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粪便菌群与炎症性肠病的肠外表现有关
摘要简介：大部分炎症性肠病患者（IBD）经历了胃肠道外IBD相关的炎症状况，称为肠外表现（EIM），进一步降低了生活质量，在极端情况下，可能会危及生命。EIMS的发病机理仍然未知，尽管肠道菌群改变是IBD患者的众所周知的特征，但其与EIMS的关系仍然很少研究。这项研究旨在比较有没有EIM的IBD患者的肠道菌群。方法：该研究中总共包括131名IBD患者，其中86例具有EIMS（IBD-EIM）史，而45例没有（IBD-C）。粪便样品接受了16S rRNA测序。放大序列变体（ASV）映射到SILVA数据库。比较了IBD-EIM和IBD-C之间的多样性指数和距离矩阵。使用自定义多重模型统计分析方法鉴定了差异丰富的ASV，并使用稀疏相关性（SPARCC）（SPARCC）鉴定了共同相关细菌的模块，并且与患者EIM状态有关。结果：IBD患者和EIMS患者表现出疾病活性增加，体重指数，粪便钙骨蛋白钙蛋白酶水平升高以及循环单核细胞和中性粒细胞。微生物学上，IBD-EIM比IBD-C（Mann-Whitney's Test，p = .01）和独特的粪便微生物群组成（方差的置换多变量分析；加权Unifrac，r 2 = 0.018，p = .01）。共有26个ASV在IBD-EIM和IBD-C之间表现出不同的相对丰度，包括减少的Agathobacter和Blautia和IBD-Eim组中的Eggerthella lenta增加。SPARCC分析确定了27个细菌共同关联模块，其中3个与EIM（逻辑回归，p <.05）呈负相关，其中包括重要的健康相关细菌，例如Agathobacter和Agathobacter和Faecalibacterium。结论：EIMS IBD患者的粪便菌群与没有EIM的IBD患者不同，对于EIM发病机理可能很重要。
定量粪便免疫化学测试指导初级保健中的结直肠癌途径
患有结直肠癌或肛门癌症状的人（直肠肿块，无法解释的肛门肿块或无法解释的肛门溃疡）在转诊之前不需要提供适合的拟合度（请参阅有关胃肠道癌症下胃肠道癌的建议中有关可疑癌症的指南的建议）。不返回粪便样本或具有负合适结果和持续无法解释的症状的人可能仍需要在二级护理中进行进一步研究。这可能是通过替代推荐途径，例如非特异性症状途径。，重要的是，GP可以在没有积极的结果的情况下转介人，如果他们认为有必要。
治疗抑郁症的粪便菌群移植的当前景观
抑郁症，预计是全球疾病负担的主要贡献者，是一种复杂的疾病，具有多种症状，包括情绪障碍和认知障碍。传统治疗（例如药物和心理疗法）通常会缺乏，促使人们采取了替代干预措施。最近的研究强调了肠道菌群在心理健康中的重要作用，影响了情绪和神经调节。粪便微生物群移植（FMT），从健康供体中输注粪便中的粪便中，是通过恢复肠道微生物平衡来减轻抑郁症状的有希望的策略。微生物甲状腺（MGB）轴代表了一种关键途径，通过该途径可以通过该途径能够纠正营养不良并调节神经精神上的结果。临床前研究表明，FMT可以增强神经化学物质并减少炎症标志物，从而减轻抑郁行为。此外，FMT在临床环境中表现出了希望，改善了抑郁症患者的胃肠道症状和整体生活质量。审查强调了肠脑轴在抑郁症中的作用，以及需要进一步研究以验证FMT的长期安全性和效率，确定特定的治疗性微生物菌株，并制定有针对性的微生物调节策略。促进我们对FMT的理解可以彻底改变抑郁症治疗，将范式转移到微生物组靶向疗法上。
对粪便样品的代谢组筛查是对婴儿过敏的牛奶蛋白过敏的临床试验的替代方法
牛奶蛋白过敏（CMPA）是食物过敏的最复发性儿科疾病之一，这是幼儿时期发生的。诊断并不容易，需要口服食物挑战测试（OFC）。在寻找可以用作CMPA的生物标志物的可能的肠道代谢产物时，评估了来自怀疑CMPA的婴儿的粪便样品的24个代谢组谱。儿童先前被诊断出患有OFC。粪便样品，并使用FT-Orbitrap质谱仪直接通过超高分辨率质谱（HRMS）直接分析。代谢组谱，该分析在区分样品以提出诊断方面并不有效。然后，在负面分析模式下获得的特定M/Z范围的代谢组谱成功地经受了正交部分最小二乘判别分析（OPLS-DA），该分析在没有CMPA的情况下将两组分开。模型拟合为R²= 0.88，在测试中具有Q²= 0.52的预测能力，其置换为2000排列，显着性p值<0.05。在这项初步研究中，使用代谢组谱获得的模型显示出显着的验证值，这表明有可能区分两组感兴趣的验证值，这表明其用作CMPA患者的可能诊断工具。
人类粪便的宏基因组学采样，存储和测序方案
DNA准备（M）标记（鳕鱼20060059）准备参考指南，没有任何修改。这是完整的Illumina文档（https://emea.support.illumina.com/downloads/illumina-dna-prep-reference-guide-guide-1000000025416.html）的链接。填写Illumina DNA库准备清单可能很有用：https：//emea.support.illumina.com/downloads/illumina-dna-dna-prep-checklist- 100000000033561.html
