背景:已经提出口服微生物群将硝酸盐还原为硝酸盐对口腔健康很重要,并导致一氧化氮形成可以改善心脏代谢状况,例如高血压和糖尿病。细菌组成在尺寸斑块中的研究表明,减少硝酸盐的细菌与健康状况有关,但是牙周炎对硝酸盐减少能力的影响,因此尚未评估一氧化氮的可用性。当前研究的目的是查看评估牙周炎和牙周治疗如何影响口服微生物群的硝酸盐降低能力。方法:首先,使用DADA2管道分析了来自不同国家的五项研究的16S rRNA测序数据,以比较减少硝酸盐的健康和牙周炎中的细菌。此外,在非手术牙周治疗(NSPT)之前和之后收集了来自42例牙周炎患者的subgingival斑块,唾液和血浆样本。使用16S rRNA基因的Illumina测序确定了尺寸的斑块细菌组成,并通过qPCR确定了硝酸盐还原生物标志物Rothia的数量。进行了唾液和血浆中硝酸盐和亚硝酸盐的测量,并在体外孵育三个小时后确定唾液硝酸盐还原能力(NRC),并与15个健康个体的NRC进行比较。结果:与健康个体相比,牙周炎患者的尺寸减少硝酸盐细菌均明显低(所有五个数据集中的p <0.05)。NSPT后,降低牙菌斑中硝酸盐还原细菌的增加(p <0.05),并与牙周炎相关细菌呈负相关(P <0.001)。
作者:S Das · 2023 · 被引用 8 次 — 并用于对有害病原体的免疫防御,4 以及其氧化物种,即过氧亚硝酸盐 (ONOO。−。)5 或/二氧化氮 (cNO2) ...
1 Life and Health Sciences Laboratory, Faculty of Medicine and Pharmacy, Abdelmalek Essaadi University, Tanger 90000, Morocco 2 Department of Soil Microbiology and Symbiotic Systems, Estaci ó n Experimental del Zaid í n-CSIC, E-18008 Granada, Spain 3 Conservation and Valorization of Natural Resources Laboratory, Faculty of Sciences Dhar El Mehraz, Sidi Mohammed Ben Abdellah大学,FèZ-Atlas 30003,摩洛哥4植物和微生物生物技术实验室,生物多样性与环境,生物多样性与环境,科学院,Mohammed v University,Rabat 10000,Rabat 10000,摩洛哥5,摩洛哥5,摩洛哥5号,摩洛哥5号,摩洛哥5号,摩洛哥5号科学系,国家科学系,国家科学研究所(CORICTORIAN和CRICTORATY)。生物学,生物技术,民族药理学与健康,科学学院,穆罕默德第一大学,摩洛哥Oujda 60000 *通信:ach@ugr.es
重整 (SMR) 为哈伯-博施法提供 H 2 气作为原料。利用来自可再生技术的电力进行电化学 H 2 生产及其后续利用可以成为“绿色 NH 3 ”的来源。尽管用于绿色 H 2 生产 的聚合物电解质膜 (PEM) 电解器的效率和稳定性已经有了显着发展,但每吨氨至少需要 30.3-35.3 GJ,运行效率甚至高达 60-70%。此外,使用空气分离装置和哈伯-博施环路压缩机供应 N 2 以进行使用绿色 H 2 的哈伯-博施法,每吨氨还需要 2.7 GJ 的 N 2 生产。这些成本目前仍然高于传统的哈伯-博施法(低于每吨氨 30 GJ)。 54,55 在这方面,电化学氮还原 (NRR) 近来引起了全球研究兴趣,以生产 NH 3 作为哈伯-博施法的替代品。迄今为止,该法产量低(低于 3·10·10 mol s 1 cm 2 )且法拉第效率 (FE,低于 10%),受到 NRN 键强度 (941 kJ mol 1 )、N 2 在水溶液中的溶解度差(环境条件下为 0.66 mmol L 1 )以及竞争性析氢反应 (HER) 的挑战。7,8
