1 都灵大学临床和生物科学系,Corso Raffaello 30, 10125 Turin, 意大利;marieangele.cucci@unito.it (MAC);margherita.grattarola@unito.it (MG);giuseppina.barrera@unito.it (GB) 2 都灵大学农业科学与技术系,Via Pietro Giuria 9, 10125 Turin, 意大利;chiara.monge@unito.it (CM);chiara.dianzani@unito.it (CD) 3 都灵大学临床和生物科学系—San Luigi Gonzaga 医院,Regione Gonzole 10, 10043 Orbassano, Turin, 意大利;antonella.roetto@unito.it 4 遗传学和生物物理研究所-IGB-CNR,“A. Buzzati-Traverso”,Via Pietro Castellino 111, 80131 那不勒斯,意大利;emilia.caputo@igb.cnr.it * 通信地址:stefania.pizzimenti@unito.it † 这些作者对这项工作做出了同等贡献。‡ 当前地址:图灵生命系统中心,马赛发育生物学研究所 (IBDM),法国国家科学研究院,艾克斯-马赛大学,Parc Scientifique de Luminy,13288 马赛,法国。
摘要:肺癌是全球男性和女性癌症相关死亡的主要原因。表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂 (EGFR-TKI) 是治疗晚期非小细胞肺癌 (NSCLC) 患者的有效药物,这些患者携带 EGFR 激活突变,但由于不可避免地会出现耐药性,因此无法治愈。最近的体外研究表明,EGFR-TKI 耐药性可能来自一小部分耐药持久细胞 (DTP),通过非遗传重编程,进入可逆的缓慢至非增殖状态,然后产生遗传耐药性。因此,揭示控制耐药状态动态的分子机制是当务之急,以便为患者提供可持续的治疗解决方案。越来越多的 DTP 存活的分子机制被描述出来,例如染色质和表观遗传重塑、抗凋亡/存活途径的重新激活、代谢重编程以及与微环境的相互作用。在这里,我们回顾并讨论了目前提出的与 DTP 状态有关的机制。我们描述了它们的生物学特征、耐受的分子机制以及针对 DTP 进行测试的治疗策略。
由于商业饮用水的成本上涨,居民(尤其是在农村地区)越来越依赖自流井水,而自流井水通常是未经处理的,并且没有经常测试是否有损坏。这可能导致摄入对抗生素耐药性的微生物的摄入风险更高。因此,这项研究的重点是从菲律宾Losbaños,菲律宾的Losbaños中检测出来自选定Barangays(Bayog,Malinta和Mayondon)的自流井水样品的粪便(特别是大肠杆菌)。分离的大肠杆菌以获得抗菌素耐药性。使用多管发酵法确定,在30个水样中,大肠菌群的八个水样呈阳性。在八个样品(MY2-2,ML2-3和ML2-4)中,有三个获得了大肠杆菌分离株,如通过表型和分子表征所识别的。使用磁盘扩散测定法,在分离株中鉴定出抗生素头孢唑酮,Meropenem,loxacinem和甲氧苄啶磺胺甲恶唑的耐药模式。的结果表明,MY2-2对头孢曲松,MeropeNem和甲氧苄啶磺胺甲氧唑具有抗性。 ML2-3对头孢唑酮和MeropeNem具有抗性,而ML2-4对所有四种抗生素具有抗性。聚合酶链与引物检测到TEM基因的反应,这是一种扩展的β-内酰胺酶基因,表明分离株对氨苄西林和青霉素具有抗性。表型和分子方法的结果表明分离株具有多药耐药性。根据家庭访谈,隔离了MY2-2的自流井水被10个家庭用来饮酒。因此,地方政府部门应定期监测自流井水的微生物质量,进行教育和信息运动,以了解可以从消耗不洁的水中染上的疾病,并确保可以使用饮用水,尤其是对于没有净化水的家庭。
