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World File Search System种群
产生亚种群特异性双室解剖...
摘要。生成统计模型在心脏解剖和功能的建模中具有多种应用，包括疾病诊断和预测，个性化形状分析以及用于电生理和机械计算机模拟的人群同类群体的产生。在这项工作中，我们提出了一种新的几何深度学习方法，基于各种自动编码器（VAE）框架的框架，这些框架准确地编码，重建和合成了双脑室解剖结构的3D表面模型。我们的非线性方法可与记忆良好的点云直接起作用，并且能够在多级设置中同时处理心脏解剖结构的多个子结构。此外，我们将亚群特定的特征引入了其他条件输入，以允许产生新的人解剖学。我们的方法在来自英国生物银行研究的数据集上达到了高重建质量，在基础图像像素分辨率下方的重建和金标准点云之间的平均倒角距离，用于所有解剖学子结构以及条件输入的组合。我们研究了我们方法的生成能力，并表明它能够通过既定的临床先例，通过体积测量来合成逼真的心脏的虚拟弹出术。我们还分析了自动编码器潜在空间中变异的影响，并在产生的解剖体上发现心脏形状和大小的可解释变化。
神经种群在其时间接收窗口的大小上
长阅读的RNA测序可以在单个转录物同工型的分辨率下对RNA修饰，结构和蛋白质相互作用位点的映射。要了解这些RNA特征的功能，在转录组和基因组注释（例如开放式阅读框架和剪接连接）的背景下对它们进行分析至关重要。为了实现这一目标，我们开发了R2Dtool，这是一种生物信息学工具，将转录映射的信息与转录本和基因组注释集成在一起，从而允许同工型分辨分析和RNA在其基因组上下文中的RNA特征的图形表示。我们说明了R2Dtool使用同志数据集成和加速RNA特征分析的能力。R2DTOOL促进了替代转录本同工型的综合分析和解释。R2DTOOL促进了替代转录本同工型的综合分析和解释。
流浪动物种群控制 - 世界兽医期刊
流浪动物人口过多已成为最严重的全球问题之一，对社区，环境和公共卫生产生了许多负面影响。大多数流浪动物不依靠人类来食物和庇护所，因此，可以无法控制地繁殖。流浪动物的不受控制的繁殖增加了人口，从而导致捕食，道路交通事故，人畜共患病的传播，因此成为某些疾病的向量。根据流浪动物的情况和性质，有几种散布动物种群控制的方法。这些方法包括避孕药，陷阱中的返回，中毒，安乐死和枪支射击。每种概述的方法都具有其实用性，易于进行，成本，有效性，道德和动物福利问题的优势和缺点。总而言之，为了实现杂散动物种群的成功控制措施，相关当局需要设计和制定动物权利法，提供医疗服务（治疗和疫苗接种），喂养，为动物提供庇护，并控制其繁殖。公共卫生和环境机构可以通过规范可以从流浪动物传播到公共和其他牲畜的人畜共患病和可传播疾病来改善服务。
AY 染色体连锁基因组编辑器，用于高效种群 1
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可，根据 提供（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2024 年 5 月 14 日发布。；https://doi.org/10.1101/2024.05.14.594116 doi：bioRxiv 预印本
揭示多个神经元种群中并发信号的基序
现代记录技术现在使我们能够从不同大脑网络中不同神经元群体中记录。但是，尤其是当我们考虑多个（超过两个）人群时，需要新的概念和统计框架来表征这些人群中信号的多维，同时流动。在这里，我们开发了一个确定每个潜在维度所描述的人群的子集，（2）这些人群之间信号流的方向，以及（3）这些信号在实验试验内部和整个实验试验中如何演变。我们在模拟中说明了这些特征，并通过将其应用于猕猴视觉区域V1和V2中神经元种群的先前研究的录音来进一步验证该方法。然后，我们研究了与多个Neuropixels探针同时记录的区域V1，V2和V3D区域跨层隔室的相互作用。我们的方法揭示了与视网膜一致性相关的这三个领域的选择性交流的签名。这项工作推进了多个神经元种群中并发信号的研究。
麻醉引起的小儿种群中的发育神经毒性
麻醉和镇静剂可能会导致儿童长期负面神经认知后果。关于该学科的许多临床报告对临床小儿麻醉学领域产生了深远的影响。来自动物模型的发现表明，早期暴露于麻醉可能会导致大脑中神经认知障碍和凋亡细胞死亡。，尽管由于许多可变因素，因此无法将实验动物的发现直接转化为儿科人群中麻醉的方法，但父母和政府监管机构已经变得敏感，并且专注于儿童麻醉的潜在不良影响。人类中的多次流行病学研究增加了越来越多的证据体系，表明早期麻醉后的神经系统障碍和认知能力下降。这得到了几个结果指标的支持，包括经过验证的神经心理学测试，神经发育或行为障碍的教育干预措施以及学业成绩或学校准备就绪。这些结果已在涉及患有全身麻醉的儿童的临床研究中进行了评估。本文的主要目的是批判性地检查临床发现，进行证据的系统分析，讨论神经毒性的潜在潜在基础机制，麻醉诱导的发育神经毒性的病理生理学涉及线粒体，内脑脑肿瘤肿瘤和溶酶体，以及dedicia inst and dediciacia涉及线粒体。尽管有必要进行详细的控制良好的临床研究，但迄今为止的证据支持手术麻醉对小儿人群诱导神经毒性的潜在不利影响并未被夸大。
社论：基因组学在选择或保护牲畜种群中的应用
