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隐杆线虫和其他线虫内胚层基因调控网络的进化和发育系统漂移
发育基因调控网络 (GRN) 是后生动物胚胎发生的基础，经历了重大修改，形成了当今地球上种类繁多的动物形态。线虫秀丽隐杆线虫一直是推动基础机械生物学许多重要发现的核心模型，最近，它为探索 GRN 结构的进化多样化和其他物种的发育过程提供了坚实的基础。在这篇简短的综述中，我们将重点关注最古老的胚胎胚层内胚层的 GRN 进化多样化。早期胚胎发生在线虫门中存在很大差异。值得注意的是，虽然一些物种部署了调控发育，但更衍生的物种，如秀丽隐杆线虫，则表现出胚胎发生的马赛克模式。尽管不同物种的线虫肠道形态相对相似，但已观察到启动内胚层 GRN 的信号输入存在广泛差异，这是发育系统漂移 (DSD) 的一个典型。我们将探索内胚层 GRN 的遗传变异如何帮助在物种间和物种内推动 DSD，从而形成强大的发育系统。使用不同线虫进行比较研究有望揭示控制发育可塑性的遗传机制，并为控制胚胎 GRN 进化修饰的原理提供范例。
通过...对植物寄生线虫进行生物防治
作者：J Poveda · 2020 · 被引用 409 次 — 植物还具有一系列天生的防御策略，可以有针对性地保护自己免受害虫和病原体的攻击。一旦攻击...
社论：nemophagous真菌作为线虫控制剂
不适当和过度使用化学物质会对一种健康产生几种负面影响。因此，对害虫控制替代措施的研究是紧迫而必要的。此外，联合国2030年议程强调了实现粮食安全和促进可持续农业的目标。因此，使用生物控制是非常必要的。在这种情况下，使用真菌的微生物控制突出。一些特定的真菌是线虫的天然敌人，因为真菌消耗了线虫。这些食肉真菌被称为黑凝真菌（NF）。nf几乎存在于真菌王国的几乎所有分类群中，可以分为五个群体：线虫捕获/捕食者，机会主义或卵巢群，内寄生虫，产生毒素的真菌，以及特殊攻击设备的生产者（Soares等人，2018年）。这些微生物具有生物技术利益，超出了生物控制。此外，突出了这些酶和纳米颗粒的产生，这些酶和纳米颗粒的生产得到了强调，这些生物被强调了核苷酸活性（Barbosa等，2019； Soares等，2023）。因此，在这个研究主题中，Al-Ani等人。回顾了NF在生物技术和可持续农业中的作用。根据影响线虫的机制，他们将NF分为两种类型：直接（载植物，内寄生虫，囊肿或产生毒素的卵寄生虫，以及特殊攻击装置的生产者）或非导向效应（瘫痪的毒素，影响Nematodes的生命周期）。这种机会性真菌具有在壳聚糖作为其唯一营养来源的能力。此外，作者讨论了NF关于NF对环境的适应及其对线虫的作用的一些分子机制。是最突出的NF产品之一，并且在控制感兴趣的植物寄生线虫的研究中是Pochonia chlamydosporia。壳聚糖是由几丁质的N-二乙基形式产生的多糖。此外，它在控制植物有害生物和疾病方面有效。在这个研究主题中，Lopez-Nuñes等。讨论了白疟原虫在植物上执行的有益内生作用，以及壳聚糖和黑凝真菌的联合使用如何成为对线虫和其他根病原体生物学控制的新型策略。
细菌和真菌对植物寄生线虫的生物防治
植物寄生线虫 (PPN) 对全球作物产量构成重大威胁，估计每年造成农业损失 1570 亿美元。虽然合成化学杀线虫剂可以有效控制 PPN，但过度使用会对人类健康和环境造成不利影响。生物防治剂 (BCA)，例如根际细菌和真菌，是安全且有前景的 PPN 控制替代方案。这些 BCA 与植物根系相互作用，产生胞外酶、次生代谢产物、毒素和挥发性有机化合物 (VOC) 来抑制线虫。植物根系分泌物在吸引有益微生物进入受侵染的根系方面也发挥着至关重要的作用。植物与根际微生物之间对抗 PPN 的复杂相互作用大多尚未开发，这为通过多组学技术发现新型杀线虫剂开辟了新途径。先进的组学方法，包括宏基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学，已促成杀线虫化合物的发现。本综述总结了细菌和真菌生物防治策略的现状及其对线虫病（PPN）的控制机制。此外，还探讨了基于组学的方法对于探索新型杀线虫剂的重要性，以及PPN生物防治的未来发展方向。本综述强调了多组学技术在PPN生物防治中的潜在重要性，以确保可持续农业。
真菌，原生动物和线虫在土壤中的重要性...