在五个同胞欧洲草食动物的Sun，X。的粪便中的微生物群落组成；保姆，朱迪思； Ruytinx，Joske； Wassen，Martin J.；
fi g u r e 5在草食动物粪便中不同模式的真菌群落的功能表征。（a）在营养模式下相对丰度（> 1％）。（b）公会模式下预测的功能分布的组成； （c）在公会模式下对应于功能组的家庭层面上特定主要的真菌分类单元的相对丰度（第一级标题是真菌物种及其所在的类别；次级标题是与真菌相对应的官能团）。不同的字母表示在p <.05级别（n = 6）的显着差异;表S14列出了真菌公会模式下的比较统计结果；表S15列出了确切的p值。
第三方粪便微生物群移植，用于较低胃肠道的高风险治疗 - 无急性GVHD
这些研究确立了针对微生物组的干预措施的基础，作为HCT接受者的一种新型治疗方法。粪便微生物群移植（FMT），将粪便从捐赠者施用到接收者中，目的是直接修改受体的肠道微生物组组成，是一种已建立的干预措施，已经探索了多种医疗条件的探索。12-14近年来，FMT在预防和治疗急性LGI GVHD方面已获得了有希望的初步结果。迄今为止，FMT作为急性LGI GVHD疗法的应用仅限于治疗难治性疾病。 鉴于在难治性疾病中对FMT的临床反应显示，并且担心急性LGI GVHD的持续时间可能会导致响应性较低的生物学，因此我们假设在治疗过程中纳入以微生物组指导的干预措施可能会改善临床结果。 因此，我们进行了一项试点研究，以治疗高危急性LGI GVHD的参与者，重点是未经治疗的病例，该病例可以与全身性皮质类固醇相结合在急性GVHD的初始治疗中结合使用FMT。迄今为止，FMT作为急性LGI GVHD疗法的应用仅限于治疗难治性疾病。鉴于在难治性疾病中对FMT的临床反应显示，并且担心急性LGI GVHD的持续时间可能会导致响应性较低的生物学，因此我们假设在治疗过程中纳入以微生物组指导的干预措施可能会改善临床结果。因此，我们进行了一项试点研究，以治疗高危急性LGI GVHD的参与者，重点是未经治疗的病例，该病例可以与全身性皮质类固醇相结合在急性GVHD的初始治疗中结合使用FMT。
比较嵌入结直肠癌筛查计划中的微生物分析的粪便样品收集方法
然而，为了有可能告知建立基于大肠癌筛查计划的国际研究，需要进行其他方法学工作来测试适合和标本收集卡，这些标本收集卡在其他国家采用了不同的拟合方法和筛选程序。因此，我们评估了存储在室温下的粪便标本中的微生物稳定性，并评估了来自两个不同标本收集卡（用于阿富汗）的微生物组指标的准确性，以及在正在进行的国际大型癌症筛查程序中使用的四个不同的拟合管（在法国和大多数欧洲国家，摩洛哥，土耳其，火鸡和伊朗）。此外，我们研究了结直肠癌筛查程序和替代运输温度（例如夏季和冬季温度）对微生物组准确性和稳定性确定的影响。
基于粪便的定量PCR测定法用于诊断青少年和成人的结核病：一项跨国，前瞻性诊断准确性研究
建议引用推荐引用kay，亚历山大； Vasiliu，ANCA；卢西亚的Carratala-Castro； Mtafya，Bariki；门德斯·雷耶斯（Mendez Reyes），何塞·尤伯托（Jose Euberto）； Maphalala，Nontobeko；穆加姆，希尔西亚； Mulengwa，Durbbin；尼斯，塔拉；贝伦的萨维德拉；巴查，杰森； Maphalala，Gugu; Mejia，Rojelio； Mtetwa，Godwin； Acacio，Sozinho； Manjate，Patricia； Mambuque，Edson； Nosisa的志Ba；诺克万达哥达； Ziyane，Mangaliso； Ntinginya，Nyanda Elias；兰格，克里斯托夫；基尔奇纳（H Lester）； Dinardo，Andrew R； Garcia-Basteiro，Alberto L；曼达拉卡斯，安娜·玛丽亚；和Stool4TB全球合作伙伴关系，“基于粪便的定量PCR测定法对青少年和成人的结核病诊断：一项跨国，前瞻性诊断准确性研究”（2024）。教职员工出版物。1687。https://digitalcommons.library.tmc.edu/baylor_docs/1687
一种改进的转导视网膜粪便细胞的方法...
眼睛和视网膜提供了一个独特的模型系统，用于研究神经元中遗传操作的影响。视网膜的输出细胞是视网膜神经节细胞（RGC），它们是位于视网膜内表面的神经元，与眼睛的玻璃体室相邻[1，2]。RGCS将其轴突向下伸出视神经，以将视觉信息从视网膜传输到大脑[1，3]。因此，不同的隔室允许通过玻璃体向RGC提供处理，并监测治疗对大脑中RGC的视神经和末端场中轴突的影响。RGC的正常功能对于维持视力至关重要，对RGC或疾病（例如青光眼或视神经神经病）的损伤[4]可能导致视力丧失。使用基因疗法介入神经元变性的过程可能会导致RGC存活，潜在地保留或恢复视力。治疗RGC的一种方法是通过注射重组腺相关病毒（AAV）向量转导这些细胞。