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World File Search System糖蛋白
沉默白细胞介素 6 和糖蛋白 130 可抑制癌细胞生长并诱导细胞凋亡
摘要背景：各种信号通路促进癌症生长并抑制癌细胞凋亡。据报道，各种癌症中白细胞介素 (IL)-6 细胞因子水平升高及其通过 IL-6 受体的信号传导与预后不良有关。另一方面，靶向 IL-6 和 IL-6 受体与癌症的改善作用有关。因此，本研究旨在抑制 IL-6 及其受体 (糖蛋白 130，[gp130]) 并协同减少体外癌症进展。方法：因此，使用 4T1 和 CT26 癌细胞系分析同时阻断 IL-6 和 gp130 的疗效。此外，使用小干扰核糖核酸 (siRNA) 分子来抑制这些因子的表达。使用定量实时聚合酶链反应测定法研究靶基因的表达。此外，采用 MTT 测定法研究细胞存活率。最后，用酶联免疫吸附试验测定细胞因子。结果：用脂质体转染癌细胞导致两种细胞系中这些因子的显著下调。此外，IL-6 和 gp130 的下调导致细胞死亡显著诱导，这与两种细胞的增殖潜力降低有关。最终，IL-6 沉默显着抑制了两种细胞中 IL-6 的分泌。结论：这些发现意味着同时沉默 IL-6 和 gp130 可以被视为一种潜在的抗癌治疗方法，应在未来的研究中进一步考虑。关键词：白细胞介素 6、癌症免疫疗法、糖蛋白 130、siRNA、白细胞介素 6 受体
将 CRISPR 干扰与 FACS 富集相结合：CHO 细胞系糖工程用于治疗性糖蛋白生产的新方法
图 2 富集具有低细胞表面岩藻糖基化的细胞。（A）Fut8 和对照池以及富集池和克隆的 AAL-FITC 染色。仅对生成的三个对照池和 Fut8 池中的一个进行染色并用于进一步富集。每个组中选择用于进一步评估的克隆都标有星号（参见图 S3 中仅选定的克隆）。（B）对来自 a) 的 FITC 信号的 MFI 进行量化。点表示每个染色池或克隆的测量值。（C）对对照和 Fut8 池以及在 6 天批次中培养的选定富集池和克隆中的 Fut8 基因表达进行 qPCR 量化。所有三个未富集的对照和 Fut8 池都进行了培养。点表示池（条 1、2、4、5）或单个克隆（3 和 6）的生物学重复。误差线表示池或单个克隆的生物学重复的 SEM。使用非配对 t 检验来计算对照和 Fut8 富集克隆之间的统计学意义
通过无洗涤剂膜蛋白提取与表面等离子体共振生物传感器相结合筛选潜在的 P-糖蛋白抑制剂
摘要 P-糖蛋白(P-gp)在癌细胞中高表达可导致多药耐药(MDR)，抗癌药物与P-gp抑制剂联用是逆转癌症MDR治疗的一种有前途的策略。本研究建立了一种无标记、无洗涤剂的系统，结合表面等离子体共振(SPR)生物传感器和苯乙烯马来酸(SMA)聚合物膜蛋白(MPs)稳定技术来筛选潜在的P-gp抑制剂。首先，利用SMA聚合物从MCF-7/ADR细胞中提取P-gp，形成SMA脂质体(SMALPs)。随后，将SMALPs固定在SPR生物传感器芯片上，建立P-gp抑制剂筛选系统，并测定P-gp与小分子配体的亲和力。方法学考察证明该筛选系统具有良好的特异性和稳定性。从50个天然产物中筛选出9个P-gp配体，并测定了它们与P-gp的亲和常数。体外细胞验证实验表明，粉防己碱、防己诺林碱、前花素B、新黄芩素和淫羊藿苷可以显著增加MCF-7 / ADR细胞对阿霉素（Adr）的敏感性。此外，粉防己碱、前花素B和新黄芩素可以通过抑制P-gp的功能来逆转MCF-7 / ADR细胞的MDR。这是首次将基于SMALPs的稳定化策略应用于SPR分析体系。SMA聚合物可以将P-gp保留在天然脂质双层环境中，从而保持P-gp的正确构象和生理功能。所开发的系统可以快速
重新定位靶向刺突糖蛋白的配体作为抗 SARS-CoV-2 的潜在药物
