蔗糖磷酸酶通过二糖基化反应是有趣的酶,可以从蔗糖中将葡萄糖从蔗糖(供体底物)转移到诸如avonyoids之类的受体中以形成果糖二轭物,从而调节其溶解度和生物活性。在这里,我们第一次报告了来自海洋细菌Alteromonas地中海(AM SP)及其酶特性的蔗糖磷酸化酶的结构。研究了(þ) - catechin的蔗糖水解和转葡萄糖基能力的动力学。野生型酶(AMSP-WT)在蔗糖上显示出高的水解活性,并且没有(Þ) - catechin上的转氨基化活性。两个变体,AM SP-Q353F和AM Sp-P140d cat-((þ) - catechin的重新杂质葡萄糖基化,新型化合物(Þ)-catechin-4 0-o-o-o-o-a-d-d-d-glucopopyranoside(amssp--p- p-4 0),以获取(þ)-CATECHIN:89% )-CATECHIN -3 0 -O -A -D -d -gulucopyranoside(Cat -3 0),用于AMSP -Q353F。化合物CAT-4 0通过NMR和质谱法充分表征。通过分子对接模拟在原子水平上提供了对这种差异差异的一种解释:AM SP-P140D在一种模式下,在AMSP-Q35353-Q35353的结合模式下,在其在其羟基中的hydroxy组中,在gluco-Q35353的结合模式下,在gluco-sydrox群体上优先结合(þ)-CATECHIN,该模式有利于gluco-sylation gluco- sylation-syly-Q353-Q353-Q353-Q353-Q353FF。 3'。©2024作者。由Elsevier B.V.这是CC BY-NC-ND许可证(http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/)下的开放访问文章。
摘要背景:癌症中最常见的零星纯合缺失之一是9p21损失,其中包括甲基硫酸盐基因氨基磷酸化酶(MTAP),CDKN2A和CDKN2B,并且与恶化的结构和免疫治疗疗法相关。mtap -loss是通过与MAT2A和PMRT5抑制剂的合成致死性来发展的药物靶标。这项研究的目的是研究晚期胃肠道(GI)肿瘤中MTAP-损失的患病率和基因组局势,并研究其作为预后生物标志物的作用。材料和方法:我们对包括5个GI癌的64 860个肿瘤进行了下一代测序以及比较基因组和临床分析。我们比较了一项回顾性研究,比较了gi癌患者的临床结果。结果:GI癌症中MTAP -loss的患病率为8.30%。mtap -loss在胰腺导管腺癌(PDAC)中最普遍,为21.7%,结直肠癌(CRC)为1.1%。mTAP -loss肿瘤更为普遍。在MTAP -loss肿瘤中观察到了潜在靶向基因组改变的患病率(ATM,BRAF,BRCA2,ERBB2,IDH1,PIK3CA和PTEN)的显着差异,并根据肿瘤类型而变化。mtap -loss PDAC,IHCC和CRC的患病率较低或肿瘤突变负担升高。结论:在GI癌中,MTAP -loss是9P21损失的一部分,总体患病率为8%。阳性PD -L1肿瘤细胞表达在MTAP -loss与MTAP -INTACT IHCC肿瘤(23.2%vs 31.2%,p = .017)中的频率较低。mtap -loss发生在22%的PDAC,15%的IHCC,8.7%的胃食管腺癌,2.4%的肝细胞癌和CRC的1.1%,并且与其他可靶向突变相互排斥。关键词:MTAP损失; 9p21损失;基因组学;生物标志物;瘤;胆管癌。
fi g u r e 1抑制糖原磷酸化酶会刺激20至22个月大的小鼠的记忆形成。(a)实验的示意图;有关更多详细信息,请参阅图S2 a。(b,c)在第0天和第14天进行的熟悉会议期间的探索时间。(d)在熟悉会议中对任何对象的第一次探索的潜伏期,以及(e)延迟与第14天到第0天之间的第一次探索的比率是与海马可塑性相关的记忆形成索引。我们观察到Y-CTR和O-bay小鼠的空间取向增加(第14天的时间缩短),Y-bay和O-CTR小鼠的空间取向降低(第14天的时间延长)。(f)第14天的蔗糖偏好测试。(g)体重指数为第0天的体重百分比。(h)在第14天在rotarod测试中花费的时间。每个实验组n =9。组之间的统计学上显着变化表示(* p <0.05; ** p <0.01; *** p <0.001)。
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证(未经同行评审证明)获得的是作者/资助者,他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可,以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人,该版本发布于2025年2月17日。 https://doi.org/10.1101/2025.02.12.12.637574 doi:Biorxiv Preprint
