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World File Search System糖蛋白
prevotella timonensis通过高糖苷酶和唾液酸酶活性降解阴道上皮糖蛋白
摘要细菌性阴道病（BV）是女性再生产地段的多数菌感染。bv的特征在于通过包括众所周知的gardnerella daginalis在内的多种厌氧菌替代与健康相关的乳杆菌物种。prevotella timonensis和prevotella bivia是在大量BV患者中发现的厌食症，但它们对疾病过程的贡献仍有待确定。定义BV中厌氧过度生长的特征是粘膜表面的依从性，并且在阴道分泌物中粘液降解酶（例如唾液酸酶）的活性增加。我们证明了timonensis，但没有强烈粘附于阴道和宫颈细胞的水平与阴道G. g。Timonensis基因组独特地编码了大量粘液降解酶，包括四种假定的诱导酶和两个假定的唾液酸酶PTNANH1和PTNANH2。酶测定表明，岩藻糖苷酶和唾液酸酶的活性在结合细胞链球菌和分泌的馏分中明显高于其他阴道厌食症。在感染测定中，蒂莫宁SIS有效去除了来自上皮糖蛋白的岩藻糖和α2,3和α2,6和α2,6-链接的唾液酸部分。重组表达的timonensis nanh1和nanh2从上皮表面切割α2,3和α2,6-连接的唾液酸，而在抑制剂上可以阻止timonensis通过抑制剂来阻断唾液酸。我们的结果强调了了解不同厌氧菌在BV中的作用的重要性。这项研究表明，Timonensis具有不同的毒力相关特性，其中包括初始粘附和在阴道上皮粘膜表面粘蛋白降解的高能力。
牛奶中与妊娠相关糖蛋白估计的奶牛怀孕损失的遗传参数
这项研究检查了在育种中使用预养生相关的糖蛋白（PAG）的可行性，以维持妊娠维持妊娠，并评估了妊娠损失特征的遗传差异。在1,119个瑞典群的每月测试日挤奶中收集了41,889名瑞典红（SR）和82,187牛奶的374,206个PAG样品。妊娠状态是根据PAG水平定义的，并通过人工授精（AI），产犊和从D 1后汇总到Calving的数据确认。妊娠损失特征被定义为胚胎丧失（AI后28 d至41 d），胎儿损失（AI后42 d直至产犊）和总妊娠损失。最小二乘平均值（±标准误差，％）和使用混合线性模型估算的遗传参数。遗传力估计分别为0.02、0.02和0.03，胚胎丧失，胎儿丧失和总妊娠丧失分别为0.02、0.02和0.03。妊娠损失的母牛的PAG浓度低于成功保持怀孕并产生血管的母牛。PAG记录仅限于每月测试日挤奶，导致估计较低的胚胎损失（分别为SR和SH为17.5±0.4和18.7±0.4）和较高的胎儿损失（分别为32.8±0.5和35.1±0.5和35.1±0.5，SR和SH）。妊娠损失可能较早发生，但仍未发现直到下一个测试日挤奶，当时它被记录为胎儿损失而不是胚胎损失。估计胚胎和胎儿妊娠丧失性状与经典生育特征之间的遗传相关性通常很高。需要进一步的研究来阐明这些结果如何从PAG数据中鉴定出新的遗传性状可以是高度特异性的，因为PAG仅由胎盘分泌。因此，PAG可能是选择的有用指标，可从基因上改善妊娠维持并减少牛奶产量中的生殖损失。
成像观察聚焦超声引起的血脑屏障破坏对 P 糖蛋白功能的影响
Sébastien Goutal、Anthony Novell、Sarah Leterrier、Louise Breuil、Erwan Selingue 等人。成像聚焦超声引起的血脑屏障破坏对 P 糖蛋白功能的影响。《Controlled Release 杂志》，2023 年，第 361 页，第 483-492 页。�10.1016/j.jconrel.2023.08.012�。�hal-04254542�
社论：p-糖蛋白过表达抗药性癌症的FDA批准的药物重新定位
