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感觉运动学习的小脑种群编码模型
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证未通过同行评审获得证明）是作者/资助者，他已授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。它是此预印本的版权持有人（该版本发布于2024年4月10日。; https：//doi.org/10.1101/2023.07.04.547720 doi：biorxiv Preprint
用于种群更替的自主基因驱动
摘要 基因驱动蚊子种群替换是控制疟疾的有前途的工具。然而，目前还没有明确的途径可以在疟疾流行国家安全地测试此类工具。缺乏与感染相关的组织的特征明确的启动子和监管障碍是设计和使用此类工具的进一步障碍。在这里，我们探讨了如何对内源性蚊子基因进行最小限度的遗传修饰，将其直接转化为非自主基因驱动，而不会破坏其表达。我们利用疟疾媒介冈比亚按蚊的三个中肠特异性基因座的天然调控序列来承载原型抗疟分子和编码在人工内含子内的指导 RNA，以支持有效的基因驱动。我们评估了这些修饰干扰恶性疟原虫发育的倾向及其对适应性的影响。由于其固有的简单性和被动驱动模式，这些特性可以成为可接受的疟疾根除基因驱动测试途径的一部分。
无限维元种群 SIS 模型
1.1.3. 走向概括。到目前为止讨论的流行病学模型假设人口庞大，可能由几个行为不同的群体组成，因此流行病是确定性的。在建模范围的另一端，一些相互作用粒子的概率模型可能被视为流行病的建模。1974 年，哈里斯 [24] 在 Z d 上引入了所谓的接触过程。接触过程是一个连续时间马尔可夫过程，常用作感染传播的模型。图上的节点代表一个种群中的个体。他们可能是被感染的，也可能是健康的。受感染的个体在指数时间后会恢复健康，与配置无关。健康个体的感染率与受感染邻居的数量成正比。接触过程与多群 SIS 方程有许多共同的属性：存在上不变测度、无病不变测度和单调耦合 [35, 36]。这种接近性并不奇怪，因为方程 (2) 可以通过接触过程的平均场近似得到 [47，第 VA 节]。请注意，方程 (2) 也可以作为基于个体的模型的极限获得，参见 [3]。
使用种群生存能力分析和化石的研究...
摘要：种群下降和灭绝通常是由多种压力源驱动的。自公元1500年以来，预测的鸟类的全球灭绝率估计比长期背景平均水平至少高出80倍。pāteke/棕色蓝绿色（Anas Chlorotis）是新西兰Aotearoa的威胁性水禽，目前的人口为c。 2500，分布在两个残余人群和少数重新引入地点。自人类到来以来，帕特克的下降是由于栖息地的丧失和破碎，捕食和其他人为相互作用而导致的。两个残余人群之一位于Aotea大屏障岛上，自1980年代以来一直在下降。我们使用了种群生存能力分析和物种分布建模的组合来更好地理解（1）AOTEA下降的驱动因素，（2）最有可能降低灭绝风险的管理干预措施以及（3）Pāteke在Aotearoa跨Aotearoa的史前分布。我们的模型通过了来自AOTEA的七年密集监控数据以及全国分布的化石记录的结合。人口生存能力分析结果表明，在接下来的100年中，AOTEA上的Pāteke人口灭绝的可能性为46％，有99％的机会降至50个人的丰度低于50个人。管理应主要关注成人的生命阶段，因为保护这个阶段导致人口增长率最大。物种分布建模结果表明，从历史上看，帕特克在沿海的大部分Aotearoa中都存在。正如人口下降通常是多种压力源的结果一样，通常需要进行多种干预措施才能停止灭绝。对于Pāteke，这将意味着控制多种哺乳动物捕食者物种，改善栖息地质量，并在其前范围内重新建立人口。对于Pāteke，这将意味着控制多种哺乳动物捕食者物种，改善栖息地质量，并在其前范围内重新建立人口。
CRISPR 内切酶对果蝇种群适应性的影响
摘要 成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR)/Cas9 是一种高效灵活的基因组编辑技术，具有从基因治疗到种群控制等众多潜在应用。一些拟议的应用涉及将 CRISPR/Cas9 内切酶整合到生物体的基因组中，这引发了对转基因个体可能有害影响的疑问。一个特别相关的例子是基于 CRISPR 的基因驱动，旨在改变整个种群的基因。此类驱动的性能在很大程度上取决于驱动携带者所经历的适应性成本，但人们对这些成本的大小和原因知之甚少。在这里，我们通过跟踪四种不同转基因构建体的等位基因频率来评估果蝇笼养种群中基因组 CRISPR/Cas9 表达的适应性效应，这使我们能够将 Cas9 的整合、表达和靶位活动造成的“直接”适应性成本与潜在的脱靶切割造成的适应性成本区分开来。使用最大似然框架，我们发现没有直接适应度成本但因脱靶效应而产生中等成本的模型最适合我们的笼状数据。与此一致，我们没有观察到具有 Cas9HF1（Cas9 的高保真版本）的构建体的适应度成本。我们进一步证明，在归巢驱动器中使用 Cas9HF1 代替标准 Cas9 可实现类似的驱动器转换效率。这些结果表明，基因驱动应使用高保真内切酶进行设计，并且可能对涉及 CRISPR 内切酶基因组整合的其他应用产生影响。
在空间隔离的巨噬细胞种群中预测了不同的...
