XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System磷酸二酯
BCH-2011：核苷酸和核酸
核酸被定义为与生物聚合物有关的生物聚合物，这些生物聚合物参与了从一代到另一代的遗传信息的保存和传播。构成核酸的核苷酸与糖在3'和5'位置之间的磷酸二酯键相连。连接称为3'-5'磷酸二酯键。
RNase T1 REF: EG24210-S/M 储运条件
RNase T1 是一种来源于米曲霉 (Aspergillus oryzae) 的核糖核 酸内切酶，可特异性地在单链 RNA 的鸟嘌呤核糖核苷酸 (G) 后进行 切割，产生 3' 磷酸末端。 RNase T1 能够形成核苷 2' ， 3'- 环磷酸中 间体，以切割 3'- 鸟苷残基与邻近核苷 5'-OH 基团之间的磷酸二酯键， 产生含末端 3'-GMP 的寡核苷酸和 3'-GMP 。
继承的分子基础
DNA和RNA世界：1。在门德尔（Mendel）之后的几年中，研究了遗传物质的性质，从而意识到DNA是大多数生物中的遗传物质。2。脱氧核糖核酸（DNA）和核糖核酸（RNA）是活体系中发现的两种核酸。核酸是核苷酸的聚合物。3。DNA在大多数生物体中充当遗传物质，而RNA在某些病毒中充当遗传物质。4。RNA主要用作Messenger。RNA具有其他功能作为衔接子，结构或催化分子。 5。 多核苷酸链的结构（i）核苷酸具有三个部分，即 氮基，五糖糖（DNA中的脱氧核糖，RNA中的核糖）和磷酸基团。 （ii）氮碱是嘌呤，即 腺嘌呤，鸟嘌呤和嘧啶，即 胞嘧啶，尿嘧啶和胸腺嘧啶。 （iii）胞嘧啶在DNA和胸腺氨酸中都存在于DNA中。 尿嘧啶存在于胸腺嘧啶位置的RNA中。 （iv）氮基碱通过N-糖苷键连接到五糖糖，形成核苷，即 腺苷和鸟嘌呤等。 （v）当磷酸基团通过磷酸二酯键连接到核苷的5' - OH时，形成了相应的核苷酸。 （vi）两个核苷酸通过3' - > 5'磷酸二酯键连接以形成二核苷酸。 （vii）可以连接几个核苷酸以形成多核苷酸链。 （x）基碱对彼此互补。RNA具有其他功能作为衔接子，结构或催化分子。5。多核苷酸链的结构（i）核苷酸具有三个部分，即氮基，五糖糖（DNA中的脱氧核糖，RNA中的核糖）和磷酸基团。（ii）氮碱是嘌呤，即腺嘌呤，鸟嘌呤和嘧啶，即胞嘧啶，尿嘧啶和胸腺嘧啶。（iii）胞嘧啶在DNA和胸腺氨酸中都存在于DNA中。尿嘧啶存在于胸腺嘧啶位置的RNA中。（iv）氮基碱通过N-糖苷键连接到五糖糖，形成核苷，即腺苷和鸟嘌呤等。（v）当磷酸基团通过磷酸二酯键连接到核苷的5' - OH时，形成了相应的核苷酸。（vi）两个核苷酸通过3' - > 5'磷酸二酯键连接以形成二核苷酸。（vii）可以连接几个核苷酸以形成多核苷酸链。（x）基碱对彼此互补。（viii）多核苷酸链中的主链由于糖和磷酸盐而形成。（ix）与主链糖部分相关的氮基碱基。6。在RNA的情况下，每个核苷酸残基都有一个额外的OH组，核糖中的2位位于核糖中。另外，在胸腺氨酸（5-甲基尿嘧啶）的位置也发现了尿嘧啶。
CRISPR中非目标DNA裂解的催化机制...