Genomics is one of the newest branches of biology that has progressed tremendously during the last decades. Genomics deals with the molecular structures, functions, evolution, and mapping of the genomes of any species and has signi fi cantly generated new information that has improved our understanding of the complex biology and genetic mechanisms of animal production systems. The advancement of genomics is linked with a number of key developments, which include the rapid expansion of next-generation sequencing and chip- based genotyping assays. Large-scale genomics data are now utilized more and more due to the dwindling cost of such sequencing and genotyping techniques. Livestock breeding programs, including selection and conservation efforts, have attained huge success due to affordable genomic prediction, particularly in dairy cattle. It is expected that there will be further reduction in the cost of these high-throughput genomic data generation platforms and more development of precise estimation methodologies. Multi-disciplinary involvement is going to further bene fi t the genomics community with the advancement of robust and reliable tools in the fi eld of bioinformatics and their use in livestock breeding. Keeping these developments in the area of livestock genomics in mind, the present Research topic of the Frontiers in Genetics titled “ Application of Genomics in Livestock Populations under Selection or Conservation ” was aptly selected with several major themes that highlighted the usage of genomics for conservation, current methods of genomics, application of whole-genome- and genome-wide-based techniques, and use of different bioinformatics tools and pipelines for the processing of genomic data. The resulting efforts contributed to the publication of a total 19 research papers in the current volume, comprising major focal points in the area of genomics of livestock and other species with the concerns of the present day. However, the ocean of genomics is too vast, and even this wide-array of published articles could hardly justify an ounce of that vastness! Nonetheless, genuine efforts were made to include articles in this volume on those central themes of genomics that comprise the major skills and techniques employed in various animal populations for selection and conservation issues. These include genome- wide association studies (GWAS), differential gene expression utilizing transcriptome data, and analysis of selection signatures through whole-genome sequencing and high-density genotyping datasets, which are utilized for discovering genes and genomic variants that control signi fi cant traits of importance in livestock species.
遥感和机器学习以改善空中野生动植物种群调查
遥感和机器学习的技术和方法论进步为推进野生动植物调查创造了新的机会。我们组建了一个实践社区（COP），以利用这些发展，以探索从管理层的角度来提高空中野生动植物监测的效率和有效性。COP的核心目标是组织遥感和机器学习方法的开发和测试，以改善支持管理决策的空中野生动植物种群调查。从2020年开始，COP合作确定了由野生动植物调查数据所告知的自然资源管理决策，重点是水鸟和海洋野生动植物。我们调查了我们的会员资格以建立1）他们使用野生动植物数量数据的管理决定； 2）在遥感/机器学习方法出现之前，如何收集这些计数数据； 3）过渡到遥感/机器学习方法学框架的动力； 4）从业者过渡到此框架时面临的挑战。本文记录了这些发现，并确定了朝着基于遥感的野生动植物调查迈向野生动植物管理方面的研究优先级。