CUT&RUN 方法 CUT&RUN 使用 CUTANA™ChIC/CUT&RUN 试剂盒进行,起始于 500k K562 细胞,含 0.5 µg IgG(EpiCypher 13-0042)、H3K4me3(EpiCypher 13-0060)、H3K27me3(EpiCypher 13-0055)或 0.125 µg CTCF(EpiCypher 13-2014)抗体,一式两份。使用 CUTANA™CUT&RUN 文库制备试剂盒(EpiCypher 14-1001/14-1002)以 5 ng DNA(或回收总量,如果少于 5 ng)进行文库制备。文库在 Illumina NextSeq2000 上运行,采用双端测序(2x50 bp)。样本测序深度为 5.5/18.8 百万个读数 (IgG Rep 1/Rep 2)、14.2/17.0 百万个读数 (H3K4me3 Rep 1/Rep 2)、24.7/18.1 百万个读数 (H3K27me3 Rep 1/Rep 2) 和 8.6/5.5 百万个读数 (CTCF Rep 1/Rep 2)。使用 Bowtie2 将数据与 T2T-CHM13v2.0 基因组比对。过滤数据以删除重复、多比对读数和 ENCODE DAC 排除列表区域。
该溶液以 6x 格式提供,包含两种用于监测 DNA 迁移的示踪染料。这些染料在 2% TAE 琼脂糖凝胶上以大约 150 bp 和 800 bp 的距离迁移,或在 1% TAE 琼脂糖凝胶上以大约 500 bp 和 4,000 bp 的距离迁移。缓冲液还含有甘油,用于在加载后将 DNA 保留在孔底,并含有 EDTA 以抑制金属依赖性核酸酶的活性。
编制 SDS 所用数据的主要参考文献和来源 有毒物质与疾病登记署 (ATSDR) 美国环境保护署 ChemView 数据库 欧洲食品安全局 (EFSA) 欧洲化学品管理局 (ECHA) 风险评估委员会 (ECHA_RAC) 欧洲化学品管理局 (ECHA) (ECHA_API) 环境保护署急性暴露指导水平 (AEGL) 美国环境保护署联邦杀虫剂、杀菌剂和灭鼠剂法案 美国环境保护署高产量化学品 食品研究杂志 危险物质数据库 国际统一化学信息数据库 (IUCLID) 国家技术与评估研究所 (NITE) 澳大利亚国家工业化学品通报与评估体系 (NICNAS) NIOSH(国家职业安全与健康研究所)
编制 SDS 所用数据的主要参考文献和来源 有毒物质与疾病登记署 (ATSDR) 美国环境保护署 ChemView 数据库 欧洲食品安全局 (EFSA) 欧洲化学品管理局 (ECHA) 风险评估委员会 (ECHA_RAC) 欧洲化学品管理局 (ECHA) (ECHA_API) 环境保护署急性暴露指导水平 (AEGL) 美国环境保护署联邦杀虫剂、杀菌剂和灭鼠剂法案 美国环境保护署高产量化学品 食品研究杂志 危险物质数据库 国际统一化学信息数据库 (IUCLID) 国家技术与评估研究所 (NITE) 澳大利亚国家工业化学品通报与评估体系 (NICNAS) NIOSH(国家职业安全与健康研究所)
b. 微生物分析:用于微生物指标和病原体特异性测试。指标测试通过指示 ATP、蛋白质和/或微生物测试(通常是总菌落计数、酵母和霉菌或大肠菌群)的残留水平来监测一般卫生水平。特定测试可检测大肠杆菌、沙门氏菌、李斯特菌等致病微生物。有关清洁和消毒措施的信息,建议在清洁和冲洗后但在消毒之前或在消毒后很长时间在规定时间内进行拭子取样。这将允许验证清洁效果以及残留消毒剂的有效性。为了获取生产过程中微生物环境条件的信息,建议在生产表面和产品之前和期间取样,如果在使用推荐的缓冲液消毒后取样。重要的是确保所选的中和剂/缓冲液对所使用的消毒剂有效。当在之前暴露于化学品(清洁剂或消毒剂)的表面上取样时,必须加入适合该介质的中和剂以保持微生物细胞的活力。推荐用于食品厂微生物质量监测的中和溶液为:
编制 SDS 所用数据的主要参考文献和来源:美国有毒物质与疾病登记署 (ATSDR) 美国环境保护署 ChemView 数据库 欧洲食品安全局 (EFSA) 美国环境保护署急性接触指导水平 (AEGL) 美国环境保护署联邦杀虫剂、杀菌剂和灭鼠剂法案 美国环境保护署高产量化学品 食品研究杂志危险物质数据库 国际统一化学信息数据库 (IUCLID) 国家技术与评估研究所 (NITE) 澳大利亚国家工业化学品通报与评估计划 (NICNAS) 澳大利亚工业化学品引进计划 (AICIS) NIOSH(国家职业安全与健康研究所) 美国国家医学图书馆的 ChemID Plus (NLM CIP) 美国国家医学图书馆的 PubMed 数据库 (NLM PUBMED) 美国国家毒理学计划 (NTP) 新西兰化学品分类和信息数据库 (CCID) 经济合作与发展组织环境、卫生与安全出版物经济合作与发展组织高产量化学品计划经济合作与发展组织筛查信息数据集世界卫生组织
65040D Dynabeads™ RNA 结合缓冲液包装批次:2980952 有效期:2024 年 12 月 12 日 (DD.MM.YYYY) 储存:5±3°C 注意:仅供研究使用。不可用于诊断程序。
规格:6x DNA载荷缓冲液用于预处理DNA样品,然后再通过聚丙烯酰胺凝胶中的Acarose凝胶或电泳分析。缓冲液由染料组成,包括溴苯酚蓝色指示剂和氯烯氰醇FF。指标用于视觉监测电泳期间的DNA迁移。甘油确保样品在样品底部积聚。EDTA与二价金属离子结合,并抑制这些离子的依赖性核酸酶。6倍DNA载荷缓冲液由EDTA 30毫米,36%(v/v)甘油组成,0.05%(p/v)Cylene FF,0.05%(p/v)Bromophenol Blue。说明:
主要的文献参考和用于编译SDS毒物和疾病注册机构(ATSDR)的数据来源危险物质数据库国际化学信息数据库(IUCLID)国家技术与评估研究所(NITE)澳大利亚国家工业化学化学通知和评估计划(NICNAS)NIOSH(国家职业安全与健康研究所国家医学研究所)经济合作环境,健康与安全出版物组织经济合作与开发组织的数据库(CCID)组织高产量化学批量化学计划组织的经济合作和发展筛查信息数据集