6美国加利福尼亚州斯坦福大学斯坦福大学发展生物学系7 Stanford University，Stanford University，Stanford，加利福尼亚州斯坦福大学，美国加利福尼亚州斯坦福大学8史坦福大学，斯坦福大学，斯坦福大学，加利福尼亚州斯坦福大学，加利福尼亚州斯坦福大学。 #correspondence应解决：Magdalena Matusiak，Ph.D.。 300 Pasteur DR，RM L209，94305 Stanford，美国加利福尼亚州，美国病理学系，斯坦福大学，斯坦福大学，加利福尼亚州，美国加利福尼亚州，美国，美国，美国，美国，美国，美国病理学。 300 Pasteur DR，RM L235，94305，美国加利福尼亚州斯坦福大学，美国病理学系，斯坦福大学，加利福尼亚州斯坦福大学，美国加利福尼亚州，MRIJN@Stanford.Edu +1 +1（650）723-5252 723-5252宣言，所有作者都没有宣布任何潜在的冲突。 运行标题人类巨噬细胞的空间图6美国加利福尼亚州斯坦福大学斯坦福大学发展生物学系7 Stanford University，Stanford University，Stanford，加利福尼亚州斯坦福大学，美国加利福尼亚州斯坦福大学8史坦福大学，斯坦福大学，斯坦福大学，加利福尼亚州斯坦福大学，加利福尼亚州斯坦福大学。#correspondence应解决：Magdalena Matusiak，Ph.D.。 300 Pasteur DR，RM L209，94305 Stanford，美国加利福尼亚州，美国病理学系，斯坦福大学，斯坦福大学，加利福尼亚州，美国加利福尼亚州，美国，美国，美国，美国，美国，美国病理学。 300 Pasteur DR，RM L235，94305，美国加利福尼亚州斯坦福大学，美国病理学系，斯坦福大学，加利福尼亚州斯坦福大学，美国加利福尼亚州，MRIJN@Stanford.Edu +1 +1（650）723-5252 723-5252宣言，所有作者都没有宣布任何潜在的冲突。运行标题人类巨噬细胞的空间图
当代小儿种群中有氧健身的参考值
摘要众多研究表明，体育活动有助于词汇整合（即“制定效应”），表明行动可以提高记忆力的性能并支持语言编码。这种现象最近被描述为“体现的学习”，或者涉及与学习内容直接相关的自我执行或自我生成的动作的学习。体现的语义认为，认知基于源自人类经验的多模式表示，并且运动过程在语言处理中起着至关重要的作用。这一证据的许多证据在于神经影像学研究表明，在发育和成人期间，无论是在词汇加工过程中招募了感觉和运动系统。对成人第二语言（L2）学习者的研究通常表明，感觉运动网络也参与L2处理，但比L1少。与L1获取相比，这可能是由于L2学习经常被脱皮的。最近，人们对促进体现学习及其对L2学习的影响的神经认知过程的兴趣越来越大。在本章中，我们回顾了由行为和神经认知研究报告的主要结果，探讨了本地语言处理和成人L2学习者中体现的语言处理和学习。1。体现的语义是找到我们如何将概念与语言标签联系起来的关键，这是我们理解我们如何获得第一语言，后来在生活中学习第二种语言的基础（另请参见Tokowicz＆Tkacikova，本卷）。尽管进行了数十年的研究，但关于人脑如何将声学信号（例如[g ɪˈ tː]）与特定概念（例如吉他）联系起来（Saussure，1916; Shapiro，2011年）仍然几乎没有共识。当前有两个相反的观点，这些观点与为概念信息构建的表示类型不同。根据经典的Amodal理论，认知是一个计算过程，从感知和通过操纵心理符号来创造意义（Fodor，1998； Landauer＆Dumais，1997）。通过“三明治模型”隐喻描述了这一点：感觉运动系统简单地感知信息（输入），然后产生动作（输出）（Hurley，1998）。同时，将认知夹在两者之间，以便1）将感知的输入转换为Amodal符号，并将其链接到我们语义内存中的相关信息，并在我们的语义内存中链接到2）对这些符号进行操作以进行输出。本质上，知识存储在一个孤立的语义记忆系统中，独立于感觉运动过程。经典的Amodal理论并不能说明我们如何理解这些符号的现实世界含义，而这些符号本身是由其他符号定义的。挑战传统认知研究的一些基本信念，体现了理论，规定概念符号在某些时候必须与现实世界有关，并以感觉运动体验为基础（Hauk＆Tschentscher，2013年）。这也可能适用于更抽象的概念，例如自由，至少在最初与个人经验相关（例如，一个孩子从请子弹中提取自己并听到“您是免费的！”）。根据体现的语义，概念表示受到感觉运动过程的影响很大，语言形式基于我们人体的感知和行动计划体系（Barsalou，1999）。