XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System结构质量
蛋白质集合通过变异自动编码器潜在空间采样
摘要：映射有助于功能的蛋白质构象的整体，可以用小分子药物来靶向，这仍然是一个重大的挑战。在这里，我们探讨了变异自动编码器的使用来减少蛋白质结构合奏生成问题中维度的挑战。我们将高维蛋白质结构数据转换为连续的，低维的表示，在以结构质量度量为导向的空间中进行搜索，然后使用由采样的结构信息引导的Rosettafold来生成3D结构。我们使用这种方法为癌症相关的蛋白质K-RAS生成合奏，在可用的K-Ras晶体结构的子集上训练VAE和MD模拟快照，并评估接近与训练中与晶体结构接近的取样程度。我们发现，我们的潜在空间采样程序迅速生成具有高结构质量的合奏，并且能够在固定晶体结构的1Å内进行采样，其一致性高于MD模拟或Alphafold2预测。采样结构充分概括了固定的K-RAS结构中的隐性口袋，以允许小分子对接。
DiskSat：二维卫星架构的演示任务
考虑到这些因素，我们提出了一种新的卫星配置，我们称之为 DiskSat：一种大孔径、准二维卫星总线，其形式为薄盘，设计用于堆叠以进行集装箱化，同时最大限度地利用有效载荷体积。4 典型的 DiskSat 是一个直径为一米、厚度仅为 2.5 厘米的圆盘。DiskSat 的结构主要由复合夹层板、石墨/环氧树脂面板和铝蜂窝芯组成。总线和有效载荷的非结构部件分布在圆盘的表面或体积内。这种尺寸的圆盘的体积约为 20 升，相当于一个假设的 20U 立方体卫星的体积。然而，DiskSat 并不打算在装满这个体积的情况下飞行；该概念的目标是增加用于电源、孔径和热管理的表面积，并增加体积以简化制造，同时保持与典型的 6U 立方体卫星相当的质量。圆盘本身的结构质量不到 2 公斤，因此将整个总线质量（电源、ACS 和其他航空电子设备）保持在 5 公斤以下应该不是什么难事。同时，表面面积足够大，可以在一个面上支撑高达 200 W 的太阳能电池。在有效载荷为 5 公斤的情况下，卫星总质量仍然不到 10 公斤。
“实体经济中企业财务架构的轨迹”
建立有效的公司财务架构对于维持一定的市场地位和确保稳定的盈利能力具有重大影响，其中包括资本结构、所有权结构和公司治理状况等基本要素。本研究旨在确定财务架构的状态、变化轨迹及其对公司市场地位的影响。从销售收入最高的前 200 家公司名单中选出了 22 家乌克兰公司进行研究，这些公司提供了 2007 年至 2017 年期间的完整财务报表。为了确定公司的财务架构状态和相关的市场地位，作者使用了最远邻居法的聚类分析。应用了 Kohonen 自组织映射算法。使用 Harrington 的可取性函数来确定积分指数。所选样本显示几乎所有公司的所有权集中度都很高，只有少数人控制着大量资产，从而证实了乌克兰经济的寡头结构。结果获得了七个集群组，反映了公司的财务结构质量。在整个样本中，只有五家公司拥有高质量的财务结构，即资本结构和所有权结构一致且最佳，并确保公司保持领先的市场地位。
新辅助免疫疗法会影响手术
目的：在用于肺癌的治疗疗法中，免疫疗法已成为患者生存的革命里程碑。但是，有足够的观察证据可以肯定组织的变化阻碍了程序。我们的目的是在视觉上比较此类更改。方法：我们获得了两名患有相似病史的患者，他们接受了相同类型的肺切除，均通过机器人辅助，只有一名完成了新辅助免疫疗法治疗，而另一种则没有。记录了两项手术，并在视觉上比较了不同的步骤。结果：未完成新辅助治疗的患者称为患者“ A”，而完成新辅助治疗的患者被称为患者“ B”。脂肪组织的质量不同，在B中与A.纤维化反应甚至会导致中叶支气管的病变。支气管的结构质量可防止在技术上有义务进行下等肌肉切除术。两者的最终病理解剖结构在B中显示出完整的病理反应，而在可行的肿瘤细胞中，必须继续进行辅助治疗。结论：虽然免疫治疗是我们患者的一场治疗革命，但手术仍然是确定治疗的常见途径。免疫疗法以纤维化形式引起的变化在宏观上显而易见，通常使手术更加困难，但是，这些原因并非不可能，使患者能够以良好的进化来完成他的治疗。
foldmark：使用水印
