XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System筛选试验
用于识别中性粒细胞胞外陷阱形成 (NETosis) 新型抑制剂的高通量筛选平台
NETosis 是一种特殊的细胞死亡机制，通过形成中性粒细胞胞外陷阱 (NET) 实现。1 NET 可导致多种疾病的发病，包括类风湿性关节炎和 COVID-19。1,2 开发直接靶向 NET 或抑制上游激活和信号传导事件的抑制剂提供了一种有吸引力的治疗方法。1-3 该领域正在进行的商业活动包括同类首创抗组蛋白治疗药物 CIT-013 (Citryll) 的 1 期试验，以及 DDP-1 抑制剂 Brensocatib (Insmed Inc.)，正在进行非囊性纤维化支气管扩张的 3 期试验。新型 NETosis 抑制剂的开发将依赖于强大的高通量筛选试验来推进药物发现。为此，开发了使用原代人中性粒细胞和分化 HL-60 (dHL60) 细胞的 NETosis 筛选试验。
掌握染色质阅读器的化学探针
组蛋白翻译后修饰（如甲基化或乙酰化）的动态特性使得通过操纵相关的表观遗传机制来改变与疾病相关的表观遗传状态成为可能。一种方法是通过小分子扰动。表观遗传读取域的化学探针对于提高我们对调节其靶标的生物学后果的理解至关重要，同时也使得开发新的基于探针的试剂成为可能。通过在读取域探针上附加功能句柄，可以创建试剂的化学工具箱，以促进表观遗传复合物的化学沉淀，评估探针选择性，开发体外筛选试验，可视化细胞靶标定位，实现靶标降解并以高度可控的方式将表观遗传机制招募到基因组内的某个位置。
使用下一代技术进行转基因检测和识别...
然而，由于该系统最初是为了更具体地针对已正式进入欧盟授权程序的转基因事件而开发的，因此在检测欧盟未经授权的转基因生物方面可能会遇到一些问题。首先，如果转基因生物不含有 qPCR 筛选分析中专门针对的转基因元件，则无法检测到。然而，最近的估计表明，当同时使用筛选标记 p35S 和 tNOS 时，这种情况发生在不到 10% 的欧盟未经授权的转基因生物中。10,12,13 其次，如果欧盟未经授权的转基因生物含有至少一种 qPCR 筛选分析针对的转基因元件，则可能出现两种情况。一方面，当样本由欧盟授权和未授权的转基因生物组成，且这些生物具有一些共同的转基因元件，例如 p35S 和 tNOS，qPCR 筛选试验通过鉴定欧盟授权的转基因生物而得出的阳性结果并不能保证不存在欧盟未授权的转基因生物。另一方面，如果无法在观察到的 qPCR 筛选信号与欧盟授权的转基因生物列表之间建立联系，则只能怀疑存在欧盟未授权的转基因生物。此外，qPCR 事件特异性方法通常不适用于欧盟未授权的转基因生物。4,10
1281O Atezolizumab (atezo) 与铂类化疗在血液肿瘤突变负荷阳性 (bTMB+) 患者 (pts) 的一线 (1L) 晚期/转移性 (m) NSCLC 中的应用：血液首次检测筛选试验 (BFAST) III 期队列 C 的结果
1 意大利那不勒斯 G. Pascale 基金会 IRCCS 国家癌症研究所临床试验部； 2 意大利帕多瓦 IRCCS 威尼托肿瘤研究所肿瘤内科 2； 3 意大利米兰国家癌症研究所 - IRCCS 基金会肿瘤医学系； 4 意大利拉文纳罗马涅 AUSL，拉文纳医院肿瘤内科； 5 意大利皮亚琴察综合医院肿瘤科和血液科； 6 意大利那不勒斯 G. Pascale 基金会 IRCCS 国家癌症研究所胸部肿瘤内科； 7 意大利梅尔多拉罗马涅肿瘤研究与治疗科学研究所 (IRST) IRCCS 肿瘤医学系； 8 意大利米拉诺威尼托大区米拉诺 ULSS 3 肿瘤内科和血液科； 9 意大利乌迪内中央弗留利大学卫生局肿瘤学系； 10 意大利米兰欧洲肿瘤研究所 IRCCS IEO 胸部肿瘤科； 11 意大利那不勒斯坎帕尼亚路易吉万维泰利大学精准医学系肿瘤医学科； 12 意大利那不勒斯 G. Pascale 基金会 IRCCS 国家癌症研究所细胞生物学和生物治疗； 13 意大利那不勒斯坎帕尼亚大学“ Luigi Vanvitelli ”医学统计学； 14 意大利阿韦利诺“SG Moscati”医院基金会肿瘤内科