其背后的关键概念之一是“相关学习原理”，根据该原则，动作感知和意义的同时存在导致神经元的共同触发，形成神经连接或分布式神经网络，以进行语义处理（Pulvermu ller，1999; 2013; 2013; 2013; 2013; 2013; 2013; 2013）。简而言之，“什么共同开火，将电线一起开火”（Hebb，1949年），例如，如果孩子经常在踢球时听到“踢”一词，那么词典语义网络，负责处理“踢”一词的词典语义网络，以及负责处理和执行运动必要的动作的人，将成为共享的网络，将会随着时间的推移而成为共享的网络。这个想法与Amodal理论形成鲜明对比，该理论声称用于概念知识和语言的表示形式独立于身体及其经验。尽管本章中描述的许多研究所描述的，但在该领域的最新研究最初是黑色和白色的，但该领域的最新研究变得更加细微，并集中在何时以及如何体现语言上。
从重金属中隔离土壤微生物种群
摘要：当存在有毒水平时，许多金属对生命至关重要，对人类，动物，植物和微生物有害。土壤中重金属的发生主要归因于工业，采矿和农业活动。这项研究的重点是将土壤微生物种群与重金属污染的土壤中分离，并确定重金属对从金属行业地点收集的细菌种群的最低抑制浓度（MIC）。土壤中的重金属污染构成了重大的环境挑战。研究中确定的微生物群落包括两组：重金属耐药和敏感人群。抗性微生物分离株包括假单胞菌，芽孢杆菌，小杆菌和微球菌等物种。在土壤培养基中评估了分离株的MIC，以评估镉（CD），铬（CR），镍（Ni）和铅（Pb）等金属。孤立的重金属细菌可能有效，可用于重金属污染土壤的生物修复。关键字： - 被污染的土壤，重金属，生物修复，土壤微生物。
克罗地亚地方驴品种的遗传和种群结构
摘要：克罗地亚的两个本土驴品种（滨海狄那里克驴和伊斯特拉驴）在 20 世纪下半叶被边缘化，濒临生物灭绝。本研究旨在通过分析两种驴品种的谱系和遗传结构，分析它们在保护开始后的 20 年内的人口统计和遗传状况。伊斯特拉驴的平均世代间隔（7.73）高于滨海狄那里克驴（7.27）。滨海狄那里克驴（1.03；325/316）和伊斯特拉驴（1.08；70/65）中创始人有效数量与祖先有效数量的比率没有显示遗传瓶颈的证据。滨海-狄那里克驴种群的近交系数 (F) 和平均亲缘系数 (AR) (0.99%; 0.13%) 低于伊斯特拉驴种群 (1.77%; 1.10%)。遗传微卫星分析表明，滨海-狄那里克驴和伊斯特拉驴品种的遗传多样性相对较高，以平均等位基因数 (5.92; 5.85) 和预期杂合度 (0.650; 0.653) 来表达。在过去的二十年里，滨海-狄那里克驴和伊斯特拉驴之间的遗传分化并没有显著增加 (F ST = 0.028)。遗传分析还表明，这两个品种都没有高度近交或遗传瓶颈的证据。在 30 个样本中总共发现了 11 种单倍型，包括 28 个多态性位点。线粒体DNA分析表明，滨海-狄那里克驴和伊斯特拉驴品种属于非洲马群。该研究证实，需要使用不同的分析方法来定期、全面地了解品种内和品种间的情况和趋势，以便充分保护现有的多样性。
运输模型中的基于池的种群综合方法
传统的Popsyn方法，例如迭代比例拟合（IPF）（例如（Beckman等人）1996; Ye等。 2009））和贝叶斯网络（例如（Ilahi和Axhausen 2019; Sun and Erath 2015），试图将合成种群与两个数据源相结合，但遭受了几种限制。> IPF，例如，在尺寸和零电池问题的诅咒中挣扎，其中属性的某些组合在示例数据中完全缺少。 贝叶斯网络虽然更灵活，但可以产生难以置信的组合，这些组合不能准确地代表现实世界，并且不能与边际数据匹配（Rahman and Fatmi 2023）。 这些缺点强调了需要更强大的方法，该方法可以更好地整合多种数据源并保持现实的人口特征。1996; Ye等。2009））和贝叶斯网络（例如（Ilahi和Axhausen 2019; Sun and Erath 2015），试图将合成种群与两个数据源相结合，但遭受了几种限制。>2009））和贝叶斯网络（例如（Ilahi和Axhausen 2019; Sun and Erath 2015），试图将合成种群与两个数据源相结合，但遭受了几种限制。IPF，例如，在尺寸和零电池问题的诅咒中挣扎，其中属性的某些组合在示例数据中完全缺少。贝叶斯网络虽然更灵活，但可以产生难以置信的组合，这些组合不能准确地代表现实世界，并且不能与边际数据匹配（Rahman and Fatmi 2023）。这些缺点强调了需要更强大的方法，该方法可以更好地整合多种数据源并保持现实的人口特征。