“这项研究的动机是量化纯种马的遗传变异和近亲繁殖程度,”马丁-加顿 CAFE 的马克斯韦尔 H. 格鲁克马研究中心教授、这项研究的主要作者欧内斯特·贝利说。“通过识别趋势,我们为饲养者提供了必要的数据,使他们能够做出明智的选择,保护品种的健康和性能。”
- 马: 0101.21 0101.21.00 00 3 - - 纯种种畜 u 零 0101.29 0101.29.00 00 0 - - 其他 u 零 0101.30 - 驴: 0101.30.10 00 3 - - 纯种种畜 u 零 0101.30.90 00 2 - - 其他 u 零 0101.90 0101.90.00 00 6 - 其他 u 零 01.02 活牛科动物。- 牛: 0102.21 0102.21.00 00 4 - - 纯种种畜 u 零 0102.29 - - 其他: - - - 公牛: 0102.29.11 00 2 - - - - 公牛 u 零 0102.29.19 00 4 - - - - 其他 u 零 0102.29.90 00 6 - - - 其他 u 零 - 水牛: 0102.31 0102.31.00 00 2 - - 纯种种畜 u 零 0102.39 0102.39.00 00 6 - - 其他 u 零 0102.90 - 其他: 0102.90.10 00 6 - - 纯种种畜 u零 0102.90.90 00 5 - - 其他 u 零 01.03 活猪。0103.10 0103.10.00 00 3 - 纯种种畜 u 零 - 其他: 0103.91 0103.91.00 00 5 - - 体重不足50公斤 u 10 0103.92 0103.92.00 00 2 - - 体重50公斤及以上 u 10 01.04 活绵羊和山羊。0104.10 - 绵羊: 0104.10.10 00 3 - - 纯种种畜 u 零 0104.10.90 00 2 - - 其他 u 零 0104.20 - 山羊: 0104.20.10 00 1 - - 纯种种畜 u 零 0104.20.90 00 0 - - 其他 u 零
- 马: 0101.21 0101.21.00 00 3 - - 纯种种畜 u 零 0101.29 0101.29.00 00 0 - - 其他 u 零 0101.30 - 驴: 0101.30.10 00 3 - - 纯种种畜 u 零 0101.30.90 00 2 - - 其他 u 零 0101.90 0101.90.00 00 6 - 其他 u 零 01.02 活牛科动物。 - 牛: 0102.21 0102.21.00 00 4 - - 纯种种畜 u 零 0102.29 - - 其他: - - - 公牛: 0102.29.11 00 2 - - - - 公牛 u 零 0102.29.19 00 4 - - - - 其他 u 零 0102.29.90 00 6 - - - 其他 u 零 - 水牛: 0102.31 0102.31.00 00 2 - - 纯种种畜 u 零 0102.39 0102.39.00 00 6 - - 其他 u 零 0102.90 - 其他: 0102.90.10 00 6 - - 纯种种畜 u 零0102.90.90 00 5 -- - 其他 u 零 01.03 活猪。 0103.10 0103.10.00 00 3 - 纯种种畜 u 零 - 其他: 0103.91 0103.91.00 00 5 -- - 体重少于 50 千克 u 10 0103.92 0103.92.00 00 2 -- - 体重为 50 千克或以上 u 10 01.04 活绵羊和山羊。 0104.10 - 绵羊: 0104.10.10 00 3 - - 纯种种畜 u 零 0104.10.90 00 2 - - 其他 u 零 0104.20 - 山羊: 0104.20.10 00 1 - - 纯种种畜 u 零 0104.20.90 00 0 - - 其他 u 零
- 马: 0101.21 0101.21.00 00 3 - - 纯种种畜 u 零 0101.29 0101.29.00 00 0 - - 其他 u 零 0101.30 - 驴: 0101.30.10 00 3 - - 纯种种畜 u 零 0101.30.90 00 2 - - 其他 u 零 0101.90 0101.90.00 00 6 - 其他 u 零 01.02 活牛科动物。 - 牛: 0102.21 0102.21.00 00 4 - - 纯种种畜 u 零 0102.29 - - 其他: - - - 公牛: 0102.29.11 00 2 - - - - 公牛 u 零 0102.29.19 00 4 - - - - 其他 u 零 0102.29.90 00 6 - - - 其他 u 零 - 水牛: 0102.31 0102.31.00 00 2 - - 纯种种畜 u 零 0102.39 0102.39.00 00 6 - - 其他 u 零 0102.90 - 其他: 0102.90.10 00 6 - - 纯种种畜 u 零0102.90.90 00 5 -- - 其他 u 零 01.03 活猪。 0103.10 0103.10.00 00 3 - 纯种种畜 u 零 - 其他: 0103.91 0103.91.00 00 5 -- - 体重少于 50 千克 u 10 0103.92 0103.92.00 00 2 -- - 体重为 50 千克或以上 u 10 01.04 活绵羊和山羊。 0104.10 - 绵羊: 0104.10.10 00 3 - - 纯种种畜 u 零 0104.10.90 00 2 - - 其他 u 零 0104.20 - 山羊: 0104.20.10 00 1 - - 纯种种畜 u 零 0104.20.90 00 0 - - 其他 u 零
