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Daniel R. Berry 博士
2020 首席研究员：奖学金和创造性活动补助金，加州州立大学圣马科斯分校研究生院。简短的正念训练是否会通过同情心增加亲社会行为？通过实验操纵和事件相关电位框架识别同情心机制。（$2686.08）2019 首席研究员：课程重新设计补助金，加州州立大学圣马科斯分校教师中心。心理学入门统计学课程重新设计（$6000）2017 – 2019 首席研究员：教师发展补助金，加州州立大学圣马科斯分校人文、艺术、行为和社会科学学院。正念是否会增加群体间的善意？为研究和创造性活动购买小型设备（$3,941.73，共 3 个奖项）2018 首席研究员：补助金提案种子资金，加州州立大学圣马科斯分校研究生院。测试与事件相关的正念训练在促进群体间亲社会性方面的潜在机制：购买设备进行试点测试，用于未来的资助提案 ($3,150) 2014 – 2016 首席研究员：Varela Grant，心智与生命研究所。弥合同理心鸿沟：短期正念训练对帮助有需要的外来成员的影响 ($15,000 直接资助) 2014 – 2016 联合研究员：弗吉尼亚大学沉思科学中心资助。正念作为缓解同伴排斥痛苦的缓冲剂 ($11,000 直接资助)
黑色素瘤的免疫疗法
黑色素瘤是皮肤癌最具侵略性的形式，约占所有皮肤肿瘤的4％，占死亡人数的80％。黑色素瘤的高级阶段涉及转移过程，并且具有高死亡率和发病率的社会性，这主要是由于对当前疗法的快速传播和异质反应，包括免疫疗法。免疫检查点抑制剂（ICI）目前用于治疗转移性黑色素瘤（MM），尽管与患者存活率的增加有关，但其中很高的数百分比仍然没有利用。因此，单独或与其他疗法结合使用ICI的MM患者的治疗方案数量增加了，以及对可靠的生物标志物的需求，可以预测和监测对ICIS的反应。在这种情况下，由于能够反映疾病状态的能力，出现了循环生物标志物，例如DNA，RNA，蛋白质和细胞。此外，血液检查是最少的侵入性，并为检测生物标记物提供了有吸引力的选择，避免了压力大的医疗程序。该系统评价旨在评估可以指导治疗决定的非侵入性生物标志物签名的可能性。此处报道的研究提供了关于循环生物标志物如何在接受ICIS治疗的黑色素瘤患者中发挥作用的宝贵见解，强调需要进行严格的临床试验以确定效果并建立标准化程序。©2024作者。由Elsevier Inc.出版这是CC BY-NC-ND许可证（http：//creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/）下的开放访问文章。
人工智能 (AI) 的临床应用
摘要 人工智能 (AI) 和机器学习 (ML) 技术在医学研究中占据着重要的地位，在创新和开发新技术方面占有重要地位。然而，尽管许多人认为人工智能是一种充满希望和希望的技术——一种可以实现更早、更准确的诊断的技术——但医院对人工智能和机器学习技术的接受度仍然很低。造成这种情况的主要原因是这些技术缺乏透明度，特别是认知透明度，这导致人工智能扰乱或困扰临床环境中既定的知识实践。在本文中，我们描述了一个用于临床环境的人工智能应用程序的开发过程。我们展示了人工智能开发人员、临床医生和生物医学科学家如何密切合作，协商和共同产生认知透明度，从而形成人工智能被接受为认知操作符的环境。本文借鉴与合作研究人员进行的定性研究，开发一种用于早期诊断罕见呼吸系统疾病（肺动脉高压/PH）的 AI 技术，探讨了如何将临床医生和临床科学家纳入 AI 开发人员的协作实践中，以消除透明度问题。我们的研究表明，消除透明度问题发生在与 PH 相关的 AI 开发的三个维度上：查询数据集、构建软件和训练模型。密切合作产生了一种既具有社会性又具有技术性的 AI 应用程序：它整合并铭刻了不同参与者在开发过程中的知识过程。我们认为将这些应用程序称为“人工智能”是一种误称，如果将它们重新定义为社会技术智能的形式，它们将得到更好的开发和实施。
