摘要:糖合成酶是突变的糖基水解酶,可以在受体糖酮/aglycone基团和活化的供体糖之间合成糖苷键,并具有合适的离开组(例如Azido,Fluoro)。但是,快速检测涉及偶氮糖作为供体糖的糖合酶反应产物的糖合酶反应产物一直具有挑战性。这限制了我们将合理工程和定向演化方法应用于快速筛选的能力,以改善能够合成定制聚糖的聚糖合成酶。在这里,我们概述了我们最近开发的筛查方法,用于使用模型的岩藻合成酶酶快速检测糖合酶活性,该酶设计为活性在岩藻糖基叠氮化物供体糖上。我们使用半随机和随机误差诱发诱变创建了一个多元化的建筑物联合组织突变体库,然后使用我们的小组开发的两种不同的筛选方法来鉴定了具有所需活性的相关的岩体合成酶突变体,以检测糖合酶的活性(即,通过检测在纤维蛋白酸盐反应后的同体形式上检测偶极外形); a)PCYN-GFP调节方法,b)单击化学方法。最后,我们提供了一些概念验证结果,说明了两种筛查方法的实用性,以快速检测涉及氮杂糖作为捐助者组的糖合酶反应的产物。
摘要人乳寡糖(HMOS)是人类母乳中存在的复杂的多功能聚糖。它们代表了异质结构的复杂混合物,这些结构在抵抗胃肠道消化时以完整形式到达婴儿肠。因此,他们直接和/或间接地向发展中国家赋予了许多好处。某些双歧杆菌物种是母乳喂养婴儿的最早肠道殖民者之一,具有适应性的功能能力来代谢各种HMO结构。通常在婴儿相关的双歧杆菌RIA中观察到这种能力,而不是与成熟的菌群相关的双歧杆菌。近年来,有关这些婴儿相关的双歧杆菌以及某些其他类群如何能够吸收HMO的信息,包括如何使其获取和消费的机械策略。此外,HMO促进的微生物之间发生了复杂的代谢相互作用,包括利用HMO降解释放的分解产物。对HMO介导的微生物组成和功能变化的兴趣一直是众多研究的焦点,在近期,由于单个生物合成HMO的可用性,其中一些现在通常包含在婴儿配方中。在这篇综述中,我们概述了婴儿相关双歧杆菌采用的主要HMO同化和分解代谢策略,讨论其他具有母乳聚糖降解能力的类群,并涵盖了HMO支持的交叉食物相互作用和相关的代谢物,因此已经描述过。
抽象几乎没有比免疫检查点受体及其配体在免疫肿瘤学中更广泛地研究任何分子。然而,通过在实验模型和临床环境中进行激烈的研究,不断发现其他免疫逃避机制和免疫抑制途径。这些包括甲状腺素,这是一个可溶性聚糖结合蛋白的家族,它们通过重新编程淋巴样和髓样细胞的命运和功能来塑造抗肿瘤免疫反应的性质和大小。细胞外,它们与多种糖基化受体相互作用,调节其细胞表面保留,内吞作用,分离和信号传导。值得注意的是,越来越多的证据表明,甲状腺蛋白可以与免疫检查点受体结合,包括T细胞免疫球蛋白结构域和粘蛋白结构域-3(TIM-3),程序性死亡-1(PD-1),淋巴细胞激活基因3(lag-3),lag-3),lag-3),lag-3),细胞毒性tlymphocip and Lymphocipy and anty-eatimphocipy(ctigignen-4) Ig样受体亚家族B3(LILRB3)和B4(LILRB4)有利于它们的信号传导活性和抑制功能。但是,需要更多的工作来剖定这些作用的确切机制,尤其是半乳糖素和规范免疫检查点配体之间的相互作用,以及这些相互作用的生化性质和聚糖结合依赖性。对“ Galectin-rmmune检查点”中心的更好理解将有助于设计新型的免疫治疗方式,旨在在广泛的癌症环境中靶向Galectin驱动的电路。
摘要:人类唾液 - 酸性结合免疫球蛋白样凝集素-9(SIGLEC-9)是在几个免疫细胞上表达的糖免疫检查点受体。SIGLEC-9与含糖酸(唾液聚糖)的唾液酸的结合已充分记录,以调节其作为抑制受体的功能。在这里,我们首先使用良好的三维核磁共振(NMR)方法分配了SIGLEC-9 V-SET结构域(Siglec-9 D1)的氨基酸骨架。然后,我们将溶液NMR和分子动力学模拟方法结合在一起,以解释Siglec-9与天然配体α2,3和α2,62,6 siAllyl乳糖胺(SLN)(SLN)(SAIALYL LEWIS X(SALEX)(SALEX)和6-O硫的分子细节,并与两个固定型结合,并将其与两个固定型结合。正如预期的那样,在规范的唾液酸结合位点的F和Gβ链之间容纳了neu5ac。在NEU5AC的C9位置添加杂型支架9 N -5-(2-甲基噻唑-4-基)噻吩磺酰胺(MTTS)会产生与位于Siglec-9的N-末端区域的疏水性残基的新相互作用。同样,在neu5ac的C5位置添加芳族取代基(5- n-(1-二苯基 - 1 H-1 H- 1,2,3-三唑-4-基)甲基(BTC))稳定在SigleC-9中存在长长的B'-c loop的构象。这些结果暴露了负责SIGLEC-9对这两个改良的唾液聚糖的增强的亲和力和特异性的基本机制,并阐明了针对Siglec-9的下一代修改后的Sialoglycans的合理设计。■简介
