抽象的组织质发生是北美的一种流行真菌病,经常在俄亥俄州和密西西比河河谷沿线报道,尽管自动病例发生在非流行地区。在美国,这种疾病是由两个遗传学上不同的组织囊肿sensu lato,组织的密西西比州组织(NAM1)和H. ohiense(NAM2)引起的。为了弥合分子流行病学间隙,我们基因分型93个组织型分离株(62种新型基因组),包括通过整个基因组测序的临床,环境和兽医样本,包括整个基因组测序,然后进行进化和物种小niche模型分析。我们表明,组织胞浆病是由两个主要谱系H. Ohiense和H. Mississippiense引起的。由加利福尼亚州和德克萨斯州的H. seramericanum引起的零星病例。虽然H. Ohiense在东部州普遍存在,但发现密西西比州的H. Mississipiense在美国的中部和西部地区很普遍,但在某些地区也在地理上重叠,表明这些物种可能共同存在。物种生态裂建模表明,H。ohiense在温暖和干燥的地方繁衍生息,而密西西比州H. Mississippiense则是温度较低和降水量更高的地区的特有。此外,我们预测了两个物种共发生的多个次级接触区,有可能促进基因交换和杂交。这项研究提供了对美国组织胞浆病的基因组流行病学的最全面的理解,并为侵入性真菌疾病的研究奠定了蓝图。
引言真菌病真菌(MF)是皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)最常见的亚型,并由转化的皮肤居民记忆CD4 + T细胞的克隆膨胀来表征(1,2)。被诊断出患有早期MF的患者会出现皮肤斑块和斑块,并经历了有利预后的顽固疾病病程(2)。在初始阶段,大多数T细胞都居住在皮肤中,只有少量在外周血和淋巴结中循环。然而,大量患者进入晚期阶段,恶性淋巴细胞扩散到人体其他部位,这可能导致致命的结果(2-4)。MF的惊人特征是对皮肤的淋巴细胞增殖的限制,这意味着恶性细胞取决于其特异性皮肤肿瘤微环境(TME),包括细胞对细胞相互作用,空间分布和分泌因子(5,6)。恶性皮肤浸润淋巴细胞伴随着非恶性T细胞以及其他免疫细胞和基质细胞的真皮浸润(7-9)。所有这些细胞都会产生各种影响皮肤炎症的细胞因子和其他免疫调节剂因子,并且是TME的重要组成部分,促进了增殖,存活以及迁移并抑制肿瘤细胞免疫外生物保护剂。单细胞RNA测序(SCRNA-SEQ)(10)的进步允许从大型异质种群(例如患者活检)中对数千个单个细胞进行转录分析。对细胞异质性的这种分析提供了一个独特的机会,可以在其微环境的背景下评估单个细胞的功能(11,12)。通过MF皮肤病变的SCRNA-SEQ,我们(13)和其他(14,15)表明,MF TME中的T淋巴细胞显示出大量的患者间和患者内基因表达异质性。
摘要 引言 侵袭性曲霉病是血液病患者发病和死亡的最重要原因。目前,伏立康唑是侵袭性真菌病的一线治疗药物。伏立康唑的药代动力学个体间差异取决于遗传因素。伏立康唑总代谢的 70%–75% 参与 CYP450,主要是 CYP3A4 和 CYP2C19,其余 25%–30% 的代谢由单加氧酶黄素进行。CYP2C19 单核苷酸多态性可以解释伏立康唑代谢中 50%–55% 的变异性。材料和方法主要目的是比较预先伏立康唑基因分型与常规实践的效率。主要结果是第五天血清伏立康唑是否在治疗范围内。次要结果是与伏立康唑相关的治疗失败和首次给药后 90 天内不良事件的综合变量。总共将招募 146 名可能接受伏立康唑治疗的侵袭性曲霉病风险患者,并进行 CYP2C19 基因分型。如果患者最终接受伏立康唑治疗,他们将被随机分配(1:1 实验/对照)。在实验组中,患者将根据药物遗传学算法接受剂量,包括 CYP2C19 基因型和临床及人口统计信息。在对照组中,患者将根据临床实践指南接受剂量。此外,将进行西班牙国家医疗保健系统 (NHS) 的成本效益评估。将对每个组进行直接成本计算。结论这项试验将提供有关在西班牙 NHS 中实施预防性伏立康唑基因分型策略的可行性和成本效益的信息。伦理与传播 该方案的西班牙语版本已通过拉巴斯大学医院伦理委员会和西班牙药品和医疗器械管理局的评估和批准。 试验结果
这两种类型发生在同一位置,可能与相同的症状有关,并且在体格检查时通常具有相似的外观。但是,它们可以通过微观检查很容易区分。许多NHL亚型看起来相似,但是它们在功能上截然不同,并且对具有不同治疗概率的不同疗法有反应。hl亚型在显微镜上是不同的,并且键入基于显微镜差异和疾病程度。非霍奇金淋巴瘤非霍奇金的淋巴瘤是淋巴组织的癌,其中包括免疫系统的淋巴结,脾和其他器官。有许多不同类型的非霍奇金淋巴瘤(NHL),因此对其进行分类可能会令人困惑(即使对于医生来说)。已经使用了几种不同的系统,但最新的系统是世界卫生组织(WHO)分类。WHO系统基于:•淋巴细胞的类型淋巴瘤开始于•显微镜下淋巴瘤如何看待•淋巴瘤细胞的染色体特征•癌细胞表面上存在某些蛋白质的癌细胞,S。&Shaikh,H。2020。“非霍奇金淋巴瘤(NHL)是源自B细胞前体,成熟B细胞,T细胞前体和成熟T细胞的淋巴组织的肿瘤。非霍奇金淋巴瘤包括各种亚型,每个亚型具有不同的流行病学,病因,免疫表型,遗传,临床特征和对治疗的反应。可以根据疾病的预后将其分为两组,“懒惰”和“侵略性”。最常见的成熟B细胞肿瘤是卵泡淋巴瘤,伯基特淋巴瘤,弥漫性大B细胞淋巴瘤,地幔细胞淋巴瘤,边缘区淋巴瘤,原发性CNS淋巴瘤。最常见的成熟T细胞淋巴瘤是成年T细胞淋巴瘤,真菌病真菌。NHL的治疗方法差异很大,具体取决于肿瘤阶段,淋巴瘤的类型和各种患者因素(例如症状,年龄,表现状态)。这些肿瘤的自然病史显示出显着变化。酸不变的淋巴瘤有多年的打蜡和淋巴结肿大的淋巴结肿大,而侵袭性淋巴瘤具有特定的B症状,例如体重减轻,汗水,发烧,发烧并可能在几周内导致死亡,如果没有治疗。淋巴瘤通常具有懒惰的表现,包括卵泡淋巴瘤,慢性淋巴细胞性白血病/小淋巴细胞淋巴瘤和脾脏边缘区淋巴瘤。侵袭性淋巴瘤包括弥漫性大B细胞淋巴瘤,伯基特淋巴瘤,前体B和T细胞淋巴细胞白血病/淋巴瘤,以及成人T细胞白血病/淋巴瘤以及某些其他外周外周围T细胞淋巴瘤。最多三分之二的患者患有周围淋巴结肿大。皮疹上的皮疹,对昆虫叮咬,普遍疲劳,瘙痒,不适,未知来源的发烧,腹水和积液的高敏反应增加是不太常见的特征。在其疾病过程中,大约一半的患者患有外疾病外疾病(继发性外疾病),而10%至35%的患者在诊断时患有原发性淋巴瘤。原发性胃肠道(GI)淋巴瘤可能出现恶心和呕吐,