单倍体的产生是加速植物育种过程的最有效手段之一。在大多数作物物种中,有效的单倍体技术尚未出现或仅适用于有限的一组基因型。最近发表的关于拟南芥和玉米、小麦等主要谷类作物通过 CRISPR/Cas9 介导的着丝粒组蛋白 H3 基因 (CENH3) 编辑成功诱导单倍体的研究结果表明,这种生产单倍体植物的新方法也可能适用于胡萝卜等蔬菜物种。在这里,我们报告并总结了过去几年专注于基于 CRISPR/Cas9 编辑胡萝卜 CENH3 基因的不同实验和遗传方法。我们还描述了在胡萝卜基因组中发现的第二个 CENH3 基因位点,这使生成和分析假定的单倍体诱导基因型的尝试变得复杂。我们表明,三种不同的 CRISPR/Cas9 靶构建体(单独使用或组合使用)可以成功靶向胡萝卜 CENH3。已经发现了有希望的突变体,例如同框插入/缺失或同框删除突变体,但它们是否能成功用作假定的单倍体诱导物尚不确定。跨越 CRISPR 靶位点的扩增子的下一代测序和基于转录本的扩增子测序似乎是选择有希望的突变体、估计突变频率和首次预测涉及哪个基因的合适方法。本研究的另一个目的是用外来 CENH3 基因同时敲除和补充内源胡萝卜 CENH3 基因。利用根瘤菌将基于 CRISPR/Cas9 的胡萝卜 CENH3 敲除构建体与从人参 (Panax ginseng) 克隆的 CENH3 基因共转化。结果表明,人参 CENH3 蛋白在胡萝卜染色体的着丝粒区域内积累,表明 PgCENH3 可能是这种方法的合适候选者。然而,目前尚不清楚该基因是否在减数分裂细胞分裂过程中充分发挥作用并能够补充致死配子。本文讨论了开发基于 CENH3 的胡萝卜 HI 系统的挑战和未来前景。
背景:超过 40% 的肺癌患者在 70 岁以上时才被确诊。然而,他们之间的基因组和临床特征仍然难以捉摸。在这里,我们进行了靶向捕获序列分析,以表征中国肺腺癌 (LUAD) 患者各年龄段的突变谱。患者和方法:2025 名 LUAD 患者分为三组:年轻(≤50 岁)(n=416,20.54%)、中年(51~69 岁)(n=1271,62.77%)和老年(≥70 岁)(n=338,16.69%)。使用 1,021 个基因组和 59 个基因组对组织样本进行测序。研究了 LUAD 患者的基因改变和肿瘤突变负荷 (TMB)。结果 :20个基因的突变频率在老年组中显著高于青年组,其中14个基因突变以前没有被报道过,包括涉及细胞周期/凋亡信号转导(FAT1、FAT2)、DNA损伤修复(FANCA和FANCM)、染色质组蛋白修饰(KDM6A)、RTK/RAS/PI3K信号转导(FLT4和MTOR)、NOTCH信号转导(NOTCH1、NOTCH2和NOTCH4)以及其他信号通路或细胞调控因子(KEAP1、ASXL1、EPHB1和ABCB1)。6个以前报道的突变基因(RBM10、KRAS、LRP1B、CDKN2A和KMT2C/D)在老年组中的发生率也显著高于青年组。在临床可操作的突变位点中,KRAS突变在老年组中更为常见; MET 14号外显子跳跃和MET扩增均与高龄呈显著正相关;ALK、ROS1、RET和ERBB2 20号外显子插入等融合在老年组中较少见。此外,老年组的TMB水平高于青年组。结论:本研究揭示了青年和老年LUAD患者体细胞基因突变和TMB的差异,为今后针对老年患者的靶向治疗和免疫治疗提供优势。
cichorium intybus var。叶子(witloof)是一种经济上重要的作物,由于许多专门的代谢产物,例如多酚和萜类化合物,其营养价值很高。然而,Witloof植物富含倍半萜烯内酯(SL),这对于植物防御很重要,但也具有苦味的味道,从而限制了工业应用。SL生物合成途径中的特定基因灭活可能会导致SL代谢物含量的变化,并导致苦味改变。在这项研究中,从witloof实施了CRISPR/CAS9基因组编辑工作流量,从聚乙烯乙二醇(PEG)介导的原生质体转染开始,用于CRISPR/CAS9载体递送,然后进行全植物再生和突变分析。原生质体转染效率范围为20%至26%。