癫痫发作仍然是药物发现和开发过程中人员流失的重要原因,导致竞争力下降、延误和成本增加。目前的检测方法依赖于旨在支持临床试验的体内研究中的观察结果,例如震颤或其他异常运动。这些迹象可能会被遗漏或误解;因此,药物引起的癫痫发作的明确确认需要进行后续脑电图研究。使用自动视频系统记录和分析动物运动的体内癫痫发作检测已经取得了进展。尽管如此,最好能够尽早预测癫痫发作风险,以便在发现早期消除责任,同时药物化学家可以选择制造潜在的新药。常规早期筛查可以减少因心脏不良事件而导致的人员流失;我们能否使用类似的方法减少因癫痫发作而导致的人员流失?具体来说,微电极阵列可用于检测干细胞衍生神经元中的潜在癫痫发作信号。此外,有明确证据表明神经元电压门控和配体门控离子通道、GPCR 和转运蛋白与癫痫发作有关。在应激或炎症状态下与周围神经胶质细胞的相互作用也会调节神经元的离子通道功能,这增加了癫痫发作预测的难度。现在正是评估开发与一组预测癫痫发作的离子通道检测相关的癫痫发作体外评估机会的好时机,目的是在设计阶段影响结构-活性关系并消除预测与促癫痫状态相关的化合物。
1 鲁汶天主教大学发育与再生系子宫内膜、子宫内膜异位症和生殖医学实验室 2 比利时鲁汶天主教大学脑与疾病研究中心 VIB-鲁汶离子通道研究实验室和鲁汶天主教大学分子医学系
除了这些危险信号外,DC的许多功能,包括成熟,细胞因子产生和迁移,还受到体内电信号的调节。DC中钾和钙离子的浓度与其成熟过程密切相关。然而,金属离子进入和流出细胞的运动严格由离子通道控制,目前没有有效的方法激活这些通道。
冠状病毒包膜(E)蛋白是一种小的结构蛋白,具有离子通道活性,在病毒组装,萌芽,免疫发病和疾病严重程度中起重要作用。病毒蛋白E也位于感染细胞的高尔基体和ER膜中,与炎性体激活和免疫失调有关。在这里,我们评估了Bit225的体外抗病毒活性,作用机理和体内功效,用于治疗SARS-COV-2感染。BIT225在CALU3和VERO细胞中对SARS-COV-2和VERO细胞中的宽光谱直接作用抗病毒活性在6种不同的病毒菌株中具有相似的效力。位225抑制E蛋白的离子通道活性,但未抑制内源性术语或钙诱导的TMEM16A在Xenopus卵母细胞中的离子通道活性。位225在感染前12小时从口腔烤12天服用12天,完全预测SARS-COV-2感染的K18小鼠的体重减轻和死亡率(100%存活,n = 12),而所有车辆剂量的动物在两项研究中以第9天(n = 12)到达了死亡率终点(n = 12)。当感染后24小时开始治疗时,还可以预防体重减轻和死亡率(100%存活,n = 5),而在感染后48小时开始治疗开始时,有5只小鼠中的4只小鼠体重增加并增加了。治疗功效取决于位225剂量,并且与肺病毒载量(3.5 log 10),病毒滴度(4000 PFU/mL)以及肺和血清细胞因子水平的显着减少有关。这些结果将Viroporin E验证为可行的抗病毒靶标,并支持Bit225的临床研究,以治疗SARS-COV-2感染。
摘要:相似的药物分子通常具有相似的特性和活性。因此,量化分子相似性对于药物发现和优化至关重要。在这里,我回顾了我所在跨学科网络 NCCR TransCure 内开发的使用分子相似性测量的计算方法,该网络研究离子通道和膜转运蛋白的生理学、结构生物学和药理学。我们设计了一种 3D 分子形状和药效团比较算法,通过骨架跳跃优化弱和非选择性抑制剂,并发现了离子通道 TRPV6 和 TRPM4、内源性大麻素膜转运以及二价金属转运蛋白 DMT1 和 ZIP8 的强效和选择性抑制剂。我们通过将不同分子指纹的分子相似性搜索与 ChEMBL 数据库中的靶标注释化合物相结合来预测脱靶效应。最后,我们创建了反映分子相似性的交互式化学空间图,以方便筛选化合物的选择和筛选结果的分析。这些不同的工具可在线获取,网址为 https://gdb.unibe.ch/tools/。
