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在表达 SOX2 的细胞中检测到古代人类内源性逆转录病毒的运动
摘要 人类内源性逆转录病毒 (HERV) 约占人类基因组的 8%。HERV 在早期胚胎中转录，在体细胞中表观遗传沉默，病理条件下除外。HERV-K 被认为可以保护胚胎免受外源性病毒感染。然而，体细胞中不受控制的 HERV-K 表达与多种疾病有关。在这里，我们表明 SOX2 对 HERV-K LTR5H 至关重要，它在维持干细胞多能性方面起着关键作用。在没有 Env 表达的情况下，HERV-K 在生产细胞内进行逆转录转座。此外，我们在表达 SOX2 的诱导多能干细胞的长期培养中发现了新的 HERV-K 整合位点。这些结果表明，HERV-K 对 SOX2 的严格依赖使得 HERV-K 能够在进化过程中保护早期胚胎，同时限制 HERV-K 逆转座对这些早期胚胎中宿主基因组完整性的潜在有害影响。
通过测量 128Cs 中 I = 9 同质异能态的磁矩来检验核手性
1 国家核研究中心，05-540 'wierk，波兰 2 华沙大学重离子实验室，02-093 华沙，波兰 3 华沙大学物理学院，02-093 华沙，波兰 4 华东师范大学物理系，上海 200241，中国 5 Horia Hulubei 国家物理与核工程研究所，077125 布加勒斯特，罗马尼亚 6 国家核物理研究所，I-35131 帕多瓦，意大利 7 北京大学物理学院核物理与技术国家重点实验室，北京 100871，中国 8 北京航空航天大学物理学院，北京 102206，中国 9 京都大学汤川理论物理研究所，京都 606-8502，日本 10 IJCLab，CNRS/IN2P3；巴黎萨克雷大学，91405 奥赛，法国 11 塔尔苏斯大学工程学院自然科学与数学科学系，33480，梅尔辛，土耳其
检查在可变形的地形中挖掘车轮装载机的模拟对真实差距
摘要我们研究了基于物理的模拟器如何复制一个真实的车轮装载机在一堆土壤中填充水桶。比较使用车辆运动和驱动力的场时间序列进行比较，负载质量和全部工作。车辆被建模为具有摩擦触点，传动系统和线性执行器的刚性多体系统。对于土壤，我们测试了不同分辨率的离散元素模型，并且没有多尺度加速。时空分辨率在50-400 mm至2-500毫秒之间，计算速度比实时快1/10,000至5倍。发现模拟到现实差距约为10％，并且对实现水平的依赖性较弱，例如与实时模拟兼容。此外，研究了在不同的模拟操作之间转移下的优化力反馈控制器的敏感性。尽管域间隙约为15％，但观察到域偏置会导致5％的性能降低。
通过粗粒分量并发提高地球系统模型的可伸缩性 - 与图标v2.6.5建模系统的案例研究
摘要。在Exascale计算时代，具有前所未有的计算能力的机器可用。使这些大规模平行的机器有效地使用了数百万个核心，提出了一个新的挑战。需要多级和多维并行性来满足这种挑战。粗粒分量并发性提供了一个差异的并行性维度，该维度通常使用了通常使用的并行化方法，例如域分解和循环级别的共享内存方法。虽然这些主教化方法是数据并行技术，并且它们分解了数据空间，但组件并发是一种函数并行技术，并且分解了算法MIC空间。并行性的额外维度使我们能够将可扩展性扩展到由已建立的并行化技术设置的限制之外。，当通过添加组件（例如生物地球化学或冰盖模型）增加模型复杂性时，它还提供了一种方法来提高性能（通过使用更多的计算功率）。此外，货币允许每个组件在不同的硬件上运行，从而利用异质硬件配置的使用。在这项工作中，我们研究了组件并发的特征，并在一般文本中分析其行为。分析表明，组件并发构成“并行工作负载”，从而在某些条件下提高了可扩展性。这些通用考虑是