将靶向植物去饱和酶(CIPDS)基因的第一个外显子的CRISPR/CAS9载体转染到witloof protoplasts中,并导致了CIPDS敲除,从而在23%的再生植物中引起了白化表型。进一步实施我们的方案,SL生物合成途径基因生物氨基烯A合酶(GES),生殖A氧化酶(GAO)和Costunolide合酶(COS)在独立实验中靶向。在基因组靶点基因座的高度多重(Hiplex)扩增子测序中揭示了用CIRSPR/CAS9载体靶向CIGA,CIGAO和CICOS转染的再生植物中的植物突变频率为27.3、42.7和98.3%。这些结果证明了基于转染和witloof protoplasts的再生和随后的Hiplex扩增子测序的基因组编辑的直接工作流。我们观察到整个基因座的不同突变光谱,范围从独立的突变线跨CICOS中的相同 + 1个核苷酸插入到跨独立突变线的CIGAO中的20种突变类型的复杂集。我们的CRISPR/CAS9工作流可以使基因功能研究和更快地纳入精英Witloof系列中,从而促进了Witloof的新型工业应用的发展。
简介:头部和颈部鳞状细胞癌(HNSCC)的特征是复发的发生率很高,这是HNSCC患者死亡的常见原因。识别支持HNSCC疾病管理的生物标志物在临床肿瘤学中仍然是未满足的需求。Meetials和方法:为此,我们为下一代测序(NGS)分析设计了一个突变芯片,以检测HNSCC患者的肿瘤组织中的突变和匹配的血浆。对HNSCC TCGA队列的分析表明,TP53(72%),CDKN2A(22%)和FAT1(24%)是HNSCC中最常见的突变基因。明显的TP53突变与预后不良相关。已收集了来自HNSCC患者的250种新鲜冷冻组织。特定于每位患者的三个活检,代表非肿瘤(切除缘),周围(距肿瘤≥1cm的组织学上无肿瘤组织)和肿瘤组织。结果:该队列受到定制的突变芯片的挑战,用于NGS分析突变,其中包括TP53,CDKN2A和FAT1基因的整个CD。我们发现,我们队列肿瘤中的TP53(743%)和CDKN2A(243%)突变频率与TGCA相似。我们的数据集中FAT1(38.6%)突变的频率较高。尚未注释许多识别的FAT1突变。由于我们还在手术中收集了匹配的血浆,因此在随访期间,我们的分析正在朝着鉴定患者CCF-DNA突变的鉴定。结论:此分析正在进行中,并将介绍相关数据。F. Ganci:不。F.Stinella:不。G. Cottone:不。 E. Cotronoon:不。 A.非:不。 A.出生:不。 A. Sacconi:不。 V.睡觉:不。 M. Palloca:不。 F. Rollo:不。 A. Covello:不。 M.贝沃夫:非。 Q.春季:不。 F. F. F.:不。 G. Blandino:不。G. Cottone:不。E. Cotronoon:不。A.非:不。A.出生:不。A. Sacconi:不。 V.睡觉:不。 M. Palloca:不。 F. Rollo:不。 A. Covello:不。 M.贝沃夫:非。 Q.春季:不。 F. F. F.:不。 G. Blandino:不。A. Sacconi:不。V.睡觉:不。M. Palloca:不。 F. Rollo:不。 A. Covello:不。 M.贝沃夫:非。 Q.春季:不。 F. F. F.:不。 G. Blandino:不。M. Palloca:不。F. Rollo:不。A. Covello:不。 M.贝沃夫:非。 Q.春季:不。 F. F. F.:不。 G. Blandino:不。A. Covello:不。M.贝沃夫:非。Q.春季:不。 F. F. F.:不。 G. Blandino:不。Q.春季:不。F. F. F.:不。 G. Blandino:不。F. F. F.:不。G. Blandino:不。G. Blandino:不。