摘要:相似的药物分子通常具有相似的特性和活性。因此,量化分子相似性对于药物发现和优化至关重要。在这里,我回顾了我所在跨学科网络 NCCR TransCure 内开发的使用分子相似性测量的计算方法,该网络研究离子通道和膜转运蛋白的生理学、结构生物学和药理学。我们设计了一种 3D 分子形状和药效团比较算法,通过骨架跳跃优化弱和非选择性抑制剂,并发现了离子通道 TRPV6 和 TRPM4、内源性大麻素膜转运以及二价金属转运蛋白 DMT1 和 ZIP8 的强效和选择性抑制剂。我们通过将不同分子指纹的分子相似性搜索与 ChEMBL 数据库中的靶标注释化合物相结合来预测脱靶效应。最后,我们创建了反映分子相似性的交互式化学空间图,以方便筛选化合物的选择和筛选结果的分析。这些不同的工具可在线获取,网址为 https://gdb.unibe.ch/tools/。
通讯作者:安吉勇 摘要:背景:预测新的药物-靶标相互作用(DTI)在发现新的候选药物和寻找新的靶标蛋白质中起着重要作用。考虑到实验方法耗时且昂贵。因此,如何开发有效的计算方法来准确预测药物和靶标之间的潜在关联是一项具有挑战性的任务。结果:在本文中,我们提出了一种基于药物指纹和蛋白质进化信息的新型计算方法WELM-SURF来识别DTI。更具体地说,为了利用蛋白质序列特征,应用位置特异性评分矩阵(PSSM)来捕获蛋白质进化信息,并使用加速机器人特征(SURF)从PSSM中提取序列关键特征。对于药物指纹,使用分子子结构指纹的化学结构来表示药物作为特征向量。考虑到加权极限学习机(WELM)具有训练时间短、泛化能力强以及最重要的是能够通过优化权重矩阵的损失函数有效地执行分类的优势。因此,采用WELM分类器对提取的特征进行分类以预测DTIs。通过五重交叉验证检验在酶、离子通道、GPCRs和核受体数据集上进行实验验证,评估了WELM-SURF模型的性能。WELM-SURF在酶、离子通道、GPCRs和核受体数据集上的平均准确率分别为93.54%、90.58%、85.43%和77.45%。我们还将其性能与极限学习机(ELM)、在酶和离子通道数据集上最先进的支持向量机(SVM)以及在四个数据集上的其他现有方法进行了比较。与实验结果相比,WELM-SURF的性能明显优于ELM、SVM和该领域的其他先前方法。结论:结果表明,所提出的WELM-SURF模型能够高精度、稳健地预测DTIs。预计 WELM - SURF 方法是一种有用的计算工具,可广泛促进与 DTI 预测相关的生物信息学研究。
药物发现研究服务 英国剑桥,2025 年 1 月 20 日:Metrion Biosciences(“Metrion”),一家专业的临床前合同研究组织 (CRO) 和离子通道筛选领域的领导者,今天宣布它已被列入《星期日泰晤士报》100 Tech,英国增长最快的私营科技公司。首期专题于 1 月 19 日发布,重点介绍英国增长最快的私营公司,这些公司正在开发或销售独特的专有技术,并得到 Singer Capital Markets、汇丰创新银行和 BDO 的支持。