摘要：CRISPR-CAS9是一种尖端的基因组编辑技术，它使用核酸内切酶Cas9在基因组所需的位点引入突变。这个革命性的工具有望治疗无数的人类遗传疾病。然而，尚未确定DNA裂解的分子基础，这是基因组编辑的基本步骤。在这里，使用量子 - 经典分子动力学（MD）和自由能方法来披露CRISPR-CAS9中磷酸二酯键裂解的两级依赖机理。从头算MD揭示了Mg 2+磅重的RUVC活动位点的构象重排，这需要H983的搬迁作为一般基础。然后，DNA的裂解通过两个Mg 2+离子的联合动力学从根本上进行的一致的关联途径进行。这证明了先前有争议的实验证据，这些证据无法完全确定保守的H983和金属簇构象的催化作用。与其他两级依赖性酶的比较支持了识别机制，并提出了基因组编辑和重组的常见催化策略。总体而言，此处描述的非目标DNA裂解催化解决了CRISPR-CAS9生物学中的基本开放问题，并为提高Cas9酶的催化效率和金属依赖性功能提供了宝贵的见解，这是基于基因组编辑工具的开发的基础。关键字：基因组编辑，QM/mm，自由能模拟，蛋白质/核酸相互作用，非编码RNA，磷酸二酯键裂解，镁辅助催化催化，CRISPR-CAS9■简介
核苷酸及其各种作用的概述。
核苷酸中的磷酸基团在DNA和RNA的结构中起重要作用。它为分子提供负电荷，这对于维持DNA双螺旋结构的稳定性很重要。磷酸基团还形成了核酸链的骨干，将单个核苷酸通过磷酸二酯键将其连接在一起。除了它们在DNA和RNA中的作用外，核苷酸在许多其他细胞过程中都起着重要作用。它们参与了富含能量的分子（例如ATP）的合成，ATP被用作细胞过程的能量来源。核苷酸也用作辅酶，它们是有助于酶执行其功能的分子。例如，NAD+和FAD是两个重要的辅酶，它们源自核苷酸[2]。
AccuCRISPR™ 突变检测试剂盒 (T7E1)
(T7E1)] 可以检测靶向基因组编辑并评估其效率。该方法具有能够快速简单地进行分析的优点。在 T7E1 检测中，通过 PCR 扩增目标基因组区域，并将 PCR 产物变性并重新退火以产生异源双链 DNA。T7E1 识别异源双链 DNA 并在错配 5´ 处的第一、第二或第三个磷酸二酯键处切割。结果可以通过琼脂糖凝胶电泳进行分析。这是一种通过凝胶带的强度来测量基因组编辑效率并获得一致数据的可靠方法。应用
生物物理学前沿研讨会系列
位点特异性 DNA 重组酶以极其整齐的方式催化单向 DNA 插入、反转和缺失反应，不会留下断裂的磷酸二酯键。然而，它们这样做的机制给它们留下了一个有趣的热力学问题：产物中的共价键净数量与底物中的共价键净数量相同。这些酶如何推动它们的反应完成？此外，它们如何“决定”将哪些 DNA 位点配对为底物以及以何种相对方向配对？我们最近的一系列低温电子显微镜结构为我们最喜欢的位点特异性重组酶（大型丝氨酸整合酶）如何实现这一目标提供了结构解释。主办方：生物系
DNA连接酶III/LIG3单克隆抗体
背景信息DNA连接酶III（DNA连接酶3）是一种酶，在人类中被LIG3基因编码。人类Lig3基因编码依赖ATP的DNA连接酶，该连接酶密封双链DNA的磷酸二酯主链中的中断。真核生物中有三个依赖ATP的DNA连接酶。这些酶利用相同的三步反应机制； 1形成共价酶 - 腺苷酸中间体； 2将腺苷酸基的转移到DNA柱的5'磷酸末端； 3磷酸酯键的形成。与几乎所有真核生物中发现的Lig1和Lig4家族成员不同，Lig3家族成员的分布较差。LIG3基因通过替代翻译起始和替代剪接机制编码几种不同的DNA连接酶。