核孔(NUPS)组装核孔,形成核质和细胞质之间的渗透屏障。核苷也位于胞质灶中,提议充当孔隙组装中间体。在这里,我们表征了完整动物秀丽隐杆线虫中细胞质NUP灶的组成和发生率。我们发现,在年轻的非压力动物中,NUP灶仅出现在发育的精子,卵母细胞和胚胎,表达高水平核孔蛋白的组织。焦点是高度有粘性FG重复核苷(FG-Nups)的冷凝物,它们通过翻译后修饰和伴侣活性在细胞质中的溶解度极限接近其溶解度极限。只有一小部分FG-NUP分子集中在NUP灶中,后者在M期溶解,并且对于核孔组装而言是可分配的。核孔蛋白的凝结通过压力和增长而增强,并且在后有丝分裂神经元中单个FG-NUP的过表达足以诱导异位凝结和生物麻痹。我们推测NUP焦点是非必需的且潜在的毒性冷凝物,其组装在健康细胞中被积极抑制。
经过数十年的研究,我们对癌症机制的复杂性的了解(优雅地总结为“癌症的标志”)正在扩大,这种知识带来的治疗机会也在扩大。然而,癌症仍然需要深入研究以减少其巨大影响。在这种情况下,使用简单的模型生物(例如秀丽隐杆线虫),其中发现了凋亡途径的遗传学,可以促进对几种癌症标志的研究。可用于遗传和药物筛查,方便快速有效的基因组编辑,并与伦理动物研究的3RS(“替代,减少和改进”)原理保持一致,秀丽隐杆线虫在揭示癌症机制的复杂网络中起着重要的作用,并在癌症机制中提出了有希望的选择。
图5。TARDIS启动子库。a)概述两个分裂的着陆垫及其相关的启动子插入向量。正确整合后,选择性标记和荧光团表达都会恢复。b)从单个TARDIS阵列线的单个热轴(PX819)中回收了9个基因的转录记者。集成到单个McSarlet-I /Hygr着陆垫中。主图像显示了指定的报告基因的MSCARLET-I表达,而插图显示同一区域的极化图像。c)示例同时,从单个TARDIS阵列中的双重整合到带有害虫的双降落垫菌株中。ceh-10p :: mneongreen :: pest是假彩色绿色和ceh-40p :: mcarlet-i :: pest是假彩色的洋红色。所有比例尺均代表20µm
寄生线虫对人类和动物的健康构成了重大威胁,并在农业部门造成经济损失。使用驱虫药物(例如伊维菌素(IVM))来控制这些寄生虫的使用导致了广泛的耐药性。识别寄生线虫中抗药性的遗传标记可能具有挑战性,但是秀丽隐杆线虫的自由生活的Nema-Tode Caenorhabditis提供了合适的模型。在这项研究中,我们旨在分析成人c的转录组。秀丽隐杆线虫蠕虫暴露于驱虫药伊维菌素(IVM)的N2菌株,并将其与抗性菌株DA1316和最近确定的杀伤蛋白定量性状基因座(QTL)进行比较。 RNA并在Illumina NovaseQ6000平台上对其进行了排序。使用内部管道确定差异表达的基因(DEG)。将DEG与先前关于IVM抗性c的微阵列研究的基因进行了比较。秀丽隐杆线虫和Abamectin-QTL。我们的结果显示,N2 c中不同基因家族的615摄氏度(183个上调和432个下调基因)。秀丽隐杆线伤。31与DA1316菌株的IVM成年蠕虫的基因重叠。我们确定了19个基因,包括叶酸转运蛋白(Folt-2)和跨膜转运蛋白(T22F3。11),在N2和DA1316菌株中表现出相反的表达,被认为是潜在的候选物。此外,我们编制了进一步研究的潜在候选列表,包括T型钙通道(CCA-1),氯化钾共转运蛋白(KCC-2),以及其他映射到Abamectin-QTL的基因,例如谷氨酸门控通道(GLC-1)。
在不同遗传背景中的遗传扰动会导致物种内的一系列表型。这些表型差异可能是遗传背景与扰动之间相互作用的结果。以前,我们报道说,秀丽隐杆线虫发育控制的重要参与者GLD-1的扰动释放了影响不同遗传背景的适应性的隐性遗传变异(CGV)。在这里,我们研究了转录体系结构的变化。我们发现了414个基因,具有顺式表达定量性状基因座(EQTL)和991个基因,具有跨eqTL,这些基因在GLD-1 RNAI处理中特异性发现。总共检测到16个EQTL热点,其中7个仅在GLD-1 RNAi处理中发现。对这7个热点的富集分析表明,受调节的基因与神经元和咽部有关。 此外,我们在GLD-1 RNAi处理的线虫中发现了加速的Tran术语衰老的证据。 总体而言,我们的结果表明,研究CGV会导致发现隐藏的多态性调节剂。对这7个热点的富集分析表明,受调节的基因与神经元和咽部有关。此外,我们在GLD-1 RNAi处理的线虫中发现了加速的Tran术语衰老的证据。总体而言,我们的结果表明,研究CGV会导致发现隐藏的多态性调节剂。