抗癌药是癌症治疗的重要组成部分。癌细胞可以通过例如P-糖蛋白1（P-gp）过表达或突变积累的一部分生长信号通路，凋亡途径或修复系统中突变的一部分突变中对这些药物产生抗性。本质上，转移性癌症，晚期癌症或干细胞样癌症通常具有耐药性，并且很难使用当前的抗癌药物治疗。P-gp的过表达，也称为多药抗性蛋白1（MDR1）或ATP结合盒子子家庭B成员1（ABCB1），是抗癌药物抗性的众所周知的机制之一。干细胞状的癌症经常在其膜上过表达P-gp，从而使用当前可用的抗癌药物导致不足的治疗（1）。因此，研究新的治疗方法以治疗过表达药物耐药性癌细胞的新型治疗选择。识别靶向这些癌症的机制可以克服当前抗癌药物的不确定，并为P-gp过表达的癌症患者带来更好的预后。已经开发了多种P-gp抑制剂，但是它们在正常细胞中，尤其是与抗癌药物结合使用，限制了其公用事业。药物重新定位已用于治疗各种疾病。可以避免重复大量毒性测试，因此可以降低成本并加快用于治疗耐药癌症患者的药物的过程（2）。食品药品监督管理局（FDA）已经在长期以来在人类中使用的大量药物的利益和不利影响很容易获取数据。识别现有的FDA批准药物，可以重新定位到靶向过表达P-gp的癌细胞，可以在对抗癌药物抗性的患者中更好地治疗。由于这些药物已经在临床环境中使用，因此药物重新定位将提供一种有效的方法来满足P-gp
重新定位靶向刺突糖蛋白的配体作为抗 SARS-CoV-2 的潜在药物
从构象上看，刺突糖蛋白以同源三聚体的形式排列在病毒表面 [29]。当 RBM 被隐藏时，构象称为向下（受体不可接近）（见图 1C）。然而，同源三聚体是不对称的，因为它们不断进行结构重排（向上构象），以将病毒膜与宿主细胞膜融合 [13]。当两个 RBD 结构域被隐藏（受体不可接近）时，一个 RBD 结构域暴露（受体可接近），称为向上构象（见图 1D）。这是因为 S1 的 RBD 经历了铰链状运动 [32]。在 SARS-CoV 中，有两个铰链位点被鉴定（铰链 1 位点（354-361）和铰链 2 位点（552-563），它们负责上下切换
针对EBV糖蛋白42的高IgG滴度与鼻咽癌的较低风险相关
基于鼻咽癌EBV感染的基于抗体的筛查与中国南部等流行地区的鼻咽癌（NPC）密切相关（NPC）（1）。筛查高危抗体特征的种群可以通过改善早期诊断来减轻NPC的负担（2，3）。用于针对EBV蛋白的检查，粘膜特异性抗体（IGA），例如EBNA1和VCA病毒capsid抗原（VCA）p18和全身性抗体（IgG），针对BNLF2B可以分散患有早期NPC（2、4、5、5、5、5、5、5、5、5、5、5、5、5、5、5、5、5、5、5、5）的人。同样，通过对后来被诊断为NPC的健康个体中的抗体进行抗体（6-8）的健康个体中的抗体（6-8）。尽管此类研究揭示了NPC风险的生物标志物，但健康的EBV
使用 CaverDock 和机器学习筛选全球批准的针对 SARS-CoV-2 高动态刺突糖蛋白的药物
新型严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 会引起病理性肺部症状。针对这种病毒的疫苗和药物的大多数开发工作都针对刺突糖蛋白，特别是其 S1 亚基，该亚基被血管紧张素转换酶 2 识别。在这里，我们使用内部开发的工具 CaverDock 使用低温电子显微镜结构 (PDB-ID: 6VXX) 和来自先前发布的分子动力学模拟的五个最密集簇的代表性结构对刺突糖蛋白进行虚拟筛选。配体数据集来自 ZINC 数据库，包括全球批准用于临床的药物。针对完整数据集计算了单个药物通过刺突糖蛋白同源三聚体通道的轨迹、它们在通道内的结合能以及它们与三聚体三个亚基的接触持续时间。然后使用多元统计方法建立结构-活性关系并选择运动抑制的最佳候选药物。这种用于快速筛选多状态蛋白质结构（6 种状态）中全球批准药物（4359 种配体）的新协议在完成计算的速度方面表现出很高的稳健性。该协议是通用的，可以应用于任何具有包含蛋白质隧道或通道的实验性三级结构的目标蛋白质。该协议将在 CaverWeb 的下一个版本中实现（https://loschmidt.chemi.- muni.cz/caverweb/），以便更广泛的科学界可以访问它。2021 作者。由 Elsevier BV 代表计算和结构生物技术研究网络出版。这是一篇根据 CC BY 许可开放获取的文章（http://creativecommons. org/licenses/by/4.0/）。
