摘要该研究采用计算策略来鉴定对结核分枝杆菌FTSZ的潜在抑制剂,这是一种关键的细胞分裂蛋白。对FTSZ的晶体结构进行了精心验证,是基于药效团的虚拟筛选和随后的分子对接模拟的基础。piperine是一种源自黑胡椒的天然配体,指导了三分药团模型的开发,该模型成功筛选了多种化学数据库。十种顶级化合物以有希望的药效分数出现,证明了与FTSZ结合位点的潜在相互作用。分子对接模拟揭示了特定化合物,包括Zinc000012440615和Zinc000014658239,分别显示出对口袋C5和C1的一致偏好。FTSZ的结构分析揭示了一套不同的口袋(C1 – C5),其体积和尺寸不同,强调了蛋白质结构的复杂性。这些发现为潜在的抑制剂提供了至关重要的见解,以进一步实验验证和针对结核分枝杆菌的药物开发。关键词:结核分枝杆菌,FTSZ蛋白,分子对接,药物团筛查,计算药物发现,杂氨酸,晶体结构验证,虚拟筛选,铅化合物,袋装分析。国际药品保证杂志。2024; 15(1):351-356。支持来源:零。利益冲突:无国际药品保证杂志(2024); DOI: 10.25258/ijpqa.15.1.56 How to cite this article: Deore S, Wagh V, Thube U, Kayande N, Tare H. In-silico Discovery of Potential Mycobacterium tuberculosis Cell Division Protein FtsZ Inhibitors: A Natural Ligand Piperine-Derived 3-Point Pharmacophore Screening and Structure-Guided Blind Docking Study.
众所周知,植物激素的生长素和细胞分裂素是植物生长和发育的关键调节剂,它们是在芽和根,幼叶,种子,种子和水果的顶端分生组织中合成的[1-4]。它们对种子发芽,芽的形成和生长以及植物阶段的植物的不定和侧根表现出刺激的影响[1-4]。植物生物学家的大量关注致力于筛选合成起源的生长素和细胞分裂素的新有效类似物,以改善农业的生长并提高农作物的生产率。近年来,已经创建了新的生长素和细胞分裂素的新合成类似物,例如NAA(1-萘乙酸),2,4-D(2,4-二氯苯氧基酸),3,4-D(3,4-二氯苯甲乙酸),2,4,4,4,5-T
•转录和复制等过程要求DNA的两条链暂时分开,从而允许聚合酶访问DNA模板。但是,核小体的存在以及将染色质折叠为30纳米纤维的折叠构成障碍物,以放松并复制DNA的酶。
I am 1 , Vincent Francis 1 , Sheng-Jia Lin 2 , Flare Kharfallah 1 , Vladimir Forv 1 1 , Maximamir Fun 1 , Chanshua Han 1 , Chanshua Han 1 , the Marine 1 , the Marine 1 , the Marine 1 , the Marine 1 , the Macink 1 , Armin Bally 1 , Armin Bayi 1 , Armin Bayi 1 , Armin Bayi 1 , Armin Bally 1 , Armin Bally 1 , Armin Bally 1 , Armin Bally 1 , Armin Bally 1 , Armin Bally 1 , Armin Bally 1 , Armin Bally 1 , Armin Bally 1 , Armin Bally 1 , Armin Bally 1 , Armin Bally 1 , Armin Bally 1 , Armin Bally 1 , Armin Bally 1 , Armin Bally 1 , Armin Bally. Al-Chater 3,Fowzan S. Alkuraa 4,Argyriu 5的Loukhas,Meisam Babaho 6,7,Beahlo,Bakhshood Bakhshood 8,Basshodeh 9,Basshodeh 9,Laura Bar 9,Laura Bar 9,Laura Bar 9,Laura Bar 9,Laura Bar 9,Bastus 12 ,Dominique Braun 14,Rebecca Buchett 13,Maura Buttta 15,Marima Cadieux-Dion 16,Daniel Calame 17-19,Daniel 17-19,Daniel 20,Daniel 20,Donna Cugan 20,Stephany Eflonee 21,Stephany Eflone,Stephany Eflon 24,Tawfiq Froukh 25,Harnder K. Gill 26,约瑟夫27,28,Laura Gongel 14,Elaca Gogott 14,Elaciah S.