了解促进转移播种早期事件的机制是开发减少转移的治疗方法的关键,这是与癌症相关死亡的主要原因。使用全动物筛查在癌症的基因工程小鼠模型中,我们已经确定了与转移相关的循环代谢产物。具体来说,我们将嘧啶尿嘧啶作为突出的转移相关代谢物。尿嘧啶是由表达尿苷磷酸酶-1(UPP1)的中性粒细胞产生的,癌症中嗜中性粒细胞的特异性UPP1表达增加。改变的UPP1活性会影响中性粒细胞表面上的粘附分子的表达,从而导致嗜中性肺前肺中性粒细胞运动降低。此外,我们发现表达UPP1的中性粒细胞抑制T细胞增殖,UPP1产物尿嘧啶可以增加细胞外微环境中的纤连蛋白沉积。始终如一,具有乳腺肿瘤的小鼠中UPP1的敲除或抑制会增加T细胞的数量,并减少肺中的纤连蛋白含量,并降低发展肺转移的小鼠比例。这些数据表明UPP1在肺中影响中性粒细胞的行为和细胞外基质沉积,并表明该途径的药理靶向可能是减少转移的有效策略。
定量实时PCR(QPCR)是一种敏感且常用的基因表达分析技术,并提供了对生物系统的见解。成功的QPCR需要使用适当的参考基因来进行数据归一化。在本研究中,我们旨在识别和评估近乎异构抗性(R)和易感的(S)番茄线中最佳的参考基因感染了begomovirus番茄卷曲卷曲特技病毒(TOCSV)。十个候选参考基因,即Actin7(ACT),β-6微管蛋白(TUB),ubiqui-3(UBI),网格蛋白辅助络合物中等亚基(CAC),植物苯乙烯去饱和酶(PDS),表达蛋白质(Exp),表达蛋白(Exp),糖 - 3-氢酶(Gap)dehyhydyhyhyhyhyhyhyhyhyhyddroplhats gaplospy(Gap)(Gap)(Gap)(Gap)(磷酸化磷酸化酶(Gap))(Gaps)(磷酸化磷酸化酶(Gap))(Gaps)(磷酸化磷酸化酶(Gap))(磷酸化磷酸化酶(Gap))(磷酸化磷酸磷酶)选择磷酸贝素转移酶样蛋白(APT1),TAP42相互作用蛋白(TIP41)和伸长因子1-α(EF1α)(EF1α),并评估其在耐药性和易感番茄叶中使用分析性工具,Normfin-der,Normfin-der,BestEpeper和Reffinder和Reffindine的耐药性和敏感番茄叶片中的表达能力。在将参考基因从大多数到最不稳定进行排名之后,结果表明,在S系中,ACT,EXP和EF1α的组合以及R在R线中的TIP41,APT1和ACT的组合适用于QPCR归一化。此外,为了验证已鉴定的参考基因,超级氧化物歧化酶(SOD),热休克蛋白70(HSP70)和谷胱甘肽-S-转移酶(GST)的选择是作为TAR-获取归一化的。与最稳定的基因相比,针对最稳定的参考基因进行标准化时,靶基因的相对表达变化。这些结果强调了在QPCR研究中仔细选择参考基因以进行准确正常的重要性。
背景:辣木peregrina被广泛用于阿拉伯半岛的传统医学中,以治疗各种疾病,因为它具有许多具有多种治疗作用的药理活性成分。目的:本研究旨在研究辣木peregrina种子乙醇提取物(MPSE)对参与人体病理学涉及的关键酶的抑制作用,例如血管生成(胸苷磷酸化酶),糖尿病(α-葡萄糖苷酶)和省含量疗法疗法,糖尿病(α-g-葡萄糖苷酶)和省含量疗法内静脉内高含量(car)。此外,还测试了针对SH-SY5Y(人神经母细胞瘤)的抗癌特性。结果:MPSE提取物显着抑制α-葡萄糖苷酶,胸苷磷酸化酶和碳酸酐酶,分别为303.1±1.3、471.30±0.3和271.30±5.1 µg/mL,具有半末端抑制浓度(IC 50)值(IC 50)值。此外,在SH-SY5Y癌细胞系上观察到MPSE的抗增殖作用,IC 50值为55.1 µg/ml。结论:MPSE具有对关键酶和人类神经母细胞瘤癌细胞系的有趣抑制能力。
摘要:folfoxiri,即5-脂肪酸,奥沙利铂和伊立替康的组合是对结直肠癌(CRC)的第一线治疗,但非人性化和侵略性。在这项研究中,为了模仿被诊断为晚期CRC并接受Folfoxiri长期治疗的患者的临床状况,我们已经生成了用Folfoxiri长期治疗的CRC细胞克隆。与未得到治疗的调用相比,在所有四个细胞系中,对Folfoxiri的敏感性均显着损失,如2D培养和异型3D共培养所示。通过在肌动灯的组织中形态变化观察到获得的耐药性诱导。块状RNA测序表明,在SW620抗性细胞系中,葡萄糖转运蛋白家族5(GLUT5)的重要上调,而在LS174T耐药细胞系中,蛋白质酪氨酸磷酸酶磷酸酶S(PTPRS)的显着下调和氧气磷酸化酶脱氢酶含量(oxoglutarate eDhifeNAPE)(蛋白酪氨酸磷酸化酶受体S(PTPRS)的显着下调。通过RAS-RAF-MEK-ERK途径作用的优化的低剂量协同药物组合(ODC)克服了对Folfoxiri的抗性。ODC抑制了SW620和LS174T 3DCC中的细胞代谢活性,分别抑制了高达82%。
