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World File Search System种系
鉴定种系种群变异的识别为癌症相关的体细胞变异
在临床变异解释数据库的背景下，一个潜在的问题是，当它们实际上是种系（与患者的祖先人群相关的）时，将变体的分类错误（与癌症相关）。这可能取决于所使用的参考基因组，如果错误分类的变体与诊断，治疗或预后直接相关，则可能在临床上有问题（13）。换句话说，当这种变体可能不是癌症特异性时，可以用作潜在治疗的指示，或者在诊断过程中肿瘤学家可能会意外使用的是提供不准确的预后信息或分子病理学家。错误分类的变体对于在癌症研究的背景下也要意识到。人类变体起源（无论是种系还是躯体）通常是转化肿瘤学研究中的必要规范，从药物机理到临床试验的纳入标准（14，15）。
种系基因组编辑的全球监管：伦理考量和国际人权法的应用
* 美国医学会高级研究员、AMA 伦理学杂志法律编辑。宾夕法尼亚大学 MBE；凯斯西储大学法学博士；圣路易斯华盛顿大学文学士。 我非常感谢 Cesare Romano 教授邀请我前往洛杉矶洛约拉法学院参加他们的研讨会“建立人类生殖基因组改造全球监管制度的挑战”。还要特别感谢我的同事 Sean McConnell 提供的有益建议和反馈。1. N AT'LA CADS. OF S CIS., E NG'G , & M ED., H UMAN G ENOME E DITING: S CIENCE, E THICS, AND G OVERNANCE 1（美国国家科学院出版社 2017 年），https://doi.org/10.17226/24623。本报告是对基因组编辑的极好介绍，并对所涉及的技术、关键治理和道德原则进行了精彩的总结。2. Julia Belluz，《CRISPR 婴儿争议是否是基因编辑领域一个可怕的新篇章的开始？》，V OX（2019 年 1 月 22 日，下午 12:40），https://www.vox.com/science-and-health/2018/11/30/18119589/crispr-gene-editing-he-jiankui；Antonio Regalado，《独家：中国科学家正在创造 CRISPR 婴儿》，MIT T ECH. R EV.（2018 年 11 月 25 日），https://www.technologyreview.com/s/612458/exclusive-chinese-scientists-are-creating-crispr-babies/。 3. David Baltimore 等人，《基因组工程和种系基因改造的审慎之路》，348 S CI . 36, 36-37 (2015)（“CRISPR-Cas9 技术以及其他基因组工程方法可用于改变生殖细胞核中的 DNA，从而将信息从一代传递到下一代（即生物体的种系）。”）。
SAFIR02肺试验的高级NSCLC中的体细胞和种系BRCA 1和2突变
法国法国维勒维夫（Vilejuif）的古斯塔夫·鲁西夫（Gustave Roussy） US23/CNRS UNS3655，Gustave Roussy，Vilejuif，法国F Unicancer，巴黎，法国G肺炎部，Chi Toulon，法国H肿瘤学部，西南癌症研究所，Nantes，France I Peremology Department，Institute i Paoli Calletes，Marey Callestes，Gouste j joly j callance j call of France j of France j of France j of France j Callance i Pernicology Departicat Roussy和CESP，Inserm，大学巴黎 - 萨克莱大学，Vilejuif，法国KAIX MARSEILLE UNIVERYS，CNRS，INSERM，CRCM，APHM，APHM，MARSEILL，法国，法国法国法国维勒维夫（Vilejuif）的古斯塔夫·鲁西夫（Gustave Roussy） US23/CNRS UNS3655，Gustave