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World File Search System碎裂
染色体碎裂是 CRISPR 的靶向后果......
数据可用性 图 1f、6e、i 和扩展数据图 2e 中呈现的细胞全图以及过滤的 SV 调用可在 doi: 10.5281/ zenodo.4533300 下获得。图 1c-e、4、6a-d、f、h 和扩展数据图 1b-f、h-j、2a-d、4、5c 和 6 的源数据随论文提供，包括扩展图 1c 中未处理的 Western blot。有助于图 1e、4、6c、h、扩展数据图 1d、2、5c 和 Look-Seq 实验（图 2、3、5、扩展数据图 3）分析的原始图像和视频因文件大小限制而未发布，但可根据合理要求提供。 CD34+ HSPC 衍生的 FISH 和 SKY 图像和分析（图 6d-g）由圣犹达细胞遗传学共享资源实验室生成，支持图 6d-g 中发现的衍生数据可应要求从通讯作者处获得。序列读取数据可在 Bioproject PRJNA676146 下的测序读取档案 (SRA) 中找到。
CRISPR 染色体碎裂：基因治疗中 CRISPR/Cas9 诱发染色体碎裂的风险
摘要 成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR)/Cas9 核酸酶系统已经能够生成疾病模型并开发许多遗传和非遗传疾病的治疗方法。然而，大规模基因组重排的产生引发了人们对 CRISPR/Cas9 核酸酶方法临床应用的安全性担忧。在这些事件中，由于染色体截断而形成的微核和染色体桥可导致局限于一条或几条染色体的大规模基因组重排。这种被称为染色体碎裂的现象最初是在癌细胞中描述的，人们认为它是由有丝分裂过程中染色体分离缺陷或 DNA 双链断裂引起的。在这里，我们将讨论影响 CRISPR/Cas9 诱导的染色体碎裂（以下称为 CRISPR 碎裂）的因素及其结果、表征这些事件的工具以及将其最小化的策略。 关键词：基因组编辑； CRISPR/Cas9；染色体碎裂；基因治疗；基因毒性；微核；染色体不稳定性。
低地球轨道卫星对意外和故意碎裂事件的恢复能力
人们普遍认为，随着这种大型（或巨型）星座中卫星数量的增加，扩散式 LEO 星座的“弹性”会单调增加。本文结合使用分析和蒙特卡罗工具研究了多种场景，以评估意外或故意随机碎片事件（可能发生在星座的一部分）对星座其余部分产生的短期影响。结果表明，增加卫星数量可能会显著增加因碎片事件而导致的后续碰撞事件数量。因此，大型 LEO 星座可能会因相关的 SST、SSA 和 STM 活动而给所有星座带来重大成本，也可能对其他附近星座造成重大后续碰撞风险。用预期碎片增长来表征这种成本对于了解未来的 SST、SSA 和 STM 要求以及设计更具弹性的星座非常重要。我们建议进一步研究这些工具，以评估高度扩散的星座对任务性能弹性的影响，以及故意针对的动能碎裂事件的碰撞风险和弹性后果。
反应材料碎裂行为与能量释放的基础研究
反应材料 (RM) 是一类由金属、金属氧化物和/或聚合物组成的工程颗粒复合材料。这些复合材料在国防应用方面很有吸引力，因为它们的碎裂和能量释放特性或热机械行为可增加向目标的有效能量传递。了解和预测 RM 的热机械行为对于有效设计和应用这些材料至关重要。在这项工作中，我们制作了具有不同成分、孔隙率和粒度的铝和 Al/PTFE RM 样品，以产生不同的机械响应和能量释放。准静态压缩试验、Kolsky 杆压缩试验和高速冲击研究用于评估 RM 样品在应变率在 10 −3 s −1 和 10 5 s −1 之间的机械响应。开发并验证了一种广义参数化模型，用于预测具有不同成分、孔隙率和粒度的 RM 的准静态材料响应。Kolsky 棒样本的碎片分布和高速撞击研究用于评估现有的碎片模型，表明广义的 RM 碎片模型仍然难以捉摸。展示了最小能量状态碎片模型在预测动态碎片粒状复合材料的特征碎片尺寸中的应用，并讨论了其局限性。弹式量热法和通风量热法实验用于探索本质上是多相的 RM 燃烧特性。开发了一种相位兼容的吉布斯最小化自由能平衡求解器，以改进对 RM 反应的能量释放和平衡产物状态的预测，并使用弹式量热法测量进行了验证。关键词：反应材料、铝/PTFE 燃烧、颗粒复合材料、动态碎裂、多相平衡建模、Grady 碎裂模型
大规模 Schwinger 模型中的准碎裂函数