蛋白质结构是理解蛋白质功能的关键，对于生物工程，药物发现和分子生物学的进展至关重要。最近，随着生成AI的结合，计算蛋白结构预测/设计的功率和准确性已得到显着提高。然而，诸如版权保护和有害内容产生（生物安全）等道德问题对蛋白质生成模型的广泛实施构成了挑战。在这里，我们研究是否可以将水印嵌入蛋白质生成模型及其输出中，以进行版权认证和跟踪生成的结构。作为概念证明，我们提出了一个两阶段的方法折叠标记，作为蛋白质生成模型的广义水印策略。FOLSMARK首先要预处理水印编码器和解码器，它们可以轻微调整蛋白质结构以嵌入用户特定的信息，并忠实地从编码结构中恢复信息。在第二步中，蛋白质生成模型通过水印条件的低级适应（Waterlora）模块进行微调，以保持发电质量，同时学习产生具有高回收率的水印结构。广泛的实验是在开源蛋白结构预测模型（例如Esmfold和Multiflow）和从头结构设计模型（例如Framediff和Foldflow）上进行的，我们证明我们的方法在所有这些生成模型中都是有效的。同时，我们的水印框架只会对原始蛋白质结构质量产生可忽略的影响，并且在潜在的后加工和适应性攻击下具有强大的影响。
从仅序列训练数据中生成全原子蛋白结构
蛋白质设计的生成模型对其潜在的科学影响引起了人们的兴趣。但是，蛋白质功能是由许多模态介导的，同时产生多种方式仍然是一个挑战。我们提出了格子（p Rotein la tent i doffusion），这是一种多模式蛋白产生的方法，它从预测变量的潜在空间中学习和样品，从更丰富的数据模式（例如序列）映射到较少丰富的一种（例如，晶体结构）。具体来说，我们解决了全原子结构的生成设置，该设置需要产生3D结构和1D序列以定义侧链原子的位置。重要的是，格子只需要序列输入才能在训练过程中获得潜在表示，从而使序列数据库用于生成模型训练，并且与实验结构数据库相比，将数据分布增加了2至4个数量级。仅序列训练还允许访问更多的注释以进行调节。作为示范，我们对基因本体论的2,219个功能和生命之树的3,617种生物使用组成条件。尽管在训练过程中不使用结构输入，但生成的样品表现出强大的结构质量和一致性。功能条件的世代学习活跃位点的侧链残基身份和原子位置，以及跨膜蛋白的疏水模式，同时保持整体序列多样性。型号的权重和代码可在github.com/amyxlu/plaid上公开获得。
ZnGa2O4(100)单晶表面电子结构的实验和理论研究
因此，对于应用而言，非常需要一种带隙与 β -Ga 2 O 3 一样宽但对称性更高的材料。最近，Galazka 等人报道了块体熔融生长的高结构质量 ZnGa 2 O 4 (ZGO) 单晶，可由其制备不同取向的绝缘和半导体晶片。[11,12] ZGO 结晶为立方尖晶石结构（Fd3m 空间群），如图 1 中的球棒模型所示。尖晶石是指一类化学式为 AB 2 X 4 的化合物，其中 A 是二价阳离子，如 Zn，B 是三价阳离子，如 Ga，X 是二价阴离子，如 O。在 ZGO 的正常尖晶石结构中，Zn 占据四面体位置，而 Ga 占据八面体位置。在高温熔体生长过程中，八面体和四面体位置的占据是随机的。[11] 长时间冷却可稳定正常尖晶石结构，而较短的冷却时间会引入反位缺陷。反位缺陷导致 n 型导电性，自由电子浓度在 10 18 – 10 19 cm 3 的数量级上。在氧化气氛中以 800 – 1400 C 的温度进行 10 小时的生长后退火或在 700 C 的温度进行 40 小时的生长后退火后，ZGO 晶体可转变为绝缘状态。[11 – 13] 由于其立方尖晶石结构，ZGO 具有各向同性的热性能和光学性能。发现 ZGO 的光学带隙为 4.6 eV，接近 β -Ga 2 O 3 的光学带隙，并且没有观察到优选的解理面。[11,12]
使用外膜蛋白A，C和F
Salmonella Kentucky带来的全球公共卫生风险（S。肯塔基州）正在上升，特别是由于人类和动物种群中抗菌抗性基因的传播。这种血清在非洲普遍存在，已成为人类非脑性胃肠炎的显着原因。在这项研究中，我们使用了一种生物信息学方法来开发基于肽外膜蛋白A，C和F的基于肽的疫苗。肯塔基州。此外，我们采用了鼠伤寒沙门氏菌的鞭毛蛋白（FLIC）（s。鼠伤寒）作为增强疫苗有效性的佐剂。通过这种方法，我们确定了14个CD8+和7个CD4+ T细胞表位，这些表位预先限制为各种MHC I类和MHC II类等位基因。预计的表皮预计将在疫苗配方中使用时达到94.91％的覆盖率。此外，我们确定了七个高度免疫原性的线性B细胞表位和三个构象B细胞表位。然后，使用适当的接头将这些T细胞和B细胞表位连接起来，以创建多角色疫苗（MEV）。增强了肽构建体的免疫原性，从s。鼠伤寒在N末端包括在内。由此产生的MEV结构表现出高结构质量和有利的理化特性。通过Toll样受体1、2、4和5进行了分子对接研究，然后进行分子动力学模拟，表明疫苗受体综合在能量上是可行的，稳定的和健壮的。免疫模拟结果表明，MEV引起的显着反应，包括IgG，IgM，CD8+ T细胞，CD4+ T-细胞和各种细胞因子（IFN-γ，TGF-β，IL-2，IL-10和IL-12），以及抗原水平的显着降低。尽管有这些有希望的内部发现结果，但进一步验证