令人担忧的泛 INSTI 耐药性的出现:对 INSTI 初治患者治疗失败后多替拉韦耐药性的系统范围评价 Sumit Arora,医学教授,印度新德里陆军医科学院 Nishant Raman,印度新德里德里坎特基地医院 Anirudh Anilkumar,首席医疗官,Ferry Lifesciences,印度孟买 Kuldeep Ashta,医学教授,印度贾朗达尔陆军医院 N Kisenjang,医学副教授,印度新德里德里坎特基地医院 Charu Mohan,医学教授,印度新德里陆军医科学院 摘要 简介 多替拉韦 (DTG) 是一种第二代整合酶链转移抑制剂 (INSTI),广泛用于 HIV 治疗,尤其是在资源匮乏的环境中。尽管其疗效被证实,但在基于 NRTI + DTG 的双重 ART 方案失败的患者中,人们出现了对 DTG 耐药突变 (DRM) 的担忧。本综述研究了 INSTI 初治患者中这些 DRM 的模式和频率。方法进行了系统的范围界定审查,综合了 21 项研究(2013-2024 年)的数据,这些研究涉及 59 名 INSTI 初治 HIV-1 (PLH) 患者,他们在接受 NRTI + DTG 双重 ART 治疗后出现病毒学失败 (VF)。数据由两名独立审阅者提取,关键信息包括 ART 史、DRM 概况、基于 DTG 的 ART 持续时间以及失败时的病毒载量。定性综合确定了常见的耐药模式、地理分布和 HIV 亚型相关性。结果最常见的 DRM 是 G118R (42.4%) 和 R263K (38.9%)。G118R 与 T66I 和 E138K 结合时与高水平耐药性和泛 INSTI 耐药性相关。R263K 经常单独出现或与轻微突变一起出现,也赋予中等程度的耐药性。耐药模式因 HIV 亚型而异,非 B 亚型表现出更高的 G118R 和 Q148HRK 突变频率,而 R263K 在 B 亚型中占主导地位。结论:在 INSTI 初治患者中出现 DTG 耐药性,特别是在资源有限的环境中,令人担忧。G118R 和 R263K 是最常见的突变,前者导致全 INSTI 耐药性。这些发现强调了监测耐药模式的重要性,特别是在非 HIV-B 亚型中,以优化 ART 策略。关键词:抗逆转录病毒疗法、耐药性、HIV 感染、整合酶抑制剂、诱变、多替拉韦、HIV-1、HIV 亚型、核苷逆转录酶抑制剂、病毒学失败。
对肝细胞癌中关键致癌途径的比较基因组分析在不同人群中,M.D.,M.P.H.,F.A.C.P.1,Brigette Waldrup,B.S。 2,Francisco G. Carranza博士2和恩里克·韦拉斯克斯·维尔雷尔(Enrique Velazquez-Villarreal),医学博士,博士,M.P.H。 2,3 * 1贝塞斯达医学博士国家癌症研究所的癌症研究中心。 2希望城市,贝克曼研究所,综合翻译科学系,杜阿尔特,加利福尼亚州。 3希望之城综合癌症中心,加利福尼亚州杜阿尔特。 *通信:evelazquezvilla@coh.org摘要背景/目标:肝细胞癌(HCC)是癌症相关死亡率的主要原因,其发病率,肿瘤生物学和临床结果的种族和种族差异很大。 西班牙裔/拉丁裔(H/L)患者往往比非西班牙裔白人(NHW)患者诊断出年轻年龄的阶段,并且更高级阶段,但是这些差异的分子机制仍然很众所周知。 关键的致癌途径,包括RTK/RAS,TGF-BETA,WNT,PI3K和TP53,在肿瘤进展,治疗耐药性以及对靶向疗法的反应中起关键作用。 然而,这些途径内的民族特异性变化在很大程度上尚未得到探索。 本研究旨在比较H/L和NHW患者之间HCC中特定的途径特异性突变,评估肿瘤突变负担,并使用公开可用的数据集比较与种族相关的致癌驱动器。 此分析的发现可能会为改善代表性不足的人群的早期检测和靶向疗法提供精确的医学策略。1,Brigette Waldrup,B.S。2,Francisco G. Carranza博士2和恩里克·韦拉斯克斯·维尔雷尔(Enrique Velazquez-Villarreal),医学博士,博士,M.P.H。 2,3 * 1贝塞斯达医学博士国家癌症研究所的癌症研究中心。 2希望城市,贝克曼研究所,综合翻译科学系,杜阿尔特,加利福尼亚州。 3希望之城综合癌症中心,加利福尼亚州杜阿尔特。 *通信:evelazquezvilla@coh.org摘要背景/目标:肝细胞癌(HCC)是癌症相关死亡率的主要原因,其发病率,肿瘤生物学和临床结果的种族和种族差异很大。 