-Y.goh 21,Vykuntarau K Gowda 29,Tobias B. Haack 13,5月O. Hashem 4,Stefan Hauser 30:31,Trevor L. Hoffman 2,26,Ehsan G 42,44,Ehsan g 42,44,David Murphy 22,David Nyais Nyaga 22,Denis Nyaga tros torsenter torsenter torse tories 17:19,lynetter tor av av av av av av。 1,Sear Alves 53,Varshney 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2,David A. Rudko 1,Peter S. McPherson
抽象迫切需要一种安全有效的疫苗来应对抗多药(MDR)Neisseria Gonorrhoeae的全球威胁。我们筛选了26个由人工智能驱动的平台发现的26个淋球菌蛋白,称为疗效歧视性教育网络(EDEN),该平台训练了培训,可以识别针对致病性细菌的新型保护性疫苗抗原,以在淋病的小鼠阴道化模型中对疗效产生疗效。与GLA-SE(诱导T H 1反应)辅助的两到三种抗原的组合产生了11组,用于接种小鼠。在11组中的每一个中的抗血清的补体依赖性杀菌活性与淋球菌定殖的负担之间存在反相关。NGO1549(FTSN;细胞divisome蛋白)和NGO0265(预测的细胞分裂蛋白)的组合最大程度地减轻了MDR菌株Who X.每组抗原的伊甸园预测评分与总体细菌负担的减少呈正相关,提供了其预测潜力的证据。ftsn和NGO0265单独地施用,组合或作为嵌合蛋白通过所有三种测试菌株显着减弱了淋球菌阴道定殖。igG支持了所有50种(100%)淋球菌分离株的补体杀伤。嵌合NGO0265-FTSN疫苗的功效需要补体的膜攻击复合物(C5B-9),这证明了补体C9 - / - 小鼠的功效丧失。总而言之,一种嵌合分子构成了NGO0265和FTSN辅助伴有gla-se引起的IgG具有广泛的抗癌菌杀菌活性,可减弱与依赖的伴侣依赖性的淋球菌定殖,并代表一个令人鼓舞的果核量,并代表了一个良好的果肉候选。
摘要。microRNA(mir)-130a-3p已被解开以对糖尿病发挥影响。但是,探测其在糖尿病性视网膜病(DR)中作用的研究是有限的。我们的研究旨在通过细胞分裂周期42(CDC42)来阐明miR-130a-3p对DR发育的调节作用。建立了小鼠模型,并收集了DR患者的血清样本。检测到DR小鼠和患者的miR-130a-3p和Cdc42的水平。将修饰的miR-130a-3p或Cdc42的核酸注入DR小鼠中,以检查DR小鼠中视网膜组织中葡萄糖脂质水平,视力,氧化反应以及Cdc42的分布和表达的变化。确定miR-130a-3p和Cdc42之间的目标关系。miR-130a-3p表达降低,而DR中Cdc42水平升高(P \ 0.05)。miR-130a-3p的上调可能会阻碍葡萄糖脂质水平,提高视力,缓解氧化反应并降低DR小鼠中Cdc42表达水平(P \ 0.05)。CDC42高程逆转了上调miR-130a-3p对DR进展的积极影响(P \ 0.05)。miR-130a-3p靶向CDC42。通过调节Cdc42,升高的miR-130a-3p升高可缓解DR中DR中的葡萄糖脂质水平和氧化损伤。该研究为DR治疗提供了新的治疗靶标。