- 马: 0101.21 0101.21.00 00 3 - - 纯种种畜 u 零 0101.29 0101.29.00 00 0 - - 其他 u 零 0101.30 - 驴: 0101.30.10 00 3 - - 纯种种畜 u 零 0101.30.90 00 2 - - 其他 u 零 0101.90 0101.90.00 00 6 - 其他 u 零 01.02 活牛科动物。 - 牛: 0102.21 0102.21.00 00 4 - - 纯种种畜 u 零 0102.29 - - 其他: - - - 公牛: 0102.29.11 00 2 - - - - 公牛 u 零 0102.29.19 00 4 - - - - 其他 u 零 0102.29.90 00 6 - - - 其他 u 零 - 水牛: 0102.31 0102.31.00 00 2 - - 纯种种畜 u 零 0102.39 0102.39.00 00 6 - - 其他 u 零 0102.90 - 其他: 0102.90.10 00 6 - - 纯种种畜 u 零0102.90.90 00 5 -- - 其他 u 零 01.03 活猪。 0103.10 0103.10.00 00 3 - 纯种种畜 u 零 - 其他: 0103.91 0103.91.00 00 5 -- - 体重少于 50 千克 u 10 0103.92 0103.92.00 00 2 -- - 体重为 50 千克或以上 u 10 01.04 活绵羊和山羊。 0104.10 - 绵羊: 0104.10.10 00 3 - - 纯种种畜 u 零 0104.10.90 00 2 - - 其他 u 零 0104.20 - 山羊: 0104.20.10 00 1 - - 纯种种畜 u 零 0104.20.90 00 0 - - 其他 u 零
- 鲱鱼 ( Clupea harengus, Clupea pallasii ), 凤尾鱼 ( Engraulis spp .), 沙丁鱼 (Sardina pilchardus, Sardinops spp .), 沙丁鱼 ( Sardinella spp .), brisling or sprattus ( Sprattus sprattus ), 鲭鱼 ( Scomber scombrus , Scomber australasicus , Scomber japonicus ), 印度鲭鱼 ( Rastrelliger spp .), 锯鱼 ( Scomberomorus spp .), 竹荚鱼和竹荚鱼 ( Trachurus spp .), jacks, crevalles ( Caranx spp .)、军曹鱼 ( Rachycentron canadum )、银鲳 ( Pampus spp .、秋刀鱼 ( Cololabis saira )、鲹 ( Decapterus spp .)、毛鳞鱼 ( Mallotus villosus )、剑鱼 ( Xiphias gladius )、卡瓦卡瓦鱼 ( Euthynnus affinis )、鲣鱼 ( Sarda spp .)、马林鱼、旗鱼、旗鱼 ( Istiophoridae ),不包括子目 0302.91 的可食用鱼内脏至 0302.99:
- 鲱鱼(Clupea harengus、Clupea pallasii)、凤尾鱼(Engraulis spp.)、沙丁鱼(Sardina pilchardus、Sardinops spp.)、小沙丁鱼(Sardinella spp.)、鲂或鲱鱼(Sprattus sprattus)、鲭鱼(Scomber scombrus、Scomber australasicus、Scomber japonicus)、印度鲭鱼(Rastrelliger spp.)、鲹鱼(Scomberomorus spp.)、鲭鱼和竹荚鱼(Trachurus spp.)、鲹、鲹( Caranx spp.)、军曹鱼 (Rachycentron canadum)、银鲳 (Pampus spp.)、秋刀鱼 (Cololabis saira)、鲹 (Decapterus spp.)、毛鳞鱼 (Mallotus villosus)、剑鱼 (Xiphias gladius)、卡瓦卡瓦鱼 (Euthynnus affinis)、鲣鱼 (Sarda spp.)、枪鱼、旗鱼、旗鱼 (Istiophoridae),但不包括子目 0302.91 至 0302.99 的可食用鱼内脏:
“我们已经重新启动了Purvis植物,但是鉴于缺乏电力和洪水,可能需要几天的时间,直到我们可以安全地完成损害评估,制定计划重新启动的计划,并确定暂时关闭的设施,并确定飓风的运作能力,” Rain Carbon Carbon Gerry Gerry Gerry Sweeney说:”“这包括向客户提供产品以及购买原材料,因为我们了解到至少有两个主要的炼油厂供应商可能受到了重大影响。”
摘要背景:合适的测序策略与填补方法的结合对于从牲畜种群中收集用于研究和育种的大型全基因组序列数据集至关重要。在本文中,我们描述并验证了测序策略与填补方法混合剥离在真实动物育种环境中的结合。方法:我们使用了四个不同规模的猪种群的数据(18,349 到 107,815 头猪),这些猪种群的基因分型广泛,全基因组标记密度在 15,000 到 75,000 个之间。每个种群中大约有 2% 的个体进行了测序(大多数为 1 × 或 2 ×,每个种群有 37–92 个个体,总计 284 个,为 15–30 × )。我们使用混合剥离技术填补了全基因组序列数据。我们使用留一法设计,通过删除覆盖率高的 284 个个体的序列数据来评估填补准确性。我们模拟了模仿真实人群中使用的测序策略的数据,以使用回归树量化影响个体和变异插补准确性的因素。结果:四个人群中大多数个体的插补准确性都很高(个体剂量相关性中位数:0.97)。由于缺乏自身和祖先的标记阵列数据,每个人群最早几代个体的插补准确性低于其他人群。决定个体插补准确性的主要因素是基因分型状态、直系祖先的标记阵列数据的可用性以及与其他人群的关联程度,但亲属的测序覆盖率没有影响。决定变异插补准确性的主要因素是次要等位基因频率和每个变异位点具有测序覆盖的个体数量。通过实证观察验证了结果。结论:我们证明,将适当的测序策略与混合剥离相结合是一种强大的策略,可以在大型谱系群体中生成高精度的全基因组序列数据,其中只有一小部分个体(2%)进行了测序,而且大部分覆盖率较低。这是成功实施全基因组序列数据进行基因组预测和精细定位因果变异的关键步骤。
195 0302.73.00 - - 鲤鱼(鲤鱼属、鲫鱼属、草鱼属、鲫鱼属、卷鱼属、青鱼属、喀拉鱼属、鲫鱼属、哈氏骨鱼、鲂鱼属、鲂鱼属) )