长度至少为 1 千碱基 (kb) 且重复序列同一性超过 90% 的 DNA 旁系同源物被归类为低拷贝重复 (LCR) 或片段重复 (SD)。它们占基因组的 6.6%,聚集在特定的基因组位点上。由于这些重复区域之间的序列同源性很高,它们可能在减数分裂期间错位,导致非等位基因同源重组 (NAHR),并导致结构变异,例如缺失、重复、倒位和易位。当此类重排导致临床表型时,它们被归类为基因组疾病。较大基因组片段的多个副本的存在为进化提供了机会。首先,人类谱系中新基因的产生将导致人类特有的特征和适应性。其次,人类群体之间的 LCR 变异可能导致表型变异。因此,与 LCR 相关的重排倾向应该在进化优势的背景下进行解释。
大型丝氨酸重组酶 (LSR) 是一种 DNA 整合酶,可促进移动遗传元件在细菌基因组中的位点特异性整合。迄今为止,只有少数 LSR(如 Bxb1 和 PhiC31)被鉴定,作为人类细胞中 DNA 整合的工具,其效率有限。在这项研究中,我们开发了一种计算方法来识别数千个 LSR 及其 DNA 附着位点,将已知的 LSR 多样性扩大了 100 倍以上,并能够预测它们的插入位点特异性。我们在人类细胞中测试了它们的重组活性,将它们归类为着陆垫、基因组靶向或多靶向 LSR。总体而言,我们实现了比 Bxb1 高出七倍的重组率,基因组整合效率为 40-75%,货物大小超过 7 kb。我们还展示了无病毒的质粒或扩增子文库的直接整合,以改进功能基因组学应用。这种直接从微生物测序数据中系统地发现重组酶的做法,提供了超过 60 种在人体细胞中经过实验表征的 LSR 资源,可用于大负载基因组插入,且不会暴露 DNA 双链断裂。
宋逸游毕业于西交利物浦大学,获理学学士学位,现为利物浦大学计算机系博士生,研究方向为生物信息学和深度学习。王悦毕业于西交利物浦大学,获理学学士学位,现为利物浦大学计算机系博士生,研究方向为生物信息学、生物统计学和数据挖掘。王宣毕业于西交利物浦大学,获理学学士学位,现为西交利物浦大学生物科学系硕士生,研究方向为生物信息学和数据库。黄岱云毕业于利物浦大学,获博士学位,现为西交利物浦大学药学院研究助理,研究方向为深度学习、生物信息学和计算生物学。阮安是利物浦大学计算机科学系助理教授。他的研究领域为医学成像、医疗机器人和深度学习。孟佳是西交利物浦大学生物科学系的教授。他的工作重点是表观转录组、生物信息学和计算生物学。
如果对这些疾病的无意或不可避免的偏差发生,则应隔离上述条件以外的疫苗,并评估风险,以适合持续标签外使用或适当处置。请参阅疫苗事件指南。Menveo®和Nimenrix®重组后,应立即使用该疫苗。但是,重建后的稳定性已在25°C以下8小时(Nimenrix®低于30°C)。丢弃在8小时内未使用的任何重构疫苗。menquadfi®稳定性数据表明,暴露于25°C的温度后,该疫苗最多可使用72小时。
•浴室和东北萨默塞特郡,史云顿和威尔特郡•布里斯托尔,北萨默塞特郡和南格洛斯特郡•康沃尔郡和斯科利岛•德文郡•德文郡•多塞特郡•格洛斯特郡•格洛斯特郡•格洛斯特郡•萨默塞特郡的委托限制了该授权的授权(PGD)仅由登记式医疗界命名为医疗实践者,只有在识别的实践中,只有在识别的实践者中使用了3章。必须使用NHS英格兰授权的最新最新版本 - 西南必须使用。该PGD包括在国家免疫计划中对个体的疫苗接种。该PGD的用户应注意,在委托某些小组免疫的地方,该PGD不构成允许的许可,即超出他们被委托进行免疫的群体之外的免疫接种。
抽象背景和目的:为了提高对炎症性肠道疾病[IBD]病理生理的理解,我们比较了新发育小儿IBD患者与症状性非IBD对照中的粘膜和血浆代谢组,以及相关的等离子体炎症标记和疾病特征与改变的代理。方法:来自67名未经治疗的儿童患有Crohn病的儿童成对的结肠和回肠活检和血浆[CD; n = 47],溃疡性结肠炎[UC; n = 9],并使用超表现液相色谱 - 质谱法[UPLC-MS/ MS]分析了非IBD对照[n = 11]。评估炎性血浆蛋白[n = 92]。 结果:IBD患者和对照组之间发炎的粘膜活检中的代谢组有所不同。 在CD中,几种溶物磷脂的粘膜水平[溶血磷脂酰胆碱,溶物磷脂酰脊髓胺,溶血磷脂酰肌醇和溶物磷脂酰甲酯酶]降低,与包括各种质量代谢物的氨基化代谢物和N -N -N -N -N--核酸盐和n -N -aceconsylsylsylsynylsylsyclsylsycysyclsys降低。 在CD和UC中,粘膜鞘脂,包括神经酰胺[D18:2/24:1,D18:1/24:2],乳糖基-N- palmitoyl-sphindosine [D18:1/16:0] [D18:1/24:0]和/或鞘磷脂[D18:1/24:1,D18:2/24:0]增加,与等离子中的鞘脂,胆汁酸,胆汁酸,胆汁酸和/或N-乙酰化的代谢物相关。 