摘要 在美国田纳西州橡树岭,Rhodanobacter 是受高浓度硝酸盐和铀污染的蓄水层中的优势菌属。原位刺激反硝化已被提出作为修复硝酸盐和铀污染的潜在方法。在 Rhodanobacter 种中,据报道 Rhodanobacter denitri filcans 菌株具有反硝化能力并含有丰富的金属抗性基因。然而,由于这些菌株缺乏诱变系统,我们对低 pH 抗性和在污染环境中占主导地位的能力的潜在机制的理解仍然有限。在这里,我们在两株 R. denitri filcans 菌株中开发了一种无标记缺失系统。首先,我们优化了 10 株 Rhodanobacter 菌株的生长条件,测试了抗生素抗性,并确定了合适的转化参数。然后,我们在 R. denitri filans 菌株 FW104-R3 和 FW104-R5 中删除了编码尿嘧啶磷酸核糖基转移酶的 upp 基因。所得菌株被命名为 R3_ D upp 和 R5_ D upp,并用作宿主菌株,以 5-氟尿嘧啶 (5- FU) 抗性作为反选择标记进行诱变,以产生无标记缺失突变体。为了测试开发的方案,在 R3_ D upp 和 R5_ D upp 宿主菌株中敲除了编码硝酸盐还原酶的 narG 基因。正如预期的那样,narG 突变体无法在以硝酸盐为电子受体的缺氧培养基中生长。总体而言,这些结果表明,同框无标记删除系统在两种 R. denitri ficans 菌株中有效,这将有助于未来对这些菌株进行功能基因组研究,进一步了解 Rhodanobacter 种中存在的代谢和抗性机制。
摘要 在美国田纳西州橡树岭,Rhodanobacter 是受高浓度硝酸盐和铀污染的蓄水层中的优势菌属。原位刺激反硝化已被提出作为修复硝酸盐和铀污染的潜在方法。在 Rhodanobacter 种中,据报道 Rhodanobacter denitri filcans 菌株具有反硝化能力并含有丰富的金属抗性基因。然而,由于这些菌株缺乏诱变系统,我们对低 pH 抗性和在污染环境中占主导地位的能力的潜在机制的理解仍然有限。在这里,我们在两株 R. denitri filcans 菌株中开发了一种无标记缺失系统。首先,我们优化了 10 株 Rhodanobacter 菌株的生长条件,测试了抗生素抗性,并确定了合适的转化参数。然后,我们在 R. denitri filans 菌株 FW104-R3 和 FW104-R5 中删除了编码尿嘧啶磷酸核糖基转移酶的 upp 基因。所得菌株被命名为 R3_ D upp 和 R5_ D upp,并用作宿主菌株,以 5-氟尿嘧啶 (5- FU) 抗性作为反选择标记进行诱变,以产生无标记缺失突变体。为了测试开发的方案,在 R3_ D upp 和 R5_ D upp 宿主菌株中敲除了编码硝酸盐还原酶的 narG 基因。正如预期的那样,narG 突变体无法在以硝酸盐为电子受体的缺氧培养基中生长。总体而言,这些结果表明,同框无标记删除系统在两种 R. denitri ficans 菌株中有效,这将有助于未来对这些菌株进行功能基因组研究,进一步了解 Rhodanobacter 种中存在的代谢和抗性机制。
除草剂clopyralid的污染物(3,6-二氯-2-吡啶 - 羧酸,CLP)对生态系统构成了潜在的威胁。然而,普遍缺乏研究CLP对生物衍生过程扰动的研究,其生物反应机制尚不清楚。在此,对CLP的长期暴露进行了系统的研究,以探索其对硝化性能和动态微生物反应的影响。结果表明,CLP的低浓度(<15 mg/ L)最初引起严重的亚硝酸盐积累,而在长期适应后,CLP的浓度较高(35 E 60 mg/ L)没有进一步的影响。这项机械研究表明,CLP减少了亚硝酸盐还原酶(NIR)活性,并抑制了代谢活性(碳代谢和氮代谢),从而导致氧化应激和膜损伤,从而导致亚硝酸盐的积累。