XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System群落
飞机过滤器和面罩的机载微生物群落的宏基因组分析
机载微生物群落虽然经常因生物量低而挑战研究，但在公共卫生和病原体传播中起着至关重要的作用。通过shot弹枪宏基因组学，这项研究利用面罩和飞机舱滤清器的非侵入性空气采样来研究具有频繁人类相互作用的环境中的微生物多样性，包括医院和飞机。开发了全面的抽样和分析工作流程，并结合了环境和富集方案，以增强微生物DNA恢复和多样性分析。尽管存在生物量的局限性，但允许成功鉴定407种的优化提取方法，其中包括cutibacterium痤疮，表皮葡萄球菌，hankookensis和Radiotolerans甲基杆菌。富集加工导致更大的元基因组组装基因组（MAG）恢复和较高的抗菌耐药基因（ARG）鉴定。这些发现突出了高占用公共场所中ARG的存在，这表明监测的重要性以及在这种环境中减轻空气传播风险的潜力。这项研究证明了将环境和富集采样相结合以捕获狭窄空间中综合微生物和ARG概况的实用性，从而为在公共卫生环境中增强病原体监测提供了框架。
熏蒸剂dazomet通过改变根际微生物群落
在连续种植多年后，农作物通常会受到生长抑制作用，这严重影响了其产量。在农业生产中，土壤熏蒸可以有效地减轻植物的生物压力。然而，对土壤熏蒸变化和植物反应的微生物群之间的关系，以及它们的存在是否对植物做出了有益的贡献，尚不清楚。我们通过影响微生物来探索土壤熏蒸的机理，从而促进植物生长。结果表明，dazomet的治疗显着缓解了烟草的生长迟缓，而这种差异在烟草的繁荣时期最为明显，当时植物高度和叶子面积分别增加了3.33次和3.24次。此外，地上组织的生长优势与根部优势显着相关（p <0.05）。同时，我们发现dazomet处理显着增加了与根相关的大量微生物基团，例如g_pedobacter，g_microbacterium和g_brevundimonas。结构方程建模的结果表明，与所应用的dazomet量正相关的微生物群落，并且与根部正相关（p <0.05）是有助于烟草生长优势的重要因素。总体而言，这项研究的发现对于增强我们通过熏蒸的土壤修复的理解具有重要意义，并且可能对dazomet熏蒸的实际应用具有很大的影响。
土壤微生物群落对消化应用的短期反应取决于消化和土壤类型的特征
F. Vautrin，P。Piveteau，M。Cannavacciuolo，P。Barre，C。Chauvin等。土壤微生物群落对消化施用的短期反应取决于消化和土壤类型的特征。应用土壤生态学，2024，193，pp.Art。105105。10.1016/j.apsoil.2023.105105。hal- 04266661
保护城市生物多样性从丛林群落到选票：与候选人计数
3。候选人的承诺和跟进•带上自然优先级记分卡并用作指南•将补丁连接到WA中更好的自然保护的优先需求•寻求候选人的承诺，并使用记分卡来捕获回答•填写表格。跟进候选人
深入研究不同土壤水系统对日期棕榈根建筑和相关真菌群落的影响
在干旱地区，过度用水威胁着农业可持续性和整体生计。 必须最大程度地减少用水量解决这些问题。 日期棕榈（Phoenix dactylifera L.）是象征性的干旱地区和主要的水消费者作物。 将当前的灌溉系统定制到新的水，效率高效的系统中可以帮助应对这种作物的水消耗。 与植物相关的微生物群落对于农业可持续性至关重要，可以提高受水稀缺威胁的地区的用水效率。 因此，当将农业系统适应当前的全球变化设置时，应认真考虑这些社区。 但是，目前尚无有关这些修饰对日期棕榈微生物群落的影响的信息。 这项研究强调了不同土壤水系统（洪水和滴灌，自然条件和废弃农场）对不同土壤深度处的棕榈根真菌群落的影响。 调查结果表明，土壤水系统对真菌群落有明显影响，并且滴灌减少了真菌的多样性，但增加了丰富的羊膜菌根真菌。 我们表明，在所有采样深度上，这些效果都是相似的。 最后，由于根建筑是吸水的主要决定因素，因此我们在这些不同的土壤水系统下揭示了根建筑的不同行为至160 cm的深度。在干旱地区，过度用水威胁着农业可持续性和整体生计。必须最大程度地减少用水量解决这些问题。日期棕榈（Phoenix dactylifera L.）是象征性的干旱地区和主要的水消费者作物。将当前的灌溉系统定制到新的水，效率高效的系统中可以帮助应对这种作物的水消耗。与植物相关的微生物群落对于农业可持续性至关重要，可以提高受水稀缺威胁的地区的用水效率。因此，当将农业系统适应当前的全球变化设置时，应认真考虑这些社区。但是，目前尚无有关这些修饰对日期棕榈微生物群落的影响的信息。这项研究强调了不同土壤水系统（洪水和滴灌，自然条件和废弃农场）对不同土壤深度处的棕榈根真菌群落的影响。调查结果表明，土壤水系统对真菌群落有明显影响，并且滴灌减少了真菌的多样性，但增加了丰富的羊膜菌根真菌。我们表明，在所有采样深度上，这些效果都是相似的。最后，由于根建筑是吸水的主要决定因素，因此我们在这些不同的土壤水系统下揭示了根建筑的不同行为至160 cm的深度。这项研究的结果为棕榈根建筑和相关的真菌群落提供了新的见解，尤其是在供水危机的背景下，这推动了农业系统的适应性。
