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World File Search System眼组学
多组学基因组学和转录组学信息图
在一个实验中研究多个“ eme”可以帮助研究人员获得对信息从基因到蛋白质的运动的宝贵见解，以更好地了解生活的复杂性。1许多多组合组合是可能的，每个组合都具有独特的好处。具体来说，基因组学和转录组学的组合可以揭示出遗传变异及其后果的更完整的情况。虽然基因组从细胞之间保持相同，但转录组可能会变化，从而扩大研究人员的观点。2
帕金森氏病的眼动 - 视觉认知组
运动障碍，例如帕金森氏病（PD）影响眼动函数 - 能够准确，有目的地移动眼睛以提供感官，认知和次级运动任务的能力。数十年的猴子和人类行为研究的神经物理研究已经表征了健康动眼控制的神经基础。 本综述将具有PD的人的眼睛运动与潜在的神经生理学机械学和途径联系起来。 在这个基础上建立了基础，我们重点介绍了使用眼动作来衡量症状严重程度，评估治疗效果并用作潜在的精确生物标志物的最新进展。 我们得出的结论是，尽管眼睛运动为PD机制提供了见解，但基于当前的证据，它们似乎缺乏足够的敏感性，并且可以用作独立的诊断工具。 与大数据集中的其他疾病指标结合使用时，可能会实现其全部潜力。数十年的猴子和人类行为研究的神经物理研究已经表征了健康动眼控制的神经基础。本综述将具有PD的人的眼睛运动与潜在的神经生理学机械学和途径联系起来。在这个基础上建立了基础，我们重点介绍了使用眼动作来衡量症状严重程度，评估治疗效果并用作潜在的精确生物标志物的最新进展。我们得出的结论是，尽管眼睛运动为PD机制提供了见解，但基于当前的证据，它们似乎缺乏足够的敏感性，并且可以用作独立的诊断工具。与大数据集中的其他疾病指标结合使用时，可能会实现其全部潜力。
文章探讨了青光眼中的眼表面微生物组和撕裂蛋白质组
摘要：尽管青光眼是全球不可逆性失明的主要原因，但其发病机理尚不完全理解，而眼内压（IOP）是靶向这种疾病的唯一可修改的危险因素。已经提出了包括IOP在内的肠道微生物组和青光眼之间的几个关联。越来越多的证据表明，在眼表面上的微生物之间的相互作用称为眼表面微生物组（OSM）和泪液蛋白质（统称为泪液蛋白质组），也可能在诸如青光眼等眼疾病中起作用。这项研究旨在在青光眼患者中找到OSM和撕裂蛋白的特征。32个结膜拭子的全元基因组shot弹枪测序鉴定出肌动杆菌，富公司和蛋白质细菌是同类中的主要门。该物种仅在健康对照中发现，与青光眼患者相比，它们的结膜微生物组可能富含磷脂酶途径的基因。尽管OSM在OSM中存在较小的差异，但与对照组相比，患者表现出与免疫系统相关的许多撕裂蛋白的富集。与OSM相反，这强调了蛋白质组的作用，并可能引起免疫过程在青光眼中的参与。这些发现可能有助于设计针对青光眼和其他相关疾病的新治疗方法。
iMLGAM：基于集成机器学习和遗传算法驱动的多组学分析 ...
