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功能精准肿瘤学方法用于确定粘液纤维肉瘤患者的治疗策略 Chantal Pauli 1、Lamberto De Boni 2、Jonath
摘要 ◥ 在这个精准医疗时代，已经开发出许多针对常见肿瘤类型中高复发性突变的工作流程，让患有罕见疾病的患者几乎没有选择。在这里，我们实施了一种功能精准肿瘤学方法，利用全面的基因组分析与高通量药物筛选相结合，为患有粘液纤维肉瘤等罕见肿瘤类型的患者确定肿瘤特异性药物敏感性。从一位参加英格兰精准医学研究所 (EIPM) 项目的高级别粘液纤维肉瘤患者那里，我们建立了患者衍生的 3D 肉球和异种移植模型，用于功能测试。由于缺乏大量临床相似病例，因此对患者来源的细胞进行了高通量药物筛选，并与另外两种粘液纤维肉瘤系和一种良性成纤维细胞系进行了比较，以功能性地识别肿瘤特异性药物敏感性。
后段眼科药物输送：粘液的作用...
1沃特福德理工学院的药物和分子生物技术研究中心，爱尔兰X91 K0ek Waterford的眼科治疗研究小组； wcummins@wit.ie（W.C.）; noreilly@wit.ie（N.J.O.）; lfitzhenry@wit.ie（l.f.）; hhughes@wit.ie（H.H.）2眼科的创新，治疗和药物开发（创新）研究小组，药物和食品技术系，药学系，圣卡洛斯临床医院卫生研究所（IDISSC），马德里大学28040 Madrid，San Carlos临床医院（IDISSC）； vandres@ucm.es 3仿生和生物杂交材料，生物医学设备和药物递送实验室，美国新泽西州格拉斯伯勒，罗恩大学生物医学工程系，美国新泽西州08028； byrnem@rowan.edu 4美国科罗拉多州矿业学院化学与生物工程系chauhan@mines.edu *通信：ayah.burhanawad@wit.ie（A.M.B.）; butsabarat.klahan@wit.ie（B.K.）†这些作者为这项工作做出了同样的贡献。
胰腺粘液表皮样癌患者CASEREPO RT靶向基因测序及生物信息学分析：病例报告及文献
背景：原发性胰腺粘液表皮样癌（MEC）是一种极为罕见的恶性肿瘤，病因和发病机制不明。1959年至2020年发表的英文论文中仅有11例报道。MEC通常发生在涎腺中，但也有发生在胰腺的病例报道。尽管胰腺MEC被认为是一种低度惰性癌，但它常侵犯周围淋巴结并发生转移。胰腺MEC的预后不理想。迄今为止，胰腺MEC的基因改变、突变基因之间的机制关系和信号通路尚不清楚。患者和方法：本文介绍了一例罕见的原发性胰腺MEC病例，患者为56岁的男性，伴有肝转移。对两个肝转移灶进行了远端胰腺切除和射频消融（RFA）的根治性手术。利用靶向基因测序和生物信息学分析工具，包括STRING、DAVID、cBioPortal、DGidb和人类蛋白质图谱数据库（HPA），阐明胰腺MEC中突变基因的生物学功能和特点。结果：观察到8个基因突变（TP53、KRAS、ATR、FLI1、FLT4、MAGI2、RBM10和TNFAIP3），通过靶向基因测序计算出胰腺MEC的肿瘤突变负荷（TMB）为5.6 muts/Mb。患者随后接受辅助化疗，并在手术三个月后死亡。构建的基因-基因相互作用网络显示8个突变基因之间存在显著的相互作用。本文根据GO和KEGG对8个基因突变的功能和通路进行了20个肿瘤相关结果的分析，并进一步将胰腺MEC与胰腺导管腺癌的生物学功能和特点进行了比较。结论：胰腺MEC需要早期有效的治疗，淋巴结转移和多器官转移是预后不良因素。胰腺MEC可以与其他具有特征性临床表型、分子改变、功能信息和富集途径的胰腺癌进行比较。关键词：胰腺粘液表皮样癌，靶向基因测序，生物信息学分析
知道您的敌人 - 粘液四囊的转录组蓝乳果会揭示了针对Salmo