部分子分布和碎裂函数是分析大多数高能数据的核心 [1,2]。在光前沿，由于时间膨胀和渐近自由，强子由冻结的部分子组成 [3 – 5]。因此，量子色动力学 (QCD) 中的硬过程可以分解为可微扰计算的硬块乘以非微扰矩阵元素，例如部分子分布函数 (PDF) 和碎裂函数 (FF)。PDF 在光前沿被估值，并且本质上是非微扰的，这使得它们无法用标准欧几里得格子公式来计算，除了几个最低矩之外。这个缺点可以通过使用准分布 [6] 及其变体 [7,8] 来避免。这些提议现在已被许多 QCD 格子合作所采用 [9 – 14]。我们最近展示了如何将这些概念扩展到量子计算 [15] 。夸克碎裂的概念起源于菲尔德和费曼的原创工作，他们提出了夸克喷流模型来描述半包容过程中介子的产生 [16] 。该模型本质上是一个独立的部分子级联模型，其中硬部分子通过发射连续的
采用酶促碎裂法制备文库所得的测序产物
DNA 片段化是基于杂交捕获的短读测序中文库制备过程中的一个基本步骤。迄今为止，人们一直使用超声波来制备适当大小的 DNA，但这种方法会导致大量 DNA 样本损失。最近，研究采用了依赖于 DNA 内切酶酶促片段化的文库制备方法来最大限度地减少 DNA 损失，尤其是在纳米量样本中。然而，尽管它们被广泛使用，但酶促片段化对所得序列的影响尚未得到仔细评估。在这里，我们对使用超声波和酶促片段化方法制备的相同肿瘤 DNA 样本的体细胞变异进行了成对比较。我们的分析显示，与通过超声波创建的文库相比，内切酶处理的文库中反复出现的人工 SNV/indel 数量要多得多。这些人工制品以基因组背景下的回文结构、测序读取中的位置偏差和多核苷酸替换为标志。利用这些独特的特性，我们开发了一种过滤算法，可以高特异性和灵敏度地区分真正的体细胞突变和人为噪声。噪声消除恢复了肿瘤样本中突变特征的组成。因此，我们提供了一种信息学算法来解决因内切酶介导的碎片化而产生的测序错误，这是本研究中首次强调的。
一种脂肪族胺的无痕连接剂，还原后可快速定量碎裂
RSL 的一个重要应用是对蛋白质上赖氨酸残基进行可逆修饰。例如，已经开发出大量可提高蛋白质治疗效果的化合物，如 PEG 或细胞穿透肽。10 – 12 这些佐剂需要与蛋白质结合以增强蛋白质递送。赖氨酸残基在蛋白质上普遍存在，由于其高亲核性，可以在温和的水条件下轻松修饰，因此是将佐剂与蛋白质结合的有吸引力的靶标。然而，赖氨酸残基也经常对蛋白质活性至关重要，大量修饰通常会损害蛋白质活性。因此，可逆修饰赖氨酸残基的 RSL 有可能克服这一限制，从而成为一种有前途的蛋白质递送策略。13
一种脂肪族胺的无痕连接剂，还原后可快速定量碎裂
RSL 的一个重要应用是对蛋白质上赖氨酸残基进行可逆修饰。例如，已经开发出大量可提高蛋白质治疗效果的化合物，如 PEG 或细胞穿透肽。10 – 12 这些佐剂需要与蛋白质结合以增强蛋白质递送。赖氨酸残基在蛋白质上普遍存在，由于其高亲核性，可以在温和的水条件下轻松修饰，因此是将佐剂与蛋白质结合的有吸引力的靶标。然而，赖氨酸残基也经常对蛋白质活性至关重要，大量修饰通常会损害蛋白质活性。因此，可逆修饰赖氨酸残基的 RSL 有可能克服这一限制，从而成为一种有前途的蛋白质递送策略。13
研究共振低能电子与甲酰胺的结合：模型肽键解离动力学和其他碎裂通道
我们报告了通过解离电子附着于气态甲酰胺而产生的阴离子的三维动量成像测量的实验结果。从动量图像中，我们分析了 NH7、O~ 和 H~ 碎片的角能和动能分布，并讨论了两种入射电子能量范围（从 5.3 eV 到 6.8 eV 以及从 f 0.0 eV 到 ff .5 eV）的多重共振的可能电子附着和解离机制。与实验结果相比，对于 ^6 eV 入射电子，NET 阴离子的角分布的从头算理论结果强烈表明，产生该碎片的两个共振之一是 2 A" Feshbach 共振。
研究共振低能电子与甲酰胺的结合：模型肽键解离动力学和其他碎裂通道
电子-分子碰撞过程指的是分子捕获低能电子（即能量高达 ∼ 20 eV）形成短暂、不稳定的分子阴离子，然后解离成几个碎片（一个负离子，其他都是中性），这是一个长期研究的过程，称为解离电子附着（DEA）。DEA 是基于电子-分子碰撞的基本相互作用之一 [1-8]，在凝聚态物质 [9-12]、气态电子 [13] 到低能等离子体 [14] 等多个领域中发挥着重要作用。自然环境中 DEA 与分子相关的低能电子通常是物质与高能光子或粒子之间初级相互作用的副产物。研究表明，这些电子在生物过程中起着关键作用，例如引发 DNA 链断裂和其他 DNA 解离过程 [ 15 – 18 ] 以及蛋白质的辐射损伤 [ 19 ]。甲酰胺 (HCONH 2 ) 被广泛认为是研究蛋白质和肽化学的原型模型分子，因为它具有简单而丰富的结构，其中包括一个酰胺键。甲酰胺分解成其他值得注意的简单有机分子（例如 CH、HCN、HCNO 等）已在实验和理论环境中得到广泛研究。甲酰胺由许多复杂生物分子（如蛋白质和核酸）的祖先组成，被认为是简单生物分子进化为复杂结构的重要环节。此外，甲酰胺由于其 NC 酰胺键而引起了广泛关注。这一特征使甲酰胺成为研究电子捕获的典型分子