Metrion 为包括欧洲、美国和亚洲在内的全球主要市场中不断增长的大型制药公司和小型药物发现企业网络提供临床前药物发现服务。该公司的服务利用十多年的专业离子通道研究,这些研究建立在开发和使用自动膜片钳技术进行药物发现的开创性工作之上。其先进的专有检测和细胞系套件可通过标准或定制研究项目提供给客户,为一系列应用提供高质量数据,包括体外心脏安全性、高通量离子通道筛选、表型测定和使用脑切片组织和一系列原代神经元的神经科学研究。公司对实验结果进行仔细解读,提供战略建议以支持决策,从而为筛选策略提供最佳信息。在 2023 年 12 月公司完成 370 万英镑的股权融资后,Metrion 在 2024 年投入巨资扩大运营规模,以满足全球对其专业离子通道、心脏安全性和神经科学药物发现服务日益增长的需求。作为其中的一部分,公司进行了一系列战略任命以推动商业扩张,Lee Patterson 于 2024 年 12 月加入公司担任首席执行官 1,Chris Mathes 博士于 2024 年 7 月担任首席商务官 2,Clare Rutty 于 2023 年 12 月晋升为首席财务官 3。 “Metrion 很荣幸今年庆祝成立 10 周年,在此期间,公司已成为临床前药物发现领域值得信赖的全球合作伙伴。入选 100 Tech 榜单彰显了我们的成功,因为我们将继续拓展业务并满足日益增长的服务需求,”Metrion Biosciences 首席执行官 Lee Patterson 评论道:“我要感谢《星期日泰晤士报》对我的认可,还要感谢我们的投资者、合作伙伴,最重要的是,感谢我们辛勤工作、敬业的团队对我们转变合作伙伴研发计划、为促进人类健康做出有意义贡献的使命的坚定支持。”
嘌呤受体 P2X 配体门控离子通道 7 型 (P2X7R) 是一种三磷酸腺苷 (ATP) 门控离子通道。1-3 P2X7R 广泛存在于身体几乎所有组织和器官中,并在免疫、外周和中枢神经系统中高度表达,因此该受体在健康和疾病中发挥着重要作用。4-6 P2X7R 的过度表达与许多下游事件有关,以细胞特异性的方式进行,包括炎症、ATP 介导的细胞增殖和死亡、代谢事件和吞噬作用,并与多种炎症、免疫、癌症、神经、肌肉骨骼和心血管疾病有关。7-12 P2X7R 是一个有吸引力的治疗靶点,许多 P2X7R 拮抗剂已被开发用于治疗与 P2X7R 相关的疾病,如炎症、感染、神经、癌症和心脏疾病。 13-17 因此,P2X7R 已成为一个有趣的分子成像靶点,因为成像剂的开发与药物开发过程同步进行。18 先进的生物医学成像技术正电子发射断层扫描 (PET) 和单光子发射计算机断层扫描 (SPECT) 是两种有前途的分子成像方式,
推荐书籍/文献:PC-520:普通药理学(2 学分)第 1 章:药理学简介:ADME 和影响疾病状况的因素。第 2 章:受体作为药物靶点的概念、受体分类、结构、药物受体相互作用、G 蛋白、受体特性、受体理论、激动剂、拮抗剂 第 3 章:GPCR 分类、受体调节:GPCR 脱敏、下调、上调、G 蛋白信号调节剂 第 4 章:离子通道和离子通道连接受体及其调节 第 5 章:核受体和跨膜信号传导机制、第二信使系统 第 6 章:转录因子,特别强调 Nrf2 和 NF-kB,转录因子的作用机制、药理学靶点和在不同疾病条件下的作用 第 7 章:膜转运蛋白和药物反应 第 8 章:剂量反应关系和不同类型的拮抗作用 第 9 章:使用不同实验模型进行功效和毒性评估、剂量反应分析、临床前开发中的安全边际。 第 10 章:药物研发、制药行业和监管 推荐书籍