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分析快速启动：注释的稀有变体调用
bionano访问支持不同的工作流以检测人类基因组中的结构变体（SV）（图1）。根据Bionano技术，一种罕见的变体被定义为样品中低丰度中存在的变体，并且在参考分子中不存在。为了有效地识别此类变体，使用专用的生物信息学管道，该管道在局部将分子与参考保持一致，将它们与假定的差异组装成共识图，并以较少的计算负担确定结构变化。有关这些工作流中每一个的更多信息，请参阅Bionano求解操作理论：结构变体呼叫（CG-30110），Bionano求解操作理论：变体注释管道（CG-30190）和Bionano solve of操作理论：ENFOCUS FSHD分析（CG-303221）。要获取有关数据覆盖目标的信息，这些信息可能会根据分析而变化，请参见数据收集指南（CG-30173）。获取有关Bionano如何确定原始数据质量控制的信息，请参阅Bionano Access仪表板和芯片指标指南（CG-30304）和Bionano Access分子质量报告指南（CG-30223）。
人工智能是否是使先进技术文明在宇宙中变得稀有的巨大过滤器？
本研究考察了以下假设：人工智能 (AI) 的快速发展最终导致了超级人工智能 (ASI) 的出现，这可能充当了“大过滤器”，导致宇宙中先进技术文明稀缺。有人提出，这种过滤器在这些文明能够发展出稳定的多行星存在之前就出现了，这表明技术文明的典型寿命 (L) 不到 200 年。当将 L 的这种估计应用于德雷克方程的乐观版本时，与最近的 SETI 调查以及其他在电磁频谱上检测各种技术特征的努力所获得的零结果一致。通过 SETI 的视角，我们反思了人类当前的技术轨迹——本文提出的 L 的适度预测强调了迅速建立地球上人工智能发展和多行星社会发展的监管框架的迫切需要，以减轻此类生存威胁。宇宙中智慧和有意识生命的存续可能取决于此类国际监管措施和技术努力的及时有效实施。
NaCC1突变模型的稀有神经发育障碍具有潜在的突触功能障碍
在C.892C> T（P.ARG298TRP）上，转录阻遏核与伏隔核核的错义突变在染色体19上导致严重的神经发育延迟（Schoch等，2017）。为了建模这种疾病，我们用同源突变（NACC1 +/R284W）设计了第一个小鼠模型，并检查了E17.5到8个月的小鼠。两个性别的体重增加，癫痫样排放量延迟，并改变了皮质脑电图，行为癫痫发作和明显的后肢紧握的功率谱分布；女性在一个开放式场上显示thigmotaxis。在皮质中，NACC1长同工型（含有突变）从3个月增加到6个月，而短的同工型（在人类中不存在，在小鼠中缺乏AAR284），从产后日开始稳步上升（p）7。核NaCC1免疫反应性在皮质锥体神经元和含有中间神经元的Parval-bumin的核NACC1免疫反应性升高，而在星形胶质细胞或寡头胶质细胞核中不增加。星形胶质细胞过程中的神经胶质纯酸性蛋白质染色减少。P14突变小鼠皮层的 RNA-SEQ揭示了1,000多种差异表达的基因（DEGS）。 神经胶质文字被下调并上调突触基因。 来自上调DEG的顶级基因本体术语与结合后和离子通道功能有关，而下调的DEG富含与代谢功能，线粒体和核糖的术语相关的术语。 突触蛋白的水平已更改，但突触接触的数量和长度在3个月时没有改变。 纯合性恶化了一些表型，包括产后存活，体重增加延迟和核NACC1的增加。RNA-SEQ揭示了1,000多种差异表达的基因（DEGS）。神经胶质文字被下调并上调突触基因。来自上调DEG的顶级基因本体术语与结合后和离子通道功能有关，而下调的DEG富含与代谢功能，线粒体和核糖的术语相关的术语。突触蛋白的水平已更改，但突触接触的数量和长度在3个月时没有改变。纯合性恶化了一些表型，包括产后存活，体重增加延迟和核NACC1的增加。该小鼠模型模拟了一种罕见的自闭症形式，对于评估病理生理学和治疗干预靶标的是必不可少的。
