XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System组蛋白
非小细胞肺癌中的组蛋白脱乙酰基酶抑制：炒作还是希望？
表观遗传调节，包括乙酰化，甲基化，磷酸化和泛素化，在基因表达的调节中起关键作用。组蛋白乙酰化 - 组蛋白乙酰转移酶（HATS）和组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）的活性之间的平衡 - 是关键的表观遗传事件之一。我们对HDAC在癌症中的作用的理解正在发展。许多HDAC同工酶在多种恶性肿瘤中过表达。异常组蛋白乙酰化与肿瘤抑制基因失调有关，导致几种实体瘤和血液学恶性肿瘤的发展。临床前研究表明，HDAC-1基因表达与肺癌进展有关。组蛋白低乙酰化与肺腺癌中更具侵略性的表型有关。HDAC抑制剂（HDACI）具有多效细胞作用，并诱导凋亡基因/蛋白质的表达，导致细胞分化和/或细胞周期停滞，抑制血管生成，并抑制过渡到间质表型。 因此，用HDACI治疗在非小细胞肺癌（NSCLC）细胞系中显示出抗增殖活性。 尽管在临床前研究中有希望的结果，但HDACI在肺癌临床试验中仅显示出适度的单药活性。 HDAC激活被认为是引起化学疗法，分子靶向治疗和免疫检查点抑制的机制之一。 因此，将HDACI与这些试剂相结合以增强其效率或反向抵抗力的兴趣越来越大。HDAC抑制剂（HDACI）具有多效细胞作用，并诱导凋亡基因/蛋白质的表达，导致细胞分化和/或细胞周期停滞，抑制血管生成，并抑制过渡到间质表型。因此，用HDACI治疗在非小细胞肺癌（NSCLC）细胞系中显示出抗增殖活性。尽管在临床前研究中有希望的结果，但HDACI在肺癌临床试验中仅显示出适度的单药活性。HDAC激活被认为是引起化学疗法，分子靶向治疗和免疫检查点抑制的机制之一。因此，将HDACI与这些试剂相结合以增强其效率或反向抵抗力的兴趣越来越大。在本文中，我们回顾了在NSCLC中使用HDACI的可用临床前和临床证据。我们还审查了排除HDACI作为癌症疗法和未来方向的广泛临床实用性所面临的挑战。
开发 SARS-CoV 受体结合域 (RBD) 重组蛋白作为抗冠状病毒感染性异源人疫苗的潜力
摘要 2016 年，根据现行良好生产规范开发和生产了一种 SARS-CoV 受体结合域 (RBD) 重组蛋白。该蛋白在 Alhydrogel® 上配制时称为 RBD219-N1，在用 SARS-CoV（MA15 毒株）同源病毒攻击小鼠后，诱导出高水平中和抗体和保护性免疫，且免疫病理学极小。我们研究了已发表的证据，以支持 SARS-CoV RBD219-N1 是否可以重新用作针对冠状病毒传染病 (COVID)-19 的异源疫苗。我们的研究结果包括 SARS-CoV 患者恢复期血清可以中和 SARS-CoV-2 的证据。此外，对已发表的研究进行了回顾，这些研究使用针对 SARS-CoV RBD 产生的单克隆抗体 (mAb) 在体外中和 SARS-CoV 病毒，发现其中一些 mAb 与 RBD 内的受体结合基序 (RBM) 结合，而另一些 mAb 与 RBD 内该区域以外的域结合。这些信息具有相关性，并支持开发针对 COVID-19 的异源 SARS-CoV RBD 疫苗的可能性，特别是因为发现 SARS-CoV 和 SARS-CoV-2 刺突和 RBD 域之间的整体高氨基酸相似性 (82%) 并未反映在 RBM 氨基酸相似性 (59%) 中。然而，RBM 外区域的高序列相似性 (94%) 为两种病毒之间保守的中和表位提供了潜力。
组蛋白伴侣 FACT 诱导 Cas9 多
Alan S. Wang, 1 , 2 Leo C. Chen, 1 , 2 R. Alex Wu, 3 , 4 Yvonne Hao, 1 David T. McSwiggen, 1 , 5 Alec B. Heckert, 1 , 5 Christopher D. Richardson, 1 , 2 Benjamin G. Gowen, 1 , 2 Katelynn R. Kazane, 1 , 2 Jonathan T. Vu, 1 , 2 Stacia K. Wyman, 1 , 2 Jiyung J. Shin, 1 , 2 Xavier Darzacq, 1 , 5 Johannes C. Walter, 3 , 4 和 Jacob E. Corn 1 , 2 , 6 , 7 ,* 1 加州大学伯克利分校分子与细胞生物学系，美国加利福尼亚州伯克利市 94720 2 加州大学创新基因组学研究所加利福尼亚州伯克利市，伯克利，加利福尼亚州 94720，美国 3 哈佛医学院生物化学与分子药理学系，马萨诸塞州波士顿 02115，美国 4 霍华德休斯医学研究所，哈佛医学院生物化学与分子药理学系，马萨诸塞州波士顿 02115，美国 5 加州大学伯克利分校加州再生医学卓越中心研究所，伯克利，加利福尼亚州 94720，美国 6 ETH Z € urich 生物系，8093 Z € urich，瑞士 7 主要联系人 *通信地址：jacob.corn@biol.ethz.ch https://doi.org/10.1016/j.molcel.2020.06.014