人工智能（AI）在临床中的应用
摘要 人工智能 (AI) 和机器学习 (ML) 技术在医学研究中占据着重要的地位，因为它可以实现更早、更准确的诊断。然而，尽管许多人认为人工智能是一种充满希望和希望的技术，可以实现更早、更准确的诊断，但医院对人工智能和机器学习技术的接受度仍然很低。造成这种情况的主要原因是这些技术缺乏透明度，尤其是认知透明度，这导致人工智能扰乱或困扰临床环境中既定的知识实践。在本文中，我们描述了一个用于临床环境的人工智能应用程序的开发过程。我们展示了人工智能开发人员与临床医生和生物医学科学家如何密切合作，协商和共同产生认知透明度，从而形成人工智能被接受为认知操作符的环境。本文借鉴与合作研究人员合作开发用于罕见呼吸系统疾病（肺动脉高压/PH）早期诊断的人工智能技术的定性研究，探讨了如何将临床医生和临床科学家纳入人工智能开发人员的协作实践中，以消除透明度的困扰。我们的研究表明，在与 PH 相关的 AI 开发的三个维度上，如何消除令人不安的透明度：查询数据集、构建软件和训练模型。密切合作产生了一种既具有社会性又具有技术性的 AI 应用程序：它整合并铭刻了不同参与者在开发过程中的知识过程。我们认为将这些应用程序称为“人工智能”是一种错误的说法，如果将它们重新定义为社会技术智能的形式，它们将得到更好的开发和实施。
营养和能量传感器 mTORC1 和 AMPK 可能参与非后生动物细胞命运分化
mTORC1 和 AMPK 是相互拮抗的营养和能量状态传感器，与许多人类疾病有关，包括癌症、阿尔茨海默病、肥胖症和 2 型糖尿病。社会性变形虫 Dictyostelium discoideum 的饥饿细胞会聚集并最终形成由柄细胞和孢子组成的子实体。我们关注如何实现细胞命运的这种分歧。在生长过程中，mTORC1 高度活跃，而 AMPK 相对不活跃。饥饿时，AMPK 被激活而 mTORC1 被抑制；细胞分裂被阻止并诱导自噬。聚集后，少数细胞（前柄细胞）继续表达与聚集期间相同的发育基因集，但大多数细胞（前孢子细胞）切换到前孢子程序。我们描述了表明过表达 AMPK 会增加前柄细胞比例的证据，抑制 mTORC1 也会增加前柄细胞的比例。此外，刺激细胞内酸性区室的酸化同样会增加前柄细胞的比例，而抑制酸化则有利于孢子途径。我们得出结论，细胞分化的前柄途径和前孢子途径之间的选择可能取决于 AMPK 和 mTORC1 活性的相对强度，这些活性可能受细胞内酸性区室/溶酶体 (pHv) 的酸度控制，pHv 低的细胞具有高 AMPK 活性/低 mTORC1 活性，pHv 高的细胞具有高 mTORC1/低 AMPK 活性。深入了解这种转换的调节和下游后果应该会提高我们对其在人类疾病中潜在作用的理解，并指出可能的治疗干预措施。
Technobrainbodies in-Incultures：交叉案例