从构象上看，刺突糖蛋白以同源三聚体的形式排列在病毒表面 [29]。当 RBM 被隐藏时，构象称为向下（受体不可接近）（见图 1C）。然而，同源三聚体是不对称的，因为它们不断进行结构重排（向上构象），以将病毒膜与宿主细胞膜融合 [13]。当两个 RBD 结构域被隐藏（受体不可接近）时，一个 RBD 结构域暴露（受体可接近），称为向上构象（见图 1D）。这是因为 S1 的 RBD 经历了铰链状运动 [32]。在 SARS-CoV 中，有两个铰链位点被鉴定（铰链 1 位点（354-361）和铰链 2 位点（552-563），它们负责上下切换
通过计算机模拟和体外药物再利用策略靶向弗林蛋白酶活性以抑制 SARS-CoV-2 刺突糖蛋白的裂解
开辟了快速识别潜在新型治疗方法的新途径 58,59 。分子建模技术和虚拟筛选可以明确地帮助药物重新定位工作。因此，面对 COVID-19 大流行的情况以及缺乏经过验证的治疗方法或疫苗，我们决定使用不同的生物信息学方法和我们新收集的约 8,000 种已批准和正在研究的化合物来寻找新型的潜在弗林蛋白酶抑制剂。抗真菌剂 Sulconazole 是在结构分析后确定的，并进一步发现它可以抑制主要细胞表面的成熟
使用 CaverDock 和机器学习筛选全球批准的针对 SARS-CoV-2 高动态刺突糖蛋白的药物
新型严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 会引起病理性肺部症状。针对这种病毒的疫苗和药物的大多数开发工作都针对刺突糖蛋白，特别是其 S1 亚基，该亚基被血管紧张素转换酶 2 识别。在这里，我们使用内部开发的工具 CaverDock 使用低温电子显微镜结构 (PDB-ID: 6VXX) 和来自先前发布的分子动力学模拟的五个最密集簇的代表性结构对刺突糖蛋白进行虚拟筛选。配体数据集来自 ZINC 数据库，包括全球批准用于临床的药物。针对完整数据集计算了单个药物通过刺突糖蛋白同源三聚体通道的轨迹、它们在通道内的结合能以及它们与三聚体三个亚基的接触持续时间。然后使用多元统计方法建立结构-活性关系并选择运动抑制的最佳候选药物。这种用于快速筛选多状态蛋白质结构（6 种状态）中全球批准药物（4359 种配体）的新协议在完成计算的速度方面表现出很高的稳健性。该协议是通用的，可以应用于任何具有包含蛋白质隧道或通道的实验性三级结构的目标蛋白质。该协议将在 CaverWeb 的下一个版本中实现（https://loschmidt.chemi.- muni.cz/caverweb/），以便更广泛的科学界可以访问它。2021 作者。由 Elsevier BV 代表计算和结构生物技术研究网络出版。这是一篇根据 CC BY 许可开放获取的文章（http://creativecommons. org/licenses/by/4.0/）。
社论：p-糖蛋白过表达抗药性癌症的FDA批准的药物重新定位
抗癌药是癌症治疗的重要组成部分。癌细胞可以通过例如P-糖蛋白1（P-gp）过表达或突变积累的一部分生长信号通路，凋亡途径或修复系统中突变的一部分突变中对这些药物产生抗性。本质上，转移性癌症，晚期癌症或干细胞样癌症通常具有耐药性，并且很难使用当前的抗癌药物治疗。P-gp的过表达，也称为多药抗性蛋白1（MDR1）或ATP结合盒子子家庭B成员1（ABCB1），是抗癌药物抗性的众所周知的机制之一。干细胞状的癌症经常在其膜上过表达P-gp，从而使用当前可用的抗癌药物导致不足的治疗（1）。因此，研究新的治疗方法以治疗过表达药物耐药性癌细胞的新型治疗选择。识别靶向这些癌症的机制可以克服当前抗癌药物的不确定，并为P-gp过表达的癌症患者带来更好的预后。已经开发了多种P-gp抑制剂，但是它们在正常细胞中，尤其是与抗癌药物结合使用，限制了其公用事业。药物重新定位已用于治疗各种疾病。可以避免重复大量毒性测试，因此可以降低成本并加快用于治疗耐药癌症患者的药物的过程（2）。食品药品监督管理局（FDA）已经在长期以来在人类中使用的大量药物的利益和不利影响很容易获取数据。识别现有的FDA批准药物，可以重新定位到靶向过表达P-gp的癌细胞，可以在对抗癌药物抗性的患者中更好地治疗。由于这些药物已经在临床环境中使用，因此药物重新定位将提供一种有效的方法来满足P-gp
碳酸酐酶XII抑制克服P-糖蛋白...
