋友，c。格罗托（Grotto）肾脏，f。; Drive，T.G。 ;伊斯兰教。 Sidlik，J.A。 ;亨德森（L.B.）Sheppard，S.E。; Brying，L。; Wickramascaker，R.N。;疫苗接种，c。罗伯茨，b。简，J。; Hulen，J。；沃森（C.J.）; Faunds，V。; duffourd，y。 Lee，P。;西蒙，M.C。; Cruz，X。 N。Patilla；弗洛雷斯·梅德（Flores-Mend）； Akizu，n。;微笑，J。；来自R. Silva的Pellemino；仪式。;月，米；玫瑰，a。; Barcelo-Serts，i。 Choa，Z.X。; Lim，C.Y。;杜布格，c。日记，H。； Demurger，f。; Mulhern，M。；阿克曼，c。 Lippa，n。;安德鲁斯（M。）； Baldridge，D。君士坦丁，J。；毛发，A。Van； Snoeck-streef，i。 Chow，P。; Hing，A。; J.M. Graham Jr; au，m。; Faivre，L。; Shen，W。;毛。 J。Palubos； Viscope，d。; Gahl，W。； tifft，c。; Mamamara，E。； Hauser，n。; Miller，R。； Maffeo，J。； Afenjar，A。; Doummar，d。; Keren，b。 Arn，P。; Macklin-Mania，S。；消息，i。 Callewaert，b。对，a。; Zweier，c。; Brewer，C。； Saggar，A。; Smeland，M.F。;库马尔，阿吉斯； Elmslie，F。; Deshpand，c。很好，m。 Cogne，b。 Ierland，Y。Van；威尔克（M。）； Slegtenst，M。Van；海岸Chhen，J.Y。;干燥，d。码头，d。 Wormanmann，S.B。; Kamstean，E.J。; Coch，J。； Haynes，d。;污染，L。； Tither，H。; Ranguin，K。； Pitch-Man，A.S。；韦伯，葬礼的佩雷斯，a。 Sanchez del Pozo，J。； J.M. Rosals; Jose，P。;标准，K。；劳赫（Rauch） Mei，D。；玛丽，f。; Guerrini，r。 Lesin，J。； Tran Mau-Them，f。;菲利普，c。 Dauriat，b。雷蒙德（L. Raymond）； Moutton，S。； Quiet-Gonzal，A.M。；火灾，T.Y。;朋友，c。格罗托（Grotto）肾脏，f。; Drive，T.G。;伊斯兰教。 Sidlik，J.A。;亨德森（L.B.）; Hennessy，L。； Raper，A。;父母，我。 Caiser，F.J。;有时，一个。布克，Ø.L。; Juusola，J。；人，r。 Schnur，R.E。; Vitobello，A。;银行； Bhoj，E.J。; Stepman，H.A.F。2023，文章 /编辑（Adventure Science，9，10，（2023），pp。EADE1463，第1463条）
蛋白质Z依赖性蛋白酶抑制剂的抗炎活性
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