西班牙裔/拉丁裔(H/L)患者往往比非西班牙裔白人(NHW)患者诊断出年轻年龄的阶段,并且更高级阶段,但是这些差异的分子机制仍然很众所周知。 关键的致癌途径,包括RTK/RAS,TGF-BETA,WNT,PI3K和TP53,在肿瘤进展,治疗耐药性以及对靶向疗法的反应中起关键作用。 然而,这些途径内的民族特异性变化在很大程度上尚未得到探索。 本研究旨在比较H/L和NHW患者之间HCC中特定的途径特异性突变,评估肿瘤突变负担,并使用公开可用的数据集比较与种族相关的致癌驱动器。 此分析的发现可能会为改善代表性不足的人群的早期检测和靶向疗法提供精确的医学策略。2,Francisco G. Carranza博士2和恩里克·韦拉斯克斯·维尔雷尔(Enrique Velazquez-Villarreal),医学博士,博士,M.P.H。2,3 * 1贝塞斯达医学博士国家癌症研究所的癌症研究中心。 2希望城市,贝克曼研究所,综合翻译科学系,杜阿尔特,加利福尼亚州。 3希望之城综合癌症中心,加利福尼亚州杜阿尔特。 *通信:evelazquezvilla@coh.org摘要背景/目标:肝细胞癌(HCC)是癌症相关死亡率的主要原因,其发病率,肿瘤生物学和临床结果的种族和种族差异很大。 西班牙裔/拉丁裔(H/L)患者往往比非西班牙裔白人(NHW)患者诊断出年轻年龄的阶段,并且更高级阶段,但是这些差异的分子机制仍然很众所周知。 关键的致癌途径,包括RTK/RAS,TGF-BETA,WNT,PI3K和TP53,在肿瘤进展,治疗耐药性以及对靶向疗法的反应中起关键作用。 然而,这些途径内的民族特异性变化在很大程度上尚未得到探索。 本研究旨在比较H/L和NHW患者之间HCC中特定的途径特异性突变,评估肿瘤突变负担,并使用公开可用的数据集比较与种族相关的致癌驱动器。 此分析的发现可能会为改善代表性不足的人群的早期检测和靶向疗法提供精确的医学策略。2,3 * 1贝塞斯达医学博士国家癌症研究所的癌症研究中心。2希望城市,贝克曼研究所,综合翻译科学系,杜阿尔特,加利福尼亚州。3希望之城综合癌症中心,加利福尼亚州杜阿尔特。*通信:evelazquezvilla@coh.org摘要背景/目标:肝细胞癌(HCC)是癌症相关死亡率的主要原因,其发病率,肿瘤生物学和临床结果的种族和种族差异很大。西班牙裔/拉丁裔(H/L)患者往往比非西班牙裔白人(NHW)患者诊断出年轻年龄的阶段,并且更高级阶段,但是这些差异的分子机制仍然很众所周知。关键的致癌途径,包括RTK/RAS,TGF-BETA,WNT,PI3K和TP53,在肿瘤进展,治疗耐药性以及对靶向疗法的反应中起关键作用。然而,这些途径内的民族特异性变化在很大程度上尚未得到探索。本研究旨在比较H/L和NHW患者之间HCC中特定的途径特异性突变,评估肿瘤突变负担,并使用公开可用的数据集比较与种族相关的致癌驱动器。此分析的发现可能会为改善代表性不足的人群的早期检测和靶向疗法提供精确的医学策略。方法:我们使用公开可用的HCC数据集进行了生物信息学分析,以评估RTK/RAS,TGF-BETA,WNT,PI3K和TP53途径基因中的突变频率。该研究包括547例患者,由69例H/L患者和478例NHW患者组成。通过种族(H/L与NHW)进行分层的患者,以评估突变患病率的差异。卡方检验用于比较突变频率,而Kaplan-Meier生存分析评估了与两个人群中途径特异性变化相关的总体生存差异。结果:与NHW患者相比,在RTK/RAS途径相关的基因中观察到显着差异,尤其是在FGFR4突变中,H/L患者更为普遍(4.3%vs. 0.6%,P = 0.02)。此外,IGF1R突变表现出边缘意义(7.2%vs. 2.9%,p = 0.07)。在PI3K途径中,H/L患者的INPP4B改变比NHW患者(4.3%vs. 1%,1%,P = 0.06)更频繁,而在TGF-BETA途径中,TGFBR2突变在H/L患者中更为普遍(2.9%vs. 0.4%vs. 0.4%,P = 0.07,P = 0.07),暗示了潜在的道理。
