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World File Search System粪便
从粪便样品中分离出的甲烷素史密斯菌株B181的基因组序列
3。课程C，Hammer HF，Hammer，Hammer， 人类胃鼻虫中的甲烷发育。 Hepol Gastroenterol Nat 19：805–813。 ：//doi.org/10.1038/s41575-022- 00673-z 4。 Catelier E，完成T，Qin J，Prince E，Hildebrand F，False G，Aluminum M，Aluminant M，Batto J-M，Kennedy S等。 2013。 人类具有代谢标记的丰富性。 自然500：541–546。 https://doi.org/10.1038/natur12506 5。 用户U，Shukla R，Wrimp D，UC Hashal。 2016。 非常综合征肠。 Word 10：932–938。 https://doi.org/10.5009/ GNL15588 6。 AJM海峡，Van Dijk JB，CM Pluge，CM。 1993。 IMPL返回微生物59：1114–1119。 59.4.4 fastQC：数据集的质量控制。 编织：http：//www.braham。 B. 2014。 BBTools软件包装。 编织： 练习A，Antipov D，Meleshko D，Lapidus A，Chorobell A. 2020。 使用组件的水疗中心。 原始的Currish Bioinform 70：E102。课程C，Hammer HF，Hammer，Hammer，人类胃鼻虫中的甲烷发育。Hepol Gastroenterol Nat 19：805–813。Catelier E，完成T，Qin J，Prince E，Hildebrand F，False G，Aluminum M，Aluminant M，Batto J-M，Kennedy S等。2013。人类具有代谢标记的丰富性。自然500：541–546。https://doi.org/10.1038/natur12506 5。 用户U，Shukla R，Wrimp D，UC Hashal。 2016。 非常综合征肠。 Word 10：932–938。 https://doi.org/10.5009/ GNL15588 6。 AJM海峡，Van Dijk JB，CM Pluge，CM。 1993。 IMPL返回微生物59：1114–1119。 59.4.4 fastQC：数据集的质量控制。 编织：http：//www.braham。 B. 2014。 BBTools软件包装。 编织： 练习A，Antipov D，Meleshko D，Lapidus A，Chorobell A. 2020。 使用组件的水疗中心。 原始的Currish Bioinform 70：E102。https://doi.org/10.1038/natur12506 5。用户U，Shukla R，Wrimp D，UC Hashal。2016。非常综合征肠。Word 10：932–938。 https://doi.org/10.5009/ GNL15588 6。 AJM海峡，Van Dijk JB，CM Pluge，CM。 1993。 IMPL返回微生物59：1114–1119。 59.4.4 fastQC：数据集的质量控制。 编织：http：//www.braham。 B. 2014。 BBTools软件包装。 编织： 练习A，Antipov D，Meleshko D，Lapidus A，Chorobell A. 2020。 使用组件的水疗中心。 原始的Currish Bioinform 70：E102。Word 10：932–938。https://doi.org/10.5009/ GNL15588 6。 AJM海峡，Van Dijk JB，CM Pluge，CM。 1993。 IMPL返回微生物59：1114–1119。 59.4.4 fastQC：数据集的质量控制。 编织：http：//www.braham。 B. 2014。 BBTools软件包装。 