组蛋白去乙酰化酶复合物 MiDAC 调节神经发育基因表达程序以控制神经突生长
摘要有丝分裂脱乙酰酶复合物 (MiDAC) 是一种最近发现的组蛋白脱乙酰酶 (HDAC) 复合物。虽然其他 HDAC 复合物与神经发生有关，但 MiDAC 的生理作用仍然未知。在这里，我们表明 MiDAC 是神经分化的重要调节器。我们证明 MiDAC 可作为神经发育基因表达程序的调节器，并与神经突生长的重要调节器结合。MiDAC 通过一种暗示启动子和增强子上 H4K20ac 去除的机制上调促神经基因（例如编码分泌配体 SLIT3 和 NETRIN1 (NTN1) 的基因）的表达。相反，MiDAC 通过减少神经发生负调节因子的启动子近端和远端元件上的 H3K27ac 来抑制基因表达。此外，MiDAC 的缺失会导致神经突生长缺陷，可以通过补充 SLIT3 和/或 NTN1 来挽救。这些发现表明 MiDAC 在调节 SLIT3 和 NTN1 信号轴的配体以确保神经突发育的正确完整性方面发挥着至关重要的作用。
使用边缘无形体亚显性 IV 型分泌系统重组蛋白的疫苗无法抵御强毒攻击
边缘无形体是全球分布的最普遍的蜱传牲畜病原体。牛无形体病对养牛业构成了重大威胁。通过接种脾切除小牛产生的活中心无形体疫苗，可以预防流行地区的无形体病爆发。由于中心无形体活疫苗可携带其他病原体并导致成年牛患病，因此研究工作致力于开发安全的重组亚单位疫苗。先前的研究发现，边缘无形体 IV 型分泌系统 (T4SS) 的亚优势蛋白和亚优势延伸因子-Tu (Ef-Tu) 参与了用边缘无形体外膜 (OM) 免疫的牛对实验性攻击的保护性免疫。本研究评估了在大肠杆菌中克隆和表达的重组 VirB9.1、VirB9.2、VirB10、VirB11 和 Ef-Tu 蛋白赋予的免疫原性和保护性。将 20 头公牛随机分成 4 组 (G)，每组 5 头。G1 和 G2 组的牛分别用 50 μ g 重组蛋白与 Quil A ® 或 Montanide ™ 佐剂的混合物进行免疫。G3 和 G4 (对照) 组的牛分别用 Quil A 和 Montanide 佐剂进行免疫。牛每隔三周进行四次免疫，并在第四次免疫后 42 天用 10 7 A . marginale 寄生红细胞进行攻击。攻击后，所有牛均出现临床症状，红细胞压积显著下降，寄生红细胞显著增加 (p < 0.05)，需要用土霉素治疗以防止死亡。免疫组诱导的 IgG2 水平与观察到的缺乏保护无关。需要额外的策略来评估这些蛋白质的作用及其在开发有效疫苗中的潜在效用。
romidepsin增强了细胞丁滨在体内的疗效，揭示了组蛋白脱乙酰基酶抑制作用，这是KMT2A重新培养婴儿急性淋巴细胞淋巴细胞性白血病
剂量强化化疗已纳入当代治疗方案；但是，这增加了在治疗过程中的毒性负担和幸存者的晚期影响。1,2迫切需要确定新的疗法以改善结果。组蛋白脱乙酰基酶抑制作用似乎是KMT2A -R婴儿的有前途的治疗策略，我们最近的化学基因组分析确定了romidepsin的潜力。romidepsin被证明可以增强Cytarabine的体外活性，Cytarabine是婴儿所有疗法的关键成分，当与高剂量细胞蛋白酸酯结合使用时，体内信号鉴定出体内信号。3在这项研究中，我们研究了romidepsin和Cytarabine之间的体内协同作用，确定了这种组合的体内毒性，并探索了romidepsin对DNA损伤对细胞丁滨的影响的影响。所有体内实验均由澳大利亚珀斯Telethon Kids Institute动物伦理委员会批准。为了确定治疗组成后的药物毒性和功效，用1x10 6每-785A细胞接种了7周的女性点头/SCID小鼠。PER-785a是具有t（4; 11）易位的遗传表征的细胞系。3对于所有体内研究，当人类CD19 +或CD45 +细胞的百分比在骨髓（BM）中达到1％时，开始药物治疗，这是每种模型的白血病细胞动力学的广泛映射所识别的（在线补充图S1）。