关于土壤中微生物寿命的讨论通常集中在细菌和较小程度的放线菌（一组专业的厌氧菌细菌）上。这部分是由于在土壤中发现的细菌和放线菌的种群通常比所有其他微生物寿命都大，其次是由于对有益细菌的广泛了解可以添加到农作物系统中。经常被排除在讨论之外的是其他微生物，例如真菌，原生动物和线虫，它们在土壤健康中都具有关键作用。虽然在英亩的犁沟中发现的真菌，原生动物和线虫（6英寸深度x 1英亩）被细菌和放线菌在种群中矮小，它们对土壤的微生物生物量比较大的种群贡献更多（表1）。虽然土壤应用的农产品添加真菌，原生动物和线虫很少见，但重要的是要了解这些微生物物种在植物营养和土壤健康中的重要性。
寄生线虫蛔虫的程序性 DNA 消除
在大多数生物中，整个基因组在整个生命周期中都保持不变。然而，也有一些物种例外，它们的基因组在发育过程中会通过一种称为程序性 DNA 消除 (PDE) 的过程减少。在人类和猪的寄生虫蛔虫中，PDE 发生在胚胎发生的 4 到 16 个细胞阶段，此时生殖系染色体碎裂，特定 DNA 序列在所有体细胞中可重复丢失。PDE 是在 120 多年前在蛔虫中发现的，但直到最近人们才对其分子细节知之甚少。基因组测序显示，蛔虫中大约 1,000 个生殖系表达基因被消除，这表明 PDE 是一种基因沉默机制。在 PDE 期间，所有生殖系染色体末端都会被去除和重塑。此外，PDE 通过分裂许多生殖系染色体来增加体细胞基因组中的染色体数量。比较基因组学表明这些生殖系染色体源自融合事件。PDE 在融合位点将这些染色体分开。这些观察结果表明 PDE 在染色体核型和进化中发挥作用。此外，对其他寄生和自由生活线虫中 PDE 的比较分析表明 PDE 具有保守的特征，表明它具有重要的生物学意义。我们总结了关于蛔虫及其亲属中 PDE 的已知信息。我们还讨论了这些人类和兽医动物寄生虫中 PDE 的其他潜在功能、机制和进化。
MicroRNA 在旧线虫中的新作用
使用秀丽隐杆线虫作为衰老研究的模型生物对于我们了解该过程中涉及的基因和通路至关重要。几种响应胰岛素信号、饮食和蛋白质稳态攻击的保存良好的信号通路在控制寿命方面发挥着明确的作用。新的证据表明微小 RNA (miRNA) 在调节这些通路方面发挥着重要作用。在某些情况下，关键的衰老相关基因已被确定为特定 miRNA 的直接靶标。然而，其他 miRNA 及其蛋白质辅因子在促进或拮抗长寿方面的确切功能仍需确定。在这里，我们重点介绍了最近发现的 miRNA 在常见衰老通路中的作用，以及正在研究的用于在衰老秀丽隐杆线虫中发现 miRNA 功能的新技术。
细菌和真菌的植物寄生线虫生物防治
CD20抗原是一种跨膜蛋白，以前被描述为存在于广泛的正常和肿瘤B细胞上的PAN-B细胞标记。还发现了一小部分CD3+ T细胞表达CD20，这是Hultin等人首次报道的。在健康的外周血中（1）。Algino等。急性淋巴细胞白血病（ALL）和慢性淋巴细胞性白血病（CLL）（2）患者的T细胞识别CD20（2）。 后一个报告显示，在某些偶尔的T细胞肿瘤病例中，CD20在T细胞上以异常现象出现（3，4）。 在类风湿关节炎患者中也可以看到T细胞上的 CD20，但发现这被认为是流动细胞仪（FCM）的伪像（5）。 Schuh等。 （6）在胸腺，骨髓和继发性淋巴器官中描述了它们，并且在多发性硬化症患者中也发现了它们在脑脊液中发现它们。 de Bruyn等。 （7）将它们描述为腹膜腹水流体中的TC1效应子记忆T细胞，患有卵巢癌患者。 