编织： 练习A，Antipov D，Meleshko D，Lapidus A，Chorobell A. 2020。 使用组件的水疗中心。 原始的Currish Bioinform 70：E102。https://doi.org/10.5009/ GNL15588 6。AJM海峡，Van Dijk JB，CM Pluge，CM。1993。IMPL返回微生物59：1114–1119。59.4.4fastQC：数据集的质量控制。编织：http：//www.braham。B.2014。BBTools软件包装。编织：练习A，Antipov D，Meleshko D，Lapidus A，Chorobell A.2020。使用组件的水疗中心。原始的Currish Bioinform 70：E102。https：//doi.org/10.1002/cpbi.102
精致的肠型分型揭示了全球粪便宏基因组中的营养障碍
。cc-by 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他已授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本于2024年8月14日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.08.13.607711 doi：Biorxiv Preprint
第三方粪便微生物群移植，用于较低胃肠道的高风险治疗 - 无急性GVHD
这些研究确立了针对微生物组的干预措施的基础，作为HCT接受者的一种新型治疗方法。粪便微生物群移植（FMT），将粪便从捐赠者施用到接收者中，目的是直接修改受体的肠道微生物组组成，是一种已建立的干预措施，已经探索了多种医疗条件的探索。12-14近年来，FMT在预防和治疗急性LGI GVHD方面已获得了有希望的初步结果。迄今为止，FMT作为急性LGI GVHD疗法的应用仅限于治疗难治性疾病。 鉴于在难治性疾病中对FMT的临床反应显示，并且担心急性LGI GVHD的持续时间可能会导致响应性较低的生物学，因此我们假设在治疗过程中纳入以微生物组指导的干预措施可能会改善临床结果。 因此，我们进行了一项试点研究，以治疗高危急性LGI GVHD的参与者，重点是未经治疗的病例，该病例可以与全身性皮质类固醇相结合在急性GVHD的初始治疗中结合使用FMT。迄今为止，FMT作为急性LGI GVHD疗法的应用仅限于治疗难治性疾病。鉴于在难治性疾病中对FMT的临床反应显示，并且担心急性LGI GVHD的持续时间可能会导致响应性较低的生物学，因此我们假设在治疗过程中纳入以微生物组指导的干预措施可能会改善临床结果。因此，我们进行了一项试点研究，以治疗高危急性LGI GVHD的参与者，重点是未经治疗的病例，该病例可以与全身性皮质类固醇相结合在急性GVHD的初始治疗中结合使用FMT。
BT051的安全性，耐受性和药代动力学，一种炎症性
缩写：cumaef 0-t（％），从时间0到每个收集间隔的结束时间从粪便中排出剂量的累积百分比；最小，最低；最大最大，最大一个受试者没有可量化的粪便浓度的BT051 B粪便排泄被低估了100毫克队列的低估：在24-48h间隔期间，受试者1006提供的粪便未记录，尽管可量化的分析物浓度在24-48h间隔内，尽管该量不超过55.10小时，但在55.10小时的实际限制中，该且无需记录。低估
医疗政策 - 人类 FIT-DNA 分析（即...
样本作为结直肠癌筛查技术的描述/背景筛查粪便或粪便 DNA（Cologuard TM ）检测可检测出结直肠癌和癌前息肉脱落细胞中所含改变 DNA 的分子标记。DNA 检测旨在检测极少量的 DNA 标记，以识别结直肠癌或癌前结直肠肿瘤。该技术是目前可用的筛查方法的另一种潜在替代方案，例如粪便潜血检测、粪便免疫化学检测 (FIT) 和结肠镜检查。目前可用的粪便 DNA 检测结合了 FIT 和 DNA 分析，在本综述中称为 FIT-DNA，尽管其他出版物也使用术语粪便 DNA (sDNA)-FIT 和多目标粪便 DNA (mt-sDNA)。 Cologuard TM 是一种专有的体外诊断多目标 FIT-DNA 测试，它使用一种结合了 DNA 和粪便免疫化学测试技术的设备，旨在分析个人粪便样本中与结直肠癌和癌前结直肠肿瘤相关的标记物。结直肠癌几种细胞基因改变与结直肠癌 (CRC) 有关。在提出的多步骤致癌模型中，肿瘤抑制基因 p53 和原癌基因 KRAS 改变最为频繁。还检测到了腺瘤性结肠息肉 (APC) 基因和表观遗传标记物 (例如特定基因的高甲基化) 的变异。CRC 还与林奇综合征 (以前称为遗传性非息肉病 CRC) 患者和散发性结肠癌患者亚组中微卫星序列 (称为微卫星不稳定性) 中的 DNA 复制错误有关。粪便样本中脱落的肠细胞可检测到肿瘤相关基因变异和表观遗传标记。由于癌细胞会脱落到粪便中，因此已开发出检测粪便样本中分离的脱落 CRC 细胞 DNA 中这些基因变异的检测方法。
