在精准医疗 (PM) 中,生物标志物可识别个体患病风险和预后、对特定干预措施的可能反应,并可用于监测临床反应或治疗毒性。1 精准医疗还通过以下方式提高预防疾病、促进健康和减少人群健康差距的能力:(1) 应用新兴方法和技术测量人群的疾病、病原体、暴露、行为和易感性;(2) 制定政策和有针对性的实施方案以改善健康。2
引言 精准医疗对患者和医生来说都是一个越来越重要的前景。对癌症潜在生物学的新见解使得前瞻性地检测患者是否携带导致肿瘤生长的特定基因突变成为可能。携带特定基因突变的癌症患者可以被引导至直接针对该致病途径的疗法,同时避免未携带突变的患者承受无效干预带来的不必要的毒性和负担。然而,尽管这种治疗策略有着明显的前景,但要成功地将这种靶向疗法从研究环境转化为临床,仍必须克服若干挑战。例如,一个挑战来自于这样一个事实:精准医疗的测试单位是一个复杂的干预组合,它结合了治疗剂、标记物和用于检测该标记物的诊断检测 ( 1 )。对这一复杂干预组合进行严格测试要求每个组成部分(治疗、标记物和检测)都针对特定病症进行了优化。第二个挑战来自于这样一个事实:诊断检测需要其自身的多步骤开发和验证过程,其中包括对检测的分析前效度(正确的标本处理和加工)、分析效度(检测准确性、可靠性和可重复性)、临床效度(检测结果与感兴趣的临床结果之间的强关联)和临床实用性(使用检测来指导患者护理比不使用检测可获得更有利的风险-收益平衡)的评估(2)。未能
健康研究部 (DHR) 致力于提升来自医学院的教职员工和学生以及来自全国各地研究机构和大学的中期科学家的技能。目标是使研究人员能够利用现代技术解决与国家相关的健康问题。根据这一举措,国家生殖和儿童健康研究所 (NIRRCH) 正在举办精准医学培训课程,NIRRCH 是一家一流的 ICMR 研究所,在基础、临床、操作和实施研究方面拥有专业知识,并拥有一流的先进设施。
碱基编辑器是一类有前途的下一代基因组编辑技术,既可以精确纠正致病的遗传变异,又可以同时安全地敲除多个基因靶标。Pin-point 碱基编辑平台是一个模块化组装的 DNA 结合 Cas 和 DNA 修饰脱氨酶组件,它们通过序列靶向向导 RNA (gRNA) 中编码的适体连接。碱基编辑器应用中的一个主要挑战是准确地通过计算机预测给定 Cas 和脱氨酶组合在目标序列上的编辑效率和特异性。Pin-point 碱基编辑系统的模块化允许创建大量配置,这些配置的 PAM 特异性、序列编辑偏好和编辑效率可能有所不同。为了促进和加速基于 Pin-point 平台的应用程序开发,我们创建了一个自定义工具来设计 gRNA 以靶向感兴趣的基因并安装碱基转换,包括那些会引入过早的终止密码子或破坏剪接位点以敲除目标基因的转换。此外,我们进行了大规模并行细胞筛选,以分析两种不同的 Pin-point 碱基编辑器配置的编辑活动,其中 gRNA 靶向数千个目标序列。我们使用从筛选中获得的数据构建了每种配置观察到的编辑结果的模型。我们应用这些模型对设计用于产生多个临床相关基因靶标(包括 CIITA 和 PCSK9)功能性敲除的 gRNA 进行排序。在分析了计算机预测与 gRNA 的细胞性能之间的相关性后,我们确认模型预测与 Pin-point 碱基编辑平台观察到的编辑效率准确相关。自定义 gRNA 设计工具和预测模型的结合导致识别出一种新型、高效的 gRNA,它能够通过破坏剪接位点来敲除 PCSK9,并且我们确认了文献中先前报道的其他 gRNA 设计的预测性能。我们的 gRNA 设计规则是使用我们广泛的基于细胞的性能数据集得出的,从而创建了可靠的自定义工具来优先考虑 gRNA 并选择具有最高编辑效率的 gRNA。
参考文献:1. Drenner,Basu GD,Goodman LJ 等人。全面基因组测序对最大限度地识别晚期癌症患者临床可操作改变的价值:一系列病例。Oncotarget。2021;12:1836-1847。2. Nikanjam M,Okamura R,Barkauskas DA,Kurzrock R。靶向融合以改善肿瘤治疗结果。癌症。2020;126:1315-1321。3. White T,Szelinger S,LoBello J 等人。综合基因组分析测试的分析验证和临床应用,Oncotarget 2021;12:726-739 免责声明:OncoExTra 测试由 Genomic Health, Inc. 开发,其性能特征由 Exact Sciences Corporation 的全资子公司根据美国病理学家协会 (CAP) 和临床实验室改进修正案 (CLIA) 规定进行验证。OncoExTra 测试在 Genomic Health Phoenix 临床实验室进行。Exact Sciences 临床实验室经 CAP 认可,根据 CLIA 法规认证,并有资格执行高复杂性临床实验室测试。此测试尚未获得美国食品药品监督管理局或其他指定监管机构的批准或认可。
