分离染色体的流式细胞术是细胞遗传学的一种新方法,可快速测量单个中期染色体。在这种方法中,用适当的荧光染料染色的水悬浮液中的染色体被限制在激发染料的窄激光束中高速流动。发射的荧光通过光度法测量,累积的数据形成染色体荧光的频率分布。该频率分布的峰值归因于单个染色体或具有相似荧光的染色体组;峰值平均值与染色体荧光成正比,峰值面积与染色体出现频率成正比。因此,频率分布可作为核型(1、2)。此外,流式分选可根据染色体的染色特性分离染色体(3、4),这与传统的中期染色体纯化方法不同,后者依赖于速度或等密度沉降、区域离心或选择性过滤(5)。纯化单个中期染色体很重要,原因如下。富集或纯染色体部分已进行生化分析,以提供有关 DNA 或蛋白质结构的信息(6),将遗传信息转移到整个细胞(7-9),或通过体外杂交绘制基因图谱(10)。但一般来说,传统技术无法提供足够纯度的染色体,无法进行高分辨率生物或生化研究。通过基于溴化乙锭荧光的流式分选,我们以 90% 的纯度将雄性鹿 Muntiocus muntjak (2n = 7) (4) 的每个染色体和中国仓鼠 M3-1 细胞系的 14 种染色体类型分离成 8 个染色体组 (1, 3)。在我们之前对溴化乙锭染色的人类染色体的研究中,我们仅从雄性 (2n = 46) 的 24 种染色体类型中分辨出 8 个染色体组 (2, 3)。在本研究中,使用 DNA 荧光染料 33258 Hoechst 和改进的仪器,
加入6孔板中并在28°C下孵育2小时(不摇晃)以形成单层。我们制备了8μL Cellfectin II 试剂(Gibco-10362-100)和1μg每种DNA样本,并根据Bac-to-Bac手册提供的指导进行孵育。去除培养基后,将DNA转染试剂复合物逐滴加入6孔板中。将板在28°C下孵育5小时。然后,在从细胞培养板中取出DNA样本后,向每个孔中加入3mL不含抗生素的新鲜培养基进行孵育。每隔24小时观察一次细胞病变效应(CPE)。感染后72-96小时收获P0重组杆状病毒,并进行噬斑测定(Bac-to-Bac手册)以检查滴度。收获P1和P2以增加重组杆状病毒的库存和滴度,用于蛋白质表达。
开始之前要做的事情■将样品平衡到室温(15–25°C)。■将水浴或加热块加热到56°C以供步骤4使用。■在步骤11中平衡缓冲液或蒸馏水到室温。■确保根据第16页的说明准备了缓冲液AW1,Buffer AW2和Qiagen蛋白酶。■如果在缓冲液中形成沉淀物,请在56°C下孵育。
注意6·通过添加能够破坏二硫键键的还原剂(例如ß-甲醇(ß -me)或二硫代硫醇(DTT))的减少剂,从而污染了污染的RNass。为了促进二硫键的还原,使用前,每1 mL缓冲液DRP加入10 µLß -ME。添加ß -ME后,DRP缓冲液保持稳定1个月。使用前,每1 ml缓冲液在使用前,在RNase无rNase无水中添加10 µl [1 m] DTT的毒性但更昂贵的替代品。dtt在缓冲区DRP中不稳定,因此不得存储DTT-供应的DRP缓冲液等分试样。[1 M] DTT储备溶液在RNase无水酶中的工作等分试样必须存储在-20°C下,以保持稳定性。设置[1 M] DTT储备溶液(MW = 154.25 g mol -1),溶解1.54 g DTT每10 ml RNase无rNase无水,并将其存储在等分试样中以进行一次使用。
1.引言水是所有生物生存和发展的最重要资源。与人口的增加同时,对清洁水的需求增加会引起水的稀缺性,并关注世界人口的50%以上。基于最近的发展和变化,人们强调,大约有八分之一的人缺乏安全饮用水的可用性[1]。由于工业快速发展和人类活动的增加,例如使用肥料,农药和杀虫剂,采矿,造纸,金属加工,各种危险的无机污染物和有机污染物被释放到环境中,污染了水并使生态环境危及危险。这些有机污染物降低了水中溶解的氧气的量,危害水生动物和生态系统。因此,必须立即采取行动毫不犹豫地解决环境污染,这威胁了我们的世界和我们的未来[2]。