当今使用计算机硬件和软件的脑机器化的机器化范围从脑 - 计算机接口（BCIS）到硅的视觉上传到硅的范围，后者是针对超人类未来的。重新发现了人类主义的概念，以形成后人类的观点，并将这些方法与超人类主义的轨迹进行对比，我探索了真实性和神经技术发展的视觉的相互作用，我将其称为Technobrainbodies-Inturanbodies Inturantures。在交叉分析中，我研究了基于现代神经生物学决定论的概念，由神经科学研究和神经技术发展带来的超人类视觉的嵌入和合法化。BCI研究与发展的相连轨迹以及超人类主义的视觉使截舌的铭文永存，并带来产生歧视作用的危险。这最终以规范能力被视为与竞争的融合，成功，白人男性化的技术脑的冲突。但是，我的更深入的分析也使最近的BCI研发中的位移可以表征：从“思想翻译”到情感条件，从BCI内的可控性到顽固性，甚至可以打开封闭的环路。这些实现挑战了有关BCI的演员身份和代理机构的观念，并提出了有关相应主题 - 对象关系中的转变的问题。基于这些分析，我研究了神经技术和超人类政府的影响对要改善其生活的问题，并应将其生活排除在这些发展之外。在政治女权主义唯物主义的框架内，我将后人类的概念与我对技术培养基的概念相结合，以设想和讨论一种物质歧视策略，包括情感，社会性，抵抗，抵抗，同情心，同情，文化多样性，种族多样性，多种性别/性别，不及格，使得''在这些机器人期货中预见的固执的技术 - 脑机构和污点。
成年蜜蜂的蘑菇体发育和学习能力受到蛹期早期寒冷暴露的影响
蜜蜂是农作物和新鲜农产品生产中最重要的传粉昆虫。温度影响蜜蜂的存活，决定其发育质量，对养蜂生产意义重大。但对于发育阶段的低温应激如何导致蜜蜂死亡以及对后续发育产生什么亚致死影响知之甚少。早期蛹期是蛹期对低温最敏感的阶段。在本研究中，早期蛹虫分别暴露在20°C下12、16、24和48小时，然后在35°C下孵化直至羽化。我们发现48小时的低温持续时间导致70％的蜜蜂个体死亡。虽然12和16小时的死亡率似乎不是很高，但幸存个体的联想学习能力受到很大影响。蜜蜂脑切片显示低温处理可以导致蜜蜂大脑发育几乎停止。低温处理组（T24、T48）与对照组的基因表达谱显示，分别有1,267个和1,174个基因发生差异表达。差异表达基因功能富集分析表明，MAPK和过氧化物酶体信号通路上Map3k9、Dhrs4、Sod-2基因的差异表达对蜜蜂头部造成了氧化损伤；在FoxO信号通路上，InsR和FoxO基因上调，JNK、Akt、Bsk基因下调；在昆虫激素合成信号通路上，Phm和Spo基因下调。因此，我们推测低温应激影响激素调控。检测到与神经系统相关的通路有胆碱能突触、多巴胺能突触、GABA能突触、谷氨酸能突触、5-羟色胺能突触、神经营养素信号通路和突触小泡循环。这意味着蜜蜂的突触发育很可能受到低温应激的重大影响。了解低温应激如何影响蜜蜂大脑发育的生理及其如何影响蜜蜂行为，为更深入地理解社会性昆虫“恒温”发育的温度适应机制提供了理论基础，并有助于改进蜜蜂管理策略以确保蜂群的健康。
何时以及为什么人的大脑尺寸减小？蚂蚁
人类大脑的大小在Homo上一次与黑猩猩共享一个共同祖先以来的六百万年中几乎相当三倍，但自从上次冰河时代结束以来，人的大脑被认为减少了体积。这种减少的时机和原因是神秘的。在这里，我们使用变更点分析来估计人类脑进化速率变化的时机。我们发现，人类的大脑在2.1和150万年前经历了正变化，这与考古记录中HOMO和技术创新的早期发展相吻合。，但我们还发现，在过去的3000年中，人脑大小的减少是令人惊讶的。我们的约会不支持有关减少脑大小的假设，这是体型减少的副产品，这是转向农业饮食的结果或自我措施的结果。我们建议我们的分析支持以下假设：脑大小的最新减小可能是由于知识的外部化和小组级决策的外在化而导致的，部分原因是分布式认知的社会系统出现以及信息的存储和信息共享。人类生活在社会群体中，其中多个大脑有助于集体智慧的出现。尽管很难研究HOMO的深刻历史，但可以使用ANT作为模型来阐明群体规模，社会组织，集体智力和其他潜在选择性对脑进化的影响。蚂蚁及其物种丰富度的显着生态多样性涵盖了人类社会性方面的收敛，包括庞大的群体规模，农业生活历史，劳动分工和集体认知。蚂蚁提供了广泛的社会系统，以产生和检验有关大脑大小扩大或减少的假设，并有助于解释人类确定的大脑进化模式。尽管人类和蚂蚁代表了社会和认知进化中截然不同的途径，但蚂蚁提供的见解可以广泛地告知我们影响脑大小的选择性力量。