胰腺癌的胰腺癌特异性基因组改变,塞西莉亚·蒙格(Cecilia Monge),M.D.,M.P.H. 1,Brigette Waldrup,B.S。 2,Francisco G. Carranza博士2和恩里克·韦拉斯克斯·维尔雷尔(Enrique Velazquez-Villarreal),医学博士,博士,M.P.H。 2,3 * 1贝塞斯达医学博士国家癌症研究所的癌症研究中心。 2希望城市,贝克曼研究所,综合翻译科学系,杜阿尔特,加利福尼亚州。 3希望之城综合癌症中心,加利福尼亚州杜阿尔特。 *信件:evelazquezvilla@coh.org摘要背景/目标:胰腺癌(PC)是一种侵略性恶性肿瘤,发病率上升和存活率较差。 与非西班牙裔白人(NHW)患者相比,西班牙裔/拉丁裔(H/L)患者的总体发病率较低,但他们被诊断出年龄较小,经常出现更晚期疾病,并且经历更差的生存结果。 这些差异为基础的分子驱动因素仍然很少理解。 关键的致癌途径,包括TP53,WNT,PI3K,TGF-BETA和RTK/RAS,在肿瘤进展,耐药性和对靶向治疗的反应中起着至关重要的作用。 然而,他们在PC中的民族特定变化和预后含义在很大程度上尚未得到探索。 本研究旨在表征H/L和NHW患者PC中PC的特异性突变,评估肿瘤突变负担,并使用公开可用的数据集识别出种族 - 特异性致癌驱动因素。 这些发现可能会提供关键见解,以优化精确的医学策略并增强代理人群不足的靶向疗法。胰腺癌的胰腺癌特异性基因组改变,塞西莉亚·蒙格(Cecilia Monge),M.D.,M.P.H.1,Brigette Waldrup,B.S。 2,Francisco G. Carranza博士2和恩里克·韦拉斯克斯·维尔雷尔(Enrique Velazquez-Villarreal),医学博士,博士,M.P.H。 2,3 * 1贝塞斯达医学博士国家癌症研究所的癌症研究中心。 2希望城市,贝克曼研究所,综合翻译科学系,杜阿尔特,加利福尼亚州。 3希望之城综合癌症中心,加利福尼亚州杜阿尔特。 *信件:evelazquezvilla@coh.org摘要背景/目标:胰腺癌(PC)是一种侵略性恶性肿瘤,发病率上升和存活率较差。 与非西班牙裔白人(NHW)患者相比,西班牙裔/拉丁裔(H/L)患者的总体发病率较低,但他们被诊断出年龄较小,经常出现更晚期疾病,并且经历更差的生存结果。 这些差异为基础的分子驱动因素仍然很少理解。 关键的致癌途径,包括TP53,WNT,PI3K,TGF-BETA和RTK/RAS,在肿瘤进展,耐药性和对靶向治疗的反应中起着至关重要的作用。 然而,他们在PC中的民族特定变化和预后含义在很大程度上尚未得到探索。 本研究旨在表征H/L和NHW患者PC中PC的特异性突变,评估肿瘤突变负担,并使用公开可用的数据集识别出种族 - 特异性致癌驱动因素。 这些发现可能会提供关键见解,以优化精确的医学策略并增强代理人群不足的靶向疗法。1,Brigette Waldrup,B.S。2,Francisco G. Carranza博士2和恩里克·韦拉斯克斯·维尔雷尔(Enrique Velazquez-Villarreal),医学博士,博士,M.P.H。 2,3 * 1贝塞斯达医学博士国家癌症研究所的癌症研究中心。 2希望城市,贝克曼研究所,综合翻译科学系,杜阿尔特,加利福尼亚州。 3希望之城综合癌症中心,加利福尼亚州杜阿尔特。 *信件:evelazquezvilla@coh.org摘要背景/目标:胰腺癌(PC)是一种侵略性恶性肿瘤,发病率上升和存活率较差。 与非西班牙裔白人(NHW)患者相比,西班牙裔/拉丁裔(H/L)患者的总体发病率较低,但他们被诊断出年龄较小,经常出现更晚期疾病,并且经历更差的生存结果。 这些差异为基础的分子驱动因素仍然很少理解。 关键的致癌途径,包括TP53,WNT,PI3K,TGF-BETA和RTK/RAS,在肿瘤进展,耐药性和对靶向治疗的反应中起着至关重要的作用。 然而,他们在PC中的民族特定变化和预后含义在很大程度上尚未得到探索。 本研究旨在表征H/L和NHW患者PC中PC的特异性突变,评估肿瘤突变负担,并使用公开可用的数据集识别出种族 - 特异性致癌驱动因素。 