iMeta 期刊 ( 影响因子 23.8 ) 由宏科学、千名华人科学家和威立出版，主编刘双江和傅静远教授。目标为生物 医学国际综合顶刊群 ( 对标 Nature/Cell) ，任何领域高影响力的研究、方法和综述均欢迎投稿，重点关注生物 技术、生信和微生物组等前沿交叉学科，已被 SCIE 、 PubMed 等收录，位列全球 SCI 期刊前千分之五，微生 物学研究类期刊全球第一；外审平均 21 天，投稿至发表中位数 57 天。 子刊 iMetaOmics ( 主编赵方庆和于君教授 ) 、 iMetaMed 定位 IF>10 的综合、医学期刊，欢迎投稿！
整合代谢组学和蛋白质组学，鉴定1种新型药物靶点
此预印本的版权所有者此版本于 2023 年 10 月 20 日发布。；https://doi.org/10.1101/2023.10.19.23297247 doi: medRxiv preprint
DNA提取协议影响眼表面微生物组曲线
方法：抽样了7个合格志愿者的两只眼睛。基于眼表微生物组领域的先前出版物选择了五种市售的DNA提取方案，并根据其报道的有效宿主DNA耗竭添加了2种宿主DNA耗竭方案，而没有细菌DNA浓度显着降低。使用Illumina Miseq测序靶向16S rRNA基因的V3-V4区域。R中的DADA2管道用于执行生物信息处理，并使用SILVA V132数据库进行了分类学分配。VEGDIST函数用于计算Bray-Curtis距离，并使用Galaxy Web应用程序通过线性判别分析效应大小（LEFSE）来识别潜在的元基因组生物标志物。r包decontam用于控制潜在的污染物。
眼动追踪技术在皮肤病学领域的新兴应用
眼动追踪技术已在众多学科中得到应用，提供将眼球运动与各种刺激（即 X 射线、情境定位、印刷信息和警告）的视觉处理联系起来的数据。尽管眼动追踪技术在识别和量化视觉注意力方面具有优势，但皮肤病学学科尚未广泛应用该技术。尽管皮肤科医生严重依赖视觉模式和线索来区分良性和非典型痣，但将眼动追踪技术应用于皮肤病学研究的文献很少；而专门针对患者发起的行为（例如皮肤自我检查 (SSE)）的文献基本上不存在。本文回顾了眼动追踪在各个医学领域的研究，并最终讨论了眼动追踪在皮肤病学研究中的当前应用和优势。© 2018 日本皮肤病研究学会。由 Elsevier B.V. 出版。保留所有权利。
通过整合代谢组学和转录组学发现糖尿病视网膜病变的潜在生物标志物
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放射组学预测疗效的系统评价
摘要 目的：先进的医学图像分析越来越多地用于预测胃肠道肿瘤患者的临床结果。本综述概述了放射组学在预测胃肠道肿瘤患者治疗反应中的价值。方法：根据 PRISMA 指南进行系统评价。该方案是前瞻性注册的（PROSPERO：CRD42019128408）。搜索了 PubMed、Embase 和 Cochrane 数据库。纳入了报告放射组学在预测胃肠道肿瘤患者治疗反应中的价值的原始研究。对结果进行了叙述性综合。结果按肿瘤类型分层。根据放射组学质量评分对纳入的研究进行质量评估。结果：全面文献检索确定了 1360 项独特研究，其中 60 篇文章被纳入分析。在 37 项研究中，放射组学模型和个体放射组学特征显示出对治疗反应的良好预测性能（曲线下面积或准确度 > 0.75）。构建预测模型的策略多种多样。预测模型通常进行内部验证，而大多数研究缺乏外部验证。没有一项研究报告在临床实践中实施的预测模型。结论放射组学越来越多地用于预测胃肠道癌症患者的治疗反应。本综述展示了其在帮助预测治疗反应、以非侵入性方式改善患者选择和早期调整治疗策略方面的巨大潜力。
Trinity-Biotech 宣布收购代谢组学...
“人体诊断通常被认为是医疗保健领域中从人工智能和机器学习的进步中获益最多的领域之一。因此，拥有一个专有的集成人体诊断平台对于 Trinity Biotech 具有战略意义，该平台将先进的生物标志物分析与机器学习相结合，为患者提供更好的诊断。更广泛地说，此次收购符合我们的战略，即将 Trinity 的既有能力（在本例中，我们的制造专业知识和纽约州卫生部认证的 Immco 参考实验室）与尖端技术（如 Metabolomics Diagnostics 的分析、机器学习和生物信息学专业知识）相结合，以解决大规模、紧急和重要的临床问题，在本例中是孕产妇和胎儿健康问题，”Trinity Biotech 总裁兼首席执行官 John Gillard 表示。“此外，这笔低成本交易的结构将迅速增值我们的整体特许经营权。”