摘要:抗菌耐药性(AMR)提出了有关医院可获得感染的管理的几个问题,从而导致发病率和死亡率提高和更高的护理成本。多药(MDR)细菌可以通过不同的方式在医疗保健环境中传播。最重要的是当一个人与受感染或定植的患者进行物理接触(可能涉及医疗保健工作者,患者或访客)并进行间接接触传播时,发生直接接触传播。此外,近年来,医院环境中的厕所越来越被认为是MDR细菌的隐藏来源。洗手间中的不同地点,从厕所和料斗到排水管和虹吸管,可能会被MDR细菌污染,这些细菌可能会持续很长时间。因此,共享厕所可能在医院感染的传播中起重要作用,因为它们可以代表MDR细菌的储层。可以通过厕所使用或冲洗过程中可能生产的生物溶质和/或液滴进一步传播此类病原体,并通过吸入并与受污染的Fomites接触而传播。在这篇评论中,我们总结了有关MDR细菌污染医疗保健环境厕所的分子特征的可用证据,特别关注管道组件和卫生安装。最后,在这里,我们提供了传统和新方法的概述,以减少这种感染的传播。在采用有效的管理和含有针对医院感染的干预措施时,应考虑因环境污染而对不同厕所的特定特征的存在。
摘要 结核性脑膜炎 (TBM) 的死亡率仍然保持在 30% 左右,大多数死亡发生在开始治疗后的 2 个月内。耐药菌株的死亡率更高,因此及早发现耐药性 (DR) 至关重要。靶向下一代测序 (tNGS) 产生高读取深度,可以检测低频率的 DR 相关等位基因。我们将 Deeplex Myc-TB(一种 tNGS 检测)应用于 72 名经微生物学确诊的 TBM 成人的脑脊液 (CSF) 样本,并将其基因组药物敏感性预测与表型敏感性测试 (pDST) 和全基因组测序的综合参考标准以及临床结果进行了比较。Deeplex 在 24/72 (33.3%) 个 CSF 样本中检测到结核分枝杆菌复合体 DNA,并为 22/24 (91.7%) 生成了完整的 DR 报告。 Deeplex 生成的读取深度与 MTB/RIF Xpert 的半定量结果相关。在与一线 DR 相关的典型基因座上可以看到频率 <20% 的等位基因。忽略这些低频等位基因,Deeplex 与除吡嗪酰胺和链霉素以外所有药物的综合参考标准 100% 一致。三名患者在治疗 30 天后脑脊液培养呈阳性;参考测试和 Deeplex 在其中两名患者中鉴定出异烟肼耐药性,而 Deeplex 单独在一名患者中鉴定出低频利福平耐药等位基因。五名患者死亡,其中一名患者通过 pDST 鉴定出吡嗪酰胺耐药性。脑脊液 tNGS 可以快速准确地检测出耐药 TBM,但其应用仅限于细菌负荷较高的患者。对于细菌负荷较低的患者,需要开发诊断和耐药性检测的替代方法。
AML 是一种侵袭性血癌,其特征是恶性造血干细胞和祖细胞不受控制地增殖。全面的基因组研究揭示了这种疾病的遗传复杂性,从而导致了更完善的分类系统和风险分层 [ 1 – 4 ]。长期以来,AML 的治疗纯粹以化疗为基础,阿糖胞苷和蒽环类药物是大多数一线治疗中的标准治疗方法 [ 5 , 6 ]。然而,随着对该疾病遗传异质性的了解不断增加,以及相关针对遗传病变的药物的开发努力,治疗前景开始发生变化。2017 年,FLT3 抑制剂米哚妥林是首个获得当局批准的 AML 小分子 [ 7 ]。从那时起,已经开发了大量小分子。这些抑制剂已经获批或目前处于临床前或临床试验的不同阶段。尽管这些药物在临床上取得了无可争议的成功,但原发性耐药或复发是一个巨大的临床问题。因此,了解和克服耐药机制是临床医生和研究人员面临的一项重大挑战。在这篇综述中,我们重点介绍了目前对临床上最相关、权威机构批准的 AML 小分子药物的遗传和非遗传耐药机制的了解。这些药物包括各种 FLT3 抑制剂、IDH1/IDH2 抑制剂和
细胞外基质 (ECM) 对维持组织稳态至关重要,因此其产生、组装和机械刚度在正常组织中受到严格调控。然而,在实体肿瘤中,异常 ECM 结构变化导致的刚度增加与疾病进展、转移风险增加和生存率低有关。作为肿瘤微环境的动态和关键组成部分,ECM 越来越被认为是肿瘤的重要特征,因为它已被证明通过生化和生物力学信号传导促进癌症的多种特征。在这方面,黑色素瘤细胞对 ECM 成分、刚度和纤维排列高度敏感,因为它们通过细胞表面受体、分泌因子或酶直接与肿瘤微环境中的 ECM 相互作用。重要的是,鉴于 ECM 主要由肌成纤维细胞基质成纤维细胞沉积和重塑,它是促进它们与黑色素瘤细胞旁分泌相互作用的关键途径。本综述概述了黑色素瘤,并进一步描述了 ECM 特性(例如 ECM 重塑、ECM 相关蛋白和硬度)在皮肤黑色素瘤进展、肿瘤细胞可塑性和治疗耐药性中所起的关键作用。最后,鉴于 ECM 动力学在黑色素瘤中的重要性日益凸显,本文讨论了使肿瘤中 ECM 正常化的治疗策略的未来前景。