Roussy，Vilejuif，法国F Unicancer，巴黎，法国G肺炎部，Chi Toulon，法国H肿瘤学部，西南癌症研究所，Nantes，France I Peremology Department，Institute i Paoli Calletes，Marey Callestes，Gouste j joly j callance j call of France j of France j of France j of France j Callance i Pernicology Departicat Roussy和CESP，Inserm，大学巴黎 - 萨克莱大学，Vilejuif，法国KAIX MARSEILLE UNIVERYS，CNRS，INSERM，CRCM，APHM，APHM，MARSEILL，法国，法国法国法国维勒维夫（Vilejuif）的古斯塔夫·鲁西夫（Gustave Roussy） US23/CNRS UNS3655，Gustave Roussy，Vilejuif，法国F Unicancer，巴黎，法国G肺炎部，Chi Toulon，法国H肿瘤学部，西南癌症研究所，Nantes，France I Peremology Department，Institute i Paoli Calletes，Marey Callestes，Gouste j joly j callance j call of France j of France j of France j of France j Callance i Pernicology Departicat Roussy和CESP，Inserm，大学巴黎 - 萨克莱大学，Vilejuif，法国KAIX MARSEILLE UNIVERYS，CNRS，INSERM，CRCM，APHM，APHM，MARSEILL，法国，法国法国法国维勒维夫（Vilejuif）的古斯塔夫·鲁西夫（Gustave Roussy） US23/CNRS UNS3655，Gustave Roussy，Vilejuif，法国F Unicancer，巴黎，法国G肺炎部，Chi Toulon，法国H肿瘤学部，西南癌症研究所，Nantes，France I Peremology Department，Institute i Paoli Calletes，Marey Callestes，Gouste j joly j callance j call of France j of France j of France j of France j Callance i Pernicology Departicat Roussy和CESP，Inserm，大学巴黎 - 萨克莱大学，Vilejuif，法国KAIX MARSEILLE UNIVERYS，CNRS，INSERM，CRCM，APHM，APHM，MARSEILL，法国，法国
鉴定增加前列腺癌风险和影响恶性疾病发展的种系遗传变异
摘要：前列腺癌 (PrCa) 是一种异质性疾病，在个体患者中表现出多种表型，从惰性到致命形式。目前尚无可靠的生物标记物可用于常规筛查 PrCa 或区分具有临床意义的形式，因此晚期疾病的晚期识别和无症状疾病的过度诊断和过度治疗仍然是医疗保健领域关注的领域。PrCa 具有大量可遗传成分，自人类基因组计划完成以来，技术进步促进了对影响家庭和人群中疾病易感性的遗传因素的更好识别。这些遗传标记有望使我们更好地了解 PrCa 发展背后的生物学机制，促进基于遗传的 PrCa 筛查计划并指导适当的治疗。然而，对于其表现的许多方面仍然缺乏了解；尤其是与侵袭性表型相关的基因、非欧洲人群的风险因素以及能够准确分层高风险和低风险个体的适当方法。本综述讨论了用于阐明负责调节 PrCa 易感性的基因位点、基因和个体因果变异的方法；目前对导致 PrCa 风险的等位基因谱的理解状态；以及这些发现在基因组学和个性化医疗发展时代未来的转化应用前景。
ME31b通过防止果蝇雄性种系的过量去分化来调节干细胞稳态