泰国采后储存的大蒜鳞茎中蓝霉病原体的鉴定及其杀菌剂敏感性
摘要 青霉病是影响大蒜采后的主要病害之一。2023年，该病害在泰国清迈府的大蒜[Allium ampeloprasum var. ampeloprasum (Borrer) Syme]采后储藏期间被发现。从大蒜中分离得到3个真菌分离株，根据形态特征和核糖体DNA内部转录间隔区(ITS)、β -微管蛋白(BenA)、钙调蛋白(CaM)和RNA聚合酶II第二大亚基(rpb2)基因组合序列的系统发育分析，鉴定为大蒜青霉菌(Penicillium allii)。在致病性测定中，接种分离真菌的大蒜表现出与采后储藏期间观察到的症状相似的症状。在杀菌剂筛选试验中，多菌灵、苯醚甲环唑 + 嘧菌酯和苯醚甲环唑在半剂量和推荐剂量下均能有效完全抑制该真菌，而该真菌对克菌丹和代森锰锌不敏感。此外，多菌灵、氧氯化铜、苯醚甲环唑与嘧菌酯的组合以及苯醚甲环唑单独使用时，双倍推荐剂量可完全抑制该真菌。据我们所知，这是泰国首次报道由 P. allii 引起的大蒜鳞茎采后蓝霉病。此外，杀菌剂敏感性筛选的结果有助于制定有效的管理策略，以控制由 P. allii 引起的大蒜鳞茎采后蓝霉病。
从决明子茎皮乙酸乙酯提取物中分离的新型三萜衍生物的抗菌活性：体外和计算机模拟
随着全球范围内抗生素耐药性的增加，细菌感染的标准治疗方法变得越来越无效。由于抗生素的过度使用，耐多药细菌已成为 21 世纪的严重危害和全球主要医疗保健问题。传统的开发新型抗菌药物的方法不足以满足现有的需求，因此正在开发抗菌发现领域的新策略。决明子 (C.fistula) 是豆科植物的一种，天然具有抗菌特性。这种植物用于治疗皮肤病、肝脏问题、结核腺体、呕血、瘙痒、白斑和糖尿病。因此，除抗生素之外的有效抗菌治疗至关重要。这种植物含有多种次级代谢产物，包括单宁、萜类化合物、生物碱、黄酮类化合物和糖苷，它们都具有抗菌特性。萜烯和萜类化合物可有效对抗细菌、真菌、病毒和原生动物。萜烯的作用方式涉及亲脂性化学物质破坏膜。添加甲基以增加贝壳杉烯二萜的亲水性会显著降低其抗菌效果。在这项研究中，对金黄色葡萄球菌和肺炎克雷伯菌的抗菌筛选试验表明，从 C.fistula 的乙酸乙酯提取物中分离出的一种新化学物质比阳性对照具有更宽的抑制区。用这种新化学物质处理后，处理过的培养物的基因组 DNA 图谱保持不变。这种新化学物质抑制了蛋白质合成，导致两种菌株处理过的培养物中的蛋白质含量降低，证实了其杀菌作用。需要进一步进行免疫印迹分析以确认特定的蛋白质。研究一种可降低药物负荷和耐药性风险以及治疗成本的新型三萜类化合物，可以为治疗与糖尿病相关的继发性尿路感染提供有希望的治疗选择。
2020; 10(21): 9477-9494. doi: 10.7150/thno.45763 研究论文 BRCAness 分子特征分析确定 PARP 抑制剂 Niraparib 是一种新型