阿尔茨海默氏症、帕金森氏症和亨廷顿氏病可能是由增强蛋白质聚集的突变引起的,但是我们对这些途径的分子参与者的了解还不够,无法开发出治疗这些毁灭性疾病的方法。在这里,我们筛选可能增强秀丽隐杆线虫聚集的突变,以研究防止失调稳态的机制。我们报告说,气孔素同源物 UNC-1 激活 ASJ 感觉/内分泌神经元中磺基转移酶 SSU-1 的神经激素信号传导。ASJ 中产生的一种假定激素靶向核受体 NHR-1,后者在肌肉中自主作用于细胞,调节多聚谷氨酰胺重复 (polyQ) 聚集。第二个核受体 DAF-12 起着与 NHR-1 相反的作用,以维持蛋白质稳态。 unc- 1突变体的转录组学分析揭示了参与脂肪代谢的基因表达的变化,这表明由神经激素信号传导控制的脂肪代谢变化有助于蛋白质稳态的维持。此外,参与已鉴定信号通路的酶是治疗由蛋白质稳态破坏引起的神经退行性疾病的潜在靶点。
摘要:乳酸细菌(LAB)共享并对人类健康提供了几种有益的影响,例如生物活性代谢产物的释放,病原体竞争和免疫刺激。益生菌微生物的两个主要储层是人类胃肠道和发酵乳制品。但是,由于其较大的分布和营养价值,其他来源(例如植物性食品)代表了重要的替代品。在这里,通过体外和体内方法研究了自plastiblantibacillus plantarum plantarum plantarum plantarum plantarum plantarum plantarum partarum plantarum plantarum plantarum plantarum planarum plantarum plantarum Pfa2018au,它是从富西诺高地(Fucino Highland)(意大利)(意大利)收获的胡萝卜中分离出来的。菌株被送往意大利的iStituto Zoopro fintico sperimentale della lombardia emilia romagna,目的是根据《布达佩斯条约》下的专利程序。在体外模拟的胃肠道条件下,分离株显示出很高的生存能力,抗生素易感性,疏水性,聚集以及抑制肠道肠内鼠伤寒沙门氏菌的体外生长的能力Caenorhabditis秀丽隐杆线虫被用作体内模型,以分析促进性和抗衰老效应。L. plantarum pfa2018au显着殖民了蠕虫的肠道,延长了其寿命并刺激了他们的先天免疫力。总体而言,这些结果表明,来自蔬菜的自毒实验室(例如胡萝卜)具有可以视为新型益生菌候选物的功能特征。
抽象的Argonaute(AGO)蛋白与小RNA相关,以指导其效应子在互补的转录本上。线虫秀丽隐杆线虫含有扩展的19个功能AGO蛋白质,其中许多尚未充分表征。在这项工作中,我们使用CRISPR-CAS9基因组编辑进行系统地分析了每一个秀丽隐杆线虫,以介绍GFP :: 3xflag标签。我们已经表征了整个发育过程中AGO的表达模式,鉴定了小的RNA结合补充,并确定了AGO丢失对小RNA种群和发育表型的影响。我们的分析表明将AGO的亚集分层分为不同的调节模块,并且数据的整合使我们发现了由于AGO损失而导致的新型应激诱导的生育能力和病原体反应表型。
关于土壤中微生物寿命的讨论通常集中在细菌和较小程度的放线菌(一组专业的厌氧菌细菌)上。这部分是由于在土壤中发现的细菌和放线菌的种群通常比所有其他微生物寿命都大,其次是由于对有益细菌的广泛了解可以添加到农作物系统中。经常被排除在讨论之外的是其他微生物,例如真菌,原生动物和线虫,它们在土壤健康中都具有关键作用。虽然在英亩的犁沟中发现的真菌,原生动物和线虫(6英寸深度x 1英亩)被细菌和放线菌在种群中矮小,它们对土壤的微生物生物量比较大的种群贡献更多(表1)。虽然土壤应用的农产品添加真菌,原生动物和线虫很少见,但重要的是要了解这些微生物物种在植物营养和土壤健康中的重要性。
oybean囊性线虫(SCN)是大豆的最高产量害虫,在受感染的田间,每英亩最多可将产量降低5蒲式耳。估计在过去的25年中,SCN的收益率损失了超过270亿美元的大豆种植者,并且每年继续将美国的种植者抢走超过10亿美元。1由于改善的大豆遗传学和管理而增加的产量增加可能掩盖了随着时间的推移,SCN的收益率损失的真实程度。