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World File Search System种群
使用公民科学数据评估物种种群变化的有效统计推断方法
由栖息地退化和气候破裂驱动的全球生物多样性下降是一个重大问题。准确的变化措施对于提供物种种群变化的可靠证据至关重要。与此同时，公民科学数据已经看到了数量和来源的显着扩展，并作为评估物种地位的基础。不断增长的数据储层为新颖和改进的推理提供了机会，但通常会带来计算成本：计算效率至关重要，尤其是在需要定期分析更新时。基于最近的研究，我们介绍了适用于新模型的计算有效方法的插图，该方法适用于三个主要的公民科学数据集。我们扩展了一种建模季节性生物的丰度变化的方法，首先是为了有效地适应多年的计数数据，其次是用于使用快照大众参与调查的计数。我们还提出了一种有效地适合机会主义公民科学数据的变异推理方法。公民科学数据的持续增长提供了前所未有的机会，以增强我们对物种如何应对人为压力的理解。拟合新模型的有效技术对于准确评估物种的地位，支持决策，设定可衡量的目标以及实现有效的保护工作至关重要。
中性粒细胞与淋巴细胞比是小儿种群创伤性脑损伤的预后标记？
摘要。- 目的：中性粒细胞与膜细胞比率（NLR）用于以炎症过程为特征的疾病的预言。本研究旨在讨论小儿创伤性脑损伤病例中的长期结局和NLR。患者和方法：这项研究投资于18岁以下的脑损伤患者。患者分为5组。初始入院格拉斯哥昏迷量表（GCS）瓣膜，神经检查，学生条件，心肺复苏（CPR）施用和癫痫发作。neu-trophil计数和淋巴细胞计数，这些计数是从患者入院前8小时内获得的全血数（CBC）值得出的，用于计算NLR值。结果：在研究中评估了150名患者，54名（36％）的患者和96名（64％）男性。最常见的事故类型是从高度[84例患者（56％）]掉落的。GCS，Anisocoria，Surgical Procedure和中性粒细胞计数在GOS评分之间有很大差异。GOS和NLR之间没有统计学上的显着差异（p = 0.400）。根据CPR，癫痫发作和脑损伤类型的NLR值有显着差异（P <0.05）。
农业景观中的多年生花条强烈促进worm种群
通过农业强化而丧失土壤生物多样性，是生态系统服务崩溃的主要因素。尽管它们广泛用于促进生物多样性，但浅层条对土壤生物的影响在很大程度上尚不清楚。在这里，我们研究了多年生型层状条对46个具有成对农田和多年生型式剥离的地点的worm群落的影响。earth虫种群密度较高的条带平均比相邻农田高231％。花条可以使他们能够在农田中不存在的植物和epigeic种群建立。此外，浮游条可能是繁殖胚胎的栖息地。我们期望eTthatthatthatththatthepromotionofearthorthortherstripstripsimprovessoilfunctionsfunctionsandbene -fimbene -flyphigher thigher thigher thigher thigher trophic分类群。我们提出，优化的种子混合物，改善的空间配置和建立瞬时条带的时间连续性可以进一步促进土壤生态系统服务。
无菌养殖鲑鱼是解决与野生种群基因渗入风险的一种方法
• 预计在 3-5 年内获得第一批结果 • 使用反义分子特异性抑制生殖细胞发育导致不育 • 直接应用于生产用蛋 • 正常发育和生产条件 • 方法正在开发中 • 监管环境不确定
通过遗传多样性和种群结构来优化早期培养白玉米的繁殖策略
玉米的生产和撒哈拉以南非洲的生产力受到各种因素的约束。评估新开发的精英亲属线的遗传多样性可以帮助识别具有理想基因的线条并探索杂种育种的遗传相关性。这项研究的目标是评估遗传多样性和种群结构的水平，并确定适当的聚类方法，以将玉米含量分配为杂种群体。使用多样性阵列技术（DARTTAG）中密度平台对从三个来源种群中提取的三百七十六个精英杂种进行了基因分型。从1904年获得的3,305个SNP标记的结果显示，平均标记物多态性信息含量（PIC）为0.39，观察到0.02的杂合性，基因多样性为0.37，次要等位基因频率为0.29，Shannon和Simpson Intices，分别为6.86和949.09，分别为6.86和949.09，以及787.70.70.70.70.70.70.70.70.70.70.70.70。最佳亚群是由基于混合的模型和主成分分析定义的三个。平均遗传距离为0.303，从0.03（TZEI 2772×TZEI 2761）到0.372（TZEI 2273×TZEI 2832）。对于376个精英杂交的认可杂质分类，使用IBS距离矩阵和平均链接聚类方法提供了最高的辅助相关系数（0.97）。使用IBS距离鉴定了三个杂种组（HG），而Hg 1的平均连锁聚类方法具有188个近交，Hg 2具有137个，Hg 3具有59个近百列。基于血统的系统发育树与确定的异质基团表现出很大的一致性。基于潜在人口结构的F统计量显示，亚种群之间的差异为10％，遗传分化水平中等的亚群中的差异为90％（0.10）。精英杂交线表现出高度的遗传多样性，这可能有益于开发新的，早期培养的白色杂种，以减轻撒哈拉以南非洲的生产约束。