背景：晚期软组织肉瘤 (STS) 患者预后不佳，且有效的治疗选择很少。同源重组修复 (HRR) 通路缺陷会积累 DNA 修复错误和基因突变，从而导致肿瘤发生。BRCAness 描述的是缺乏种系 BRCA1/2 突变且存在 HRR 缺陷 (HRD) 的肿瘤。然而，STS 中 BRCAness 的特征仍然很大程度上未知。因此，本研究旨在利用全外显子组测序 (WES) 探索 STS 中 BRCAness 的基因组和分子图谱，以找到 STS 治疗的潜在靶点。方法：对来自中山大学附属第一医院的 22 个 STS 样本进行 WES，以揭示可能的基因组和分子特征。然后使用来自 Cancer Genome Atlas (TCGA) 数据库的 224 个 STS 样本的数据和体外数据验证这些特征。对 BRCAness 的潜在生物标志物进行分析。在 STS 细胞系、细胞系来源的异种移植瘤 (CDX) 和患者来源的异种移植瘤 (PDX) 中评估了 STS 的靶向药物敏感性和化疗药物的联合疗法筛选。结果：与 30 种癌症体细胞突变特征相比，使用非负矩阵分解在 22 个 STS 样本中确定了 HRD 特征的高余弦相似度 (0.75)。单核苷酸多态性表明 22 个 STS 样本中 BRCA1/2 的突变率较低（分别为 11.76% 和 5.88%）。然而，拷贝数变异分析显示染色体普遍不稳定性；此外，54.55% 的 STS 样本（12/22）携带 BRCAness 性状。随后，在来自 TCGA 和体外的 224 个 STS 样本中也检测到了相似的基因组和分子特征。聚（ADP-核糖）聚合酶（PARP）-1 可能是 HRD 和治疗反应的一个有希望的反映。此外，PAR 形成水平被发现与 PARP-1 相关。随后，确定 STS 细胞系对 PARP 抑制剂（PARPi）尼拉帕尼敏感。此外，基于五种常见 PARPis 的筛选试验和阿霉素、异环磷酰胺、达卡巴嗪和替莫唑胺（TMZ）的组合试验，尼拉帕尼和 TMZ 在 STS 细胞系中具有最强的协同作用。尼拉帕尼和 TMZ 组合的协同作用和安全性也在 CDX 和 PDX 中得到证实。
可供未来学生使用的顶点项目列表...
S/N 项目标题 1 控制碳水化合物利用并促进肺炎链球菌上皮细胞结合的基因调控网络 2 基于 RNA 结构的新型 mRNA 设计，用于基因治疗和疫苗接种 3 延长寿命：CURATE.AI 用于定制 NMN 利用和治疗增强 (ACCURATE) 临床试验 4 人工智能识别人类癌症基因组中的癌症驱动突变 5 用于 HSC 靶向基因治疗的骨髓芯片 6 癌症治疗诊断学和新型示踪剂的开发，用于多模态分子成像和靶向放射性配体治疗与多种癌症免疫疗法相结合 7 表征减毒活黄病毒疫苗疫苗突变的分子机制 8 复杂生物疗法的化学合成 9 揭示类固醇诱导病毒感染增加的分子机制 10 揭示合成衍生物作为抗登革热病毒抗病毒剂的潜力 11 设计和研究下一代哑铃形DNA载体和反式剪接RNA 12 设计递送平台以提高细胞外囊泡的生物利用度以用于癌症治疗 13 开发受蝙蝠启发的基于蛋白质的局部抗炎疗法，用于治疗人类皮肤炎症疾病 14 开发线粒体抑制剂的药物类似物作为治疗剂 15 开发新型基于RNA的线粒体递送载体，用于线粒体靶向核酸以进行线粒体基因治疗和抗衰老 16 开发跨物种肝脏类器官模型以确定减轻肝脏胰岛素抵抗的新药物靶点 17 开发用于检测人畜共患病毒T细胞的快速全血检测方法 18 开发癌症疫苗：针对公共肿瘤抗原和个体化新抗原的RNA疫苗 19 发现用于检测肠道病毒D68感染的生物标志物 20 发现膜配体转运蛋白用于功能性药物筛选试验 21 基于 DNA 的非病毒基因治疗 22 表观遗传肿瘤突变调节药物疗效和结肠直肠癌的致癌作用 23 探索肌醇在调节妊娠糖尿病中胎盘脂质和肌醇衍生物代谢中的效用 24 细胞外囊泡 (EV) 和 EV 模拟疗法用于椎间盘再生 25 细胞外囊泡递送靶向 KRAS 的疗法用于治疗胰腺癌和转移