已经开发了人类凝集素阵列,以探测具有致病性和共生微生物的先天免疫受体的侵蚀。Following the successful intro- duction of a lectin array containing all of the cow C-type carbohydrate-recognition domains (CRDs), a human array described here contains the C-type CRDs as well as CRDs from other classes of sugar-binding receptors, including galectins, siglecs, R-type CRDs, fi colins, intelectins, and chitinase-like lectins.阵列是用单位生物素标签修饰的CRD构建的,以确保CRD中的糖结合位点显示在定义方向的链霉亲和素涂层的表面上,并可以访问Mi-Crobes的表面。一种用于表达和显示来自聚糖结合受体所有不同结构类别的CRD的常见方法,可以在凝集素家族之间进行比较。除了先前记录的含量标记细菌结合的方案外,还开发了通过用DNA结合染料染色来检测与阵列结合的未标记细菌的方法。筛查也已被病毒糖蛋白以及细菌和真菌多糖未侵蚀。阵列为与受体相互作用的糖配体提供了一个公正的筛选,并且许多人表现出了较早研究所没有预期的结合。例如,某些甲状腺蛋白与缺乏乳糖或N-乙酰乳糖胺的细菌甘氨酸结合。结果证明了人类凝集素阵列的实用性,以提供与先天免疫系统中多种类似聚糖蛋白相互作用的独特概述,并提供了不同类型的微生物。
传统的“中央教条”描述了从DNA到RNA再到蛋白质的遗传信息的流。这个过程突出了基因在生物体中的关键作用。尽管如此,正在进行的免疫研究即将意识到,诸如糖基因和表观遗传学等新兴学科正在挑战传统的观点,并扩大了“中央教条”的界限。这种关键发展导致我们对免疫系统如何运作的理解发生了深刻的转变。因此,人们可能会怀疑是否存在“辅助教条”,可以通过将糖作为核酸和蛋白质后的第3个生命代码来提供这些革命性发现的答案,这是蜂窝材料的生命的第1和2 nd(1,2)。糖基质的出现,尤其是在免疫学领域,已经揭示了聚糖的生物学功能及其在免疫系统中的关键作用(3)。聚糖的丰富性和复杂性赋予免疫系统具有非凡的多样性和适应性,影响免疫细胞内的关键过程,包括信号传导,相互作用和粘附。这种创新的发现为免疫研究和桥接糖基因和免疫学以及遗传学和表观遗传学提供了新的观点,从而有助于更深入地了解免疫系统的功能(4)。遗传学和表观遗传学在与免疫相关疾病研究中起着不可或缺的作用。以及co和后翻译后的修饰,遗传变异显着影响免疫系统的功能,从而导致与免疫相关疾病的发生和进展。研究遗传/表观遗传学与免疫疾病之间的关系已成为揭示免疫学之谜的重要组成部分。在这一领域的深入研究为我们提供了有关免疫系统多样性和免疫相关疾病的OMIC基础的关键信息(5)。
摘要:人类唾液 - 酸性结合免疫球蛋白样凝集素-9(SIGLEC-9)是在几个免疫细胞上表达的糖免疫检查点受体。SIGLEC-9与含糖酸(唾液聚糖)的唾液酸的结合已充分记录,以调节其作为抑制受体的功能。在这里,我们首先使用良好的三维核磁共振(NMR)方法分配了SIGLEC-9 V-SET结构域(Siglec-9 D1)的氨基酸骨架。然后,我们将溶液NMR和分子动力学模拟方法结合在一起,以解释Siglec-9与天然配体α2,3和α2,62,6 siAllyl乳糖胺(SLN)(SLN)(SAIALYL LEWIS X(SALEX)(SALEX)和6-O硫的分子细节,并与两个固定型结合,并将其与两个固定型结合。