主动自由生活的微巴拉齐微生物组在很大程度上由稀有的表面分类群
假定一个持续的微生物种子库来维持海洋生物圈，最近的发现表明，海洋表面中存在的原核分类群在整个水柱中占主导地位的原核群落。然而，环境条件对原核生物的活性产生了严格的控制，并且已知这些条件的急剧变化从表面到深水发生。总（DNA）和活动的同时表征（即具有蛋白质合成的潜力，RNA）在分布在热带和亚热带全球海洋中的13个站点的自由生活社区使我们能够评估它们沿水柱沿水柱的结构和多样性的变化。我们观察到，在垂直梯度上，主动社区比总体社区更相似。从活性和总体社区的垂直连通性观察，我们发现在表面上检测到的分类单元有时占低质体水的活性微生物组的75％以上（平均为50％）。这些活性分类单元通常在表面很少见，代表了所有表面分类单元的一小部分。我们的发现表明，环境条件的急剧变化会导致大部分表面分类单元的失活和消失，但是某些表面稀有的分类群保持活跃（或具有蛋白质合成的潜力）并占据了沐浴型活性微生物组。
稀有疾病的研究成功
海德堡，2024年2月28日 - 2024年2月29日，将在全球范围内举行罕见病日，以提高人们对罕见疾病的认识。目前可以治疗大约6,000至10,000种已知稀有疾病的大约6,000至10,000个已知稀有疾病的5％。有针对性的治疗方法的研究和开发是耗时的，因此鉴于患者数量少，许多公司回避财务支出。由于医疗需求的很高，监管机构正在寻求与正在研究所谓的孤儿药物的药物制造商关闭排名。生物制药公司的rhecell已从FDA获得了积极的反馈，以进行其创新的干细胞疗法（ABCB5+间充质干细胞）的快速曲目审查过程，以治疗罕见的儿科疾病表皮溶液Bullosa（EB）。目前无法治愈遗传性皮肤病，也称为“蝴蝶疾病”。
树引导的稀有功能选择和电子健康记录数据逻辑聚合
在分析电子健康记录（EHR）数据时，通常会遇到具有大量稀有二进制特征的统计学习，尤其是在具有先前医疗诊断和程序的疾病建模时。处理所产生的高度稀疏和大规模的二进制特征矩阵是众所周知的具有挑战性的，因为传统方法可能缺乏测试和模型拟合中的不一致性，而机器学习方法可能无法产生可解释的结果或临床上有意义的风险因素。为了改善基于EHR的建模并利用疾病分类的自然分层结构，我们提出了针对大规模回归的树木制定特征选择和逻辑方法，具有稀有的二进制特征，在这种情况下，不仅通过稀疏追求来实现降低尺寸，而且还可以通过与逻辑启动子进行逻辑启动子来实现。我们将组合问题转换为线性约束的正则化估计，该估计可以通过理论上的构造实现可扩展的计算。在具有EHR数据的自杀风险研究中，我们的方法能够选择和汇总以诊断疾病的诊断层次结构为指导的先前的心理健康诊断。通过平衡EHR诊断记录的稀有性和特异性，我们的策略都改善了预测和解释。我们确定了重要的高级类别和心理健康状况的子类别，并同时确定每个人都需要与自杀风险相关的特异性水平。
印度人类遗传学学会第48届年度会议和国际会议2024：促进稀有疾病研究社区中的合作印度人类遗传学学会第48届年度会议和国际会议2024：促进稀有疾病研究社区中的合作