单核细胞募集的治疗性抑制可防止检查点抑制剂诱导的肝炎
抽象的背景检查点抑制剂诱导的肝炎（CPI-HEPATIS）是扩大CPI在癌症免疫疗法中使用CPI的新问题。在这里，我们开发了一种小鼠模型来表征CPI-肝炎的机制，并以治疗方法靶向推动这种病理学的关键途径。方法C57BL/6野生型（WT）小鼠用Toll-like受体（TLR）9激动剂（TLR9-L）进行肝启动，结合抗胞毒性T型T型脂肪毒素T型脂肪蛋白抗原-4（CTLA-4）以及抗抗细胞buffered sarine sarine sarine sarine sarine sarine sarine sarine 1（pd-1（pd-1）（pd-1（pd-1）控制长达7天。流式细胞仪，组织学/免疫荧光和信使RNA测序用于表征肝髓样/淋巴样子群和炎症。通过血浆丙氨酸转氨酶（ALT）和细胞角蛋白-18（CK-18）测量评估肝细胞损伤。在RAG2 - / - 和CCR2 RFP/RFP转基因小鼠中进行了CPI-肝炎的体内研究，并遵循抗CD4，抗CD8或Cenicriviroc（CVC; CVC; CCR2/CCR2/CCR5拮抗剂）治疗。结果CPI与TLR9-L诱导的肝脏病理的共同给药非常类似于人类疾病，随着颗粒酶B + perforin + CD8 + CD8 + T细胞和CCR2 +单核细胞的浸润和聚类增加，治疗后7天。这伴随着围绕这些簇，Alt和CK-18血浆水平升高的凋亡肝细胞。肝RNA测序鉴定出关键信号通路（JAK-STAT，NF-κB）和细胞因子/趋化因子网络（IFNγ，CXCL9，CCL2/ CCR2）是CPI-肝炎的驱动因素。使用此模型，我们表明CD8 + T细胞介导了实验性CPI-HEPATIS中的肝细胞损伤。然而，它们的肝募集，聚类和细胞毒性活性取决于CCR2 +单核细胞的存在。在CCR2 RFP/RFP小鼠中不存在肝单核细胞募集，而CCR2通过CVC治疗在WT小鼠中抑制CCR2能够防止发展并逆转实验性的CPI-肝炎。结论这种新建立的小鼠模型为CPI-肝炎的体内机械研究提供了一个平台。使用该模型，我们证明了肝脏抑制性CCR2 +单核细胞与组织损害CD8 + T细胞相互作用在CPI-肝炎发病机理中的核心作用，并突出了CCR2抑制作用作为一种新型的治疗靶标。
CAS12A的反式DNA裂解活性没有可检测到的免疫力对质粒或噬菌体
CAS12A是V-A型CRISPR-CAS RNA引导的内切酶。它在特定位点切割了dsDNA，然后在体外反式跨体内激活以非特征ssDNA的裂解。反式活性的免疫功能仍然未知。为了解决这个问题，我们在大肠杆菌中构建了一个CAS12A靶向系统，其中CAS12A裂解了高拷贝靶质粒以释放反式ssDNA裂解活性。然后，我们分析了Cas12a靶向对非目标质粒和ssDNA噬菌体的影响。结果表明，CAS12A有效地消除了目标质粒，但对噬菌体的非目标质粒或鼠疫形成的维持没有影响。此外，有助于靶质粒耗竭的两间隔crispr阵列仍然对非目标质粒或噬菌体没有可检测的影响。一起，数据表明CAS12A的反式ssDNA切割不会导致体内免疫力。
2% 利多卡因雾化对健康马呼吸道微生物群没有可检测到的影响