ESCRT-III家族蛋白形成复合聚合物,在整个生命之树的广泛细胞生物过程的背景下变形并切割膜管。在重建的系统中,AAA - 腺苷三磷酸酶VPS4诱导的ESCRT-III聚合物组成的顺序变化已被证明可以重塑膜。然而,尚不清楚如何在细胞环境中在空间和时间内组织和重塑复合材料ESCRT-III聚合物。Taking advantage of the relative simplicity of the ESCRT-III – dependent division system in Sulfolobus acidocaldarius , one of the closest experimentally tractable prokaryotic relatives of eukaryotes, we use super-resolution microscopy, electron microscopy, and computational modeling to show how CdvB/CdvB1/CdvB2 proteins form a precisely patterned composite ESCRT-III division环(RING)逐步进行VPS4依赖性拆卸,并收缩将细胞切成两部分。这些观察结果使我们提出了模式的复合聚合物中的顺序变化,作为ESCRT-III - 脱发膜重塑的一般机制。
摘要 可以使用 16S rRNA 荧光原位杂交 (FISH) 研究微生物种群的净增长,即丰度随时间的变化。然而,这种方法不能区分死亡率和细胞分裂率。我们结合稀释培养实验,将基于 FISH 的图像细胞术用于研究两种不同的浮游植物水华中四种细菌类群的净增长、细胞分裂和死亡率:寡营养菌 SAR11 和 SAR86 以及富营养菌门拟杆菌门及其 Aurantivirga 属。细胞体积、核糖体含量和细胞分裂频率 (FDC) 随时间共同变化。在这三者中,FDC 是计算所选类群细胞分裂率的最合适的预测因子。 SAR86 的 FDC 衍生细胞分裂率高达 0.8/天,Aurantivirga 的 FDC 衍生细胞分裂率高达 1.9/天,这与寡养生物和富养生物的预期不同。令人惊讶的是,SAR11 的细胞分裂率也达到了高达 1.9/天的高水平,甚至在浮游植物大量繁殖之前也是如此。对于所有四个分类群,丰度衍生的净增长率(-0.6 到 0.5/天)比细胞分裂率低一个数量级。因此,死亡率与细胞分裂率相当高,表明大约 90% 的细菌产物在 1 天内被回收,没有明显的时间滞后。我们的研究表明,确定特定分类单元的细胞分裂率是对基于组学的工具的补充,并为包括自下而上和自上而下控制在内的单个细菌生长策略提供了前所未有的线索。
将活性细胞机制与合成构件整合在一起,是开发具有生物功能及其他功能的合成细胞的桥梁。自我复制是生命系统最重要的任务之一,有各种复杂的机制来执行这一任务。在大肠杆菌中,收缩分裂环通过自组织蛋白 (MinCDE) 的浓度振荡定位到细胞中部,在那里它切断膜和细胞壁。到目前为止,任何细胞分裂机制的重建都与脂质体有关。这里展示了在完全合成的双组分树枝状聚合物中重建基本的细菌分裂体。通过调整膜组成,可以定制生物机制与合成膜的相互作用以重现其动态行为。这构成了合成细胞与生物元素组装的重要突破,因为调整膜-分裂体相互作用是自下而上设计新兴生物行为的关键。
摘要:Trichostatin A(TSA)是一种代表性的组蛋白脱乙酰基酶(HDAC)抑制剂,该抑制剂通过调节细胞中的染色质重塑来调节表观遗传基因的表达。调查TSA对染色质DE稳态的调节是否会影响Cas9蛋白 - 蛋白 - 核核糖核蛋白(RNP)的效率提高,从植物细胞中检查了基因组编辑的基因组,使用生菜和烟草原子量进行了多种浓度,在几次浓度的TSA治疗后(tsa)(0.1)(0.1)(0.1和10,0.1)。RNP从原生质体递送。有趣的是,在莴苣原生质体中,TSA处理中SOC1基因的indel频率是DMSO处理的3.3至3.8倍。尽管没有太大差异,但糖基因原生质体中SOC1基因的indel频率的增加发生在浓度依赖性的方式中。类似于生菜,TSA在PDS基因组编辑期间使用烟草原生质体以浓度依赖性方式将indel频率提高了1.5至1.8倍。MNase测试清楚地表明,使用TSA处理的染色质可及性高于DMSO治疗的染色质。此外,TSA处理显着提高了生菜原生质体的组蛋白H3和H4乙酰化水平。QRT-PCR分析表明,通过TSA处理,增加了细胞分裂相关基因的表达(LSCYCD1-1,LSCYCD3-2,LSCYCD6-1和LSCYCU4-1)。这些发现可能有助于提高CRISPR/CAS9介导的基因组编辑的效率。此外,这可以应用于使用带有植物原生质体的CRISPR/CAS9系统开发有用的基因组编辑的作物。