“人工智能与脑科学的对比与融合”
A01：感知与预测 深度学习如今在模式识别中已经取得了很高的性能。我们将利用信息论来阐明它为什么以及在什么条件下起作用，并且利用深度学习得到的各层中的信息表示来理解大脑各个区域神经元的信息表示。 我们将通过与各种分层贝叶斯推理算法的比较，验证大脑感觉皮层神经回路实现分层贝叶斯推理的假设。 A02：运动与行为 虽然机器人技术已经进步，但如今的人形机器人的运动能力仍然不如三岁儿童。我们将通过与大脑的运动学习机制进行比较来明确其中的不足。具体来说，我们的目标是阐明大脑从多自由度系统中的有限数据中学习充分的内部模型的机制，并在此基础上实现人形机器人的学习控制。 大脑感觉皮层的学习可以理解为依赖外界信息的无监督学习，而运动皮层的学习则需要创建自发运动所必需的信息表征，其背后的原理仍不清楚。此外，基底神经节有直接通路和间接通路两大回路，且有多种控制学习的多巴胺，但这其中的计算意义尚不清楚。我们将寻求通过将学习理论与大脑数据相结合来对这些问题获得新的认识。 A03：认知与社会性 人类的认知功能被认为是通过对模拟感觉运动信息进行分类和分割来实现的。我们着眼于实现这一目标的理论模型——双分割分析，并探索其在大脑中实现的可能性，以及将其应用于人形机器人的模仿学习和意图估计。 “心理模拟”和“心智理论”在人类智力行为，尤其是社会行为中发挥着重要作用，其在脑中的位置正通过fMRI实验等方法阐明。通过阐明神经回路层面的表达和学习原理，我们希望能够理解精神分裂症和自闭症等疾病，并以此设计出更自然的人形机器人和智能代理。 3）研究区域设置期结束后的预期成果。
遗传学与社会（SOCI 138）
遗传学与社会 (SOCI 138) 2022 年夏季 每周两节三小时的课程。时间和地点待定。 Daniel Navon 教授 (dnavon@ucsd.edu) 办公时间：待定 一个多世纪以来，遗传学一直强烈地影响着我们对人类差异的看法。本课程将探讨研究我们的基因组和遗传模式如何为美国公众对种族和民族、残疾、生殖、罕见疾病、智力、社会性、犯罪和个人身份等主题的理解和政策提供信息。我们还将了解社会力量如何影响遗传学研究本身，并讨论围绕基因专利、法医学、新生儿筛查、克隆以及疾病、风险和祖先基因检测的争议。自始至终，我们将采用比较的视角，研究英国和美国之间关于遗传学和遗传性的观念是如何交流的——从 19 世纪的颅相学和达尔文，到 20 世纪早期的优生运动，再到二战后现代医学遗传学的兴起，再到现在的“后基因组”。此外，我们还将追溯爱丁堡在其中发挥了特别关键作用的几个著名故事：作为颅相学研究的世界领导者和让达尔文走上改变世界之路的智力熔炉；作为早期染色体异常研究的领先中心，以及 XYY 异常的起源地，这种异常后来成为臭名昭著的“犯罪染色体”，吸引了美国犯罪学家、大众媒体、科幻小说作家和儿童权利倡导者；而第一只克隆哺乳动物多莉羊的出生地、她度过的被人们无休止讨论的一生并最终被发现的地方，则被放进了苏格兰国家博物馆的一个玻璃展柜里，离爱丁堡大学只有一步之遥。阅读材料来自遗传学文献、流行文化和社会科学。还会有实地考察和客座讲座，以帮助我们充分利用爱丁堡及其丰富的历史。在课程结束时，学生将拥有批判性的知识基础，可以批判性地评估当代遗传学的前景和潜在的陷阱。评估课程的评估将包括阅读回应备忘录、期中家庭考试和期末家庭考试或论文。期末成绩的细目如下：