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探索与合成数据生成的髓母细胞亚组的边界
图1。研究工作流程的概述。这项研究的数据是从以前的出版物（10）中获得的，该出版物可在GEO上访问。数据被预处理以消除低变化和异常基因，然后训练VAE。vae由两个基本部分组成。首先，编码器将输入维度降低到任意数字。对于每个减小的尺寸，获得了两个参数，代表正态分布的平均值和标准偏差，构成了潜在空间。第二，解码器恢复了数据的原始空间，并带有关联的重建误差。为了最大程度地减少此错误，解码器的输出用于训练后处理神经网络。使用解码器的生成能力，可以创建类似于原始的合成数据，并使用它以高特异性研究MB的亚组。此外，为了解释MB亚组和基因之间的关系，在潜在空间上使用了一个分类器来区分四个MB亚组（SHH，WNT，第3组和组4）。可以通过获得需要两个步骤的基因的形状值来解释此分类。shap的树式插图获得了分类子组与潜在空间之间的关系。然后，最重要的潜在变量（解释大多数分类的变量）然后传递给Shap的Deepplainer，以获取解释亚组分类的基因。
原代纤毛在髓母细胞瘤中的亚组特异性作用
髓母细胞瘤是儿童中最常见的恶性肿瘤脑肿瘤，是导致肿瘤形成的失调发育机制的范式（Marino 2005）。它分为四个亚组（SHH，Wnt，G3和G4），每个子组进一步细分为亚型。已经确定了这些祖细胞的基本信号传导路径的放松调节，这些祖细胞的基本信号通路是综述的（有关审查，请参阅Marino和Gilbertson 2021）。在大脑中，原发性纤毛 - 基于微管的细胞结构，固定在基底体上，该结构用作纤毛微管组装的温度（Larsen等人2013） - 对其发展至关重要。它们从细胞的表面伸出，感知多个信号，并引入基本信号通路，包括关键的发育途径Sonic Hedgehog（SHH）和Wnt。例如，纤毛在SHH驱动的前脑图案中起着关键作用，包括中间神经元的迁移；在小脑发育中，特别是小脑祖细胞的扩张；在海马神经发生中2019）。Wnt介导的树突状细化和海马中成年牙齿颗粒细胞中的突触形成也是由Cilia进行的（Kumamoto et al。2012）。原发性纤毛在包括髓母细胞瘤在内的各种脑肿瘤的发病机理中被认为（Han等人2009），脉络丛 - 美国肿瘤（Li等人2016）和胶质母细胞瘤（Goranci-Buz-Hala等人2021）;但是，其角色的机械基础刚刚开始揭露。
Gal-1 和Gal-9 在子痫前期患者血清和胎盘表达的临床研究
0.05), 且早发型 PE 组 Gal-1 水平和 Gal-9 水平亦显着高于晚发型 PE 组 ( P <0.05)。 早发型 PE 组和晚发型 PE
急性髓样白血病诊断时的肠道微生物组改变与肌肉无力和厌食症有关
肠道微生物群为宿主体内平衡做出了重要贡献，其在治疗急性髓样Leu Kemia（AML）中的作用引起了人们的注意。我们研究了肠道微生物组是否受AML的影响，以及这种变化是否与卡氏症的标志有关。在诊断中收集了30名无抗IC的AML患者的生物样品和临床数据，并在多中心，横断面，前瞻性研究中匹配志愿者（1：1）。使用shot弹枪元基因组学分析了粪便菌群的组成和功能潜力。进行粪便，血液和泌尿代谢组学分析。AML患者表现出肌肉无力，厌食症，肠道功能改变的迹象和血糖疾病。AML和对照组患者的粪便菌群的组成有所不同，口腔细菌增加。细菌功能和粪便代谢组的改变支持肠道菌群中的RE DOX状态的改变，这可能导致AML患者观察到的氧化还原状态的改变。eubac terium eligens在AML患者中降低了3倍，与肌肉强度和瓜氨酸密切相关，这是肠球菌质量和功能的标志。blautia和parabacteroides与厌食IA相关。改变了先前与血糖疾病相关的几种细菌分类群和代谢产物（例如Blautia，prevotella，苯乙酸酯和Hippurate）。这些发现为未来的机械工作铺平了道路，以探索本研究中鉴定的细菌的功能和治疗潜力。我们的工作揭示了在DI Agnosis的AML患者的肠道微生物组中的重要扰动，与肌肉力量，氧化还原状态改变和厌食有关。
髓系NGS检测
第三个问题是开发新的靶向疗法。对于 MDS，加拿大现已批准 luspatercept 用于输血依赖性低风险 MDS，该药物具有 SF3B1 突变，这需要了解这种突变状态。对于 AML，gilteritinib 已被批准用于复发/难治性 FLT3 突变 AML；这包括我们的 PCR 检测未检测到的 FLT3-TKD 突变。针对 IDH 和 TP53 突变的新靶向药物正在研究中。与单独使用阿扎胞苷相比，在先前未接受治疗的不适合老年 AML 患者中，将维奈克拉添加到阿扎胞苷中已显示出生存益处，并且现已在加拿大获得批准。虽然不是针对特定突变的靶向药物，但生存益处与突变亚型高度相关；特别是，IDH 突变患者似乎从这种组合中受益最多。
针对急性髓系白血病
摘要：尽管对新疗法进行了广泛的研究和开发，但急性髓系白血病 (AML) 的骨干疗法在过去几十年中基本保持不变，并且经常导致不良结果。根除白血病干细胞 (LSC) 是 AML 治疗的终极挑战。新出现的证据表明，AML 将骨髓 (BM) 生态位重塑为允许白血病的微环境，同时抑制正常的造血。基质介导的 BM 中白血病细胞保护机制很复杂，涉及许多粘附分子、趋化因子和细胞因子。针对这些因素可能是一种有价值的方法，可以补充现有的疗法并克服微环境介导的耐药性。一些将 LSC 和白血病母细胞从其保护性生态位中移除的策略已经在患者身上进行了测试，并且处于临床开发过程的不同阶段。其他策略（例如针对基质细胞重塑过程）仍处于临床前阶段。需要开发人源化异种移植小鼠模型，以克服人类白血病细胞和小鼠 BM 微环境之间的不匹配，以便在小鼠中生成生理相关的、患者特定的人类微环境，这些微环境可用于揭示人类 AML 微环境的作用，并开展临床前研究以开发新的靶向疗法。
急性髓系白血病
a. 对于粒单核细胞性或单核细胞性急性髓系白血病 (AML) 患者，或白细胞计数 >40 x 10 9 /L 的患者，应考虑进行腰椎穿刺筛查。4. 应使用年龄、体能状态、世界卫生组织 (WHO) 分类和国际共识分类 (ICC) 分类、细胞遗传学和分子风险组以及对治疗的反应（包括尽可能微小残留疾病）来确定所有患者的 AML 分类和风险分层及移植资格。5. 对于有 AML 或 MDS 家族史的患者，或提示有遗传易感性疾病的患者，或 NGS 上发现的突变提示有高变异等位基因频率的遗传易感性的患者，应进行体细胞突变检测以检测遗传性髓系突变组。6. 初步评估应包括确定患者的健康状况和是否有资格接受强化诱导化疗。这应该考虑到主要合并症的严重程度、整体虚弱程度和患者偏好。7. 支持性护理：