这些发现可能会提供关键见解,以优化精确的医学策略并增强代理人群不足的靶向疗法。2,Francisco G. Carranza博士2和恩里克·韦拉斯克斯·维尔雷尔(Enrique Velazquez-Villarreal),医学博士,博士,M.P.H。2,3 * 1贝塞斯达医学博士国家癌症研究所的癌症研究中心。 2希望城市,贝克曼研究所,综合翻译科学系,杜阿尔特,加利福尼亚州。 3希望之城综合癌症中心,加利福尼亚州杜阿尔特。 *信件:evelazquezvilla@coh.org摘要背景/目标:胰腺癌(PC)是一种侵略性恶性肿瘤,发病率上升和存活率较差。 与非西班牙裔白人(NHW)患者相比,西班牙裔/拉丁裔(H/L)患者的总体发病率较低,但他们被诊断出年龄较小,经常出现更晚期疾病,并且经历更差的生存结果。 这些差异为基础的分子驱动因素仍然很少理解。 关键的致癌途径,包括TP53,WNT,PI3K,TGF-BETA和RTK/RAS,在肿瘤进展,耐药性和对靶向治疗的反应中起着至关重要的作用。 然而,他们在PC中的民族特定变化和预后含义在很大程度上尚未得到探索。 本研究旨在表征H/L和NHW患者PC中PC的特异性突变,评估肿瘤突变负担,并使用公开可用的数据集识别出种族 - 特异性致癌驱动因素。 这些发现可能会提供关键见解,以优化精确的医学策略并增强代理人群不足的靶向疗法。2,3 * 1贝塞斯达医学博士国家癌症研究所的癌症研究中心。2希望城市,贝克曼研究所,综合翻译科学系,杜阿尔特,加利福尼亚州。3希望之城综合癌症中心,加利福尼亚州杜阿尔特。*信件:evelazquezvilla@coh.org摘要背景/目标:胰腺癌(PC)是一种侵略性恶性肿瘤,发病率上升和存活率较差。与非西班牙裔白人(NHW)患者相比,西班牙裔/拉丁裔(H/L)患者的总体发病率较低,但他们被诊断出年龄较小,经常出现更晚期疾病,并且经历更差的生存结果。这些差异为基础的分子驱动因素仍然很少理解。关键的致癌途径,包括TP53,WNT,PI3K,TGF-BETA和RTK/RAS,在肿瘤进展,耐药性和对靶向治疗的反应中起着至关重要的作用。然而,他们在PC中的民族特定变化和预后含义在很大程度上尚未得到探索。本研究旨在表征H/L和NHW患者PC中PC的特异性突变,评估肿瘤突变负担,并使用公开可用的数据集识别出种族 - 特异性致癌驱动因素。这些发现可能会提供关键见解,以优化精确的医学策略并增强代理人群不足的靶向疗法。方法:使用公开可用的PC数据集进行了生物信息学分析,以评估与TGF-BETA,RTK/RAS,WNT,PI3K和TP53途径相关的基因中的突变频率。该研究包括4,248例患者,407例H/L,3,841例NHW。患者按种族分层,以评估突变患病率的差异。卡方检验以比较组之间的突变率,而Kaplan-Meier生存分析进行了基于途径特异性变化的总体生存差异。结果:在H/L和NHW患者之间的TGF-β途径中观察到显着差异。TGF-β突变在H/L患者中的普遍性较小(18.4%比24.4%,p = 8.6E-3)。此外,与TGF-β途径相关的基因显示出显着改变,SMAD2(1.5%vs. 0.4%,P = 6.3e-3)和SMAD4(15%vs. 19.9%,P = 0.02)表现出显着差异。Although RTK/RAS, WNT, PI3K, and TP53 pathway mutations were not statistically significant overall, borderline significance was observed in genes associated with these pathways, including ERBB4 (3.4% vs. 1.8%, p = 0.03), ALK (2.7% vs. 1.1%, p = 0.01), HRAS (1.2% vs. 0.1%, p = 1.3e-4), and RTK/RAS途径中的RIT1(0.7%vs. 0.1%,p = 0.03)以及CTNNB1(2.9%vs. 1.3%,p = 0.01)