糖皮质激素仍然是治疗马哮喘最常见的药物方法，但可能会产生严重的副作用，包括呼吸道微生物群改变。该研究的目的是评估 2% 利多卡因雾化（一种预计的马哮喘替代治疗方法）对健康马呼吸道微生物群的影响。进行了一项前瞻性、随机、对照、盲法、双向交叉研究，以评估 1 mg/kg 2% 利多卡因（4 天内 7 次治疗）对马呼吸道微生物群的影响，并与对照马（盐水和未治疗）进行比较。在每个样本采集时间点都获得了临床评估和呼吸道样本，包括鼻冲洗液、内窥镜气管抽吸物和支气管肺泡灌洗液。使用 16S 扩增子测序评估呼吸道细菌微生物群的概况，并使用相关样本分析比较临床数据（基于数据正态性）。治疗不会影响临床数据，也不会改变健康马的气管和鼻腔微生物群。然而，时间可以解释样本间 12.6% 的微生物群变化。在鼻腔和气管样本中观察到细菌组成的显著差异，其中放线菌和厚壁菌门的相对丰度最高。尽管尝试了多种 DNA 提取方法和 PCR 方案，并排除 PCR 抑制后，来自支气管肺泡灌洗液的细菌 DNA 并没有通过针对原核核糖体 RNA 基因小亚基核糖体 RNA 基因 V4 可变区的通用引物进行扩增。这一观察结果表明，健康马的支气管肺泡灌洗液的细菌负荷较低。
CRISPR-CAS13酶学在临床环境中迅速检测到SARS-COV-2片段
Wahab A. Khan 1,2 Rachael E. Barney 1，Gregory J. Tsongalis 1,2 * 1）病理学和实验室医学系，Audrey and Theodore Geisel医学院，达特茅斯学院，美国新罕布什尔州，美国新罕布什尔州03755，美国。 2）美国NH 03756，Dartmouth Hitchcock Medical Center，Dartmouth Hitchcock Medical Center的病理与实验室医学系临床基因组学和先进技术实验室； * 相应的。gregory.j.tsongalis@hitchcock.org
在空间中使用激光干涉仪在激光上检测到超轻的暗物质
超薄暗物质（ULDM）是领先的良好动机候选者之一，在粒子物理学和宇宙学标准模型之外，许多理论中都预测了这些候选。在物理和天文实验中搜索ULDM的兴趣越来越多，主要假设ULDM和正常物质之间还有其他相互作用。在这里我们证明，即使ULDM仅具有重力相互作用，它也应引起太阳系中的引力扰动，该引力扰动可能足够大，可以在未来的重力波（GW）激光干涉仪中引起可检测的信号。我们研究了米歇尔森时间 - 时间延迟干涉仪对各种自旋的ULDM的敏感性，并通过针对μHz频率的空间基GW检测器来探测具有质量m mass10-18 eV的向量ULDM。我们的发现表明，GW检测器可能会直接探测一些质量范围，否则否则挑战了。
基于胎儿MRI的大脑图集分析检测到产前酒精暴露的子宫效应
产前酒精暴露（PAE）可以改变人类胎儿脑发育的正常轨迹，并可能导致胎儿酒精谱系障碍形式的神经发育变化。目前，与酒精相关的中枢神经系统变化的早期产前模式尚不清楚，尚不清楚少量的PAE是否会导致早期可检测到的脑异常。这项超分辨率的胎儿磁共振成像（MRI）研究旨在确定PAE对人脑结构的区域影响。胎儿使用基于1.5 t和3 t胎儿脑MRI检查的基于ATLAS的半自动组织分割进行了前瞻性评估。在预期母亲完成了PAE的匿名婴儿车和TACE问卷之后，发现并分析了没有宏观脑脑异常的胎儿。进行了区域脑体积的线性混合效应模型，并使用Benjamini – Hochberg程序校正了多个比较。总共招募了500名孕妇，有51名报告妊娠饮酒。排除了混杂的合并症后，分析了24个胎儿（26个观察结果），并分析了没有PAE的52个年龄匹配的对照。PAE患者的体积明显更大（p≤0.001）和较小的脑室区域（p = 0.001）。即使是次要的（每周1-3种标准饮料）PAE改变了神经发育轨迹。