娱乐沙滩中的微生物危害
FIB的存在表明粪便污染和病原微生物存在的潜力。大肠杆菌，粪便大肠菌群和肠球菌通常被测量。如果有粪便污染的目的来源（例如，野生动植物粪便沉积，污水或污染的雨水流出）或浓缩有机物（尤其是海藻），则可能会在海滩上发生“高纤维数”。当波能量低时，潮间带可能会成为污染的热点，此外，风暴会导致纤维浓度在沙滩上升高。使用FIB作为指标存在一些问题；他们没有提供有关粪便污染来源的信息，死亡率与病毒和原生动物病原体不同，某些物种或菌株可能在环境中归化，并且没有表明潜在的
使用最佳指标的细菌等效性策略
1.0 技术和监管背景《清洁水法》 (CWA) 授权美国环保署和各州制定和实施水质标准，以保护人类健康和环境。粪便污染中的病原体和病毒是一种严重的污染物，会对接触受污染水体的人们的健康造成负面影响。美国环保署在 20 世纪 70 年代建议使用粪大肠菌群作为粪便污染和胃肠道疾病风险的病原体指标 1。20 世纪 70 年代和 80 年代初期的研究和流行病学研究表明，肠球菌可作为海水粪便污染和胃肠道疾病风险的指标，大肠杆菌 (E. coli) 可作为淡水中粪便污染和胃肠道疾病风险的指标。美国环保署于 1986 年更新了其粪便指标建议，以反映这些发现。
通过噬菌体介导的治疗方法克服与粪便菌群移植相关的供体变异性和风险
此预印本版的版权持有人于2024年6月21日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.06.20.599976 doi：biorxiv preprint
肠球菌粪便129 BIO 3B被归类为乳酸肠球菌129 Bio 3b
粪肠球菌129 BIO 3B是一种乳酸细菌，已安全用作益生菌产品已有100多年了。最近，由于某些粪肠球菌属于万古霉素的肠球菌。致病潜力较少的粪肠球菌组已被分为一个单独的物种（乳糖肠球菌）。在这项研究中，我研究了粪肠球菌129 Bio 3b以及粪肠球菌129 BIO 3B-R的系统发育分类和安全性，该含有天然对氨苄西林具有抗性。使用特定基因区域的质谱和基本局部比对搜索工具分析无法将3B和3B-R区分为E.粪肠球大肠杆菌或乳酸菌。然而，成功识别3B和3B-R的多焦点序列与乳酸螺旋体相同。总体基因组相关性指数表明，3B和3B-R与乳酸乳乳酵母具有很高的同源性。用E.乳酸性乳核e物种特异性引物证实了3B和3B-R的基因扩增。氨苄青霉素的最低抑制浓度被证实为3B为2 µg/ml，这是欧洲食品安全局设定的粪肠球大肠杆菌的安全标准。基于上述结果，将粪肠球菌129 Bio 3b和E.粪肠球菌129 BIO 3B-R分类为乳酸菌。除了FMS21之外，没有致病基因的缺乏表明这些细菌可安全用作益生菌。
年龄在粪便微生物群中的影响以及牛遗传核中血液参数的相关性
摘要：这项研究旨在确定年龄对牛遗传核对牛的影响，重点是微生物丰富度，组成，功能多样性以及与血液参数的相关性。粪便和血液样本。较老的牛表现出更大的细菌多样性和丰度，其α多样性指数发生了显着变化（p <0.05）。β多样性分析显示，年龄组之间的微生物组成与年龄与性别的相互作用之间存在显着差异（p <0.05）。α多样性，社区组成和血液学价值之间的相关性突出了微生物群对牛健康的影响。有益的产生丁酸酯的细菌，例如ruminococcaceae，在较老的牛中更丰富，这表明在肠道健康中起作用。功能多样性分析表明，在发酵和厌氧化学杂质营养中，年轻的牛具有更丰富的代谢途径。这些发现提出了管理策略，包括量身定制的益生菌疗法，饮食调整以及有针对性的健康监测，以增强牲畜的健康和绩效。进一步的研究应包括全面的代谢分析，以更好地将微生物群的变化与年龄相关的变化相关联，从而增强对微生物群，年龄和生殖状态之间复杂相互作用的理解。