组织特异性干细胞通过在生物体的整个生命中提供分化细胞的连续供应来维持组织稳态。分化/分化的细胞可以通过去分化恢复到干细胞的身份，以帮助维持干细胞池超越单个干细胞的寿命。尽管去分化对于维持干细胞种群很重要，但据推测它是肿瘤发生的基础。因此，必须严格控制此过程。在这里，我们表明，转化调节剂ME31b在防止果蝇男性生殖线的过量去分化方面起着至关重要的作用：在没有ME31b的情况下，精子症在频率较高的频率下将精子延伸到种系干细胞（GSC）中。我们的结果表明，过量的去分化可能是由于NOS的不正调，NOS是生殖细胞身份和GSC维持的关键调节剂。综上所述，我们的数据揭示了对去分化的负面调节，以平衡干细胞维持与分化。
种系基因组对癌症免疫逃避和免疫治疗反应具有显性遗传贡献
背景：免疫逃逸是癌症的一个基本特征。在肿瘤发展的早期阶段，肿瘤必须实施免疫逃逸策略来防止宿主免疫系统的攻击。阻断肿瘤的免疫逃逸将重新激活宿主免疫系统来消灭肿瘤。应用抗 PD-1/PD-L1 或抗 CTLA4 治疗的免疫检查点疗法 (ICT) 在过去几年中取得了显著的成功。然而，由于肿瘤免疫系统的复杂性，约 70% 的患者无法从 ICT 治疗中获得任何临床益处。过去，人们认为种系致病变异对癌症的遗传贡献很小。结果：新兴证据表明，种系基因组通过编码宿主免疫系统对癌症发挥显性遗传贡献。免疫系统的功能成分由宿主基因组编码，因此种系基因组可能对癌症免疫逃逸和免疫治疗反应产生深远影响。事实上，最近的研究表明，种系致病变异可以通过 (i) 塑造肿瘤体细胞突变、改变甲基化模式和抗原呈递能力或 (ii) 影响 NK 细胞调节肿瘤微环境中淋巴细胞滤过的功能，在群体水平上影响癌症患者的免疫能力。此外，HLA（A、B 或 C 型）基因型也会影响肿瘤体细胞突变的格局。结论：这些结果强调了种系基因组在免疫和癌症发展中不可或缺的作用，并表明应将种系基因组学整合到癌症生物学和癌症免疫治疗的研究领域中。
利用癌症突变数据为种系错义变异的致病性分类提供信息
1 加拿大安大略省多伦多市 SickKids 研究所遗传学和基因组生物学项目，2 加拿大安大略省多伦多市多伦多大学分子遗传学系，3 加拿大安大略省多伦多市病童医院应用基因组学中心，4 加拿大安大略省多伦多市多伦多大学人类生物学项目，5 加拿大安大略省多伦多市病童医院计算医学中心，6 加拿大安大略省渥太华大学东安大略省儿童医院研究所，7 美国马里兰州盖瑟斯堡 GeneDx，8 英国伦敦 Genomics England，9 加拿大安大略省多伦多市多伦多大学儿科系病童医院血液学/肿瘤学分部，10 加拿大安大略省多伦多市多伦多大学 Donnelly 细胞和生物分子研究中心 (CCBR)，11 Lunenfeld-Tanenbaum 研究所（LTRI），西奈医疗系统，多伦多，安大略省，加拿大，12 癌症系统生物学中心（CCSB），丹娜法伯癌症研究所，马萨诸塞州波士顿，美国，13 多伦多大学计算机科学系，多伦多，安大略省，加拿大，14 多伦多大学儿童医院临床和代谢遗传学分部和儿科系，多伦多，安大略省，加拿大
连接的神经发育障碍？ - 深蓝色存储库
许多染色质调节剂中的突变引起具有未知机制的神经发育障碍（NDDS）。可以理解，大多数研究都集中在染色质调节剂如何控制与脑发育和功能直接相关的基因表达（例如突触基因）。然而，一些NDD模型令人惊讶地显示出大脑种系基因的异位表达。这些种系基因通常仅在生殖细胞发育和性繁殖的原始生殖细胞，睾丸和卵巢中表达。已经报道了几种NDD中的这种异位种系基因的表达，包括免疫效率，cen-细胞不稳定性，面部异常综合征1； Kleefstra综合征1； MECP2重复综合征；和智力低下，X连锁的合成，Claes - Jensen型。负责的基因DNMT3B，G9A/GLP，MECP2和KDM5C，all aste asto contode condy consultation asto contode condiment。因此，这些突变可能导致种系基因的抑制，进而导致脑细胞的严重认同危机 - 可能会干扰诺尔脑发育。因此，种系基因的异位表达是定义该NDD子集的独特标志，进一步暗示了在大脑发育过程中种系基因沉默的重要性。种系基因表达对脑发育的功能影响仍然不确定。这篇观点文章探讨了这种明显的soma-dermlin转化如何出现，以及它如何通过基因组不稳定性和感官纤毛形成受损而干扰神经循环。此外，我们还讨论了如何在实验中测试这些假设，以最终确定异位种系转录物对染色质连接NDD的贡献。