由于 P-糖蛋白的上调，用薄荷醇预处理的阿霉素暴露的 HepG2 细胞的细胞毒性降低
本研究旨在研究人肝细胞癌 HepG2 细胞暴露于薄荷醇后 P-糖蛋白 (P-gp) 表达和活性的变化，以及它们与细胞对 P-gp 底物阿霉素 (DOX) 的细胞毒性和凋亡反应的关系。薄荷醇处理显著增加了 HepG2 细胞中 P-gp 的表达。薄荷醇处理组的 HepG2 细胞中 DOX 的细胞内积累明显低于对照组，但维拉帕米存在时这种现象被消除。在 DOX 暴露前 24 小时薄荷醇处理显著减弱了 DOX 引起的细胞活力降低，这与 Bcl-xl 和 caspase-3 mRNA 表达的变化相一致。这些结果表明，薄荷醇通过上调 P-gp 增加 DOX 的流出，导致肝细胞癌细胞获得对 DOX 的抗性。
通过无洗涤剂膜蛋白提取与表面等离子体共振生物传感器相结合筛选潜在的 P-糖蛋白抑制剂
摘要 P-糖蛋白(P-gp)在癌细胞中高表达可导致多药耐药(MDR)，抗癌药物与P-gp抑制剂联用是逆转癌症MDR治疗的一种有前途的策略。本研究建立了一种无标记、无洗涤剂的系统，结合表面等离子体共振(SPR)生物传感器和苯乙烯马来酸(SMA)聚合物膜蛋白(MPs)稳定技术来筛选潜在的P-gp抑制剂。首先，利用SMA聚合物从MCF-7/ADR细胞中提取P-gp，形成SMA脂质体(SMALPs)。随后，将SMALPs固定在SPR生物传感器芯片上，建立P-gp抑制剂筛选系统，并测定P-gp与小分子配体的亲和力。方法学考察证明该筛选系统具有良好的特异性和稳定性。从50个天然产物中筛选出9个P-gp配体，并测定了它们与P-gp的亲和常数。体外细胞验证实验表明，粉防己碱、防己诺林碱、前花素B、新黄芩素和淫羊藿苷可以显著增加MCF-7 / ADR细胞对阿霉素（Adr）的敏感性。此外，粉防己碱、前花素B和新黄芩素可以通过抑制P-gp的功能来逆转MCF-7 / ADR细胞的MDR。这是首次将基于SMALPs的稳定化策略应用于SPR分析体系。SMA聚合物可以将P-gp保留在天然脂质双层环境中，从而保持P-gp的正确构象和生理功能。所开发的系统可以快速
DNA损伤通过锥虫瘤的镶嵌变体表面糖蛋白（VSG）驱动抗原多样化。
图2。DNA双链破裂时，当同源性可用时触发镶嵌VSG形成a）沿Antat1.1转录本鉴定出的独特重组事件的直方图。Cas9 DNA断裂位点由垂直线表示。相对于VSG转录本的5'端的剪切位置为：243、369、694、894、978和1459。截面有色，以指示已确定的供体VSG。r表示与反向链结合的指南。绘制了ANTAT1.1与供体VSG之间的完美同源性的中点。如果镶嵌序列匹配> 1个潜在的供体VSG，则绘制平均重组位置。b）定量由DNA断裂引起的镶嵌重组事件。与从该区域的未经常规读数计数相比，该区域内检测到的250bp或下游中检测到的重组事件的数量被归一化，并具有最小的覆盖范围，以控制测序深度。（n = 2，两个独立的克隆）统计显着性是用带有事后Tukey HSD（** p <0.01）平均值的单向方差分析确定的。c）在ANTAT1.1内断裂后分离出的寄生虫克隆的镶嵌VSG示意图。显示的代表序列。d）在所有分离的镶嵌表达克隆中鉴定出的供体VSG插入长度的直方图。插入长度仅包括新插入的序列，不包括重组位点。e）atat1.1家族的示意图与antat1.1转录本排列。灰色序列与atat1.1的完美匹配。f）在每个重组位点，ANTAT1.1和供体VSG之间共享身份长度的直方图。g）量化Eatro1125和Lister427寄生虫的VSGNOM中VSG类型。lister427 vsgnome具有5个vsgs，可以完全复制，没有任何其他家庭成员。sl = 5'剪接领导者序列，14-mer = 3'序列在所有VSG转录本中保守