用于果蝇自然种群中转座因子删除的两步 CRISPR-Cas9 方案
Miriam Merenciano 1,2,†,*, Laura Aguilera 1 和 Josefa González 1,3,** 1 进化生物学研究所 (CSIC-Universitat Pompeu Fabra)，08003 巴塞罗那，西班牙。† 现地址：生物计量与进化生物学实验室 (LBBE, Université Claude Bernard Lyon 1)，60100 Villeurbanne，法国。2 技术联系人 3 主要联系人 *通讯地址：miriam.merenciano@univ-lyon1.fr **通讯地址：josefa.gonzalez@csic.es 摘要 该方案使用两步 CRISPR-Cas9 同源定向修复在果蝇自然种群中精确删除转座因子 (TE)。在第一步中，用荧光标记物代替 TE，而在第二个 CRISPR-Cas9 步骤中，荧光标记物被移除以避免引入的标记序列可能产生的影响。因此，这个两步方案可以精确删除任何基因组区域（此处以 TE 为例），同时便于在自然群体中筛选阳性 CRISPR-Cas9 事件，而不会改变其遗传背景。有关此方案的使用和执行的完整详细信息，请参阅（Merenciano & Gonzalez，2023 年）。
巨噬细胞属的种群基因组学。揭示神秘的宿主专业化和减数分裂重组的证据
阴道微生物组组成与宿主健康密切相关。由特定厌氧菌（例如，阴道gardnerella）主导的微生物组称为细菌性阴道病（BV），与负面的健康结果有关，而乳酸杆菌属物种的定殖被认为可以预防BV。然而，乳酸杆菌内体在阴道健康中的作用是有争议的，有证据表明某些菌株可能无法预防BV，而其他菌株则可能无法防止BV。为了更好地表征L. iners菌株，需要在体外研究它们与阴道细菌和人类细胞的相互作用，但由于缺乏液体培养基的快速生长而阻碍了这种情况。我们开发了三种液体培养基的生长：Serrador适应ISCOVE的ISCOVE的培养基（Slim），这导致了强大的L. Iners生长，Slim-V（Slim-V）的阴道适应性版本（Slim-V）和一种化学定义的培养基（Slim-CD）（Slim-CD）。纤细和纤细的V型生长可显着改善。纤细-CD导致生长速度较慢，但可能被证明可用于表征L. iners的营养需求或代谢物生产。修改后的Slim-V版本支持人宫颈上皮细胞的生长，并为将来的共培养工作提供了基础。在这里，我们介绍了纤细，纤细V和Slim-CD的制剂，并比较了培养基中细菌菌株和人类细胞的生长。
许多赢家，很少的失败者：在气候变化中的非洲山地上的稳定鸟类种群
山区的生物经常暴露于极端气候，并且最容易受到气候变化的影响。对沿着海拔梯度的鸟类的长期研究，对于理解物种动态至关重要，在热带山脉中很少见，这限制了面对气候变化时了解其人口趋势的能力。我们在13年（2011 - 2023年）中建模了地下鸟类物种（n = 18）的局部丰度。Kasigau，肯尼亚，使用沿高度梯度收集的雾网数据。 我们的模型在研究期间显示出相对稳定的鸟类丰度。 但是，我们发现两次不同的人口崩溃影响了2015年和2022年大多数物种，这表明局部动态的变化可能导致山区鸟类种群的大量下降。 大多数物种在研究期间具有稳定的局部丰富性，但是参数引导显示一些趋势的下降趋势，包括一个流行的威胁物种。 我们强调了山区在面对全球环境转变（例如气候变化带来的）方面维持相对稳定的人群中的重要性，以及相对较小的空间变化的鸟类种群的活力。 面对温暖的气候，山区生态系统被视为潜在的生物多样性避难所，但需要进一步的研究来了解较高海拔高度的鸟类种群中短期和长期下降的驱动因素，尤其是在热带非洲。Kasigau，肯尼亚，使用沿高度梯度收集的雾网数据。我们的模型在研究期间显示出相对稳定的鸟类丰度。但是，我们发现两次不同的人口崩溃影响了2015年和2022年大多数物种，这表明局部动态的变化可能导致山区鸟类种群的大量下降。大多数物种在研究期间具有稳定的局部丰富性，但是参数引导显示一些趋势的下降趋势，包括一个流行的威胁物种。我们强调了山区在面对全球环境转变（例如气候变化带来的）方面维持相对稳定的人群中的重要性，以及相对较小的空间变化的鸟类种群的活力。面对温暖的气候，山区生态系统被视为潜在的生物多样性避难所，但需要进一步的研究来了解较高海拔高度的鸟类种群中短期和长期下降的驱动因素，尤其是在热带非洲。
基于备忘录的神经调节装置，用于实时监测和自适应控制体外神经元种群
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未获得同行评审证书）获得的是作者/资助者，他已授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权所有，该版本发布于2021年5月25日。 https://doi.org/10.1101/2021.05.25.25.445577 doi：biorxiv preprint