但是,经过80天以上的适应,几乎没有在60 mg/L Clp的情况下发现亚硝酸盐积累。提出,细胞外聚合物物质(EPS)的分泌在15 mg/l Clp时从75.03 mg/g VSS增加到60 mg/l Clp的109.97 mg/g VSS,从而增强了微生物细胞的保护和改善的NIR活性和改善的NIR活性和代谢活性。此外,Mi-Crobial社区的生物多样性和丰富性经历了U形过程。最初硝化和代谢相关的微生物的相对丰度最初降低,然后随着与EPS和N-酰基 - 糖烯内酯分泌有关的微生物的富集而回收。©2021作者。这些微生物保护了微生物免受有毒物质的影响,并调节了它们之间的相互作用。这项研究揭示了成功暴露于CLP后的硝化生物反应机制,并为分析和治疗含除草剂的废水提供了适当的指导。由Elsevier B.V.代表中国环境科学研究所,中国环境科学学院出版。这是CC BY-NC-ND许可证(http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/)下的开放访问文章。
我们报告了一项系统的研究,该系统研究盐浓度及其阳离子价对模型的混合物的多种等分和转运性能,其混合物具有单价(Lino 3)的硝酸盐(lino 3),二价(mg(no 3)2和Ca(no 3)2和Ca(no 3)2)和(no 3)3)salts。由适当的实验技术确定的这些特性包括密度,声速,折射率,表面张力,电导率和粘度。单粒子动力学和径向分布函数也通过分子动力学模拟进行了分析。在Vogel-Fulcher-Tammann框架中研究了电导率的温度依赖性,我们获得了有效的激活能量,脆弱性指数和Vogel温度。此外,我们进行了高温Arrhenius分析,并计算了电导率和粘度的激活能。最后,获得了不同混合物的分数Walden规则的指数,并分析了系统的离子和脆弱性,证明所有混合物都是亚离子和脆弱的。在其第一个溶剂化壳中建立的由添加盐的阳离子和硝酸盐阴离子组成的长寿命阴离子聚集体的氢键网络的变形以及长寿命的阴离子聚集体的形成是对分析特性产生的深影响。细节分析了盐阳离子的表面电荷密度对溶液的结构和运输特性的作用,并与离子液体极性纳米孔(纳米结构溶剂化)中盐物质的溶剂化有关。2022作者。由Elsevier B.V.这是CC BY-NC-ND许可证(http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/)下的开放访问文章。
摘要 Rhodanobacter 菌种在受到酸、硝酸盐、金属放射性核素和其他重金属污染的橡树岭保留区 (ORR) 地下环境中占主导地位。为了揭示适应这些混合废物环境的基因组特征并指导遗传工具开发,我们对从 ORR 地点分离的八株 Rhodanobacter 菌株进行了全基因组测序。基因组大小范围为 3.9 至 4.2 Mb,包含 3,695 至 4,035 个蛋白质编码基因,GC 含量约为 67%。根据全长 16S rRNA 序列,七株菌株被归类为 R. denitricans,一株菌株 FW510-R12 被归类为 R. thiooxydans。根据基因注释,全基因组扩增率(泛/核心基因比率)最高的两个直系同源物簇(COG)是“复制、重组和修复”和“防御机制”。除NosZ中预测的蛋白质结构差异外,反硝化基因具有高度的DNA同源性。相反,重金属抗性基因多种多样,其中7%至34%位于基因组岛中,这些结果表明起源于水平基因转移。对四个菌株的甲基化模式分析揭示了独特的5mC甲基化基序。与类型菌株2APBS1相比,大多数直系同源物(78%)的非同义替换与同义替换之比(dN/dS)小于1,表明负选择普遍存在。总体而言,结果为水平基因转移和负选择在污染田间基因组适应中的重要作用提供了证据。罗丹诺杆菌菌株中复杂的限制-修饰系统基因和独特的甲基化基序表明其对基因操作具有潜在的抵抗力。