由Frige的人类遗传学和古吉拉特邦生物技术研究中心共同组织的印度人类遗传学学会第48届年会和国际会议于2024年1月21日至24日在印度艾哈迈达巴德举行。今年的会议很特别，因为它拟人化了人类遗传学的核心宗旨：萨尔瓦·曼加拉姆·巴瓦图（Sarva Mangalam Bhavatu），这意味着所有人的和平，健康与繁荣。会议有700多名代表参加了会议，其中包括来自13个国家的130家学院和36个生物技术公司，他们讨论和审议了基本遗传学的进展以及转化性的培训，包括筛查，诊断，预防和新颖的治疗方法。有7000多种此类疾病，据估计，印度可能患有约7,000万病例，其中大多数情况仍未诊断，并且在其中约95％的情况下，没有批准的治疗方法。这些令人震惊的统计数据反映了受到罕见遗传疾病深深影响的患者，家庭和医疗保健兄弟会的繁重生活。涵盖了诸如光学基因组映射，端粒到telomere参考基因组的发展和泛基因组分析等新兴遗传技术的演示文稿，这些分析有助于人类基因组和疾病疾病的未产生隐藏复杂性。1埃文·艾希勒（Evan Eichler）通过使用基于牛津纳米孔的甲基化肛门来分享非分离事件背后的最新理解；约翰·伯恩（John Burn）对CAPP2试验的令人兴奋的结果，该试验证明了阿司匹林和抗性淀粉为林奇综合征2、3中的癌症化学预防剂； Stylianos Antonarkis讨论了致病变体的表型结构，与FoxI3相关的颅面微粒体的渗透性以及三体三体分析的杂质结构；乔里斯·韦尔特曼（Joris Veltman）阐述了关于从头变体在神经系统疾病和男性不育症4中的作用的二十年数据；以及有关全球出生缺陷负担的令人震惊的数据
回顾性鉴定标记稀有体细胞多能性潜能的细胞内在因素
Naveen Jain, 1 Yogesh Goyal, 2 , 3 , 4 , 5 Margaret C. Dunagin, 5 Christopher J. Cote, 5 Ian A. Mellis, 6 Benjamin Emert, 6 Connie L. Jiang, 1 Ian P. Dardani, 5 Sam Reffsin, 5 Miles Arnett, 5 Wenli Yang, 7 , 8 , 9 和 Arjun Raj 5 , 10 , 11 ,* 1 宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院细胞与分子生物学研究生组遗传学与表观遗传学项目，宾夕法尼亚州费城 19104，美国 2 西北大学范伯格医学院细胞与发育生物学系，伊利诺伊州芝加哥 60611，美国 3 西北大学合成生物学中心，伊利诺伊州芝加哥 60611，美国 4 范伯格医学院 Robert H. Lurie 综合癌症中心西北大学医学院，伊利诺伊州芝加哥 60611，美国 5 宾夕法尼亚大学工程与应用科学学院生物工程系，宾夕法尼亚州费城 19104，美国 6 宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院基因组学和计算生物学研究生组，宾夕法尼亚州费城 19104，美国 7 宾夕法尼亚大学医学系，宾夕法尼亚州费城，美国 8 宾夕法尼亚大学再生医学研究所，宾夕法尼亚州费城 19104，美国 9 宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院宾夕法尼亚心血管研究所，宾夕法尼亚州费城 19104，美国 10 宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院遗传学系，宾夕法尼亚州费城 19104，美国 11 主要联系人 *通信地址：arjunrajlab@gmail.com https://doi.org/10.1016/j.cels.2024.01.001
创新的诊断和治疗方法来打击稀有疾病
主要是遗传，罕见的罕见疾病很少能治愈，而且经常是慢性疾病，对受影响的人及其家人的生活质量产生了重大影响。目前发现的大约8,000种疾病 - 每年的动态增加约250种疾病 - 通常已经显示出儿童时期的症状。在许多情况下，诊断本身是一个挑战，治疗方案通常仅限于减轻症状和减慢疾病进展的速度。同时，只能通过排他性诊断才能确定的综合征数量正在增长，并且已经很难识别疾病的开始。