与CD相关的蛋白质之间,白介素-24与血浆代谢产物相关,包括乳糖基-N--戊酰鞘氨酰鞘氨醇[D18:1/16:0]和磷脂酰甲醇胺[18:1/18:1],血红蛋白和氟贝蛋白和氟蛋白calprotectin。 关键词:炎症性肠病;小儿代谢组炎性血浆蛋白[n = 92]。结果:IBD患者和对照组之间发炎的粘膜活检中的代谢组有所不同。在CD中,几种溶物磷脂的粘膜水平[溶血磷脂酰胆碱,溶物磷脂酰脊髓胺,溶血磷脂酰肌醇和溶物磷脂酰甲酯酶]降低,与包括各种质量代谢物的氨基化代谢物和N -N -N -N -N--核酸盐和n -N -aceconsylsylsylsynylsylsyclsylsycysyclsys降低。在CD和UC中,粘膜鞘脂,包括神经酰胺[D18:2/24:1,D18:1/24:2],乳糖基-N- palmitoyl-sphindosine [D18:1/16:0] [D18:1/24:0]和/或鞘磷脂[D18:1/24:1,D18:2/24:0]增加,与等离子中的鞘脂,胆汁酸,胆汁酸,胆汁酸和/或N-乙酰化的代谢物相关。与CD相关的蛋白质之间,白介素-24与血浆代谢产物相关,包括乳糖基-N--戊酰鞘氨酰鞘氨醇[D18:1/16:0]和磷脂酰甲醇胺[18:1/18:1],血红蛋白和氟贝蛋白和氟蛋白calprotectin。关键词:炎症性肠病;小儿代谢组在UC,Interleukin-24,介菌17a和C-C基序趋化因子11中与几种血浆代谢物相关,包括N-乙基基质磷酸,色氨酸,甘油酸,甘油酸和threonate,以及儿科溃疡性溃疡性溃疡性蛋白质蛋白质,蛋白质和Faecincin和Faecin。结论:溶血磷脂和鞘脂的粘膜扰动表征了新的儿科IBD中的代谢组,并与血浆代谢物相关。通过将血浆代谢组学数据与炎症蛋白和临床数据相结合,我们确定了与IBD代谢组学特征相关的临床和炎症标志物。
摘要:本文概述了使用相变材料 (PCM) 的管壳式系统的实验和数值研究。由于管壳式系统的设计方案多种多样,因此重点介绍双管 (DT)、三管 (TT) 和多管 (MT) 单元。此外,仅考虑单程系统。特别关注传热强化方法。研究结果的分析从对上述三个系统进行分类开始。根据倾斜角度、传热强化方法 (HTE)、传热流体的流动方向 (HTF) 和管束中的管排列对系统进行划分。此外,还提出了具体研究案例的简化方案。然后,按时间顺序讨论了上述每个系统(即 DT、TT 和 MT)的工作。最后,在相应的表格中,列出了所讨论案例的详细信息,例如几何尺寸和所用的 PCM 或 HTF 类型。本研究的创新之处在于将 PCM TESU 精确分类为 DT、TTH 和 MTH。文献中对此有很多自由裁量权。其次,列出并讨论了所介绍的 PCM TESU 中的传热强化方法。第三,提出了所讨论的 PCM TESU 的统一设计解决方案。综述表明,壳管式 TESU 的发展方向包括具有不同形状、高度和间距的高导热翅片的系统、多种 PCM 和改进的壳体。
基因编辑c。使用基于质粒的CRISPR试剂的秀丽隐杆线虫需要对许多动物进行显微注射才能产生单一编辑。质粒传播CAS9的种系沉默是效率低下的主要原因。在这里,我们提供一组c。秀丽隐杆线虫菌株从综合转基因中构成了种系中表达cas9的菌株。这些菌株显着提高了基于质粒的CRISPR编辑的成功率。对于简单的,短的同源臂GFP插入,注射动物的50-100%通常会产生编辑的后代,具体取决于目标基因座。模板引导的来自外染色体阵列的编辑在几代人中维持。我们在多个杂种上使用CAS9转基因建立了菌株。此外,每个CAS9基因座还包含一个由热轴驱动的CRE重组酶,可选择可选标记物和明亮的荧光标记物,以便于易于脱落。这些集成的CAS9菌株大大减少了产生单个基因组编辑的工作量。
香蕉基因组中心提供对香蕉和香蕉近亲的基因组组装、注释和大量相关组学资源的集中访问。实施了一系列工具和独特的界面,以利用香蕉基因组学的潜力,利用比较分析的力量,同时识别数据集之间的差异。除了 BLAST 和 JBrowse 基因组浏览器等有效的基因组工具外,其他界面还支持高级基因搜索和基因家族分析,包括多重比对和系统发育。同源性查看器可以比较染色体级组装之间的基因组结构。还添加了用于差异表达分析、代谢途径和 GO 富集的界面。提供了涵盖香蕉多样性的变体目录,可供探索、过滤和导出到各种软件。此外,我们还实施了新方法,以图形方式探索泛基因组中的基因存在与否以及栽培香蕉的基因组祖先镶嵌。此外,为了指导社区未来的测序工作,我们提供了基因座标签命名法的建议,以及公共基因组资源(组装、重新测序、高密度基因分型)和即将推出的资源(计划中、正在进行中或尚未公开)的精选列表。香蕉基因组中心旨在支持香蕉科学界的基础、转化和应用研究,可在 https://banana-genome-hub.southgreen.fr 上访问。
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