估计与从大麻茎中恢复DNA有关的偏差，以进行微生物群落研究
摘要工业大麻植物大麻是纺织品和生物复合材料应用的植物纤维的来源。收获后，植物的茎被布置在地面上，并由自然存在于土壤和茎上的微生物（细菌和真菌）定植。通过产生降解植物壁聚合物的水解酶，将纤维束结合在一起的自然水泥被去除，从而促进其解离（递减过程），这是生产高性能纤维所必需的。要研究屈曲微生物群落的时间动力学（密度水平，多样性和结构），必须从茎中提取基因组DNA的可靠方案。然而，尽管对最终结果的重要性至关重要，但对核酸提取的方法学方面的关注很少。选择了三个方案并测试了三个方案：商业套件（用于土壤的FastDNA™自旋套件），GNS-GII程序和Genosol平台的自定义程序。在土壤和两种不同的大麻茎上进行了比较分析。通过评估提取的DNA的数量和质量以及细菌和真菌种群的丰度和分类法来衡量每种方法的效率。与其他两个方案相比，Genosol方案在基因组DNA的数量和质量方面提供了有趣的产量。然而，两种提取程序（FastDNA™旋转试剂盒和Genosol方案）之间微生物多样性中没有观察到重大差异。基于这些结果，FastDNA™自旋试剂盒或Genosol程序似乎适用于研究重度过程的细菌和真菌群落。应注意的是，这项工作已经证明了评估与大麻茎中DNA恢复相关的偏见的重要性。
揭示了人类尿液受精对土壤细菌群落的影响：可持续施肥的道路
使用人尿作为农作物肥料，由于其潜在的好处引起了兴趣，但其应用对尿液如何影响土壤功能和微生物群落有所了解。本研究旨在阐明土壤细菌群落对用人尿液施肥的反应。为此，菠菜作物被2种不同剂量的分离和储存的人类尿液（170 kg n ha-1 + 8.5 kg p ha-1和510 kg n ha-1 + 25.5 kg p ha-1），并与合成受肥（170 kg n ha-h ha-8.5 ka + p ha-5 k p ha-5 k p ha-1）相比根据随机块方案，在温室条件下在四个土壤罐中进行了实验。我们在开始时和土壤和植物特性的开始时评估了尿液和土壤细菌组成的地位，以了解细菌组成变化中的驱动因素。储存12个月后，尿液具有耗尽的微生物组，但仍然含有很少的尿液或粪便菌株。总体而言，土壤细菌群落对尿液施肥有抵抗力，只有3％的分类单元受到影响。然而，与合成肥料相比，尿液受精的硝化和反硝化基团的相对丰度，这意味着在用尿液施肥时可能会发出更多的n 2 o，而无需发出。尿液的高盐浓度对BAC群落几乎没有明显的影响。在更广泛的背景下，该实验提供了证据表明，一年储存的尿液可以应用于植物土壤系统，而不会在短期内对土壤细菌群落产生负面影响。
在极端，与天文学相关的缺氧地点蓬勃发展的完整微生物群落的分类学和功能分析
方法：在MASE项目（太空探索的火星类似物）中，我们选择了代表性的缺氧类似环境（多年冻土，盐矿，酸性湖泊和河流，硫磺弹簧），以对其微生物群落进行全面分析。我们通过基于丙嗪的扩增子和shot弹枪元基因组测序评估了完整细胞的微生物组谱，并补充了广泛的培养工作。结果：从微生物组分析中对MASE部位蓬勃发展的完整微生物群落检索到的信息，加上31种模型微生物的分离以及15个高质量基因组的15种模型微生物的分离，使我们能够观察到原理途径，与中度环境相比，在MASE位点上阐明了特定的微生物功能。微生物的特征是令人印象深刻的机制来承受物理和化学压力。我们的所有分析级别揭示了微生物群落对复杂有机物的强烈和无所不在的依赖性。此外，我们确定了一个在所有地点蓬勃发展的34个多生物群的极端耐药性世界。
DNA提取和采样方法对通过冷烟鲑和加工植物表面监测的细菌群落的影响
AurélienMaillet，AgnèsBouju-Albert，Steven Roblin，PaulineVaissié，SébastienLeuillet等。dna提取方法和采样方法对细菌群落的采样方法和采样方法，受16s rdna Metabarcoding在冷salmokeped salmon and Processing salmon and Processing surfaces中监测的细菌群落。食品微生物学，2021，95，pp.1-10。10.1016/j.fm.2020.103705。hal-03492706
新热带树中的干旱耐受性特征与植物层真菌群落的组成相关
与植物相关的微生物已显示可帮助植物应对干旱。但是，基本机制知之甚少，并且关于哪种微生物分类单元和功能主要涉及的不确定性。我们在新热带雨林和识别的叶面微生物中探讨了这些问题，这些生物可能在树木的干旱耐受性中发挥作用。我们的目标是（i）测试新热带树中的干旱耐受性特征与其叶面真菌和细菌群落的多样性和组成之间的关系，以及（ii）与干旱耐受性特征相关的叶片微生物分类或负相关。我们的结果表明，叶真菌群落而不是细菌群落的组成与干旱耐受性有关。我们识别27