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World File Search System突变体
基因型到表型：CRISPR 基因编辑揭示了遗传补偿是变体和突变体表型分离的机制
摘要：正向遗传筛选已显示出有害突变的后果；然而，它们最适合于繁殖率高、繁殖量大的模式生物。此外，研究人员必须如实地识别表型变化，即使是细微的变化，才能充分发挥筛选的优势。反向遗传方法也探测基因型与表型的关系，只是遗传目标是预先定义的。直到最近，反向遗传方法还依赖于非基因组基因沉默或相对低效的同源性依赖基因靶向来产生功能丧失的产物。幸运的是，成簇的规律间隔的短回文重复序列 (CRISPR)/Cas 系统的灵活性和简单性彻底改变了反向遗传学，几乎可以随意对任何生物体中的任何基因进行精确诱变。成功整合插入/缺失 (INDEL) 和无义突变，从表面上看，会产生预期的功能丧失表型，但事实证明，这些整合几乎没有效果，即使其他基因沉默方法显示出强大的功能丧失后果。结果之间的分歧提出了有关我们对基因型到表型的理解的重要问题，并强调了中心法则中的补偿能力。本综述描述了最近似乎存在基因组补偿的研究，讨论了可能的补偿机制，并考虑了对强大的基因功能丧失研究很重要的因素。
高效的多重编辑：8x烟熏本尼亚和12倍拟南芥突变体的单发生成
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。根据作者/资助人提供了预印本（未经同行评审的认证）提供的，他已授予Biorxiv的许可证，以在2021年1月18日发布的此版本中显示此版本的版权持有人。 https://doi.org/10.1101/2020.03.31.018671 doi：Biorxiv Preprint
与肿瘤相关的抗原XCT和突变体-P53作为新组合抗肿瘤策略的分子靶标
摘要：胱氨酸/谷氨酸抗植物XCT是一种与肿瘤相关的抗原，在许多癌症类型中已被新近鉴定。通过参与谷胱甘肽生物合成，XCT可以保护癌细胞免受氧化应激条件和铁毒性的影响，并有助于代谢重编程，从而促进肿瘤的进展和化学抗性。此外，XCT在癌症干细胞中过表达。这些特征使XCT成为癌症治疗的有希望的靶标，正如文献中广泛报道的，在我们的免疫靶向方面。有趣的是，对TP53基因的研究表明，野生型和突变体p53均诱导了XCT的转录后下调调节，从而导致了铁毒性。APR-246是一种可以恢复癌细胞中野生型p53功能的小分子药物，已被描述为在具有突变体p53积累的肿瘤中XCT表达的间接调节剂，因此是一种与XCT抑制相结合的有希望的药物。本综述总结了当前对XCT的知识及其对p53的调节，重点是铁the虫中这两个分子的串扰，还考虑了一些可能的组合策略，这些策略可以与抗XCT免疫促进结合使用APR-246治疗。
锌塑造了 p53 的折叠景观，并建立了重新激活结构多样的癌症突变体的途径
摘要 p53 DNA 结合域 (DBD) 中的错义突变是每年新发癌症病例的一半原因。本文我们提出了一个热力学模型，该模型量化并关联了突变使 p53 失活的主要途径。我们发现 DBD 具有两种不寻常的特性——所有真核蛋白质中锌亲和力最高的特性之一，以及在缺乏锌的情况下极度不稳定性——预计这会使 p53 处于细胞内折叠/展开的边缘，而主要决定因素是可用的锌浓度。我们分析了 20 种最常见的致瘤性 p53 突变，发现 80% 会削弱锌亲和力、热力学稳定性或两者兼而有之。生物物理、基于细胞和鼠异种移植实验表明，合成的锌金属伴侣不仅可以挽救降低锌亲和力的突变，还可以挽救使 DBD 不稳定但不损害锌结合的突变。研究结果表明，锌金属伴侣每年可在美国治疗 120,500 名患者
FGF10-CRISPR镶嵌突变体证明了基因剂量...
CRISPR/CAS9介导的基因编辑通常会产生创始人的产生（F0）小鼠，这些小鼠在靶向基因中表现出体细胞镶嵌。众所周知，成纤维细胞生长因子10（FGF10） - 否则小鼠表现出有害和无肺表型，而中间肢体表型（可变有缺陷的四肢）在FGF10 -CrispR F0小鼠中观察到。然而，尚未研究FGF10-马赛克突变体中的肺表型与肢体类型和基因型有关。在这项研究中，我们检查了FGF10靶向的F0小鼠中的可变肺Phe -notypes，以确定肺表型是否与功能性FGF10基因型的百分比相关。首先，根据先前的报告，在胚胎第16.5天（E16.5）上的FGF10 -Crispr F0胚胎分为三种类型：I型，无肢； II型，肢体缺陷；和III型，正常的四肢。软骨和骨染色表明，在腰带（I型），肾小管或Zeugopo-Dial区域（II型）中观察到肢体截断。对FGF10的深度测序 - Mutant基因组表明，I型I型的代码子的平均比例为8.3±6.2％，II型的25.3±2.7％，III类型为54.3±9.5％（在E16.5的平均值）突变体的平均值（平均平均值）突变体的平均标准误差。组织学研究表明，I型胚胎几乎没有所有肺裂片。在II型胚胎中通常没有其他裂片发育不良的肺叶。在III型胚胎中形成的所有肺叶。I型和II胚胎中末端小管的数量显着较低，但在III型胚胎中没有变化。这些识别2型肺泡2型上皮（AECII）细胞，已知在FGF10-Heletozygous突变体中降低，使用抗表面活性剂蛋白C（SPC）抗体进行免疫接种：在E18.5肺中，进行了AECII肺的数量，AECII与功能FFF相依赖于E18.5肺部。
crispr/cas9介导的双质G0 Anemonefish（Amphiprion ocellaris）突变体
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2020年10月11日。 https://doi.org/10.1101/2020.10.07.330746 doi：Biorxiv Preprint
突变体p53团队中的主要参与者：小分子，基因...