mngie是一种罕见的遗传疾病,是由胸苷磷酸化酶(TYMP)基因1中的突变引起的。这会导致核苷的积累,线粒体损伤以及进行性胃肠道和神经功能障碍,导致40岁之前死亡。没有既定的治疗方法。肝移植恢复核苷水平,但与并发症有关。腺相关病毒(AAV)基因疗法在MNGIE动物模型中成功,并且可以提供有吸引力的治疗方法。尽管如此,它尚未在人类中进行测试。
靶标和结合渗透性降低,(iv)突变(7)。通过氨基糖苷修饰酶(AMES)对抗生素失活是对氨基糖苷耐药性的主要机制(8,9)。 AME由几个基因在细菌物种之间水平转移,从而产生其他细菌耐药机制(10)。 对氨基糖苷的抗性主要由五类AME介导,如下所示:Aminoglycoside-6'-N-N-乙酰基转移酶/2'' - O- o-磷酸溶质转移酶[AAC(6'')/APH(2'')]由AAC(6')/APH(6')/APH(2')/aph(2'')Gene; Aminoglycoside-3'-o-磷酸磷酸化酶III [APH(3')-III]由APH(3')-IIIA基因编码;氨基糖苷-4'-o-磷酸磷酸化酶i [ant(4') - i]由ant(4') - ia基因编码;由ANT(9) - I基因编码的氨基糖苷-9-O核苷酸转移酶I [ANT(9)-i]和ANT(6) - I Gene编码的ANT(9) - I基因和氨基糖苷-6-O-Nucleotidyltransferase I [ANT(6)-I]。 在葡萄球菌中,蚂蚁(4') - i,aac(6')/aph(2'')和aph(3')-III分别是影响毒霉素,庆大霉素和卡纳米霉素的最常见的AME(11)。 双功能AME AAC(6') / aph(2英寸)赋予对除链霉素以外的几乎所有氨基糖苷的抗性(12)。< / div> The aac(6')-Ie/aph(2")-Ia (also named aacA - aphD ) gene has been located on the plasmids, transposons such as Tn 4001 (in S. aureus ), Tn 5281 (in enterococci), and Tn 4031 (in S. epidermidis ) and the other mobile genetic elements, increasing the aminoglycoside resistance and the对其他化合物的抗性(13) 在欧洲,亚洲和南美国家中报道了高级庆大霉素耐药性(HLGR)的增加。 材料和方法通过氨基糖苷修饰酶(AMES)对抗生素失活是对氨基糖苷耐药性的主要机制(8,9)。AME由几个基因在细菌物种之间水平转移,从而产生其他细菌耐药机制(10)。对氨基糖苷的抗性主要由五类AME介导,如下所示:Aminoglycoside-6'-N-N-乙酰基转移酶/2'' - O- o-磷酸溶质转移酶[AAC(6'')/APH(2'')]由AAC(6')/APH(6')/APH(2')/aph(2'')Gene; Aminoglycoside-3'-o-磷酸磷酸化酶III [APH(3')-III]由APH(3')-IIIA基因编码;氨基糖苷-4'-o-磷酸磷酸化酶i [ant(4') - i]由ant(4') - ia基因编码;由ANT(9) - I基因编码的氨基糖苷-9-O核苷酸转移酶I [ANT(9)-i]和ANT(6) - I Gene编码的ANT(9) - I基因和氨基糖苷-6-O-Nucleotidyltransferase I [ANT(6)-I]。在葡萄球菌中,蚂蚁(4') - i,aac(6')/aph(2'')和aph(3')-III分别是影响毒霉素,庆大霉素和卡纳米霉素的最常见的AME(11)。双功能AME AAC(6') / aph(2英寸)赋予对除链霉素以外的几乎所有氨基糖苷的抗性(12)。< / div>The aac(6')-Ie/aph(2")-Ia (also named aacA - aphD ) gene has been located on the plasmids, transposons such as Tn 4001 (in S. aureus ), Tn 5281 (in enterococci), and Tn 4031 (in S. epidermidis ) and the other mobile genetic elements, increasing the aminoglycoside resistance and the对其他化合物的抗性(13)在欧洲,亚洲和南美国家中报道了高级庆大霉素耐药性(HLGR)的增加。材料和方法本研究试图确定金黄色葡萄球菌和编码AMES和FEMA的临床分离株中抗生素耐药性的频率,AMES和FEMA是金黄色葡萄球菌在金黄色葡萄球菌中表达甲基甲基蛋白耐药性必不可少的,并且还参与了北极蛋白酶蛋白酶的葡萄球菌细胞Wall的生物合成。