这份经合组织工作文件探讨了土著、农村和偏远地区 (IRR) 社区的抗菌药物耐药性负担。各国对 IRR 社区的定义存在很大差异。尽管存在这些差异,但 IRR 社区的抗菌药物耐药性负担始终较高——比一般人群高出 1.5 到 3 倍,儿童面临的健康风险更高。一系列复杂的因素导致了抗菌药物耐药性,尽管医疗保健服务机会有限、接触受污染的水、社会经济因素、卫生和生活条件不达标、社区间流动模式以及气候变化尤其加剧了 IRR 社区的抗菌药物耐药性。这份工作文件根据“同一个健康”框架提出了 14 项政策,通过多部门行动应对抗菌药物耐药性。它强调,促进国家当局、土著合作伙伴和农村和偏远社区代表之间的密切协调与合作对于确保抗菌药物耐药性相关政策的设计和实施符合当地需求和做法至关重要。
meCA -MRSA通过PCR靶向SA-442物种特异性片段和MECA基因(6,7)。我们使用PCR(8,9),与LUKF/ LUKS-PV基因的隶属关系和存在。我们通过使用磁盘扩散方法对抗生素抗性进行了表型检测,并根据欧洲抗菌敏感性测试版本14.0(10)提供的指南来解释结果。我们使用核素体微生物DNA隔离试剂盒提取DNA(Machery-Nagel,https://www.mn-net.com)。图书馆的准备和全基因组排序被外包给Eurofins(德国体育馆),其中使用了Illumina Novaseq6000技术(https:// www.illumina.com)。读取质量质量并通过使用Shovill v1.0.4(https://github.com/tseemann/shovill)来从头组装,我们通过使用quard v5.0.2(https://quast.sourceforge.net)评估了组装质量。We performed typing by using MLSTFinder v2.0.9 and spaTyper (Genomic Epidemiology Cen- ter, http://www.genomicepidemiology.org) and identified resistance and virulence genes by using ResFinder 4.1 and VirulenceFinder v2.0.3 (Genomic Epidemiology Center) (identity >95%) and confirmed resistance genes通过使用卡3.2.9。(https://card。mcmaster.ca)。我们通过使用bakta 1.9.1(https://bakta.computational.bio)来表征转座TN 554的遗传环境。要比较主体,我们使用了国家生物技术信息中心(NCBI)BLASTN工具(https:// bast。ncbi.nlm.nih.gov)。,我们通过使用Roary以前出版的繁殖(6)(Roary v3.13.0,Gubbins v2.4.1和SNP-Dist v0.7.0; https:/https://github.com)在所有CC398 PVL-Posistive rypseques tripseq:
晚期前列腺癌的临床前景正在迅速变化,并已超出雄激素剥夺疗法和雄激素受体靶向疗法的范围。紫杉烷化疗是治疗晚期前列腺癌的重要手段。此外,PARP 抑制剂等新型药物正在研究中。尽管取得了巨大进展,但对治疗的耐药性仍然是进一步改善的主要障碍。耐药机制似乎多种多样,尚未完全了解或理解。本综述将重点介绍紫杉烷(如增加药物外排能力)和 PARP 抑制剂(如恢复 DNA 修复能力的逆转突变)耐药机制研究的最新进展。了解对治疗的耐药性有望消除阻碍患者预后改善的障碍。