粘液菌四链硫酸毛乳子是一种广泛扩散的内寄生虫，在鲑鱼鱼中引起寿命肾脏疾病（PKD）。我们开发了一条在硅管道中，以将苔藓味的苔藓植物的转录物与天然脊椎动物宿主的肾脏组织分开，布朗鳟鱼（Salmo trutta）。严格的过滤后，我们构建了一个部分转录组组件T. Bryosalmonae，包含3427个转录本。基于对组装寄生虫转录组和大西洋鲑鱼（Salmo Salar）蛋白质组的同源限制搜索，我们确定了四个蛋白质靶标（内糖糖果酰胺酶，豆科蛋白酶，碳酸性赤铁酶2，胰腺性性硬脂酶2，胰腺脂肪酶相关蛋白2），抗脂肪酶相关的药物2）抗肿瘤。这些蛋白质在寄生虫生物和蠕虫中的早期工作表明，所鉴定的抗寄生虫靶标也代表了针对苔藓乳豆乳杆菌的有前途的化学治疗候选，并加强了已知抑制剂可以在进化较远的生物中有效的观点。此外，我们在中度和严重感染的鱼之间鉴定了差异表达的苔藓乳绿os子基因，这表明寄生虫负荷低的鱼类中苔藓乳豆乳杆菌的孢子虫阶段增加了。总而言之，这项研究为在T. bryosalmonae中的未来基因组研究铺平了道路，并代表了开发针对PKD有效药物的重要一步。
上皮miR-141调节IL-13诱导的气道粘液产生
引言上皮细胞构成了外部环境的障碍，并分泌粘液吸收吸入颗粒和病原体的粘液（1，2）。有缺陷的上皮功能是哮喘的定义特征，气道上皮细胞对病理粘液的产生增加会导致粘液塞限制气流（3，4）并在哮喘发作中积聚（5）。气道杯状细胞从基底细胞中发展起来，专门生产，存储和释放粘蛋白，从而在气道插头中起主要作用。尽管粘液产生在哮喘和其他呼吸系统疾病的病理生理学中的重要性，但目前尚无有效的疗法，这些疗法专门针对气道中的粘液过量产生。哮喘是由气道中的慢性炎症定义的，这会导致支气管高反应性和气流阻塞（6，7）。许多患有哮喘的人表现出2型高（T2高）势型的证据，其特应性和正在进行的T2气道炎症（7）由细胞因子IL-4，IL-5和IL-13介导。IL-4和IL-5分别驱动IgE产生和嗜酸性粒细胞，而IL-13对包括气道上皮细胞在内的结构细胞具有重要影响。il-13通过信号转换器和转录6（STAT6）的激活因子的信号传导，随后的转录因子SAM指向域 - 包含ETS转录因子（SPDEF）（8）的域名（8），而叉子盒A2/A3（FOXA2/FOXA3）（9）的叉子箱平衡的变化是11个cell仪的至关重要的步行群体。该途径优先诱导粘蛋白糖蛋白MUC5AC在体外（12），从而从患有T2-高哮喘的人的气道上皮刷中概括了其优先诱导MUC5AC的MUC5AC（7）。
表皮粘液作为鱼类的潜在生物基质......
作者：H B Santoso · 2020 · 被引用 10 次 — 粘液层的生物活性是鱼类先天免疫系统的关键机制。第一道防线的粘液活性较弱导致...
蛋白酶抑制剂对各种粘液病毒复制的影响
我们研究了八种蛋白酶抑制剂对各种正粘液病毒和副粘液病毒多周期复制的影响。其中，广泛用于治疗胰腺炎的萘莫司他、甲磺酸卡莫司他、甲磺酸加贝酯和抑肽酶，在体外显著低于其细胞毒性阈值的浓度下，即可抑制甲型和乙型流感病毒的复制。在最高测试浓度下，所有蛋白酶抑制剂均未对呼吸道合胞病毒、麻疹病毒或3型副流感病毒产生活性。研究发现，甲磺酸卡莫司他具有最高的选择性抑制剂。其对甲型流感病毒复制的50%有效浓度为2.2 μg/ml，选择指数（以对宿主细胞增殖的50%抑制浓度与对甲型流感病毒复制的50%有效浓度之比计算）为680。用鸡胚进行卵内抗病毒活性测试时，10 μg/g剂量的甲磺酸卡莫司他可显著降低甲型和乙型流感病毒的血凝素滴度。
使用单克隆抗体分析粘液虫（粘菌门：粘孢子门）孢子抗原
摘要：开发了一种采用 Percoll™ 梯度离心法从大西洋鲑 Salmo salar 的体肌组织中纯化 Kudoa thyrsites 孢子的方法。然后用高度纯化的孢子免疫近交系 BALB/c 小鼠，以衍生分泌 Kudoa 特异性单克隆抗体 (mAb) 的杂交瘤。通过免疫荧光显微镜和流式细胞术对 mAb 进行分析表明，几种 mAb 对 K. thyrsites 孢子表面的抗原具有特异性，而其他 mAb 与 K. thyrsites、K. paniformis 和 K. crumena 孢子的极性荚膜或极性细丝发生反应。使用表面结合 mAb 对孢子裂解物进行免疫印迹，结果显示 46 至 >220 kDa 的宽条带，而针对极性荚膜和极性细丝抗原的特异性 mAb 检测到不同分子量的更清晰条带，具体取决于 Kudoa 物种。K. thyrsites 孢子表面抗原的主要表位被证明是碳水化合物，这是由其对无水三氟甲烷磺酸处理的敏感性和对蛋白酶 K 处理的抗性决定的。使用 K. thyrsites 特异性 mAb 对分离的、完整的、透化的疟原虫和含有疟原虫的体细胞肌肉组织薄切片进行免疫荧光显微镜检查，发现在产生孢子的疟原虫和受感染的大西洋鲑鱼肉中都有孢子的强烈标记。通过免疫印迹法检测到的孢子只有 100 个，表明这些 mAb 具有用于开发基于现场的诊断测试的潜力。