治疗计划模仿当代临床试验设计的概念。注射。治疗三周。目前，在诱导疗法对互化化学疗法主链的诱导治疗后正在研究新的药物，因此在低疾病负担的设置中引入了4个，而不是在BM中明显明显的诊断疾病的诊断。小鼠被随机分为五组五只小鼠，并在第12天通过腹膜（i.p.）由车辆控制组成的治疗组； 1.5 mg/kg romidepsin在星期一和星期四两次/周；星期一至周五，低剂量的Cytarabine（5 mg/kg）五次；星期一至周五，高剂量细胞押次（100 mg/kg）五次； 1.5 mg/kg romidepsin和低剂量细胞蛋白酶的联合疗法。在治疗小鼠综合后三天被处死，并通过用抗人类CD19-APC抗体的流式细胞仪测量BM中人类CD19 +细胞的百分比来确定白血病。 在牺牲时，通过心脏穿刺从每只小鼠那里获得0.2 mL的血液，并进行了完全的血数，以确定每个队列的骨髓抑制性程度。 单人活性在Romidepsin的BM中的平均百分比为66.6％（P <0.01），低剂量Cytara-Bine的平均百分比为66.6％（p <0.01），27.3％（p <0.01）（图1A）。 通过联合疗法的结合疗法和降低为3.8％浸润的平均值（p <0.0001），白血病负担的减少显着增强（图1A）。 尽管用高剂量细胞押滨治疗获得了BM的白血病细胞的清除率，但小鼠在治疗小鼠综合后三天被处死，并通过用抗人类CD19-APC抗体的流式细胞仪测量BM中人类CD19 +细胞的百分比来确定白血病。在牺牲时，通过心脏穿刺从每只小鼠那里获得0.2 mL的血液，并进行了完全的血数，以确定每个队列的骨髓抑制性程度。单人活性在Romidepsin的BM中的平均百分比为66.6％（P <0.01），低剂量Cytara-Bine的平均百分比为66.6％（p <0.01），27.3％（p <0.01）（图1A）。通过联合疗法的结合疗法和降低为3.8％浸润的平均值（p <0.0001），白血病负担的减少显着增强（图1A）。尽管用高剂量细胞押滨治疗获得了BM的白血病细胞的清除率，但小鼠
急性髓样白血病组蛋白脱乙酰基酶抑制剂靶向CD123/CD47阳性细胞，并在急性髓样白血病中反向化学耐药表
抽象的化学抗性可能是由于白血病干细胞（LSC）的存活率静止，对化学疗法反应或不反应于化学疗法，也不在AML细胞的内在或获得的耐药性上。在这里，我们发现在良好的LSC标记中，只有CD123和CD47与细胞系和患者样品之间的AML细胞化学敏性相关。进一步的研究表明，与父母细胞系相比，化学固定线中CD123 + CD47 +细胞的百分比显着增加。然而，在抗性细胞中，干性信号基因并未显着增加。相反，基因变化富含细胞周期和细胞存活途径。这表明CD123可以用作化学抗性的生物标志物，而不是AML细胞的茎。我们进一步研究了表观遗传因子在调节化学耐毒性白血病细胞存活中的作用。表观遗传药物，尤其是组蛋白脱乙酰基酶抑制剂（HDACIS），有效诱导化学耐药细胞的凋亡。此外，HDACI romidepsin在很大程度上反转了抗性细胞的基因表达和有效的靶向靶向并去除了异种移植AML小鼠模型中的化学耐药性白血病爆炸。更有趣的是，romidepsin优先靶向CD123 +细胞，而化学疗法药物ARA-C主要靶向快速生长CD123-细胞。因此，单独或与ARA-C结合使用romidepsin可能是化学耐药患者的潜在治疗策略。
组蛋白与 DNA 的结合 - PDB 1AOI
在真核生物中，DNA 有多个包装层次，用于多种用途。这让 DNA 在细胞核中占用更少的空间，但同时也保护 DNA 免受物理损伤，并调节 DNA 对蛋白质的可及性。例如，当 DNA 包装得非常紧密时，通常“读取”它的蛋白质无法访问它，从而使一些基因失去活性。
阿尔茨海默氏病的组蛋白全乙酰基组的关联研究1
控制i）Eno2的模型：r = 0.99，p <1.00e -50; ii）olig2：r = 0.99，p <1.00e -50; iii）157
有效的重组蛋白表达和纯化...
表达和纯化的重组蛋白在生物学和生物医学科学中高度使用。由于缺乏翻译后修饰（PTM）系统以及许多重组蛋白的不溶性，用于蛋白质表达和纯化的传统宿主生物，尤其是大肠杆菌，用于蛋白质表达和纯化。酵母蛋白生产系统一直是生产生物药物蛋白，蛋白质复合物和翻译后修饰蛋白的宝贵工具。在这里，我们使用半乳糖诱导系统描述了酿酒酵母中详细的蛋白质表达和纯化方案。发芽的酵母菌具有快速的细胞生长，可以达到高密度，从而产生具有高蛋白质产量的快速，简单的真核蛋白质生产平台。