图1。P53团队中的关键球员。p53是基因组“守门人”。MDM2抑制剂，突变体P53重新激活因子是防御线的参与者，而腺病毒基因疗法，基因编辑工具和免疫疗法是P53团队进攻线的一部分。新的但未知的强大玩家有望进入癌症治疗的最前沿，并在研究人员教练的领导下取得了成功。
有效的血脑屏障突变突变体IDH1抑制剂可在患者来源的正常异常转移模型中抑制使用IDH1突变的胶质母细胞瘤的生长
神经胶质瘤根据组织病的标准分类为WHO级I级I-IV。尽管I级肿瘤是良性的，但II级和III级肿瘤是恶性的，并且可以发展为最高级。即使在多模式治疗（包括手术，放疗和辅助化疗）（1-3）的多模式治疗后，IV级肿瘤（GBMS）的中位生存期也仅约16个月（1-3）。因此，迫切需要新型靶向疗法的开发。杂合突变，包括急性髓性白血病（AML），血管免疫细胞淋巴瘤，软骨瘤和胆管癌（4-7）。这些突变也发生在大部分II级–III级星形胶质细胞瘤和少突endrogliomas（53 - 83％）和次级GBM（54％；参考文献。8，9）。IDH1 ARG132（R132）密码子中的错义突变引起单个氨基酸取代，最常见于组氨酸（H），也是半胱氨酸（C），丝氨酸（S），甘氨酸（G），Leucine（k），lecine（k）和Isolecoine（I）。在神经胶质瘤中，最常见的突变是IDH1R132H，该突变约为所有IDH突变的90％，而很少检测到IDH2突变，与AML不同（4.4％；参考；参考。1，9）。野生型IDH是使用nADPÞ将异晶酸酯转换为-Ketogoglutarate（A -kg）的酶，而IDH1和IDH2分别位于细胞质和线粒体中。突变体IDH催化A-kg转换为oncometabolite 2-羟基谷物酸盐（2-HG;ref。11 - 16）。 在临床前广泛分析了突变体IDH在肿瘤发生中的作用11 - 16）。在临床前广泛分析了突变体IDH在肿瘤发生中的作用10），竞争性地抑制-kg - 依赖性双氧酶，包括表观遗传调节剂（十个易位和组蛋白脱甲基酶）等（EGL九种同源物和胶原蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白酶和胶原蛋白4-羟基酶；参考；参考。2-Hg的抑制作用导致CpG岛和组蛋白甲基化的异常DNA甲基化（11-13，17）以及缺氧诱导因子1 A的稳定，从而促进了肿瘤发生（18）。
使用 CRISPR/retron 系统进行替代突变体的多重生成、追踪和功能筛选
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。
schizosacchomyces pombe突变体在细胞壁中有缺陷的孤立和表征（1-3）1-d-葡聚糖
schizosaccharomyces pombe热敏突变体需要渗透稳定剂在非腐败温度下生存和生长。突变体在遗传和生化上都是表征的。在所有这些中，表型以孟德尔的方式隔离为单个基因，编码为隐性特征。通过互补分析定义了十四个基因座。细胞壁组成的研究表明，在37°C下生长时，细胞壁的量减少了三种菌株（JCR1，JCR5和JCR10）的I-Glucan。Galactomannan在另外两个人中减少了。菌株JCR1和JCR5分别具有突变等位基因CWGL-L和CWG2-1的菌株。CWGL基因座映射在ADE5标记左侧18.06 Centimorgans（CM）染色体III的右臂上； CWG2位于染色体I的左臂上，距离AROS标记34.6厘米。（1-3）0-D-Glucan合酶来自CWGL-L和CWG2-1突变菌株在37°C下生长的CWG2-1突变菌株与野生型菌株相比，在37°C下生长的菌株被缩小。但是，GTP的Km值和激活与野生型值相似。突变合成酶在热稳定性方面的表现像野生型酶。对源自同一四四形的子孢子的培养物中的圆形，裂解行为和低（1-3）0-D-葡聚糖合酶活性的分析显示所有这些特征的cosegregation。抗真菌剂乳头蛋白B和丙氨酸蛋白A对野生型和CWG2-1突变菌株的酶活性具有相似的影响，而在37°C下生长时，CWGL-1突变体具有更耐抑制剂的0-D-glucan 0-D-glucan Stantase。（1-3）01-D-葡聚糖合酶分解为可溶性和颗粒分数，随后的重构表明，CWGL-1突变体在酶活性的颗粒分数中受到影响，而CWG2-1在可溶性组件中受到影响。可以得出结论，CWGL+和CWG2+基因与（1-3）0i-D-葡聚糖生物合成有关。