本报告包含涉及重大风险和不确定性的前瞻性陈述。本报告中包含的所有陈述(历史事实陈述除外)均为前瞻性陈述,包括有关我们的运营和财务状况、业务战略、候选产品开发、研发活动和成本、我们业务计划的成功时间和可能性、管理计划和目标、临床试验的未来结果和时间安排、监管提交计划、我们候选产品的治疗潜力以及我们候选产品的市场潜力的陈述。这些陈述涉及已知和未知的风险、不确定性和其他重要因素,可能导致我们的实际结果、业绩或成就与前瞻性陈述表达或暗示的任何未来结果、业绩或成就存在重大差异。 “预期”、“相信”、“估计”、“期望”、“打算”、“可能”、“或许”、“计划”、“预测”、“预计”、“目标”、“潜在”、“将”、“会”、“可能”、“应该”、“继续”等词语和类似表述旨在识别前瞻性陈述,尽管并非所有前瞻性陈述都包含这些识别词。我们可能无法真正实现前瞻性陈述中披露的计划、意图或期望,您不应过分依赖我们的前瞻性陈述。实际结果或事件可能与我们做出的前瞻性陈述中披露的计划、意图和期望存在重大差异。本演示文稿中包含的前瞻性陈述反映了我们对未来事件的当前看法,除非适用法律要求,否则我们不承担更新任何前瞻性陈述的义务。
1 INSERM U981,古斯塔夫·鲁西,维尔瑞夫; 2 法国维尔瑞夫古斯塔夫鲁西癌症医学系; 3 慕尼黑综合癌症中心和慕尼黑大学医院第三医学系,慕尼黑; 4 德国海德堡大学医院和个性化医疗中心 (ZPM) 病理学研究所; 5 巴黎萨克雷大学医学院,克里姆林宫比塞特尔; 6 药物开发部(DITEP),Gustave Roussy,维尔瑞夫; 7 Oncostat U1018,法国巴黎萨克雷大学国家健康与医学研究院,标记为抗癌联盟,维尔瑞夫; 8 生物统计学和流行病学系,Gustave Roussy,维尔瑞夫; 9 法国巴黎西岱大学居里研究所遗传学系、INSERM U1016; 10 马德里 10 月 12 日大学医院、10 月 12 日健康研究中心医院肿瘤医学系; 11 巴塞罗那 Vall d'Hebron 肿瘤研究所 (VHIO),巴塞罗那 Vall d'Hebron 医院校区; 12 西班牙维克大学加泰罗尼亚中央大学; 13 巴西圣保罗肿瘤诊所; 14 德国癌症研究中心 (DKFZ) 海德堡分子血液学/肿瘤学临床合作单位; 15 德国海德堡大学内科第五系,海德堡,德国; 16 华沙玛丽亚居里国家肿瘤研究所软组织/骨肉瘤和黑色素瘤系; 17 波兰华沙波兰科学院莫萨科夫斯基医学研究中心实验药理学系; 18 美国休斯顿德克萨斯大学 MD 安德森癌症中心研究癌症治疗学系; 19 伦敦大学学院医学肿瘤学系,伦敦; 20 英国伦敦圣巴塞洛缪医院肿瘤内科; 21 意大利梅尔多拉 IRCCS 罗马涅肿瘤研究所 (IRST)“Dino Amadori”科学理事会; 22 纽约纪念斯隆凯特琳癌症中心病理学系; 23 美国纽约纪念斯隆凯特琳癌症中心医学部乳腺医学和临床遗传学服务中心; 24 法国维尔瑞夫古斯塔夫鲁西医学生物学和病理学系肿瘤遗传学服务; 25 意大利维罗纳大学医学院诊断与公共卫生系病理学系
越来越多的资产,尤其是在肿瘤学领域,都是精准医疗 (PM)。事实上,到 2023 年,约有三分之一的 FDA 批准的新分子实体是精准医疗。为了本文的目的,我们将精准医疗 (PM) 疗法定义为在疾病诊断后需要进行额外测试以确定治疗资格的疗法。在大量未满足的医疗需求和前所未有的创新水平的推动下,精准医疗交易市场(无论是资产许可、研发合作还是直接收购)继续吸引激烈的竞争,因为大型生物制药公司希望解决即将到来的专利悬崖、填补现有的投资组合空白或进入新市场。事实上,2023 年美国按美元价值计算的前 10 笔交易中有 9 笔包含一些精准医疗内容(见表 1)。