正如预期的那样,在规范的唾液酸结合位点的F和Gβ链之间容纳了neu5ac。在NEU5AC的C9位置添加杂型支架9 N -5-(2-甲基噻唑-4-基)噻吩磺酰胺(MTTS)会产生与位于Siglec-9的N-末端区域的疏水性残基的新相互作用。同样,在neu5ac的C5位置添加芳族取代基(5- n-(1-二苯基 - 1 H-1 H- 1,2,3-三唑-4-基)甲基(BTC))稳定在SigleC-9中存在长长的B'-c loop的构象。这些结果暴露了负责SIGLEC-9对这两个改良的唾液聚糖的增强的亲和力和特异性的基本机制,并阐明了针对Siglec-9的下一代修改后的Sialoglycans的合理设计。■简介
有证据表明,肠道微生物组的产后发育有助于儿童营养不良1-4。在这里,我们分析了来自微生物组指导的互补食品(MDCF-2)的随机对照试验的生物测量,该试验与在12-18个月大的班加拉德岛(12-18个月大的邦格拉德郡儿童中)相比,与热量更密集的常规辅助食品相比,其体重增加率较高。We reconstructed 1,000 bacterial genomes (metagenome-assembled genomes (MAGs)) from the faecal microbiomes of trial participants, identified 75 MAGs of which the abundances were positively associated with ponderal growth (change in weight-for-length Z score (WLZ)), characterized changes in MAG gene expression as a function of treatment type and WLZ response, and quantified carbohydrate MDCF-2和粪便中的结构。结果表明,与WLZ正相关的两个Prevotella copri mag是MDCF-2诱导的代谢途径表达的主要贡献者,该代谢途径涉及使用MDCF-2的成分聚糖。The predicted specificities of carbohydrate-active enzymes expressed by their polysaccharide- utilization loci are correlated with (1) the in vitro growth of Bangladeshi P. copri strains, possessing varying degrees of polysaccharide-utilization loci and genomic conservation with these MAGs, in defined medium containing different purified glycans representative of those in MDCF-2, and (2)试验参与者中粪便碳水化合物结构的水平。这些关联表明,通过与生长相关的细菌分类群代谢的MDCF中鉴定生物活性聚糖结构将有助于指导有关其在急性营养不良儿童中使用的建议,并能够开发出其他配方。
摘要:位于蛋白质 - 水界面的Poly(Proline)II螺旋基序稳定天然蛋白质的三维结构。在此报告是合成仿生聚(脯氨酸)稳定的多肽纳米结构的第一个例子,该纳米结构是通过连续的N-羧基氢化物(NCA)聚糖的直接开环聚合诱导的自组装(ROPISA)过程获得的。发现使用多功能8臂启动器对于形成纳米颗粒至关重要。蠕虫状胶束以及球形形态。证明了纳米结构用染料的负载。这种快速和开放式的过程可访问具有在纳米医学中应用的基于氨基酸的纳米材料。
当您与糖基团研究所合作时,您将获得我们最先进的基础设施和世界领先的科学专业知识。糖胶菌免疫母体平台研究所依赖于使用我们具有广泛配备的糖碱分析设施,该设施提供了用于定制印刷幻灯片的微阵列制造套件,以使用表面质子膜共振来表征结合动力学。糖叠式分析设施支持确定蛋白质,整个真核和原核细胞,寄生虫和病毒的聚糖结合曲线,以确定这些结合相互作用的表征。