关于CD20+ T细胞的起源，出现了以下假设。 根据假设，T细胞上的CD20分子是血液样本的离体储存的结果，该血样导致T-和B细胞之间的抗原交换（8）。 另一种方法是T细胞上的CD20表达是特定受体细胞介导的过程，称为trogococytosis或“剃须反应”。 在这种分子重组中 - 也称为“免疫突触 - ” T细胞可以从抗原呈递细胞中提取CD20，最终将其呈现在自己的表面上（7，9）。急性淋巴细胞白血病（ALL）和慢性淋巴细胞性白血病（CLL）（2）患者的T细胞识别CD20（2）。后一个报告显示，在某些偶尔的T细胞肿瘤病例中，CD20在T细胞上以异常现象出现（3，4）。CD20，但发现这被认为是流动细胞仪（FCM）的伪像（5）。Schuh等。（6）在胸腺，骨髓和继发性淋巴器官中描述了它们，并且在多发性硬化症患者中也发现了它们在脑脊液中发现它们。de Bruyn等。（7）将它们描述为腹膜腹水流体中的TC1效应子记忆T细胞，患有卵巢癌患者。关于CD20+ T细胞的起源，出现了以下假设。根据假设，T细胞上的CD20分子是血液样本的离体储存的结果，该血样导致T-和B细胞之间的抗原交换（8）。另一种方法是T细胞上的CD20表达是特定受体细胞介导的过程，称为trogococytosis或“剃须反应”。在这种分子重组中 - 也称为“免疫突触 - ” T细胞可以从抗原呈递细胞中提取CD20，最终将其呈现在自己的表面上（7，9）。相反，Schuh等人。（6）旨在澄清这些问题，因此在CD3+/CD19-/CD20+，CD3+/CD19-/CD20- T-Cells和CD3-/CD19+/CD20+/B细胞上进行了细胞分类实验，从健康个体的外围血液中进行了pcr，并在每个种群上都在其量度上均可在每个人群中进行量子。如所述，CD3+ CD19-CD20+细胞本身转录CD20。在我们关于血液恶性肿瘤的诊断工作期间，我们注意到骨髓增生综合征（MDS），MGUS和MM患者的CD20+ T细胞百分比升高。因此，在诊断MM样品中观察到最高比例，在某些情况下，这些细胞的比例在淋巴细胞中达到30-35％。将这些数据与对照骨髓比进行比较时，我们测量了
关于土壤线虫生物多样性的简短审查
线虫以四个主要的方式增强了土壤条件，它们消耗了引起疾病的生物，产生植物可以使用的矿物质，并以其他各种土壤生物为食。线虫表明，比许多其他物种对气候引起的困扰进行了更大的修改，这表明线虫的分布和种群增加并保持相对升高，因为人们朝向急性环境。由于许多其他物种的同化，土壤线虫，主要被认为是相对多学科的，因此在热带低地雨林中表现出少量和主要可忽略的丰度。可能会以令人恐惧的色调听到线虫的参与。一眼微小的微观蠕虫可能会使人的强大人类更加强大。遗憾的是，就像世界上无数的东西一样，整个蒲式耳都被几个“消极”所污染。尽管它们仅少于整个线虫人口密度的百分之一，但由于其对农作物的有害影响，其中只有一小部分吸引了大量关注。很大一部分人在生态系统，农业部门，尤其是土壤的福祉中都具有优势。
CRISPR-CAS9基因组编辑在steinernema昆虫病毒线虫
。CC-BY-NC 4.0国际许可证的永久性。根据作者/资助人提供了预印本（未经同行评审证明）提供的，他已授予Biorxiv的许可证，以在2023年11月17日发布的此版本中在版权所有者中显示预印本。 https://doi.org/10.1101/2022.05.16.492029 doi：Biorxiv Preprint