抽象的内在或获得化学疗法的抗性是癌症治疗的主要障碍。抗药性的关键机制之一是药物外转运蛋白P-糖蛋白（PGP）的过表达。PGP过表达使大量机械无关的化学疗法无效。靶向PGP抑制直接克服耐药性，尽管在概念上和机械上有吸引力，但并未转化为诊所，部分原因是PGP在许多健康组织中也具有关键的保护功能。最近发现，与癌症中pH调节相关的酶XII（Ca XII）在抗药性癌细胞中与PGP共同表达并与PGP共同表达。ca xii也被缺氧上调，这是另一种有助于耐药性的微环境因子。在这里，我们回顾了表明对CA XII的调节的发现，可能会提供一种有希望的新方法来克服耐药性和治疗障碍对固体癌症的长期障碍。本综述涵盖了小分子和抗体的CA XII抑制剂的使用，并结合了PGP底物的化学治疗剂。这种组合疗法方法恢复了化学疗法在抗性细胞中的功效，并提供了一个潜在的新治疗窗口，以重新检查PGP作为一种安全，有效且新颖的抗癌策略。
针对 SARS-CoV-2 主要蛋白酶和刺突糖蛋白模型对近期 FDA 批准的抗癌药物进行潜在探索：一项计算研究
摘要：COVID-19 已成为全球几乎所有国家医疗保健系统的全球风险，该病毒起源于中国武汉。迄今为止，尚无可用于治疗该疾病的特定药物。SARS-CoV-2 的确切来源尚不清楚，尽管早期病例与华南华南海鲜市场有关。本文报告了最近 FDA 批准的抗癌药物（Capmatinib、Pemigatinib、Selpercatinib 和 Tucatinib）的计算机分子建模，以了解它们对 COVID-19 靶标的抑制作用。将选定的抗癌药物对接在 SARS-CoV-2 主蛋白酶（PDB ID：6LU7）和 SARS-CoV-2 刺突糖蛋白（PDB ID：6M0J）上，以确定这些药物的结合能力。评估了药物的 ADMET 参数，此外，还进行了 DFT 计算以研究药代动力学、热参数、偶极矩和化学反应性描述符。讨论了对接能 (ΔG) 和相互作用的氨基酸残基。已经得出了有希望的分子对接结论，证明了所选抗癌药物具有开发用于对抗 COVID-19 的合理药物的潜力。对该药物的进一步优化可能会支持缓解疫情所急需的快速反应。
由于 P-糖蛋白的上调，用薄荷醇预处理的阿霉素暴露的 HepG2 细胞的细胞毒性降低
本研究旨在研究人肝细胞癌 HepG2 细胞暴露于薄荷醇后 P-糖蛋白 (P-gp) 表达和活性的变化，以及它们与细胞对 P-gp 底物阿霉素 (DOX) 的细胞毒性和凋亡反应的关系。薄荷醇处理显著增加了 HepG2 细胞中 P-gp 的表达。薄荷醇处理组的 HepG2 细胞中 DOX 的细胞内积累明显低于对照组，但维拉帕米存在时这种现象被消除。在 DOX 暴露前 24 小时薄荷醇处理显著减弱了 DOX 引起的细胞活力降低，这与 Bcl-xl 和 caspase-3 mRNA 表达的变化相一致。这些结果表明，薄荷醇通过上调 P-gp 增加 DOX 的流出，导致肝细胞癌细胞获得对 DOX 的抗性。