该方案用于使用Gentra Puregene血液套件纯化10 mL的全血的基因组DNA。在–20°C或在室温下(15–25°C)储存的血液样本超过24小时,或者在2-8°C下持续超过5天,被视为损害。
修改的方案向导®基因组DNA纯化试剂盒的基因组纯化试剂盒通过离心在10ml颗粒2ml中通过离心在13,000 rpm 1以13,000 rpm 1恢复5分钟,在540 µl EDTA中重悬于540 µl的EDTA中,在50 mm,PH 87 µL,pH 30 µl,在10 mg lysozeme中,lysozym/c在10 mL在13,000 rpm丢弃的13,000 rpm处离心3分钟,将沉淀物恢复为600 µl的“核酸溶液”(来自KIT),并在80°C下混合热量5分钟(允许下一步冷却至下一步)加入3 µL RNase(从KIT中)添加3 µL RNase(从KIT中)在37°C下添加200 µL,并加入200 µL(oft of kit)(oft of of kit),并加入200 µL(oft of of of kit)(oft of of Kit)。 ice for 5 min Centrifuge for 3 min at 13,000 rpm TRANSFER supernatant to a 1.5 mL tube Add 600 µL isopropanol at ambient temperature Mix by inverting the tube Centrifuge for 3 min at 13,000 rpm DISCARD the supernatant 2 Add 600 µL of 70% ethanol at ambient temperature Centrifuge for 3 min at 13,000 rpm 3 DISCARD ethanol Dry pellet at 37°C在50-100 µL的水或洗脱缓冲液中重悬于gDNA(套件):如果需要更多的DNA,则每个培养物多个管子以上一个管。这些可以在较小的体积中洗脱,并在洗脱步骤中合并。根据细菌菌株以达到所需的DNA量,提取1至4个颗粒可能是必需的。2 DNA颗粒可能并不总是可见。乙醇洗涤通常会显示出更长的3个离心机,如果白色颗粒保持松动,以促进收集干净的上清液。QC
NucleOmag®质粒程序利用了修饰的碱性裂解方案,并结合了适当的缓冲条件下核酸对顺磁珠的可逆吸附。颗粒细菌被重悬于缓冲液A1中。质粒DNA通过裂解缓冲液A2从细胞中解放出来,然后使用缓冲液S3进行中和和沉淀。粗裂解物可以通过离心或使用NucleOmag®清除珠(用于裂解液清除的专门的顺磁珠)清除。用于将核酸与顺磁珠,结合缓冲液和核瘤®M珠结合的结合添加到清除的裂解物中。磁分离后,通过获得专利的排毒缓冲液ERB去除内毒素和蛋白质。用洗涤缓冲液和空气干燥除去盐或残留乙醇等进一步的污染物。纯质粒DNA用低盐洗脱缓冲液或水洗脱,并准备好用于任何常见的下游应用(包括转染)(仅研究)。核对®质粒试剂盒已设计用于自动磁杆系统。
高质量DNA的纯化对于剪切和剪切和标记测定至关重要。与使用自旋柱纯化DNA的许多套件不同,Cutana™快速清理DNA纯化套件采用基于Spri珠的纯化策略。在这种方法中,以特定比率添加了Spri珠,以同时选择靶DNA的大小选择和纯化。更高的珠子:DNA比捕获了不同长度的DNA片段,而较低的比率优先恢复了更长的片段。值得注意的是,这些顺磁珠与8条管兼容,可以在Cutana剪切和运行和切割和标记工作流程中精简积分。